PLATAFORMA DE DIAGNÓSTICO FENOTIPICO, CITOGENÉTICO, MOLECULAR Y POR IMAGEN RESUMEN ACTIVIDAD 2008

Transcripción

1 PLATAFORMA DE DIAGNÓSTICO FENOTIPICO, CITOGENÉTICO, MOLECULAR Y POR IMAGEN RESUMEN ACTIVIDAD 2008 Madrid, 28 de Noviembre de 2008

2 PROGRAMA DE DIAGNOSTICO DEL CANCER Objetivos Promover estrategias cooperativas en el diagnóstico avanzado del cáncer en los ámbitos del diagnóstico por la imagen, fenotípico, genético y molecular Desarrollar nuevas tecnologías Diagnóstico del cáncer mas preciso Mejorar el pronóstico y la predicción de la respuesta terapéutica, Potenciar las actividades de diagnóstico precoz Evaluar la monitorización de la evolución de la enfermedad. Proporcionar el acceso de estas tecnologías a centros y grupos de forma coordinada para permitir una investigación en cáncer de mayor calidad

3 PROGRAMA DE DIAGNOSTICO DEL CANCER Objetivos Facilitar la transferencia del conocimiento al ámbito clínico Diseñar e implantar programas de control de calidad internos y externos en el diagnóstico del cáncer Promocionar, difundir e implementar los nuevos avances metodológicos y criterios para el diagnóstico, caracterización y monitorización de enfermedades las enfermedades neoplásicas

4 Estructura organizativa COORDINADOR Dr. Elias Campo Diagnóstico IMAGEN Dra. F. F. Pons (Barcelona) Diagnóstico FENOTIPICO Dr. Dr. A.Orfao (Salamanca) Diagnóstico GENETICO Dr. Dr. M. M. D Odero (Pamplona) Diagnóstico MOLECULAR TUMORES PEDIATRICOS Dr. Dr. S.Navarro (Valencia) Unidad deproducción de de AcMo Dr. Dr. G.Roncador (Madrid) HEMATOLOGIA Dra.D.Colomer (Barcelona) TUMORES SOLIDOS Dra. T.Caldes (Madrid) RITCC CANCER

5 Programa de Diagnóstico en Cáncer Distribución de las Plataformas de Servicio Citometría (2 grupos) Citogenética (3 grupos) Diagnóstico por la imagen (5 grupos) Tumores Sólidos (6 grupos) Neoplasias hematológicas (6 grupos) Tumores Pediátricos (3 grupos)

6 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO POR IMAGEN Centro de Cáncer, Universidad de Navarra Institut d Alta Tecnologia-Parc Recerca Biomèdica de Barcelona IDIBAPS-Hospital Clínic, Barcelona Hospital Infanta Cristina, Badajoz Hospital Universitario Virgen de las Nieves, Granada

7 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO POR IMAGEN Objetivos y acciones desarrolladas en 2008 Actualización del catálogo de prestaciones Elaboración de un documento informativo sobre las indicaciones actuales de la PET Participación en la formación de personal en las nuevas técnicas de diagnóstico por la imagen del cáncer: CURSO FORMACIÓN DE PERSONAL - 29 asistentes - Período de formación total de 95 meses

8 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO POR IMAGEN Objetivos y acciones desarrolladas en 2008 Realización de estudios PET en investigación: Investigación básica Investigación clínica 550 estudios micropet 570 estudios PET-TC en investigación clínica Nuevas aplicaciones de la técnica de detección del ganglio centinela: cáncer de vulva, cérvix, endometrio, cabeza y cuello (196 estudios) Perspectivas de futuro Elaboración de protocolos consensuados para la realización de los estudios PET y de la técnica de detección del ganglio centinela

9 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO FENOTÍPICO MA. Montalban/JJ Lahuerta, Hospital 12 de octubre, Madrid A. Orfao, CIC (IBMCC- CSIC/USAL), Salamanca

10 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO FENOTÍPICO: Objetivos alcanzados 1. Programa de control de calidad externo (objetivo 3): - Programa de control de calidad externo y guía para diagnóstico fenotípico de infiltración neuromeningea en LNH-B agresivos. 2. Catálogo de pruebas de diagnóstico fenotípico (objetivo 4): - Ampliación del catálogo de pruebas que incluye: - Diagnóstico de clonalidad en SMD y neoplasias de células NK - Diagnóstico de infiltración neuromeningea en LLA, LNH y tumores no hematopoyéticos - Nuevas estratégias para monitorización de EMR en hemopatías linfoides (LLA y SLPC-B) 3. Desarrollar nuevas técnicas y herramientas diagnósticas (objetivo 5): - Nuevos algoritmos para ayuda al diagnóstico fenotípico con software - Nuevos kits para diagnóstico de reordenamientos genéticos con detección de proteínas de fusión (p.ej.: bcr/abl) - Panel de diagnóstico/clasificación de tumores infantiles por CMF. - Plataforma teragnóstica para diagnóstico precoz de sensibilidad terapéutica (respuesta a 2000 fármacos/combinaciones de fármacos)

11 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO CITOGENÉTICO MD Odero/MJ Calasanz. CIMA, Universidad de Navarra F.Solé, Hospital del Mar Barcelona JM Hernandez Rivas/JF San Miguel CIC (IBMCC-CSIC/USAL, Salamanca)

12 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO CITOGENÉTICO: Objetivos 1. Ofrecer un servicio de diagnóstico citogenético a grupos de la red número de muestras analizadas: Proporcionar soporte citogenético en la identificación y caracterización de nuevos genes asociados a neoplasia SMD: (del5q)/revlimid (comité de expertos, centro de referencia) cáncer de mama (ERBB2/herceptin) (centro de referencia) leucemias y linfomas: identificación de nuevos genes implicados en reordenaciones con ETV6 y ABL1 reordenamientos 3q en pacientes con cariotipo normal y sobreexpresión de EVI1 (3q26) 3. Desarrollar nuevas técnicas diagnósticas/con impacto pronóstico asnps mirnas

13 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO CITOGENÉTICO: Técnicas disponibles/ofertadas 1. Citogenética convencional de bandas G 2. Hibridación in situ con fluorescencia (FISH) con sondas comerciales o de diseño propio sobre tejido fresco o tejido parafinado 3. FISH multi-color (mfish) 4. Cariotipo espectral (SKY) 5. FICTION 6. Arrays CGH 7. Arrays SNPs +

14 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO CITOGENÉTICO: Colaboraciones y formación Colaboración con otros grupos de la red: Grupos clínicos asociados Grupos de la Línea Mecanismos moleculares en el desarrollo y progresión del cáncer Grupos de la Línea Tumores Hematológicos Cursos de Formación: 1.- Genoma y Cáncer: una visión clínica (Hospital de Navarra) 2.- Técnicas de Análisis Genético en Cáncer (Hospital de Navarra) 3.- Genómica y Cáncer (Instituto Oncológico de San Sebastián) Cursos Acreditados por la Comisión de Formación Continuada de Navarra del Sistema Nacional de Salud (Departamento de Salud del Gobierno de Navarra) 4.- Actualización en diagnóstico genético de neoplasias hematológicas 5.- Diagnóstico Genético en un laboratorio de Genética. Implicaciones en el tratamiento de pacientes con leucemias y linfomas

15 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN HEMOPATÍAS MALIGNAS D.Clomer, IDIBAPS/Hospital Clínic debarcelona P.Bolufer, Hospital La Fe, Valencia M.Gonzalez/JF San Miguel CIC (IBMCC-CSIC/USAL, Salamanca)

16 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN NEOPLASIAS HEMATOLÓGICAS Objetivos y Acciones 3. Potenciar y Desarrollar un programa de control de calidad de Biología Molecular en colaboración con los grupos de la Asociación Española de Hematología y Hemoterapia (AEHH) y promover la introducción de nuevas técnicas en este programa Control de calidad de cuantificación del gen BCR-ABL Participación en el programa EUTOS de la European Leukemia Net para la estandarización de la técnica de cuantificación del gen BCR-ABL. El laboratorio del Hospital Clinic (Dra Colomer) es el laboratorio de referencia en España

17 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN NEOPLASIAS HEMATOLÓGICAS : CONTROL DE CALIDAD 2008 (envío de un control comercial Low BCR-ABL p210 control ) Número total de laboratorios: 43(BCR-ABL) Recibidos resultados de 32 centros PARTICIPACION: 77% Copias BCR-ABL ± N=32 (MIN:0.56-MAX:1921) valores comerciales 96 (MIN 25;MAX189) Copias ABL ± N=25 (MIN:1000-MAX: ) valores comerciales (MIN 24137;MAX170941) Copias GUS ± N=25 (MIN:371-MAX:276075)

18 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN NEOPLASIAS HEMATOLÓGICAS Programa EUTOS 2008 Objetivos: - Estandarización internacional del análisis de Q-PCR para BCR-ABL y para la detección de mutaciones BCR-ABL. - Determinar el impacto pronóstico de mutaciones BCR-ABL. - Establecer uno o más laboratorios de referencia (certificados por la ELN) en cada país. -Un programa de intercambio entre científicos y técnicos permitiría extender metodologías de PCR estandarizadas - Controles periódicos usando muestras de pacientes (lisados de células LMC diluidos en células normales). Objetivo final: estandarización a nivel europeo Trabajo realizado : 12 laboratorios han enviado 30 RNAs de LMC para validación por laboratorio de referencia El laboratorio de referencia está analizando estos resultados El laboratorio de referencia ha generado una curva estándar a partir de un plásmido consenso en toda Europa, para todos los laboratorios españoles para que sea utilizada como curva patrón. Cofinanciación por parte de Novartis y European Leukemia Net

19 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN TUMORES PEDIATRICOS J.Sanchez, Hospital Val d Hebrón, Barcelona P.Bolufer, Universidad de Valencia E. de Alava CIC (IBMCC- CSIC/USAL), Salamanca

20 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN TUMORES PEDIATRICOS Universidad de Valencia - TUMORES NEUROBLÁSTICOS (n= improntas MO + 25 MO tras cultivo) MYCN: Tumores Improntas MO Cultivo MO» NO AMPLIFICADOS » AMPLIFICADOS 9 3» GANANCIA 9 2» No tumor p36: (hasta 31 Diciembre 2007)» NO DEL 30» DEL 11» No tumor q23: (desde 1 Enero 2008)» NO DEL » DEL 12 2» DESEQUILIBRIO 1» No tumor OTROS: SARCOMA SINOVIAL: 5 SARCOMA EWING: 4 T.RABDOIDES: 3 - Matrices TMA (n=22 con muestras/tma; casos/tma) 11q23 (12 TMA); 17q23 (8 TMA); ALK (2 TMA) - MLPA vs FISH: MYCN y 1p36 (n=129) y 11q/17q (n=57)

21 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN TUMORES PEDIATRICOS CIC Salamanca (ISO ) 1.- Diagnóstico/caracterización de Sarcomas: - Análisis de patología molecular: FISH (n=63): -SYT 27 -EWS 25 -FKHR 4 -CHOP 2 -FUS 5 - GIST (KIT, PDGFRA): Nuevos métodos/sondas: - Evaluación de nuevas sondas: EWS/FLI1 (S. Ewing) CICLINA D3 (Ca. Mama, vejiga y sarcomas) TMPRSS2/ERG (Ca. Prostata) - Diseño de nuevas sondas: JAZF1/JJAZ1 (S. del estroma endometrial) (pendiente de validación)

22 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN TUMORES PEDIATRICOS Vall d`hebron (Barcelona) 1.- Diagnóstico/caracterización de rabdomiosarcomas (37/39) - erms (20/30 analizados) - arms (6/7 analizados): 5 casos positivos (1 PAX7/FOXO1; PAX3/FOXO1) 2.- Enfermedad mínima diseminada en rabdomiosarcomas

23 SUBPROGRAMA DE DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN TUMORES SÓLIDOS T.Caldes, Hospital Clínico, Madrid

24 Programa diagnóstico Molecular Subprograma tumores solidos: grupos integrantes Laboratorio de Oncología molecular Hospital Clinico San Carlos Responsable Dra Trinidad Caldes Laboratorio cáncer de pulmón CNIO Responsable Dra Montse Sanchez Cespedes Laboratorio de Biología molecular del Cáncer Hospital Germans Trias i Puyol Responsable Dr Miquel Taron Laboratori de la recerca translacional ICO Responsable Dra Conxi Lázaro García Las carteras de servicios están incluidas en la pagina web desde el año 2007, este año 2008 se han actualizado con nuevos servicios

25 Objetivos planteados para el año 2008 en el subprograma tumores solidos 1. Guias de consenso para el estudio genético de cáncer hereditario: Poliposis, mama/ovario y HNPCC 2. Establecimiento de control de calidad de estudios de genes implicados en el cáncer hereditario 3. Estudios en colaboración de los grupos del subprograma Objetivos logrados 1. Se han incorporado a la pagina web de la RTICC las guías de consenso y algoritmos para el estudio genético de Poliposis, mama/ovario y HNPCC 2. Los grupos de la Dra Conxi Lázaro y de la Dra Trinidad Caldés han pasado el control de calidad EMQN para el estudio de MLH1, MSH2, BRCA1 y BRCA2 3. Se han establecido 3 proyectos de colaboración entre el grupo del ICO y el grupo del HCSC

26 Objetivos planteados para el año 2009 en el subprograma tumores solidos 1. Continuar los estudios en colaboración de los grupos del subprograma 2. Establecer un control de calidad interno de los estudios genéticos mediante muestras con mutación estudiadas en un centro y enviadas a otro de forma blindada para su comprobación 3. Incorporar a la pagina web guías de seguimiento y manejo del cáncer hereditario

27 Estudios en colaboración por parte del Laboratori de Recerca Translational (ICO) y el Laboratorio de Oncología Molecular (HCSC) 1. Caracterización de grandes reordenamientos en los genes hmlh1 y hmsh2 detectados por la técnica MLPA en pacientes de familias con HNPCC 2. Estudio de un haplotipo en los intrones 1,6 y 11 del gen APC con el fin de determinar su riesgo en el CRC 3. Estudio de las variantes L622H y c G>A encontradas en el gen hmlh1 como posible mutaciones fundadoras en España que confieren susceptibilidad a padecer el síndrome HNPCC 4. El Laboratorio de Oncología Molecular ha estudiado el gen hmsh6 completo en 11 pacientes de familias españolas procedentes del instituto Catalan de Oncología