UNIDAD DIDÁCTICA 8: LA EFICIENCIA Y LA EFECTIVIDAD EN ANATOMÍA PATOLÓGICA

Transcripción

1 CURSO: EL CONTROL DE LA CALIDAD Y LA ACREDITACIÓN EN ANATOMÍA PATOLÓGICA La estandarización ió y la patología digital Granada,19 de enero de 2012 Marcial García Rojo Hospital General Universitario de Ciudad Real marcial@cim.es UNIDAD DIDÁCTICA 8: LA EFICIENCIA Y LA EFECTIVIDAD EN ANATOMÍA PATOLÓGICA

2 Patología digital Es un concepto que engloba informática en patología + imagen digital Incluye: Gestión de sistemas de información (datos) Gestión de imagen (macroscopía macroscopía, microscopía, preparacionesdigitales) Análisis de imagen automatizado Software de control de auteñidores Diagnóstico a distancia: Telepatología. Segunda opinión (teleconsulta) teleconsulta) Educación a distancia (e learning) y local (bases de datos para educación) Garantía de calidad Sistemas de gestión de biobancos o registros hospitalarios de tumores La Telepatología (práctica a distancia de la Patología) es sólo una parte de la Patología Digital

3 Telepatología (teleconsulta) Estática o almacenar y enviar : Sistemas no robotizados que envían imágenes fijas adquiridas antes de la sesión. Preparaciones virtuales: imagen digital de toda la preparación. Dinámica: Transmisión de información en tiempo real (vídeo, microscopio robotizado)

4 Microscopía virtual Tres componentes/fases: 1. Digitalización: Escáner de preparaciones 2. Gestión de imágenes (almacenamiento) 3. Visualización: Interfaz máquina hombre Visor (software) Manejo de la computadora ratón? (hardware) Monitor de alta calidad

5 Desventajas de preparaciones convencionales Son fá frágiles No son permanentes, sobre todo inmunofluorescencia, cristales articulación En citología, no es posible distribuir ib i copias. 24/01/2012 5

6 Preparación digital ( Laminilla virtual ) Microscopio virtual, whole slide imaging, i, preparación virtual, virtual slide Un escáner (o microscopio robotizado) recoge toda la información de una preparación (laminilla) histológica i o citológica i

7 Ventajas de las preparaciones digitales Pequeños aumentos con calidad extraordinaria. Mapa dinámico i de preparación Enviar imágenes de mayor resolución recibiendo sólo el área seleccionada Grabar y reproducir la trayectoria seguida por el patólogo durante su examen de la preparación p o laminilla Las imágenes quedan almacenadas permanentemente, y sobreellas ellas es posible realizar anotaciones que también pueden quedar grabadas. 7

8 Alta resolución necesaria (40x, 0,25 20x (40x, 0,25 microm/píxel) 40x

9 Múltiples planos enfoque en portaobjetos virtuales Z-stacks

10 Escaneado en varios planos eje Z: Citología

11 Biomarcadores y preparaciones digitales p16 Campo claro: Biopsias, citologías, IHQ, ISH, Alternativa: Nueva muestrea de citología líquida CONS: No es justo la mima área

12 Marcar áreas que ya han sido revisadas

13 Digitalización Microscopio digital : sólo visualiza, no graba. Sólo una muestra cada vez. Opciones: Nikon Coolscope ( Digital Microscope ), Leica DMD108 ( Digital Microimaging Device ) Escáner: graba toda la imagen en un fichero, procesa múltiples muestras, durante la visualización no usamos ya el escáner

14 Qué escáner elegir? Más de 25 sistemas disponibles: 3DHistech Panoramic (4) Aperio ScanScope (6) Olympus VS (3) Hamamatsu Nanozoomer (2) Claro (2) Leica SCN400 (2) Menarini idsi D.Sight(2) h(2) Omnyx (2) Philips (1) Roche Ventana (2) Menarini D.Signt Aperio Scanscope AT / XT / CS Omnyx VL4 Leica SCN400 (2) Hamamatsu Olympus Nanozoomer 2 VS800, VS120, VS110.slide 3D Histech Philips

15 Nuevos escáneres 3DHistech Pannoramic 250 Flash Claro (Japón) GE Healthcare: lh Omnyx VL120 (EEUU) Hamamatsu NanoZoomer 2.0 HT Leica SCN400F (Alemania) Menarini D Sight y D Sight fluo (Italia) Philips Slide Scanner (Holanda) UNICTechnologies (China) 24/01/

16 Fast scanning 3DHistech (Hungría) Pannoramic 250 Flash Motorized objective and camera changer Brightfield and fluorescence Slides ranging g from 0.9 to 1.2 mm of thickness

17 Leica SCN400 F (Alemania) Extra Large Slide Scanning 24/01/ microsystems.com/products/digital-com/products/digitapathology/scan/details/product/leica-scn400-f/ 17

18 Max. 210 slides Hamamatsu (Japón) NanoZoomer 2.0-HT 3 chip TDI line scanning camera Z axis 0.23 microns/pixel (40x) Fluorescence imaging module

19 GE Healthcare: Omnyx VL120 (EEUU) Slide Capacity Up to 120 slides, imaged automatically, continouos load Automated slide handling detects incorrectly loaded slides Scanning Technology Independent dual sensors with tile focusing Tissue Detection and Focusing Automated, no manual interaction Objective Lens 20x/0.75 Plan SApo (40x scanning with automated optical magnification changer) Sensor Resolution 20x: microns/pixel 40x: microns/pixel Compared to competitive products, the VL4 focuses on up to 700% more focus points, resulting in outstanding image quality.

20 Menarini D-Sight y D-Sight fluo (Italia)

21 Philips Slide Scanner (Holanda) Continuous auto-focus technology that accurately follows height variations in the tissue surface over horizontal distances as short as 30 microns, allowing extremely high definition full-slide images to be captured in under one minute per slide 24/01/ /initiatives/digitalpathology/

22 Roche VENTANA iscan HT slide scanner (11 sept 2011) (EE UU) 360 preparaciones, campo claro. Sistema de transporte de preparaciones para manejo seguro y acceso aleatorio (separar proceso de carga del proceso de escaneado) Método de enfoque dinámico Gestiona lista de trabajo /

23 1 st European Scanner Contest. Vilnius 2010 Calidad Fabricante Escáner Media Scan Mixed 20x Olympus VS-110 2,26 Scan Mixed 40x 0,23-0,25 µm/pixel 3D Histech Pannoramic 150 2,82 Scan Mixed 40x 0,16 µm/pixel Olympus VS-110 4,35 Masivo Fabricante Escáner Velocidad % enfocado Velocidad corregida foco Scan H&E 20x Leica SCN min 99,8 0,53 sq cm/ Scan H&E 40x Leica SCN min 99,75 0,26 sq cm/ min min

24 1 st European Scanner Contest. Vilnius 2010

25 NEC e-pathologist Cancer Diagnosis Assistance System

26 Aurora Interactive mscope Education Suite mscope Clinical Image Sharing Suite mscope Unified Image Solution (patient record)

27 Criterio para adquirir un escáner Calidad de la imagen: Sin artefactos de unión y si áreas desenfocadas Velocidad de escaneado a 40x Software de gestión de imagen Precio Capacidades de integración (LIS, PACS): Estándares Mantenimiento y soporte Política de actualización: Nuevas versiones de software y acceso a nuevos modelos de escáner 24/01/

28 Lo mejor de algunas soluciones disponibles Precisa escáneres de diversas capacidades o funciones (alimentador, inmersión aceite, fluorescencia): 3DHistech, Menarini Excelente calidad imagen: Hamamatsu, Leica, Omnyx Fácil de usar: Philips, Claro, Roche Flexibilidad: Olympus VS110 Rápido: Philips Barato: Ninguno! 24/01/

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30 Tecnología de imagen en el escaneado Luz polarizada Amiloidosis Líquido sinovial Escaneado de Fluorescencia FISH Piel y riñón Imagen Multiespectral: Se toma una serie de 3 Se toma una serie de 3 20 imágenes desde el azul hasta el rojo (p. ej nm) Multiplexar: separar 3 o más cromógenos 24/01/

31 Nuevas modalidades Microscopía confocal, incluyendo imagen endoscópica en vivo Chagnon et al. Lab Invest Jun;90(6):

32 Point of care pathology

33 Normalización en Patología Digital Imagen: DICOM Comunicación datos entre sistemas: HL7 Normalización semántica: SNOMED CT Cómo usar estándares y definir flujos de trabajo: IHE

34 Norma en imagen médica: DICOM Un formato normalizado y una forma estándar de enviar imágenes (mensajería): Digital Imagingand and Communications in Medicine (DICOM) Integrarlas imágenes en un repositorio central del hospital: Picture archiving and communication system (PACS) Dos opciones en DICOM: Almacenar imagen sin fragmentarla. Dos servidores (PACS estándar y repositorio de imágenes de patología: servidor JPIP) Fragmentar imagen. Basta un servidor PACS

35 Repositorio central: PACS (Picture Archiving and Communications System) Modalidad TAC Archivo PACS DICOM SCU Almacenamiento SCU = Service Class User Modalidad Virtual Slide SCP Almacenamiento SCP = Service Class Provider Archivo PACS DICOM SCU Almacenamiento SCP Almacenamiento

36 DICOM: Una preparación digital contiene múltiples l resoluciones Un fichero TIFF o JP2 es una pirámide de imágenes Imagen Thumbnai Panorámica (0,6x) Fotogramas intermedios Aumento 10x Fotograma (tile) Máxima resolución Máximo aumento (40x) Puede incluir múltiples planos en el eje Z 24/01/

37 DICOM. Suplemento 145 Objetos de imagen multi-frame DICOM. Suplemento 122. Fichero único: JPEG2000/JPIP 24/01/

38 DICOM Sup145 multi frame tiling (WG26) Objetos de imagen multi frame (no hay un objeto por cada fragmento) Thumbnail Image Single frame image Intermediate Image Tiles Multi frame image (single object) Baseline Image Tiles Multi frame image (single object) may include multiple Z planes, color planes In 1 or more DICOM Series 24/01/

39 Conclusiones Aspectos a considerar SISTEMA DE INFORMACIÓN INTEGRACIÓN DE IMÁGENES COLABORACIÓN ENTRE MÉDICOS EDUCACIÓN CALIDAD DIAGNÓSTICA NORMALIZACIÓN El punto de partida debe ser un Sistema de Información regional para todos los Servicios de Anatomía Patológica de la comunidad autónoma, que simplifique la construcción de integraciones complejas. Existen en el mercado gran número de dispositivos generadores de imágenes en diversos medios y formatos que deben ser integrados con el Sistema de Información alrededor de los servicios del PACS La necesidad de especialistas crece diariamente y puede resultar cada vez más útil el contacto con expertos del propio Servicio de Salud y Servicios de Salud externos. Los lazos entre Hospitales, Servicios de Salud y Universidades pueden y deben verse reforzados por iniciativas que incluyan la telemedicina y el diagnóstico online Integración de imágenes de alta calidad, la construcción de herramientas colaborativas, formación de residentes, sesiones clínicas, etc deben dar como resultado un proceso de mejora de calidad diagnóstica en la región. Se considera imprescindible la adopción de un modelo que permita la mayor flexibilidad y reproducción de la solución, mediante la implantación de estándares como IHE Pathology Framework, HL7, DICOM, PACS, SNOMED CT

40 Muchas gracias! 40