Departamentode BiotecnologíayBioingeniería

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1 B I O Q U Í M I C A Departamentode BiotecnologíayBioingeniería Unidad:Zacatenco A N U A R I O C I N V E S T A V 117

2 DepartamentodeBiotecnologíayBioingeniería En el año 1972, el Dr. Guillermo Massieu Helguera, Director General del Cinvestav encomendó al Dr. Carlos Casas Campillo, distinguido Profesor de la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del IPN (ENCB), la creación de un Departamento de Biotecnología. El planteamiento inicial del Dr. Casas Campillo consideró desde el inicio que el Departamento debía integrar diferentes aspectos de la Bioingeniería con los conocimientos básicos y de la Ingeniería. En un principio, los objetivos del Departamento fueron orientados hacia el desarrollo de nuevas tecnologías Biotecnológicas de aprovechamiento de recursos agrícolas u otras fuentes de carbono disponibles a nivel nacional. Hacia finales de la década de 1980 el Departamento inició un proceso para fortalecer su investigación científica. Así, en la actualidad el Departamento tiene sólidos fundamentos para realizar investigación, tanto con orientación científica como tecnológica. El Departamento cuenta actualmente con tres líneas de investigación: Biotecnología Ambiental, Biología Molecular y Biocatálisis y Bioprocesos y Bioproductos. Cada una de estas líneas de investigación está constituida por nueve investigadores, quienes desarrollan varios proyectos. El Departamento de Biotecnología cubre por lo tanto, los principales aspectos de la Biotecnología y Bioingeniería moderna. El enfoque de las investigaciones realizadas cubre tanto investigación 118 A N U A R I O C I N V E S T A V

3 básica (Biología Molecular, Genética, etc.) como aplicada (desarrollo de procesos de control de la contaminación, aprovechamiento de residuos, procesos industriales, etc.). Nuestro Departamento cuenta en la actualidad con 82 estudiantes formándose en un ambiente multidisciplinario. B I O T E C N O L O G Í A Y B I O I N G E N I E R Í A Todos los investigadores que participan en los programas de posgrado, así como la jefatura departamental y la coordinación académica han continuado de manera conjunta y sostenida los esfuerzos de mejoramiento de sus programas. El Departamento de Biotecnología y Bioingeniería presenta indicadores claramente crecientes. En la actualidad, los indicadores muestran que la Planta Académica alcanzó un nivel de competencia consolidada, que la producción científica llegó a niveles que nos habíamos planteado como metas a largo plazo en el 2003 y que la graduación de nuestros estudiantes se hace en un tiempo razonable. No obstante, el esfuerzo de mejoría debe proseguir, en particular para atender la eficiencia de graduación a tiempo de nuestros estudiantes de doctorado, que es todavía insuficiente para cumplir lo requerido y para mantener o mejorar aún más indicadores los relativos a publicación. En el Departamento cuenta en la actualidad con 82 estudiantes. A N U A R I O C I N V E S T A V 119

4 PERSONAL ACADÉMICO Y TEMAS DE INVESTIGACIÓN LUC JULIEN DENDOOVEN Investigador Cinvestav 3C. y Jefe del Departamento. Doctor en Ciencias (1990) Universidad Católica de Lovaina, Bélgica. Tema de investigación: Biotecnología ambiental, ecología de suelos. Categoría en el SNI: Nivel III JOSEFINA BARRERA CORTÉS Investigador Cinvestav 3A. Doctor en Ingeniería de Procesos (1996) Universidad Paris du Nord, Francia. Tema de investigación: Biotecnología ambiental y Supervisión y Control de Procesos Biológicos aplicando tecnologías de Inteligencia Artificial. Categoría en el SNI: Nivel I GRACIANO CALVA CALVA Investigador Cinvestav 2C. PhD. Doctor en Ciencias (1997) University of East Anglia and Institute of Food Research. Norwich, Inglaterra. Temas de investigación: Biotecnología vegetal: metabolismo secundario, biosíntesis y degradación de productos naturales y de compuestos xenobióticos. Producción de vacunas comestibles. ROSA OLIVIA CAÑIZARES VILLANUEVA. Investigador Cinvestav 3B. Doctor en Ciencias (2000) Instituto Politécnico Nacional, México, DF. Tema de investigación: Biotecnología de microalgas con énfasis en los aspectos de biorremediación y obtención de bioproductos. Categoría en el SNI: Nivel I FERNANDO JOSÉ ESPARZA GARCÍA Profesor Cinvestav 3C. Doctor en Ciencias (1978) Instituto Politécnico Nacional, México, DF. Tema de investigación: Biotecnología ambiental, fisiología microbiana. Categoría en el SNI: Nivel II LUIS BERNARDO FLORES COTERA Investigador Cinvestav 3A. Doctor en Ciencias Bioquímicas (2001) Universidad Nacional Autónoma de México (Facultad de Química). Tema de investigación: Bioingeniería de fermentaciones, metabolismo secundario de microorganismos, ingeniería de bioreactores. Categoría en el SNI: Nivel I PRÓSPERO GENINA SOTO Investigador Cinvestav 3C. Doctor en Ciencias (2002) Centro de Investigación y de Estudios Avanzados. México, DF. Tema de investigación: Deshidratación. MARÍA EUGENIA HIDALGO LARA Investigador Cinvestav 2C. Doctor en Ciencias (1997) Cinvestav, México. Temas de investigación: Caracterización y Mejoramiento. Expresión y caracterización de enzimas recombinantes. RODOLFO MARSCH MORENO Investigador Cinvestav 2B. Doctor en Ciencias (1995) Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del IPN. Temas de investigación: Análisis molecular de las poblaciones microbianas en suelos. Diseño, construcción y uso de herramientas moleculares, plásmidos y transposones. MARÍA DEL CARMEN MONTES HORCASITAS Investigador Cinvestav 3A. Doctor en Ciencias (1998) Cinvestav, México. Temas de investigación: Biocatalisis, obtención de enzimas recombinantes, purificación. Enzimas inmovilizadas. Categoría en el SNI: Nivel I 120 A N U A R I O C I N V E S T A V

5 JAIME ORTEGA LÓPEZ Investigador Cinvestav 3B. Doctor en Ciencias (1995) University of Texas Health Science Center at San Antonio, EUA. Temas de investigación: Biotecnología de proteínas, purificación de proteínas, CBD de C. flavigena como herramienta para la purificación de proteínas recombinantes y proteasas de parásitos. Categoría en el SNI: Nivel I FERMÍN PÉREZ GUEVARA Investigador Cinvestav 3B. Doctor en Ciencias (1992) I.N.P, Toulouse, Francia. Tema de investigación: Fenómenos de transporte, análisis y modelado de bioprocesos. Categoría en el SNI: Nivel I HÉCTOR M. POGGI-VARALDO Investigador Cinvestav 3C. Doctor en Ciencias (1996) Cinvestav, Depto. Biotecnología, México. Temas de investigación: Biotecnología ambiental, tratamiento biológico de efluentes industriales y tóxicos, y residuos sólidos. Restauración de suelos y acuíferos. Categoría en el SNI: Nivel II MARÍA TERESA PONCE NOYOLA Investigador Cinvestav 3C. Doctor en Ciencias (1992) Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, IPN México, D.F. Tema de investigación: Biocatálisis; mejoramiento genético de microorganismos de interés industrial. Categoría en el SNI:Nivel II EMMA GLORIA RAMOS RAMÍREZ. Investigador Cinvestav 3A. Doctor en Ciencias (1990) Universidad de Valencia, España. Temas de investigación: Biotecnología de alimentos. Nuevos aditivos alimentarios de fuentes no convencionales. Fibra dietética. Biopelículas. Categoría en el SNI: Nivel I PERSONAL ACADÉMICO Y TEMAS DE INVESTIGACIÓN ANA CARMELA RAMOS VALDIVIA Investigador Cinvestav 3B. Doctor en Ciencias (1996) Universidad de Leiden, Holanda. Temas de investigación: Biotecnología de células vegetales. Biotecnología de las interrelaciones planta ambiente. Biotecnología del metabolismo secundario. Categoría en el SNI: Nivel I ELVIRA RÍOS LEAL Investigador Cinvestav 1C. Cromatografía de Gases y Cromatografía de Líquidos. Q.F.B. UNAM (1961) Tema de investigación: Química analítica en biotecnología. REFUGIO RODRÍGUEZ VÁZQUEZ Investigador Cinvestav 3C. Doctor en Ciencias (1993) Universidad Estatal de Colorado. Tema de investigación: Biotecnología ambiental, tratamiento de compuestos aromáticos, biorremediación de suelos, utilización de residuos agroindustriales. Categoría en el SNI: Nivel II ROBERTO RUIZ MEDRANO Investigador Cinvestav 3A. Doctor en Ciencias (1996) Cinvestav Irapuato. Tema de investigación: Ingeniería genética de plantas. Categoría en el SNI: Nivel I JUAN ALFREDO SALAZAR MONTOYA Investigador Cinvestav 3A. Doctor en Ciencias (1991) Universidad Politécnica de Valencia, España. Temas de investigación: Biotecnología de alimentos. Propiedades físicas de biopolímeros. Categoría en el SNI: Nivel I B I O T E C N O L O G Í A Y B I O I N G E N I E R Í A A N U A R I O C I N V E S T A V 121

6 PERSONAL ACADÉMICO Y TEMAS DE INVESTIGACIÓN FRÉDERIC THALASSO SIRET Investigador Cinvestav 3B. Doctor en Ciencias (1992) Universidad Católica de Lovaina, Bélgica. Tema de investigación: Biotecnología ambiental, tratamiento aeróbico de agua, tratamiento de gas, transferencia de masa en bioreactores. Categoría en el SNI: Nivel II GUADALUPE BEATRIZ XOCONOSTLE CÁZARES. Investigador Cinvestav 3B. Doctor en Ciencias (1995) Cinvestav Irapuato. Tema de investigación: Ingeniería genética de hongos y plantas. Categoría en el SNI: Nivel II PROGRAMAS DE ESTUDIOS Los programas de estudio de los grados académicos que se confieren en el Cinvestav están registrados en el Padrón de Excelencia del Conacyt. MAESTRÍA REQUISITOS DE ADMISIÓN Contar con los antecedentes académicos de las licenciaturas en ingeniería química, biología, biotecnología y otras afines. Estar titulado o poseer carta de pasante con el compromiso de obtener su título profesional en un plazo máximo de seis meses después de la fecha de inicio del programa. El estudiante deberá entregar una carta compromiso de titulación avalada oficialmente por la institución de procedencia. En el caso de que la institución de procedencia acepte la opción de titulación por créditos de maestría, el período para la titulación se extenderá hasta un año después de la fecha de inicio del programa. Tener promedio de calificaciones mínimo de 8 o equivalente. Entregar a la Coordinación Académica carta del estudiante dirigida a la Comisión Académica Departamental describiendo las razones de su solicitud. Currículum vitae completo. Dos cartas de recomendación de profesores o investigadores. Proporcionar la información solicitada en el formato de admisión del Cinvestav. Presentar y aprobar los exámenes de admisión, establecidos por el departamento. Si éstos no son aprobados con calificación mínima de 8, la Comisión Académica puede recomendar la inscripción a los cursos propedéuticos o presentar nuevamente los exámenes reprobados. Los cursos propedéuticos tendrán que ser aprobados con una calificación mínima de 8. Que la Comisión Académica haya recomendado su admisión al programa. 122 A N U A R I O C I N V E S T A V

7 CURSOS PROPEDÉUTICOS Inician en junio. PROGRAMA DE ESTUDIOS Cuatrimestres Horas Créditos Primero (obligatorias) Introducción a la biotecnología (rotación) Ingeniería bioquímica Biología celular Seminario departamental estancias de laboratorio de un mes cada una, cada estancia debe cubrir mínimo 15h/semana B I O T E C N O L O G Í A Y B I O I N G E N I E R Í A Segundo (obligatorias) Seminario de investigación I 28 Seminario departamental 16 2 Genética y regulación optativa : Biocatálisis Ingeniería de bioreactores Bioquímica y nutrición Tercero (obligatorias) Seminario de investigación II 34 Seminario departamental optativa: Bioprocesos Biotecnología vegetal Biotecnología de alimentos Biotecnología ambiental Diseño de experimentos* 32 4 *Quien opte por éste curso, tendrá que llevar otro más. A partir del cuarto cuatrimestre, se llevará seminario de investigación con 40 créditos por cuatrimestre y seminario departamental con 2 créditos. Total de créditos para la maestría: 274. CONTENIDO CONDENSADO DE LOS CURSOS Introducción a la Biotecnología Tiene por objeto dar un panorama sobre la situación actual y las perspectivas de la biotecnología a nivel mundial y nacional. Ingeniería Bioquímica El objetivo del curso es el de adquirir los conocimientos y criterios de ingeniería bioquímica y microbiología necesarios para interpretar modelos matemáticos, así como plantear y resolver problemas de aplicación referentes a fenómenos y procesos biotecnológicos. A N U A R I O C I N V E S T A V 123

8 La palabra clave de este objetivo es la biotecnología. Según la Federación Europea de Biotecnología, la biotecnología se puede definir como el uso integrado de la bioquímica, microbiología y ciencias de la Ingeniería para lograr una aplicación tecnológica de las capacidades de los microorganismos. Esta definición es muy restrictiva, y una definición más general parece más conveniente. La definición siguiente logra casi la unanimidad: Ciencias del ingeniero utilizando la materia viva para producir o destruir compuestos con objetivos industriales. Esta definición incluye tanto los organismos unicelulares como los multicelulares y, de manera general, integra tanto la genética como el diseño de los bioreactores. Frente a un campo tan extenso, más vale hablar de las biotecnologías que de una sola biotecnología. Biología Celular Este curso proporciona los conocimientos básicos sobre la estructura composición y funcionamiento de todos los elementos que componen las células y estudiar la diversidad de capacidades en biosíntesis y degradación de los materiales celulares, los diferentes fenómenos fisiológicos y bioquímicos del crecimiento y la generación de energía. Lo anterior permitirá un empleo racional de los microorganismos en la investigación aplicada, como es en el diseño de procesos biotecnológicos. Biocatálisis El curso tiene como propósito dar al estudiante del posgrado en biotecnología los conceptos fundamentales para entender la relación estructura-función de las proteínas y la catálisis enzimática. Se revisarán y discutirán los avances recientes en biocatálisis y sus aplicaciones. Bioquímica y Nutrición En este curso se darán a cono cer al estudiante las principales propiedades bioquímicas de los alimentos, sus interacciones con otros compuestos y los principales cambios que ocurren durante los procesamientos, conservación y almacenamiento y proporcionar los conocimientos básicos de la nutrición y toxicología relacionados con la función nutricional de los constituyentes de los alimentos y el efecto de tóxicos, factores antinaturales y xenobióticos presentes de manera natural, incorporados intencionalmente o adquiridos durante los procesamientos de los alimentos y conocer los procedimientos teórico-prácticos para evaluar nutricional y toxicológicamente a los alimentos. Bioprocesos El objetivo del curso es analizar las características particulares de procesos de fermentación con microorganismos transgénicos y líneas celulares. Estudiar las características fundamentales de las operaciones unitarias utilizadas para la separación y purificación de productos biológicos y analizar estas operaciones junto con la fermentación, desde el punto de vista síntesis de procesos. Biotecnología Vegetal Aquí se proporcionarán al estudiante los aspectos básicos sobre las diferentes estrategias biotecnológicas en la regeneración de plantas mejoradas y producción de metabolitos de interés industrial por cultivos de células u órganos vegetales. Biotecnología de Alimentos Se pretende desarrollar en el estudiante de posgrado la aptitud para aplicar los diferentes procesos biotecnológicos para el 124 A N U A R I O C I N V E S T A V

9 manejo, transformación y conservación que se aplican a varios grupos de alimentos para su consumo. Revisar los avances recientes y sus perspectivas a futuro. Diseño de Experimentos Este curso está designado para proveer una introducción sobre el diseño de experimentos desde el punto de vista teórico-práctico. Se cubrirán los temas teóricos con el apoyo de paquetes de computación SAS que permite el manejo eficiente de los conocimientos adquiridos en las sesiones teóricas. El énfasis se hará sobre los principios prácticos, de tal manera que al terminar el curso el estudiante pueda tener la experiencia en su manejo, así como la experiencia de planear los experimentos del sistema de datos dado o de su proyecto de investigación. Finalmente el estudiante tendrá una visión general sobre la información que le pueda proporcionar los diversos diseños de experimentos estudiados durante el cuatrimestre. REQUISITOS DE PERMANENCIA Cumplir con el Reglamento General de Estudios de Posgrado del Cinvestav. Cumplir con el Reglamento del Programa del departamento. REQUISITOS PARA LA OBTENCIÓN DEL GRADO ACADÉMICO El estudiante deberá solicitar el examen de grado por escrito al Coordinador Académico. La solicitud se debe entregar por lo menos 15 días hábiles antes de la fecha prevista para el examen respectivo. A la solicitud deberá anexarse la carta firmada por todos los miembros del comité, en donde manifiesten estar de acuerdo con el manuscrito final de tesis, así como el original de éste. Para el caso de exámenes de grado se deberá incluir, adicionalmente, constancia de no adeudo de la(s) biblioteca(s) del centro de las cuales el estudiante haya sido usuario. Para obtener el grado de Maestro en Ciencias en la especialidad de Biotecnología, el alumno deberá: Comprobar un nivel intermedio del idioma inglés, mediante constancia del Cenlex-IPN o institución equivalente. Esta constancia deberá ser expedida dentro de los tres meses anteriores a su graduación. Cumplir con los requisitos establecidos por el Departamento de Servicios Escolares. Entregar a la Coordinación Académica el acta en donde los sinodales del examen de grado manifiestan que están de acuerdo con el manuscrito final de la tesis y que ya no habrá correcciones. Entregar su cuaderno de protocolo al tutor o codirector que sea miembro del departamento. Haber cumplido y acreditado el programa individual de estudios asignado. Haber desarrollado su tesis de acuerdo a los lineamientos indicados por su Comité Tutorial. Haber presentado o tener aceptado su trabajo para ser presentado en un congreso nacional o internacional; o haber publicado o tener aceptado un artículo en una revista científica. Presentar en forma escrita el trabajo experimental de tesis. Tener promedio mínimo de 8. Aprobar el examen de grado. DOCTORADO REQUISITOS DE ADMISIÓN Examen de admisión. Carta del tutor con quien se realizará el trabajo, B I O T E C N O L O G Í A Y B I O I N G E N I E R Í A A N U A R I O C I N V E S T A V 125

10 describiendo brevemente el porque de la aceptación del estudiante y la fuente de financiamiento con el que se cuenta para el desarrollo del trabajo. Carta del estudiante dirigida a la Comisión Académica Departamental describiendo las razones de la solicitud. Comité Tutorial propuesto, con: curriculum vitae completo, cargo, puesto, departamento o división de la institución de adscripción y carta de aceptación de cada uno de los miembros, así como una descripción breve de cual será la aportación académica de cada miembro en el proyecto a realizarse con base en sus publicaciones recientes. Curriculum vitae completo. Diploma de maestría o acta del examen de grado. Documento en el que se justifique y describa en forma breve y clara el tema de investigación propuesto. Dos cartas de recomendación de profesores o investigadores. Haber realizado estudios de maestría en un área afín. Presentar constancia de haber aprobado como mínimo, los cursos intermedios del idioma inglés del Cenlex- IPN o los equivalentes de otras instituciones. Promedio mínimo de 8 o su equivalente. Proporcionar la información solicitada en el formato de admisión del Cinvestav. Presentar examen de admisión. Que la Comisión Académica haya recomendado su admisión al programa y el Colegio haya avalado dicha recomendación. PROGRAMA DE ESTUDIOS Los estudiantes de doctorado siguen el seminario de investigación con 40 créditos por cuatrimestre y seminario departamental con 2 créditos. Total de créditos para el doctorado 378. REQUISITOS PARA LA OBTENCIÓN DEL GRADO ACADÉMICO Mantener un promedio mínimo de 8 durante el programa de estudios. Comprobar que tiene aceptado para su publicación en revistas internacionales, indexadas en el Science Citation Index, por lo menos un artículo en extenso, 126 A N U A R I O C I N V E S T A V

11 producto de su trabajo experimental de tesis. Cumplir con los requisitos establecidos por el Departamento de Servicios Escolares. Elaborar y defender una tesis de acuerdo con las disposiciones establecidas en el departamento. Tanto la tesis como la publicación deberán ser resultado de su proyecto de investigación. Entregar a la Coordinación Académica el acta en donde los sinodales del examen de grado manifiestan que están de acuerdo con el manuscrito final de tesis y que ya no habrá correcciones. Entregar su cuaderno de protocolo al tutor o codirector que sea miembro del departamento. Haber cumplido y acreditado el programa individual de estudios asignado. Presentar constancia de haber aprobado como mínimo los cursos avanzados del idioma inglés del Cenlex-IPN o equivalente de otras instituciones. l El estudiante deberá solicitar el examen de grado por escrito al Coordinador Académico. La solicitud se debe entregar por lo menos 15 días hábiles, antes de la fecha prevista para el examen respectivo. A la solicitud deberá anexarse la carta firmada por todos los miembros del comité, en donde manifiesten estar de acuerdo con el manuscrito final de tesis, así como el original de éste. Adicionalmente, entregar una constancia de no adeudo de la(s) biblioteca(s) del Centro de la(s) cual (s) el estudiante haya sido usuario. Aprobar el examen de grado. DOCTORADO DIRECTO Duración: 4 años. REQUISITOS DE ADMISIÓN Contar con los antecedentes académicos de las licenciaturas en ingeniería química, biología, biotecnología y otras afines. Estar titulado o poseer carta de pasante con el compromiso de obtener su título profesional en un plazo máximo de seis meses después de la fecha de inicio del programa. El estudiante deberá entregar una carta compromiso de titulación avalada oficialmente por la institución de procedencia. En el caso de que la institución de procedencia acepte la opción de titulación por créditos de maestría, el período para la titulación se extenderá hasta un año después de la fecha de inicio del programa. Tener promedio de calificación mínima de 8 o equivalente. Entregar a la Coordinación Académica carta del estudiante dirigida a la Comisión Académica Departamental describiendo las razones de su solicitud. Currículum vitae completo. Dos cartas de recomendación de profesores o investigadores. Proporcionar la información solicitada en el formato de admisión del Cinvestav. Presentar y aprobar los exámenes de admisión, establecidos por el departamento. Si éstos no son aprobados con calificación mínima de 8, la Comisión Académica puede recomendar la inscripción a los cursos propedéuticos o presentar nuevamente los exámenes reprobados. Los cursos propedéuticos tendrán que ser aprobados con una calificación mínima de 8. Carta del tutor con quien se realizará el trabajo de tesis, describiendo brevemente el porque de la aceptación el estudiante y la fuente de financiamiento con que cuenta para desarrollarlo. Si durante los primeros cinco cuatrimestres el aspirante no solicitó ninguna baja, ni obtuvo una calificación menor a 8 en sus cursos, podrá presentar examen predoctoral dentro de los primeros doce meses. REQUISITOS DE PERMANENCIA Cumplir con el reglamento General de Estudios de Posgrado del Cinvestav. B I O T E C N O L O G Í A Y B I O I N G E N I E R Í A A N U A R I O C I N V E S T A V 127

12 Cumplir con el Reglamento del Programa del departamento. REQUISITOS PARA LA OBTENCIÓN DE GRADO Barragan, E., Gordillo, B., Varga, G., Cortés, M.T., Jaramillo, B.E., Villa-Treviño, S., Fattel- Fazenda, S., Ortega, J. y Velazco, L. DNA replication inhibition and fluorescence microscopy of non-cationic porphyrins in malignant cells. Arkivoc VI (2005) 436. Los mismos enlistados en el capítulo anterior del Doctorado. PUBLICACIONES DE LOS INVESTIGADORES ARTÍCULOS PUBLICADOS EN EXTENSO EN REVISTAS DE PRESTIGIO INTERNACIONAL, CON ARBITRAJE ESTRICTO Amezcua-Allieri, M.A., Lead, J.R. y Rodríguez- Vázquez, R. Changes of chromium behavior in soil during phenanthrene removal by Penicillium frequentans. Biometals 18(1) (2005) 23. Amezcua-Allieri, M.A., Lead, J.R. y Rodríguez- Vázquez, R.Changes in Cd and Cr fluxes during the bioremediation of phenanthrene. Soil Use and Management 21(3) (2005) 337. Amezcua-Allieri, M.A., Lead, J.R. y Rodríguez- Vázquez, R., Impact of microbial activity on copper, lead and nickel mobilization during the bioremediation of soil PAHs. Chemosphere 61(4) (2005) 484. Asaff, A., Cerda-Garcia-Rojas, C. y de la Torre, M. Isolation of dipicolinic acid as an insecticidal toxin from Paecilomyces fumosoroseus. Applied Microbiology and Biotechnology 68(4) (2005) 542. Barajas-Aceves, M. Comparison of different microbial biomass and activity measurement methods in metal-contaminated soils. Bioresource Technology (2005) 96(12): Baruch, I.S., Georgieva, P., Barrera-Cortes, J. y de Azevedo, S.F. Adaptive recurrent neural network control of biological wastewater treatment. International Journal of Intelligent Systems 20(2) (2005) 173. Carrion, M., Alba, J. y Thalasso, F. Effect of hydrodynamic conditions on biofilm, oxygen consumption rate in a fixed-bed nitrifying reactor. Water Science and Technology 52(7) (2005) 91. Chávez, C., Castillo, R., Dendooven, L. y Escamilla-Silva, E.M. Poultry slaughter wastewater treatment with an up-flow anaerobic sludge blanket (UASB) reactor. Bioresource Technology 96(15) (2005) Conde, E., Cárdenas, M., Ponce-Mendoza, A., Luna-Guido, M.L., Cruz-Mondragón, C. y Dendooven, L. The impacts of inorganic nitrogen application on mineralization of C-14-labelled maize and glucose, and on priming effect in saline alkaline soil. Soil Biology and Biochemistry 37(4) (2005) 681. Contreras-Ramos, S.M., Escamilla-Silva, E.M. y Dendooven, L. Vermicomposting of biosolids with cow manure and oat straw. Biology and Fertility of Soils 41(3) (2005) 190. Dzul-Puc, J.D., Esparza-García, F., Barajas- Aceves, M. y Rodríguez-Vázquez, R. Benzo[a]pyrene removal from soil by Phanerochaete chrysosporium grown on sugarcane bagasse and pine sawdust. Chemosphere 58(1) (2005) 1. Feria-Romero, I., Lazo, E., Ponce-Noyola, T., Cerda-García-Rojas, C.M. y Ramos-Valdivia, A.C. 128 A N U A R I O C I N V E S T A V

13 Induced accumulation of oleanolic acid and ursolic acid in cell suspension cultures of Uncaria tomentosa. Biotechnology Letters 27(12) (2005) 839. Flores-Cotera, L.B. y García-Salas, S. Gas holdup, foaming and oxygen transfer in a jet loop bioreactor with artificial foaming media and yeast culture, Journal of Biotechnology 116(4) (2005) 387. García-Mena, J., Cano-Ramírez, C., Garibay- Orijel, C., Ramírez-Canseco, S. y Poggi- Varaldo, H.M. A PCR method for the detection and differentiation of Lentinus edodes and Trametes versicolor in defined-mixed cultures used for wastewater treatment, Applied Microbiology and Biotechnology 67(4) (2005) 524. García-Salas, S., Orozco-Álvarez, C., Porter, R.M. y Thalasso, F. Measurement of local gas holdup in bubble columns via a non-isokinetic withdrawal method. Chemical Engineering Science 60(24) (2005) Garibay-Orijel, C., Ríos-Leal, E., García-Mena, J. y Poggi-Varaldo, H.M. 2,4,6- Trichlorophenol and phenol removal in methanogenic and partially-aerated methanogenic conditions in a fluidized bed bioreactor. Journal of chemical Technology and Biotechnology 80(10) (2005) Hidalgo, M.E., Farr s-g-s, A. y Montes- Horcasitas, M.C. b-methyl-xyloside: positive effect on xylanase induction by Cellumonas flavigena. Journal of Industrial and Microbioogical Biotechnology 32(8) (2005) 345. Jiménez-Ávalos, H.A., Ramos-Ramírez, E.G. y Salazar-Montoya, J.A. Viscoelastic characterization of gum arabic and maize starch mixture using the Maxwell model. Carbohydrate Polymers 62(1) (2005) 11. Larios-Saldaña, A., Porcayo-Calderon, J. y Poggi-Varaldo, H.M. Obtaining a flour with low content of neutral-detergent fibre from defatted rice bran. Interciencia 30(1) (2005) 29. López-y-López, V.E. y de la Torre, M. Redirection of metabolism during nutrient feeding in fed-batch cultures of Bacillus thuringiensis, Applied Microbiology and Biotechnology 67(2) (2005) 254. Lucho-Constantino, C.A., Álvarez-Suárez, M., Beltrán-Hernández, R.I., Prieto-García, F. y Poggi-Varaldo, H.M. A multivariate analysis of the accumulation and fractionation of major and trace elements in agricultural soils in Hidalgo State, Mexico irrigated with raw wastewater. Environment International 31(3) (2005) 313. B I O T E C N O L O G Í A Y B I O I N G E N I E R Í A Gracida, J., Pérez-Guevara F. y Cardoso- Martínez J. Thermal and dynamic mechanical properties of binary blends of bacterial copolyester poly(hydroxybutyrate-co-hydroxyvalerate) (PHBHV) with poly(2-hydroxyethylmethacrylate) (PHEMA)? Journal of Materials Science 40(9-10) (2005) Lucho-Constantino, C.A., Prieto-García, F., Del Razo, L.M., Rodríguez-Vázquez, R. y Poggi-Varaldo, H.M. Chemical fractionation of boron and heavy metals in soils irrigated with wastewater in central Mexico. Agriculture Ecosystems and Environment 108(1) (2005) 57. Gutiérrez-Miceli, F.A., Rodríguez- Mendiola, M.A., Ochoa-Alejo, N., Méndez-Salas, R., Arias-Castro, C. y Dendooven, L. Sucrose accumulation and enzyme activities in callus culture of sugarcane. Biologia Plantarum 49(3) (2005) 475. Luna-Palencia, G.R., Cerda-García-Rojas, C.M., Rodríguez-Monroy, M. y Ramos-Valdivia, A.C. Influence of auxins and sucrose in monoterpenoid oxindole alkaloid production by Uncaria tomentosa cell suspension cultures. Biotechnology Progress 21(1) (2005) 198. A N U A R I O C I N V E S T A V 129

14 Martínez-Flores, H.E., Cruz, M.C., Larios, S.A., Jiménez, G.E., Figueroa, J.D.C. y Gómez-Aldapa, C.A. Sensorial and biological evaluation of an extruded product made from corn supplemented with soybean and safflower pastes. International Journal of Food Science Technology 40 (2005) 517. Montesinos, R.M., Tejeda-Mansir, A., Guzmán, R., Ortega, J. y Schiesser, W.E. Analysis and simulation of frontal affinity chromatography of proteins. Separation and Purification Technology 42 (2005) 75. Moreno-Brito, V., Yáñez-Gómez, C., Meza- Cervantez, P., Ávila-González, L., Rodríguez, M.A., Ortega-López, J., González- Robles, A. y Arroyo, R.A. Trichomonas vaginalis 120 kda protein with identity to hydrogenosome pyruvate: ferredoxin oxidoreductase is a surface adhesin induced by iron. Cellular Microbiology 7(2) (2005) 245. Ocadiz, R., Orozco, E., Carrillo, E., Quintas, L.I., Ortega-López, J., García-Pérez, R.M., Sánchez, T., Castillo-Juárez, B.A., García-Rivera, G. y Rodríguez, M.A. EhCP112 is an Entamoeba histolytica secreted cysteine protease that may be involved in the parasite-virulence. Cellular Microbiology 7(2) (2005) 221. Piedra-Ibarra, E., De La Torre-Almaraz, R., Zúñiga, G., Xoconostle-Cázares, B. y Ruiz- Medrano, R. Leonotis nepetaefolia: An important plant virus reservoir in central Mexico. Phytoparasitica 33(5) (2005) 480. Poggi-Varaldo, H.M., Alzate-Gaviria, L.M., Pérez- Hernández, A., Nevarez-Morillon, V.G. y Rinderknecht-Seijas, N. A side-by-side comparison of two systems of sequencing coupled reactors for anaerobic digestion of the organic fraction of municipal solid waste. Waste Management and Research 23(3) (2005) 270. Ramos, M.S., Dávila, J.L., Esparza, F., Thalasso, F., Alba, J., Guerrero, A.L. y Avelar, F.J., Treatment of wastewater containing high phenol concentrations using stabilisation ponds enriched with activated sludge. Water Science and Technology 51(12) (2005) 257. Rodríguez-Tovar, A.V., Ruiz-Medrano, R., Herrera-Martínez, A., Barrera-Figueroa, B.E., Hidalgo-Lara, M.E., Reyes-Márquez, B.E., Cabrera-Ponce, J.L., Valdes, M. y Xoconostle- 130 A N U A R I O C I N V E S T A V

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