IZO-SGI SGIker. Txema Mercero eta Edu Ogando SGIker Facebook: IZO-SGI. 8 de marzo de 2013

Transcripción

1 Txema Mercero eta Edu Ogando Facebook: 8 de marzo de 2013 Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

2 Resumen Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

3 Organigrama Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

4 Servicios Generales de Investigación Organigrama Los Servicios Generales de Investigación (), creados por la UPV/EHU, nacen con la vocación de responder y servir de apoyo a la Investigación, estando a disposición del propio Organismo, de otros Institutos Públicos y de la Empresa. Los disponen de recursos técnicos y humanos de primera línea, siendo su objetivo ofrecer apoyo a la investigación al más alto nivel, con un instrumental moderno y con equipos de alta tecnología. Los tenemos 29 unidades y mas de 360 projectos usarón los recursos el pasado año. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

5 Servicios Generales de Investigación Organigrama Figura 1: Organigrama Aréas Científicas Materiales y Superficies Biomedicina y Biotecnología Medio Ambiente s Comunes Apoyo Tecnológico Ciencias Histórico-Geográficas Ciencias Sociales Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

6 Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

7 El GRID Péndulo Clúster de cálculo científico que utiliza los ordenadores de las aulas docentes informáticas durante el horario en que dichas aulas permanecen inactivas. GRID que utiliza los ordenadores de las aulas como nodos de cómputo. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

8 Recursos: Cluster Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

9 Datos técnicos 1 sistema. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

10 Datos técnicos 1 sistema cores de cálculo, itanium2 y x Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

11 Datos técnicos 1 sistema cores de cálculo, itanium2 y x De 4 a 12 cores por nodo. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

12 Datos técnicos 1 sistema cores de cálculo, itanium2 y x De 4 a 12 cores por nodo. De 4 a 128 GB de RAM por nodo. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

13 Datos técnicos 1 sistema cores de cálculo, itanium2 y x De 4 a 12 cores por nodo. De 4 a 128 GB de RAM por nodo. Servidores de gestión» ÓÑ y en alta disponibilidad. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

14 Datos técnicos 1 sistema cores de cálculo, itanium2 y x De 4 a 12 cores por nodo. De 4 a 128 GB de RAM por nodo. Servidores de gestión» ÓÑ y en alta disponibilidad. Discos locales de scratch. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

15 Datos técnicos 1 sistema cores de cálculo, itanium2 y x De 4 a 12 cores por nodo. De 4 a 128 GB de RAM por nodo. Servidores de gestión» ÓÑ y en alta disponibilidad. Discos locales de scratch. 2 sistemas de archivos globales de alto rendimiento (Lustre) de 4.7 y 22 TB netos. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

16 Datos técnicos 1 sistema cores de cálculo, itanium2 y x De 4 a 12 cores por nodo. De 4 a 128 GB de RAM por nodo. Servidores de gestión» ÓÑ y en alta disponibilidad. Discos locales de scratch. 2 sistemas de archivos globales de alto rendimiento (Lustre) de 4.7 y 22 TB netos. Red de interconexión Infiniband (10-40 Gb/s). Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

17 Datos técnicos 1 sistema cores de cálculo, itanium2 y x De 4 a 12 cores por nodo. De 4 a 128 GB de RAM por nodo. Servidores de gestión» ÓÑ y en alta disponibilidad. Discos locales de scratch. 2 sistemas de archivos globales de alto rendimiento (Lustre) de 4.7 y 22 TB netos. Red de interconexión Infiniband (10-40 Gb/s). 4 Nodos con 8 tarjetas Nvidia Fermi. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

18 Datos técnicos El también gestiona el acceso del 20 % del cluster de Ikerbasque/I2basque. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

19 Datos técnicos Todo el software necesario para administración y monitorización (comercial, libre y propio). Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

20 Datos técnicos Todo el software necesario para administración y monitorización (comercial, libre y propio). Actualizaciones de infraestructura (mayores) en 2004, 2006, 2008, 2010 y 2011 ( cores). Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

21 Datos técnicos Todo el software necesario para administración y monitorización (comercial, libre y propio). Actualizaciones de infraestructura (mayores) en 2004, 2006, 2008, 2010 y 2011 ( cores). Apoyo en la infraestructura y personal TIC de la UPV/EHU. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

22 Datos técnicos Todo el software necesario para administración y monitorización (comercial, libre y propio). Actualizaciones de infraestructura (mayores) en 2004, 2006, 2008, 2010 y 2011 ( cores). Apoyo en la infraestructura y personal TIC de la UPV/EHU. CPD con todos los servicios. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

23 Datos técnicos Todo el software necesario para administración y monitorización (comercial, libre y propio). Actualizaciones de infraestructura (mayores) en 2004, 2006, 2008, 2010 y 2011 ( cores). Apoyo en la infraestructura y personal TIC de la UPV/EHU. CPD con todos los servicios. Aire acondicionado, SAI, grupo electrógeno, doble rama eléctrica, sistema antiincendios, copia de seguridad en CPD secundario, operadores, acceso electrónico, camaras de seguridad, monitorización, DMZ, firewall perimétrico, etc Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

24 Datos técnicos Todo el software necesario para administración y monitorización (comercial, libre y propio). Actualizaciones de infraestructura (mayores) en 2004, 2006, 2008, 2010 y 2011 ( cores). Apoyo en la infraestructura y personal TIC de la UPV/EHU. CPD con todos los servicios. Aire acondicionado, SAI, grupo electrógeno, doble rama eléctrica, sistema antiincendios, copia de seguridad en CPD secundario, operadores, acceso electrónico, camaras de seguridad, monitorización, DMZ, firewall perimétrico, etc Hay 1 cálculo lanzado el 1 de Enero de 2012 en. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

25 Galería Centro de Proceso de Datos Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

26 Galería Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

27 Galería Un cluster es equipamiento científico específico y de precisión. Ha de estar bien configurado, balanceado y optimizado. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

28 Servicio Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

29 Servicio OBJETIVO: Que nuestros usuarios esten contentos. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

30 Servicio Ocultar toda esta complejidad, el cluster ha de ser fácil de usar. No hay por que ser un experto en linux, aunque saber algo ayuda. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

31 Servicio Ocultar toda esta complejidad, el cluster ha de ser fácil de usar. No hay por que ser un experto en linux, aunque saber algo ayuda. Creamos aplicaciones personalizadas para facilitar el uso de. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

32 Servicio Servicio local, flexible y de cercanía. Para poder ofrecer estos servicios, el uso del mismo es facturado. Internamente no nos autofinanciamos. Lo facturado se reinvierte en el Servicio. Racionaliza en cierta medida el uso. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

33 Datos millones de horas de cálculo consumidas 74 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 39 grupos de investigación y 57 artículos. 8.8 puntos en la encuesta de satisfacción. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

34 Datos millones de horas de cálculo consumidas 74 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 39 grupos de investigación y 57 artículos. 8.8 puntos en la encuesta de satisfacción. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

35 Datos millones de horas de cálculo consumidas 74 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 39 grupos de investigación y 57 artículos. 8.8 puntos en la encuesta de satisfacción. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

36 Datos millones de horas de cálculo consumidas 74 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 39 grupos de investigación y 57 artículos. 8.8 puntos en la encuesta de satisfacción. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

37 Datos millones de horas de cálculo consumidas 74 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 39 grupos de investigación y 57 artículos. 8.8 puntos en la encuesta de satisfacción millones de horas de cálculo consumidas, 79 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 40 Grupos de Investigación y 69 artículos Más de 350 cuentas activas. 100 Mandaron cálculos el % de uso externo. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

38 Datos millones de horas de cálculo consumidas 74 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 39 grupos de investigación y 57 artículos. 8.8 puntos en la encuesta de satisfacción millones de horas de cálculo consumidas, 79 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 40 Grupos de Investigación y 69 artículos Más de 350 cuentas activas. 100 Mandaron cálculos el % de uso externo. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

39 Datos millones de horas de cálculo consumidas 74 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 39 grupos de investigación y 57 artículos. 8.8 puntos en la encuesta de satisfacción millones de horas de cálculo consumidas, 79 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 40 Grupos de Investigación y 69 artículos Más de 350 cuentas activas. 100 Mandaron cálculos el % de uso externo. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

40 Datos millones de horas de cálculo consumidas 74 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 39 grupos de investigación y 57 artículos. 8.8 puntos en la encuesta de satisfacción millones de horas de cálculo consumidas, 79 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 40 Grupos de Investigación y 69 artículos Más de 350 cuentas activas. 100 Mandaron cálculos el % de uso externo. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

41 Datos millones de horas de cálculo consumidas 74 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 39 grupos de investigación y 57 artículos. 8.8 puntos en la encuesta de satisfacción millones de horas de cálculo consumidas, 79 % de ocupación en cálculos realizados sólo en. 40 Grupos de Investigación y 69 artículos Más de 350 cuentas activas. 100 Mandaron cálculos el % de uso externo. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

42 Uso Número de cores Cores en uso Dec Jan Feb Mar Apr May Jun Jul Aug Sep Oct Nov Dec Mes Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

43 Techo de cristal Uso en % 1200 Número de cores % 200 Cores en uso 0 Dec Jan Feb Mar Apr May Jun Jul Aug Sep Oct Mes Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

44 Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

45 Drug Design Diseño de moléculas que detienen el avance del cáncer. Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Design, Synthesis, and Functional Evaluation of Leukocyte Function Associated Antigen-1 Antagonists in Early and Late Stages of Cancer Development, Journal of Medicinal Chemistry Eider San Sebastián, Tahl Zimmerman, Aizpea Zubia, Yosu Vara, Elyette Martin, Finton Sirockin, Annick Dejaegere, Roland H. Stote, Xabier Lopez, David Pantoja-Uceda, María Valcárcel, Lorea Mendoza, Fernando Vidal-Vanaclocha, Fernando P. Cossío, and Francisco J. Blanco. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

46 Altas Energías Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Extreme dynamics and energetics of Coulomb explosions of Xe clusters. Physical Chemistry Chemical Physics Volume 11 Number 1 7 January 2009 Pages ISSN COVER ARTICLE Jortner et al. PERSPECTIVE Extreme dynamics and energetics of Haran et al. Coulomb explosion of Xe clusters Collapse transition in proteins (2009)11:1;1-8 Prof. Andreas Heidenreich Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

47 t t t t t t t t 1 tt Desarrollo y aplicación el PNOF View Article Online / Journal Homepage / Table of Contents for this issue Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Downloaded on 07 March 2013 Published on 11 November 2011 on doi: /c1cp90184b P 2s s 2 P 2s s r r Biofísica Física de Materiales CFD Genómica t Resuelven la ecuación de Schrödinger usando PNOF. Xabier López, Jon M. Matxain, Fernando Ruíperez, Jesus Ugalde Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

48 Ribose Found in the Gas Phase Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Interpretan experimentos con la ayuda de los métodos teóricos. Prof. José A. Fernández y Dr. Emilio Cocinero Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

49 Supramolecular Assembly of Diplatinum Species through Weak PtII-PtII Intermolecular Interactions Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Supramolecular Assembly of Diplatinum Species through Weak PtII-PtII Intermolecular Interactions: A Combined Experimental and Computational Study, Chemistry - A European Journal Alejandro Pérez Paz, Leonardo A. Espinoss Leal, Mohammed-Reza Azani, Alejandro Guijarro, J. Sanz Miguel, Gonzalo Givaja, Oscar Castillo, Rubén Mas-Ballesté, Félix Zamora, Angel Rubio Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

50 Estudio de aspectos estructurales en Epigenética Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica El sistema consiste en la proteína, el ADN, moléculas del disolvente e iones de sodio y cloro átomos en total. Teoría simple y sistema complejo. Dr. Ronen Zangi Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

51 Propiedades electrónicas de aislante topológicos Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica InSbT2 Bulk band inversion. Resolución de la ecuación de Sch rodinger en materiales. Dr. Maia García Vergniory Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

52 Ventilación y comfort en edificios Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Prof. Gustavo Esteban Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

53 DNA new generation sequencing techniques Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Secuenciación del transcriptoma del muble. Información genómica para construir microarrays. Estos permitirán entender los cambios producidos por la contaminación en el transcriptoma en biomarcadores. Prof. I. Cancio Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

54 Resumen Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Un servicio con experiencia. Recursos computacionales de última generación puestos a punto y en producción. Recursos humanos técnica y científicamente preparados. Covertura y apoyo de una gran institución, la UPV/EHU. Muchos grupos de investigación, muchos de ellos grandes usuarios de HPC con gran nivel de exigencia, la calidad de servicio que se les ofrece se traslada a todos los investigadores. Un entorno profesional para profesionales. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

55 Resumen Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Un servicio con experiencia. Recursos computacionales de última generación puestos a punto y en producción. Recursos humanos técnica y científicamente preparados. Covertura y apoyo de una gran institución, la UPV/EHU. Muchos grupos de investigación, muchos de ellos grandes usuarios de HPC con gran nivel de exigencia, la calidad de servicio que se les ofrece se traslada a todos los investigadores. Un entorno profesional para profesionales. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

56 Resumen Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Un servicio con experiencia. Recursos computacionales de última generación puestos a punto y en producción. Recursos humanos técnica y científicamente preparados. Covertura y apoyo de una gran institución, la UPV/EHU. Muchos grupos de investigación, muchos de ellos grandes usuarios de HPC con gran nivel de exigencia, la calidad de servicio que se les ofrece se traslada a todos los investigadores. Un entorno profesional para profesionales. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

57 Resumen Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Un servicio con experiencia. Recursos computacionales de última generación puestos a punto y en producción. Recursos humanos técnica y científicamente preparados. Covertura y apoyo de una gran institución, la UPV/EHU. Muchos grupos de investigación, muchos de ellos grandes usuarios de HPC con gran nivel de exigencia, la calidad de servicio que se les ofrece se traslada a todos los investigadores. Un entorno profesional para profesionales. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

58 Resumen Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Un servicio con experiencia. Recursos computacionales de última generación puestos a punto y en producción. Recursos humanos técnica y científicamente preparados. Covertura y apoyo de una gran institución, la UPV/EHU. Muchos grupos de investigación, muchos de ellos grandes usuarios de HPC con gran nivel de exigencia, la calidad de servicio que se les ofrece se traslada a todos los investigadores. Un entorno profesional para profesionales. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

59 Resumen Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Un servicio con experiencia. Recursos computacionales de última generación puestos a punto y en producción. Recursos humanos técnica y científicamente preparados. Covertura y apoyo de una gran institución, la UPV/EHU. Muchos grupos de investigación, muchos de ellos grandes usuarios de HPC con gran nivel de exigencia, la calidad de servicio que se les ofrece se traslada a todos los investigadores. Un entorno profesional para profesionales. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29

60 Más Información Drug Design High Energies Química Cúantica Química-Física Supramolecular Chemistry Biofísica Física de Materiales CFD Genómica Eduardo Ogando (Dr. Física) CIDIR Bizakia Tel Página del Servicio: Blog del Servicio: Facebook: Txema Mercero (Dr. Química) Kimika Fakultatea (Donostia) Tel Gracias por su amable atención. Supercomputación en Euskadi - 8 de marzo de / 29