CURSO TEÓRICO-PRÁCTICO de PATOLOGÍA MOLECULAR CICLO AVANZADO

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María Josefa Palma Lozano
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1 CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES ONCOLOGICAS PROGRAMA DE PATOLOGÍA MOLECULAR CURSO TEÓRICO-PRÁCTICO de PATOLOGÍA MOLECULAR CICLO AVANZADO de Noviembre,

2 I CURSO DE PATOLOGÍA MOLECULAR CICLO AVANZADO CNIO de Noviembre de 2003 OBJETIVO Este Curso de Patología Molecular pretende ofrecer formación sobre aspectos metodológicos en patología molecular aplicados al estudio de las neoplasias, que permita la comprensión de estas nuevas técnicas y de sus aplicaciones, tanto en la práctica asistencial como en el desarrollo de proyectos de investigación. En su primer ciclo, desarrollado en el mes de abril, se puso a los alumnos en contacto con las técnicas de Patología Molecular más usadas actualmente en Patología Clínica Este segundo ciclo pretende aportar el conocimiento básico de técnicas avanzadas de Patología Molecular de gran valor en la investigación y asistencia oncológica aunque con un mayor nivel de complejidad que las tratadas en el primer ciclo. METODOLOGÍA Al igual que el ciclo básico, esta parte del curso se desarrollará según una dinámica teórico-práctica. La mañana del lunes se dedicará totalmente a los aspectos de las técnicas a desarrollar. Así mismo, la última hora de la mañana del resto de días se desarrollarán diversos aspectos. El resto del curso se desarrollará en los laboratorios del CNIO, en pequeños grupos y con una orientación eminentemente práctica. CALENDARIO Práctica Práctica Práctica Práctica Conferencia Práctica Práctica Práctica Práctica El Curso se desarrollará de Lunes 17 a viernes 21 de Noviembre de Todas las sesiones comenzarán a las 9 de la mañana y finalizarán a las 18 horas, excepto el viernes 21 que finalizarán a las 14 horas. El lunes 17 se comenzará a entregar documentación a las 8:30 horas.

En su primer ciclo, desarrollado en el mes de abril, se puso a los alumnos en contacto con las técnicas de Patología Molecular más usadas actualmente en Patología Clínica Este segundo ciclo pretende

3 SEMINARIOS TEÓRICOS Lunes 17 9,00 Saludo e introducción. MA Piris 9,10 Alteraciones Epigenéticas del Cáncer. Metilación de DNA. M Esteller 9,40 : Identificación, significado y manejo de SNPs en enfermedades humanas. M Robledo 10,10 Descanso 10,30 Fundamentos de la Microscopía Confocal y Citometría de Flujo. M Montoya 11,00 Análisis de la expresión génica mediante arrays de DNA. A Dopazo 11,30 Herramientas de análisis en expresión génica. J Dopazo 12,00 Citogenética Molecular (hibridación in situ con fluorescencia). J Cruz 12,30 Organización de grupos de prácticas. M.Morente 12,40 Descanso 13,00 Conferencia (CNIO Seminar). Aplicaciones de las técnicas moleculares a la patología quirúrgica. X. Matias-Guiu, Hospital Aranu de Vilanova, Lerida. Martes 18, 13:15 Introducción a la proteómica (Ignacio Casal) Miércoles 19, 13:15 Métodos estadísticos para la búsqueda de factores pronósticos: revisión y admoniciones varias. (Ramón Díaz) Jueves 20, 13:15 Anticuerpos monoclonales: producción y caracterización. (Giovanna Roncador) Viernes 21, 13:15 Conferencia: Patología Molecular, pieza clave en la investigación translacional en cáncer (J.Palacios) PRACTICAS (Grupos de 5 alumnos) Diagnóstico molecular en oncohematología mediante FISH Juan Cruz Cigudosa, Mª Carmen Martín, Blanca Fernández. De lunes a jueves, de a 18:00 Nociones técnicas sobre FISH Observación y Manejo de software de FISH Análisis de casos problema Microdisección: Francisca I. Camacho y Soledad Alonso De Martes a viernes, de a 13:00 Introducción teórica: Metodología y aplicaciones Tinción con HE de un porta con membrana Manejo del láser de Microdisección Metilación: Manel Esteller De Martes a viernes, de a 10:30 y de 12:30 a 13:00 Extracción de DNA y tratamiento con bisulfito MSP (PCR específica para metilación)

M Montoya 11,00 Análisis de la expresión génica mediante arrays de DNA. A Dopazo 11,30 Herramientas de análisis en expresión génica.

4 PCR en gel y análisis de resultados : Mercedes Robledo Lunes a jueves, de 15 a 18 y martes a viernes, de 10:30 a 12:30 Preparar geles de SSCP o CSGE. Equipo dhplc Tinción e interpretación de geles Lectura e interpretación de dhplc Matrices de tejido (TMA) Lidia Sánchez, Ana Díez y Juan Fernando García De lunes a jueves, de 15 a 18. Introducción teórica Diseño de un TMA Realización de un TMA Guía de problemas/causas/soluciones De Martes a viernes, de 10 a 12. Contenidos Valoración (manual y automatizada) Análisis de resultados Análisis de expresión por RT-PCR a tiempo real Maria Jesús Artiga, Alberto Pérez De Martes a viernes, de 9 a 10 y de 12 a 13. Contenidos : Introducción teórica Práctica Análisis de resultados Introducción a la Microscopía Confocal y Citometria de flujo Maria Montoya, Arancha García De lunes a jueves, de 15 a 18 Confocal: Protocolo técnico Confocal: Observación CMF: Protocolo técnico CMF: Adquisición de datos, CMF: Análisis de resultados Determinación de perfiles de expresión génica con microarrays de DNA Ana Dopazo, Orlando Dominguez De Martes a viernes, de 9 a 10:30. : Introducción a la práctica (Ana Dopazo) Fabricación de los microarrays (Gloria Soler) Procesamiento (hibridación) de los microarrays (Rebeca Álvarez) Adquisición de la imagen (Rebeca Álvarez) Análisis de imagen y cuantificación de los resultados (Rebeca Álvarez)

Introducción teórica Diseño de un TMA Realización de un TMA Guía de problemas/causas/soluciones De Martes a viernes, de 10 a 12.

5 Bioinformática Joaquín Dopazo De Martes a viernes, de 10:30 a 13:00 : Introducción a la práctica Normalización de los datos iniciales de los s Agrupamiento de genes o muestras Obtención de genes característicos o diagnóstico de clases experimentales.

iniciales de los s Agrupamiento de genes o muestras Obtención

6 GRUPOS DE PRÁCTICAS (Se constituirán 4 grupos de 5 alumnos.) Grupo A Metilación - 1 PCR Cuant - 1 Microdisección Bioinformática Metilación - 2 PCR Cuant - 2 Citogenética TMA - 1 Confocal y CMF Grupo B Metilación - 1 PCR Cuant - 1 Microdisección Bioinformática Metilación - 2 PCR Cuant - 2 TMA - 1 Confocal y CMF Citogenética Grupo C PCR Cuant - 1 Metilación - 1 Microdisección Bioinformática PCR Cuant - 2 Metilación - 2 TMA - 1 Confocal y CMF Citogenética Grupo D Metilación - 1 PCR Cuant - 1 Microdisección Bioinformática Metilación - 2 PCR Cuant - 2 Confocal y CMF Citogenética TMA - 1

Metilación - 1 PCR Cuant - 1 Microdisección Bioinformática Metilación - 2 PCR Cuant - 2 TMA - 1 Confocal y CMF Citogenética Grupo C PCR Cuant - 1

7 DURACIÓN DEL CURSO 37 horas: 9 teóricas, 28 prácticas. ALUMNOS Se admitirá un máximo de 20 alumnos. DESTINATARIOS: Alumnos que hayan cursado el primer ciclo del Curso. Especialistas en los últimos años de formación especializada (MIR). Especialistas que deseen una formación actualizada en Patología Molecular Investigadores PRIORIDADES DE ACCESO AL CURSO: Se concederá prioridad a aquellos alumnos que hayan cursado el nivel básico. Para las vacantes tendrán prioridad los residentes y especialista de los Hospitales asociados a la Red de Bancos de Tumores coordinada por el CNIO. El resto de inscripciones serán resueltas por riguroso orden de inscripción. COSTO DE LA MATRICULA: 300 euros/ ciclo INSCRIPCIÓN: Fecha límite 17 de octubre de 2003 PROFESORADO: El curso estará impartido por investigadores y técnicos del CNIO. LUGAR: Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas. Calle Melchor Fernández Almagro, Madrid INFORMACIÓN E INSCRIPCIONES: Mª Carmen Rodríguez Programa de Patología Molecular, CNIO mcrodriguez@cnio.es

Especialistas que deseen una formación actualizada en Patología Molecular Investigadores PRIORIDADES DE ACCESO AL CURSO: Se concederá prioridad a aquellos alumnos que hayan cursado el nivel básico.

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