Montserrat González Ferreiro RES management engineer

Transcripción

1 Montserrat González Ferreiro RES management engineer

2 + Equipos + Capacidad 2

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13 Raw Data 1-2TB por ejecución 2 ejecuciones/semana 10 máquinas Procesado de imagen Generación de secuencias de datos Análisis de secuencia, alineación y clustering Alineación de resultados GB/ ejecución Secuenciación rápida de individuos Estudios detallados de procesos celulares 13

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17 Anualidad Proyectos de usuarios de la RES desde su creación AECT BCV MFE QCM Proyectos * En 2005 RES solo proporcionó recursos durante 3 meses. 17

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19 Suscripción en feed:// 19

20 ! Peak performance: 1.0 Pflop/s (actualmente 0.7 Pflop/s) Rendimiento de nodo: Gflops Rendimiento de rack: Tflops! Racks de Cómputo: 36 IBM idataplex (actualmente 25 racks) Cada Rack dispone de 84 IBM dx360 M4 nodos de cómputo: 2x SandyBridge-EP E GHz/ M 8-core 115W 8x 4G DDR DIMMs (2GB/core) 500GB 7200 rpm SATA II local HDD! Nodos de cómputo en rack de gestión: 4x IBM dx460 M4! Nodos de cómputo: 3028 (actualmente 2104 nodos) Intel cores (actualmente 33664)! Memoria: TB (actualmente TB) 32GB/nodo! Red Infiniband FDR10 con topologia non-blocking Fat Tree! Consumo energético estimado: 1.08 MW (actualmente 0.7 MW ) 20

21 Cómputo Rendimiento Memoria Interconexión MN2 MN3 Cores/chip 2 8 Chip/nodo 2 2 Cores/nodo 4 16 Nodos Total cores Frecuencia 2,3 2,6 Gflops/core 9,2 20,8 Gflops/node 36,8 332,8 Total Tflops 94,2 1000,0 GB/core (GB) 2 2 GB/node (GB) 8 32 Total (TB) 20 96,89 Topologia Non- blocking Fat Tree Latencia (µs) 4 0,7 Bandwidth (Gb/s) 4 40 Almacenamiento (TB) Consumo (KW)

22 MN2 MN3 Sistema Opertaivo SLES10 SP2 SLES11 SP1 Sistema de gestión DIM xcat Sistema de ficheros GPFS Gestor de recursos/scheduler SLURM/MOAB Loadleveler Libreria MPI MPICH-GM/MX IBM PE Sistema de monitorización Ganglia/BSCtoolkit xcat Compiladores GCC, IBM XL GCC, Intel Cluster Suite Herramientas de rendimiento BSC, PAPI Librerias IBM ESSL Intel MKL Incluyendo: - Las licencias para IBM Intel HPC Stack - Las UFM y OFED stacks soportadas por Mellanox. - Licencia & soporte SLES + IBM Support line para Linux 22

23 MN2 MN3 Total cores Total de horas de cómputo en 1 año ( x 365 x 24) Total de horas de cómputo usables en 1 año ( 82%) Horas para PRACE ( 70%) Horas para BSC (20% x 30%) Horas para RES (80% x 30%) Horas para cada Call de la RES ( :3) h Sandy Bridge (MN3) = 3h Power PC (MN2) La Oferta a la RES aumenta en un factor 4,2 23

24 Rendimiento pico Procesador Memoria Disco Redes Sistema 185,78 TFLOPS 256 M2090 NVIDIA GPU Cards 256 Intel E5649 2,53 GHz 6-Cores 3 TB 31 TB Infiniband QDR, 10 GbE ReddHat Linux 24

25 Rendimiento pico 103,4 TFLOPS Procesador IBM Power7 3.3 Memoria 8700 GB Disco 190 TB Redes Infiniband, GbE Sistema Linux 25

26 Rendimiento pico 52 TFLOPS Procesador 316 Intel Xeon CPU E ,60GHz Memoria GB Disco 14 TB Redes Infiniband Sistema Scientific Linux

27 Rendimiento pico 9,4 TFLOPS Procesador IBM PowerPC GHz Memoria 2 TB Disco TB Redes Myrinet, GbE, 10/100 Sistema SUSE Linux 27

28 Rendimiento pico 18,8 TFLOPS Procesador 2048 IBM PowerPC GHz Memoria 2 TB Disco TB Redes Myrinet, GbE, 10/100 Sistema SUSE Linux 28

29 Rendimiento pico 3,1 TFLOPS Procesador 336 IBM PowerPC GHz Memoria 672 GB Disco TB Redes Myrinet, GbE, 10/100 Sistema SUSE Linux 29

30 Está siendo instalado y aún no se disponen de los datos exactos ni de su imagen Rendimiento pico 63 TFLOPS Procesador 82 AMD Opteron 6176, 96 Intel E Intel E GPUS Nvidia Tesla M2075 Memoria Disco Redes Sistema 21 TB 600 TB Lustre TB Infiniband, GbE SUSE Linux 30

31 Rendimiento pico Procesador Memoria Disco Redes Sistema 25,8 TFLOPS 3072 AMD Opteron 6272 a 2.1GHz 12,5 TB 36 TB Lustre Infiniband, GbE Scientific Linux 31

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34 Investigador ANEP Evaluación general del proyecto Panel de expertos científicos Proyecto general evaluado Defecto de forma o defecto técnico Proyecto general no evaluado previamente 4 listas de actividades priorizadas por categorías 1. Calidad de la actividad (>30%) 2. Impacto del cálculo desarrollado 3. Experiencia en HPC 4. Necesidad de supercomputación (>30%) 5. Adaptación del código a la arquitectura (>30%) Formulario web BSC-CNS Priorización Comité de Acceso DECISIÓN: Actividad Clase A Actividad Clase B Sin acceso 34

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40 Comité Científico Consejo Comité de Asesoramiento Financiero Comité Ejecutivo Comité Técnico Comité de Acceso Director (CEO) Foro de usuarios Comité de Operación STRATOS Plataforma investigación permanente

41 Richard Kenway (UK, particle physics), Chair Jose M. Baldasano (Spain, environment) Kurt Binder (Germany, statistical physics) Paolo Carloni (Italy, biological physics) Giovanni Ciccotti (Italy, statistical physics) Dann Frenkel (Netherlands, molecular simulations) Sylvie Joussaume (France, environment) Ben Moore (Switzerland, astrophysics) Gernot Muenster (Germany, particle physics) Risto Nieminen (Finland, materials) Modesto Orozco(Spain, life sciences) Maurizio Ottaviani (France, plasma physics) Michelle Parrinello (Switzerland, chemistry) Olivier Pironneau (France, mathematics) Thierry Poinsot (France, engineering) Simon Portegies Zwart (Netherlands, astrophysics) Kenneth Ruud (Norway, chemistry) Wolfgang Schroeder (Germany, engineering) Luis Silva (Portugal, plasma physics) Alfonso Valencia (Spain, bioinformatics) 41

42 Más información en: 42

43 Más información en: 43

44 Más información en: 44

45 Más información en: 45

46 Más información en: 46

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48 Solicitud en: 48

49 Convocatoria Envío de solicitud Evaluación Técnica Evaluación Científica Derecho a réplica para el solicitante Priorización por Panel Feedback de la oficina de PRACE Denegación No Decisión de asignación Si Asignación de recursos 49

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54 Información: 54

55 Contacto a través de applications@bsc.es 55

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