PLIEGO DE PRESCRIPCIONES TÉCNICAS QUE HAN DE REGIR PARA EL SUMINISTRO DE UN ESPECTROMETRO DE MASAS HÍBRIDO DE TIPO

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1 PLIEGO DE PRESCRIPCIONES TÉCNICAS QUE HAN DE REGIR PARA EL SUMINISTRO DE UN ESPECTROMETRO DE MASAS HÍBRIDO DE TIPO CUADRUPOLO-ANALIZADOR ELECTROSTATICO (EXP. 2011/UE/06)

2 1. OBJETO El presente Pliego de Prescripciones Técnicas tiene por objeto definir las características y requisitos técnicos que habrán de reunir los bienes que se oferten en el presente concurso para el suministro de un ESPECTRÓMETRO DE MASAS HÍBRIDO DE TIPO CUADRUPOLO-ANALIZADOR DE MASAS ELECTROSTÁTICO NO CRIOGÉNICO DE ALTA RESOLUCIÓN con destino a la Unidad de Proteómica del "Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares" (CNIC), sito en la calle Melchor Fernández Almagro, Madrid. 2.- CONSIDERACIONES GENERALES El CNIC es un Centro de excelencia en el campo de la investigación biomédica que cuenta con unas modernas instalaciones a partir de las cuales se posibilita la obtención de la máxima excelencia y competitividad científica de vanguardia. El objeto del suministro al que obliga el contrato tiene como fin primordial la adquisición de un equipo de espectrometría de masas capaz de realizar una fragmentación altamente eficiente de péptidos con una alta velocidad de barrido, análisis de masa exacta con muy alta resolución tanto en modo de exploración como de fragmentación y de seleccionar iones precursores para su análisis cuantitativo con alta sensibilidad. Este equipo debe permitir la identificación y cuantificación masivas de péptidos con una gran profundidad en muestras muy complejas como proteomas completos o subproteomas y los estudios de proteómica cuantitativa dirigida sobre péptidos preseleccionados. Dicha identificación y caracterización es esencial para determinar el papel que desempeñan ciertas proteínas en la biología de la célula o de los organismos, en el desarrollo de enfermedades o determinar el rol que pudieran tener como marcadores diagnósticos o pronósticos (biomarcadores), etc. 3.- CARACTERÍSTICAS TÉCNICAS El Espectrómetro de Masas debe ser de altas prestaciones de sobremesa y constar de dos analizadores en tándem, uno de ellos debe ser cuadrupolar y el segundo de tipo electrostático no criogénico de alta resolución por transformada inversa de Fourier. La configuración del cuadrupolo de altas prestaciones debe permitir utilizarlo como filtro de masas que permita la selección del ión precursor y aumente las posibilidades para experimentos MS/MS y SIM, además de dar la capacidad de barridos completos en modo MS y MS/MS en muy alta resolución. Debe permitir llevar a cabo barridos con múltiples precursores (multiplexing), que consiste en la acumulación consecutiva de varios precursores, o sus fragmentos, los cuales se puedan detectar simultáneamente en el analizador de masas electrostático, con muy alta resolución y en un único barrido, reduciéndose así el tiempo de análisis. El Espectrómetro de Masas debe combinar perfectamente una cuantificación precisa y un alto rendimiento con la posibilidad de llevar a cabo trabajos cualitativos a escala masiva, en un solo instrumento.

3 El equipo debe tener, como mínimo, los siguientes accesorios y prestaciones mínimas: Fuente API de altas prestaciones, con interfase ESI incorporada. Filtro de masas cuadrupolar, con barras hiperbólicas, para selección de iones precursores, con una resolución de 0.4 Da en todo el rango de masas. Energía de colisión normalizada, incluyendo energía de colisión paso a paso. Control de ganancia automático. Capacidad de llevar a cabo barridos en modo Full Scan, SIM, MS/MS de iones producto y fragmentación de todos los iones. Modos de barrido avanzados, incluyendo; o Lista de exclusión dinámica de iones para fragmentar y lista de inclusión preferente de iones precursores. o Modo de barrido único de múltiples precursores capturados secuencialmente (multiplexing), tanto en modo Full Scan como en modo fragmentación o Barridos de alta resolución y masa exacta de alta velocidad de repetición (según se detalla después) o Selección del ión precursor en el cuadrupolo y fragmentación en la celda de colisión multipolar, con detección en alta resolución y masa exacta en el analizador electrostático mediante transformada inversa de Fourier o Barridos en modo Dirigido (Targeted en modo SIM, MS/MS), barridos en modo Dependiente (Data Dependent) o Capacidad para excluir temporalmente un ión precursor, en adquisición MS/MS, para incrementar la selectividad de compuestos que coeluyen y aumentar la señal del compuesto seleccionado. o Capacidad para generar automáticamente espectros MS/MS cuando se detecta un patrón isotópico previamente definido. o Capacidad para generar automáticamente espectros MS/MS, cuando se produce una diferencia de masa previamente definida entre dos

4 señales. o Capacidad para generar automáticamente espectros MS/MS cuando se produce una pérdida de masa, m/z, previamente definida entre dos señales. o Capacidad para compensar de forma automática, la energía necesaria de fragmentación, dependiendo de la masa del ión a fragmentar y mejorar la reproducibilidad de un instrumento a otro. o Control automático del tiempo de inyección de iones, para optimizar la corriente iónica, durante todo el pico cromatográfico. Interfase ESI, bomba de jeringa de introducción de directa controlada desde el software y válvula externa para inyectar o desviar el flujo del LC controlada desde el software. Analizador de masas electrostático de alta precisión con electrodo central de 5 kv y análisis mediante transformada inversa de Fourier. Multipolo para transferencia de iones libre de gas. Celda de colisión multipolar de campo axial de alta energía. Adquisición de datos en tiempo real de ultra alta velocidad y sistema de control del instrumento. Sistema de vacío que permita alcanzar: o Presión en el analizador electrostático, en condiciones operativas < 1 x 10-9 Torr. o Control electrónico de presiones. Calibración automática de todos los parámetros de transferencia de iones al analizador electrostático. El espectrómetro de masas debe tener al menos las siguientes prestaciones: Rango de Masas: Resolución: i. 50 < m/z < a m/z 200 (a m/z 400) 17,500 (12,500) 12 Hz 35,000 (25,000) 7 Hz Velocidad de barrido

5 70,000 (50,000) 3 Hz 140,000 (100,000) 1.5 Hz Precisión de Masa i. < 3 ppm RMS con calibración externa ii. < 1 ppm RMS con calibración interna Dos Sistemas de Cromatografía líquida nano LC, con las siguientes características cada uno de ellos: Sistema de cromatografía líquida para trabajar en nano LC, optimizado para su utilización en acoplamientos a espectrometría de masas y especialmente diseñado para aplicaciones de Proteómica. Debe tener un sistema de bombeo sin división de flujo, configurado para mejorar la reproducibilidad, reducir el volumen de trabajo y reducir el consumo de eluyentes, con sensores de flujo, para garantizar la precisión de la mezcla y la generación de gradientes binarios altamente precisos y libres de pulsaciones a flujos de 100 nl / min. con muestreador automático que proporcione la flexibilidad necesaria para los entornos de investigación y la precisión exigida en ambientes de rutina. El sistema se entregará pre-configurado para conectar y sincronizar fácilmente con el espectrómetro de masas, permitiendo una fácil y rápida instalación. La programación del sistema se puede realizar tanto desde la pantalla del sistema como desde el software de control del Espectrómetro de Masas. Debe tener prestaciones iguales o superiores a las siguientes: i. Bomba 1. Flujo de trabajo: Desde 20 nl/min hasta nl/min 2. Flujo en gradiente: Desde 100 nl/min hasta nl/min 3. Carga y equilibrado: 100 µl/min 4. Rango de Presión: bar ( psi)

6 5. Reproducibilidad: Entre 0,1% y 0,4% en el rango de trabajo 6. Ancho de pico típico: 3-5 seg (FWHM) ii. Automuestreador 1. Capacidad: a. Viales: 6x 8 viales, más 6 viales extra para estándares b. Microplacas: 1 x 384, 1 x 96 c. Adaptador de tiras de microplacas: 6x 8 and 3x 8 2. Refrigeración: Compartimento totalmente refrigerado a 20º por debajo del ambiente 3. Volumen de inyección: Desde 0.1 a 18 μl (con loop de 20 μl); en incrementos de 0.01 μl 4. Reproducibilidad: 0.2% a 5 μl; 3.0% a 100 nl, volumen de inyección (RSD) 5. Contaminación cruzada: < 0.05%. Debe disponer de dos solventes (Además del agua en A) para repetir el ciclo de lavado, de la aguja de inyección requerido en cada situación. Debe incluir un set de columnas cromatográficas: i. Pre-columna: 2cm,75µm ID,5µm C18; ii. Columna analítica: 10cm,75µm ID,3µm C18. Dos interfases nanoesi para trabajar a nanoflujos, con cámara de CCD incorporada, para acoplar la salida de los nanolcs El equipamiento informático debe tener al menos las siguientes características: PC del tipo Core 2 Duo 3GHz, de las siguientes prestaciones: i. Procesador, 3 GHz ii. Memoria RAM 4096 MB 800 MHz DDR2 iii. Disco duro de 500 GB SATA II iv. DVD-RW v. Tarjeta de red 10/100

7 vi. 2 PCI y 1 PCI-Express- slots vii. Networkchip 10/100/1000 viii. Sistema Operativo, Windows 7 Professional (32Bit OS) version Inglés ix. MS Office 2010 Profesional. x. Monitor color de pantalla plana de 22 TFT POR EL CNIC, POR LA UNIDAD PETICIONARIA, Investigador Senior II del Dpto. de Biología Vascular e Inflamación Madrid, 6 de octubre de 2011 EL DIRECTOR-GERENTE, Fdo. Jesús Vázquez Fdo. Alberto Sanz Belmar