Sesión 8. Visualización

Transcripción

1 Sesión 8. Visualización Curso intensivo i-math de software libre orientado a Ciencias e Ingeniería Módulo de Simulación en Multifísica (SMF) Centro de Supercomputación de Galicia 8-12 de Septiembre de 2008

2 Plan 1 2 3

3 Mayavi2(Mayavi) Visit versión (1.5) 1.91 binarios Mac Os; Windows; Ubuntu; MacOs; Windows; Fedora RedHat; Suse; MacOs; Windows; Fedora desarrolladores licencia Kitware Los Alamos National Laboratory Sandia National Laboratories Army Research Laboratory CSimSoft tipo BSD No documentación en pdf Prabhu Ramachandran Gael Varoquaux BSD Univ.California(6) Lawrence Livermore National Laboratory(LLNL) BSD Entorno similar. Pensados para gran cantidad de datos. Diseñados para procesado en paralelo. Extensiones y uso a través de scripts en C y Python.

4 Páginas Mayavi2 Visit

5 : Introducción página del código Documentación del código Visualizador de propósito general basado en TVTK y Qt. Estructura distribuida jerárquicamente que permite varias escenas, varias fuentes de datos, varios filtros...

6 Modos de uso Interfaz de usuario gráfico (GUI). A través de scripts en Python: para extensiones desde aplicaciones propias en Python Permite paralelizar la lectura de datos y el randerizado (requiere instalación desde fuentes).

7 Capacidades Visualización de escalares, vectores y tensores en 2 y 3 dimensiones. Lee muchos tipos de formatos: VTK, VTK xml, PLOT3D, imágenes,... Permite salvar visualizaciones completas y exportar datos e imágenes a diversos formatos... Permite extensiones para otras fuentes de datos y filtros.

8 Entorno gráfico

9 Entorno gráfico Menus: abrir archivos de datos o crear datos (Sources), cargar/salvar visualizaciones anteriores, aplicar filtros, configurar preferencias... Accesos directos: colorear, leyenda, orientación de la vista, filtros... Vista 3D: presentación de resultados. Estructura de escenas: ver o no una vista, estructura de la visualización. Editor de objetos: propiedades de los objetos. Otras ventanas: mensajes o interprete de Python en Tools y otras en View.

10 Ejemplo: actuador Leer el archivo de datos resultado de la sesión anterior(ejemplo 1). Visualizar las variables escalares, configurar la leyenda, aplicar filtros... Utilizar Calculator para ver las componentes del desplazamiento.

11 Interacción con el entorno gráfico Zoom: Botón derecho del ratón y movimiento hacia arriba (zoom +) o hacia abajo (zoom -) Rotación: Botón izquierdo del ratón y movimiento para determinar la posición Movimiento sin rotación: Botón central del ratón y movimiento para determinar la posición

12 Mayavi2: Introducción página del código Documentación del código Visualizador de propósito general basado en TVTK (Visualization ToolKit). Estructura distribuida jerárquicamente que permite varias escenas, varias fuentes de datos, varios módulos y filtros. Programado en Python. Algunos módulos y filtros todavía no están incorporados en la nueva versión

13 Modos de uso Interfaz de usuario gráfico (GUI). A través de scripts en Python: para extensiones dentro de aplicaciones propias en Python desde aplicaciones propias en Python Como funciones para pintar desde Python a través de mlab.

14 Capacidades Visualización de escalares, vectores y tensores en 2 y 3 dimensiones. Lee muchos tipos de formatos: VTK, VTK xml, PLOT3D, imágenes,... Permite salvar visualizaciones completas y exportar imágenes a diversos formatos... Permite extensiones para otras fuentes de datos, módulos y filtros.

15 Entorno gráfico

16 Entorno gráfico Menus: abrir archivos, cargar módulos, preferencias. Escenas TVTK: presentación de resultados. Gestor de escenas: conjunto de módulos y filtros. Editor de objetos: propiedades de los objetos. Ventana de mensajes Interprete de Python

17 Menús En la parte superior de la ventana del MayaVi2 aparecen los menus File (Archivo), Visualize (Visualizacón), Tools (que sólo incluye preferencias), View (Vista) y Options (Opciones). New VTK: Abre una ventana independiende da la actual para otra escena. Open File, New File: Permiten abrir (editar) un archivo o crear uno nuevo. Save Scene (As): Permite guardar una escena en diversos formatos.

18 Menús Load Data: Mediante esta opción se cargan las imágenes o los ficheros a visualizar. En el caso de un fichero VTK aparece la opción directamente. Otro tipo de ficheros, por ejemplo vtu, pvtu aparece eligiendo la opción VTK XML file.

19 Mayavi 1.5: Introducción Primera versión de mayavi, menos potente, instalación sencilla. Visualizador de datos escrito en Python. Para su GUI emplea Tkinter. Lee directamente muchos tipos de formatos. Permite extensiones: nuevos módulos, filtros, etc Se puede obtener a partir de la URL: Bien documentado

20 Etorno gráfico

21 Menús 1 File (Archivo), Visualize (Visualización), Options (Opciones) y help

22 Visualización Módulos y Filtros Axes, Surface Map, Extract Vector Components... Opciones: permite personalizar el entorno del MayaVi. Help: acceso a un tutorial y a la página principal.

23 Panel de control 1 Contiene las herramientas para manejar la visualización. 2 Ficheros 1 control de ficheros: DataVizManager. 2 Cada DataVizManager varios módulo y filtros. 3 Visualización 1 Control de la visualización: ModuleManagers. 2 cargar un nuevo ModuleManager: botón New.

24 Ejercicio con Leer el archivo de datos resultado del Ejemplo 2. Visualizar la evolución a lo largo del tiempo de variables escalares en todo el dominio y sobre una línea. Guardar datos como imágenes y visualizaciones completas; leerlas de nuevo. Manipular los datos aplicando filtros en función de umbrales...