Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación en Aplicaciones Bioinformáticas

Transcripción

1 Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación PRATO Laura Beatriz Ingeniera en Sistemas de Información Prof. Adjunta Efectiva Doc. Investigadora Cat. III Universidad Nacional de Villa María Villa María-Córdoba-Argentina

2 País: Argentina Córdoba Provincia: Córdoba Ciudad: Villa María Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación

3 Institutos Académicos-Pedagógicos Ciencias Sociales Ciencias Básicas y Aplicadas Ciencias Humanas Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación

4 Licenciatura en Informática Ciencias Básicas y Aplicadas Licenciatura en Óptica Oftálmica Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación

5 Area de características multidisciplinarias en pleno desarrollo y expansión Variedad de tecnologías disponibles y aplicaciones que están generando cantidades abrumadoras de datos Minería de Datos, concepto que aglutina una variedad de metodologías analíticas, proporciona un marco conceptual y metodológico para el abordaje del análisis de datos y señales en distintas disciplinas Necesidad de protocolos, conceptos y métodos que permitan un análisis uniforme y asequible

6 CARACTERÍSTICAS de la BIOINFORMÁTICA Esta disciplina cumple un importante papel en el análisis de cualquier tipo de datos biológicos, ecológicos, sistemáticos y bioquímicos con el soporte principal de programas o software. Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación

7 Desarrollar un Centro de investigación, desarrollo e innovación tecnológica en el ámbito del IAP de Ciencias Básicas y Aplicadas de la UNVM, cuyo fin será analizar, investigar, desarrollar, implementar y complementar herramientas bioinformáticas/estadísticas útiles para la exploración de patrones en bio-ciencias, con el objeto de examinar, manipular y obtener información calificada de grandes volúmenes de datos biológicos provenientes de estudios específicos de cada área temática involucrada en las carreras del Instituto. Generar sinergias de trabajo entre diversos actores de la vida universitaria, especializados en múltiples y diferentes disciplinas y áreas del saber científico-tecnológico, promoviendo espacios de formación, intercambio y vinculación con el medio.

8 Desarrollo de aplicaciones informáticas para resolver problemas de índole biológico que generan grandes volúmenes de información para analizar y procesar, en este caso particular, relacionados a la agronomía, el área de alimentos, veterinaria, entre otros. Cantidad, calidad y pertinencia de temas para desarrollar tesis de grado y posgrado en el ámbito de las carreras del IAPCByA. Disminución de la deserción estudiantil motivada por la oferta temprana de actividades laborales; motivando a los alumnos a la obtención de becas de diferentes índoles. Cantidad y calidad profesional de los egresados de las carreras involucradas. Articulación investigación-desarrollo-innovación-implementación. Articulación sectores públicos y privados. Articulación Universidad-Empresa.

9 Analizar el entorno organizacional de la UNVM y su estructura académica en Institutos Académicos Pedagógicos multidisciplinares que engloban carreras de áreas afines. Estudiar la estructura multidisciplinar, particularmente del Instituto AP de Ciencias Básicas y Aplicadas. Modelar un Centro de investigación, desarrollo e implementación de proyectos multidisciplinares en el área de las ciencias básicas y aplicadas. Crear un espacio de generación de ideas-proyecto que sirvan para el desarrollo de tesis grado y posgrado de las carreras del IAPCByA de la UNVM, con firmes posibilidades de extenderlo al resto de los Institutos Académicos Pedagógicos de la UNVM. Promover la creación y consolidación de grupos de investigación y desarrollo multidisciplinarios que a través de proyectos ofrezcan soluciones a problemas del entorno, fortaleciendo el manejo de diversas herramientas de desarrollo.

10 Contribuir al mejoramiento continuo en la calidad de la formación técnica y universitaria de los jóvenes orientándolos a ser más productivos y competitivos en el mercado laboral. Formar recursos humanos nacionales en bioinformática, comprometidos ética y profesionalmente con la sociedad. Desarrollar herramientas y aplicaciones de bioinformática (librerías, software) para facilitar el procesamiento de datos biológicos. Divulgar y publicar los proyectos para hacer visible la producción científica y tecnológica de la universidad. Generar un área de servicios que provea soluciones a instituciones y empresas de la ciudad y región, en la temática de referencia. Vincular la universidad con instituciones y empresas públicas y privadas, mediante el desarrollo de proyectos tecnológicos de calidad, que permitan la consolidación y crecimiento del Centro.

11 Convocatoria 2012/2013: Proyectos de Investigación en la UNVM Minería de Datos en Bio-Ciencias: bioinformática, bioingeniería y biotecnología. Desarrollo de metodologías para el análisis ontológico-funcional en genómica/proteómica de alto rendimiento. Convocatoria 2014/2015: Minería de Datos en Bio-Ciencias: aplicaciones estadísticas y bioinformáticas. Implementación de software de modelización y simulación de sistemas como complemento de aprendizaje en las carreras de ciencias básicas y aplicadas.

12 Presentaciones en Congresos Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación ISCB Latin America Santiago de Chile, Marzo Congress annals Goboot: testing set enrichment analysis robustness to background selection-, Fresno, López, Balzarini, Prada y Fernández 3er Congreso Argentino de Bioinformática y Biología Computacional, Oro Verde, Septiembre 2012 GOboot: towards a robust SEA analysis. Fresno, Lopez, Zingaretti, Prato, Podhajcer, Balzarini, Prada y Fernández. One vs One Artificial Neural Network strategy for gene expression multiclass classification. Remón, Juarez, Arab Cohen D, Fresno C, Prato L, Villoria L y Fernández E. SVM Tree with Optimal Multiclass Partition applied to Gene expression signature classification. Pellarolo, Arab Cohen, Fresno, Prato y Fernández. VII Jornadas de Investigación, Villa María, Noviembre 2012 Minería de datos en Bio-ciencias: bioinformática, bioingeniería y biotecnología, Fernández, Prato, Fresno Exploración de distintas librerías y funciones de r para análisis cluster María Laura Zingaretti, Laura Prato, Elmer Fernández Procesamiento distribuido en bioinformática utilizando el lenguaje r, Fraccarolli, Marzioni, Ferreyra, Fresno, Prato II Escuela de Computación de Alto Rendimiento (ECAR 2013), Mendoza, Julio 2013 (Sesión de Posters) The course of parallelism in Bioinformatics: which R parallelization scheme to use? Ferreyra, Fresno, Olivera, Fernández 4to Congreso Argentino de Bioinformatica y Biologia Computacional, Rosario, Octubre 2013 (Sesión de Posters) lmdme: Linear Models on Designed Multivariate Experiments in R. Fresno, Balzarini, Prato, Fernández. The course of parallelism in Bioinformatics: which R parallelization scheme to use?. Ferreyra, Fresno, Olivera, Fernández VIII Jornadas de Investigación, Villa María, Noviembre 2013 Aplicación de cluster consenso para determinar el número de grupos en un problema de clasificación de cobertura vegetal. María Laura Zingaretti Árbol de clasificación paralelo: una herramienta de minería de datos. Nicolás Ferreyra

13 Publicaciones en revistas de referato internacional Fresno C, Llera AS, Girotti R, Valacco MP, López J; Podhajcer O, Balzarini M, Prada F, Fernández EA, The Multi-Reference Contrast Method: facilitating set enrichment analysis, Computers in Biology and Medicine, Volume 42, Issue 2, Pages , February 2012 Loreti N, Fresno C, Fernandez AE, Barrera D, Lira S, Larrea F, Campo S. Glycan structure in recombinant human FSH affects endocrine activity and global gene expression on human granulosa cells, Volume 366, Issue 1, 5 February 2013, Pages 68 80

14 Formación de RRHH Trabajo Final de la carrera Ingeniería de Sistemas de la Facultad de Ingeniería de la UCC, correspondiente a los alumnos Sergio Taleisnik y Juan Masashi Mishima, titulado Sistema de análisis estadístico de experimentos proteómicos de geles de electroforesis bidimensional. Premio Intel año 2012 y beca EVC-CIN 2012 para el alumno de la UNVM Emiliano Marzioni por su trabajo dentro del proyecto Procesamiento distribuido en Bioinformática utilizando lenguaje R. Premio Intel año 2013 y beca EVC-CIN 2013 para el alumno de la UNVM Nicolás Ferreyra por su trabajo dentro del proyecto HPC aplicado a la Bioinformática: determinación de métodos y técnicas de parelelización eficientes para algoritmos secuenciales escritos en R. Premio Intel año 2014 para el alumno de la UNVM Augusto Leszchik.

15 Ing. Laura Prato Ing. Laura Prato Centro de Investigación, Desarrollo e Innovación