Agilent MassHunter Workstation Software. Un software común para toda una plataforma de sistemas MS

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1 Agilent MassHunter Workstation Software. Un software común para toda una plataforma de sistemas MS Juan Aybar Especialista de Producto GCMS LCMS AGILENT TECHNOLOGIES

2 Agenda 1. Agilent MassHunter Workstation Software Un software único para toda una plataforma de espectrometría de masas 2. Algunas peculiaridades GCMS/GCQQQ MassHunter Quant MassHunter Qual Page 2

3 MassHunter Workstation Software Un único software para todos los MS de Agilent Objetivos iniciales Año Minimiza los tiempos destinados al aprendizaje entre las diferentes plataformas de Agilent a. Control de Agilent 6000 Series QQQ, TOF y Q-TOF b. Control de las Series 1100 y 1200 HPLC incluyendo el Chip-LCMS c. Data Processing para LC/MS QQQ, TOF, Q-TOF y Single Quad d. Control & data processing para ICP/MS e. Control & data processing para GC/MS y GC/MS/MS LC/MS GC/MS ICP-MS

4 AGILENT MassHunter Workstation Instrument Control Monitorización en tiempo real Qualitative Analysis Puesta a punto de métodos Resultados cromatográficos Autotune Resultados espectrales Búsqueda de compuestos Quantitative Analysis Vistas al gusto del usuario Cuantificación/Confirmación Curve fit assistant

5 MassHunter Data Acquisition Software MassHunter Data Acquisition for TOF and Q-TOF B.02.01/B Support of all 6500 series Q-TOF (B.02.01) incl. 6540/6538 Max Res (B.03.01) Fast pos/neg switching on the TOF MassHunter Data Acquisition for QQQ B SP1 Supports connectivity to Watson LIMS for Bioanalysis Supports Workflows using Dynamic MRM and Optimizer including automatic updating of RT Software now customer installable (!) MassHunter Optimizer B Database includes retention times and many other searchable fields Supports multiple databases MassHunter Study Manager for QQQ B Allows users to submit studies as separate worklists Schedules tasks like Acquisition, Optimizer, Quant Study Creation Wizard for Bioanalysis, Drug Discovery Screening Dynamic MRM Database Kit w/ method for QQQ B DMRM Pesticide Database with > 600 compounds B DMRM Forensics and Toxicology Database with >200 compounds MassHunter Easy-Access B Supports SQ, TOF and Q-TOF Supports 1290 LC Supports CTC type autosamplers on SQ, TOF, and QTOF Compound confirmation and sample purity BioConfirm API for MassHunter Acquisition Worklist Allows to create, edit and run worklists programmatically Used internally (Easy Acess) and given to 3rd parties (Biocius, GERSTEL)

6 MassHunter Data Processing Software Qualitative Analysis B Unknown analysis, impurity analysis, molecular formula confirmation Quantitative Analysis B New integrator, Compounds-at-a-Glance, Trend Reporting BioConfirm B (Add-on to Qual) Characterization of intact proteins (antibodies), synthetic peptides and oligonucleotides Metabolite ID B Identification of known AND unknown exogenous drug metabolites, AMRT database search Spectrum Mill A Protein database search, quantitation with labels or label-free Personal METLIN Database B ID of endogenous metabolites via accurate mass + RT (AMRT) Personal Compound Database Kit w/ method for TOF/Q-TOF B Personal Pesticide Database (PPD) with 1600 pesticides via AM(RT) B Personal Forensics and Toxicology Database (PFTD) with 7500 cmpds (5000 struct.) Personal Compound Database and Library Software (PCDL) B Create and edit AM(RT) databases and MS/MS spectral libraries Mass Profiler B Differential analysis to compare two samples or sample sets, T-test, simple to use, no PCA Mass Profiler Professional B Differential analysis of two or more sample sets (integrated with Qualitative Analysis), ID Browser, Pathway Analysis Analytical Studio Reviewer B Browser for compound confirmation and purity analysis results MassHunter Data Access Component (MHDAC) v2.1 Application interface to directly access MassHunter raw files, given to > 30 groups (academic, 3rd party) MassHunter Custom Reporting via Excel 2007 Based on templates using XML mapping, a custom reporting macro addin based on VB; 300 Quant + 30 Qual templates

7 MassHunter Software GCMS/GCQQQ Algunas cuestiones interesantes 1. Instrument Control Autotune 2. Batch-at-a-Glance Navigación sencilla 3. Parameter-less Integrator Sin parámetros 4. Outlier Detection Más de 20 criterios 5. Excel-based Reporting Reporting sencillo y fácilmente adaptable basado en Excel 2003

8 MSD Chemstation vs MassHunter Workstation Una comparación rápida MSD Chemstation MassHunter GC/MSD 597x acquisition Diferente entorno en función de la aplicación EnviroQuant, DrugQuant, etc. Un mismo entorno para la cuantificación y la búsqeuda en librería Flujo de un único fichero GCQQQ 7000B acquisition Procesado de datos GC/MSD y GC/MS/MS Módulos Quant/Qual (Library searching) independientes Flujo de trabajao orientado a secuencias - Batches Herramienta de reporting poderosa y flexible Adaptable usando lenguaje de macros Común a LC/MS e ICP-MS

9 Instrument Control UI/Navigation

10 MassHunter Editor de métodos MRM Con utilidades cut & paste para importar desde bases de datos o softwares de optimización

11 Creación de Método de Cuantificación a partir de uno de Adquisición AGILENT LC/MSD Triple Cuadrupolo Página 11 Enero 2006

12 Creación Automática de los Níveles de Calibración a partir del Esquema de Diluciones 3.- nº níveles concentración 1.- Conc. sol. Madre 4.- níveles concentración 2.-Esq. diluciones AGILENT LC/MSD Triple Cuadrupolo Página 12 Enero 2006

13 Batch-at-a-Glance Navegación + Informacion

14 Batch-at-a-Glance Batch Table: Uno o Múltiples Compuestos Single Compound, Qualifier, ISTD, ISTD Qualifier Multiple Compounds

15 Batch-at-a-Glance Información de compuestos Tolerancias en Ratio de Abundancias Relativas entre transiciones

16 Batch-at-a-Glance Calibracion

17 Integrador libre de parámetros Amplio rango de trabajo Nuevo integrador libre de parámetros SIN parámetros Discrimina entre picos y spikes de ruido Integra correctamente desde concentraciones bajas a concentraciones elevadas Elimina virtualmente la necesidad de integración manual Rendimiento > 4 órdenes de magnitud Resp. Factor 1512 RSD 14.0% 100 fg Resp. Factor 1546 RSD 2.0% 1 pg Resp. Factor 1542 RSD 0.9% 10 pg Resp. Factor 1526 RSD 0.8% 100 pg Resp. Factor 1009 RSD 1.1% 1 ng

18 Integrador libre de parámetros Validación de picos Valida la calidad de pico basándose en: Altura de pico Area de pico Anchura de pico Simetría de pico Picos unidos a la derecha/izquierda Nivel de spikes en un pico Clasifica la calidad de los picos como: Aceptados Revisar Merge Valley Height Rechazar Permite centrarse en los picos de interés! 15 % Peak Accepted Merge Valley Height 54% Merge Valley Height 39 % Peak Rejected Inspect Peak

19 Detección automatizada de valores anómalos Más de 20 criterios Limites establecidos en el método Avisos y filtros Report específico de valores anómalos

20 Reporting basado en Excel Excel XML Selección de la plantilla correcta Cola con reports múltiples Selección Impresora/Pdf Excel Carga la plantilla Importa los resultados Formatea el report Report es: Report Resultados (XML) & Gráficos generados a) Guardado como XLS b) OPT: Printer c) OPT: PDF

21 MassHunter y la línea GCMS GCMS - GCQQQ 7000A Triple Cuadrupolo GC/MS Sólo MassHunter MassHunter Acquisition MassHunter Data Analysis MassHunter Reporting GC/MSD Disponible MassHunter SOLO para Data Analysis MSD ChemStation Acquisition MassHunter Data Analysis via Translator Traduccion sencilla y rápida desde MSD ChemStation CUALQUIER fichero producido por MSD ChemStation

22 La propuesta de Agilent para proporcionar estas ventajas al usuario de GC/MS/MS Proporcionar una serie de herramientas que asisten al usuario en la CREACION y OPTIMIZACION del método de adquisición MS/MS Dynamic MRM para GC/MS es una parte del flujo de trabajo que incluye la generacion del método (basado en RTs/transiciones conocidas y LA OPTIMIZACION DE LOS PARÁMETROS DE ADQUISICIÓN MRM Flujo de Trabajo 1. Design Experiments Assistant 2. Analyze Experiments Assistant 3. DynamicMRM Assistant

23 Asistente de Diseño de Experimentos Creación automatica de un set de experimentos MRMs basados en diferentes CEs Asistente para análisis de experimentos Proceso de datos generados desde el set de experimentos anterior. Creación automatizada de un método MRM basado en las Ces que proporcionan señales más intensas para cada transición programada.

24 Herramientas de optimización. Generación manual de segmentos? Zonas de baja densidad de picos permiten una division manual sencilla En zonas de gran densidad de compuestos es casi imposible. Problema clásico del campo de residuos

25 Como funciona Dynamic MRM para GC/MS a la hora de optimizar métodos MS/MS? Dynamic MRM optimiza scan cycle time, dwell times, y el orden de adquisición (generación automatizada de segmentos) para conseguir: 1. Maxima señal 2. Mínimo ruido 3. %RSD bajas 4. La mayor velocidad de análisis 5. La mayor robustez en el método La aproximación tiene en cuenta la integración de picos y el ruido de línea de base en el proceso de optimización del valor de dwell time.

26 Ventajas del uso de dynamic MRM para GC/MS 1. Dynamic MRM automatiza y simplifica la creación de métodos complejos que requieren muchos segmentos 2. Facilita el mantenimiento de lo métodos. Pueden ser regenerados en segundos desde datos adquiridos si se cambia de columna/tune 3. Dynamic MRM proporciona mejoras en %RSD vs. métodos optimizados por expertos 4. Para métodos de 40-min con hasta 300 transiciones pueden esperarse reducciones en torno a 10-20% para los valores de %RSD 5. Dado que la mayor contribución a RSD proviene de errores sistemáticos (p.e. variación en el volumen de inyección), la disminucion de ruido en comparación con los métodos tradicionales, es bastante mayor

27 MassHunter Cualitativo Algunas mejoras para la representación de ficheros de datos MS Presentación conjunta de ficheros SCAN Cromatogramas y Espectros Extracción automtizada y superposicion de EICs provenientes de una adquisición en SCAN/SIM Page 27

28 Medidas en Scan MassHunter Editor de Librerías

29 Parámetros de búsqueda de librería Page 29

30 Perceive Compounds Utilidad de deconvolución Page 30

31 Deconvolucion usada para evaluar pureza espectral pureza de pico Page 31

32 Metrics Plot Facilitando el QC en el Laboratorio Representa una columna de datos, e.g. comportamiento de los ISTDs a lo largo de un batch Selecciona la columna a representar, elige Plot this Column y examina la representación Pueden representarse múltiples columnas a la vez

33 Resumen 1. MassHunter Workstation es un gran paso adelante en las plataformas de software de cromatografía y espectrometría de masas 2. Permite un mismo entorno de control para los diferentes sistemas de espectrometría de masas 3. Facilita tareas hasta ahora tediosas tanto en la parte de cuantificación como en la de cuantificación 4. Mejora notablemente las capacidades en cuanto a representación y reporting de resultados 5. Facilita la exportación de datos hacia otros softwares de control y tratamiento de datos

34 Gracias por su Atención Juan Aybar AGILENT TECHNOLOGIES

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