Sistema para la documentación de colecciones Programa de Recursos Genéticos del CIAT
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- Felipe Cruz Ayala
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1 Sistema para la documentación de colecciones Programa de Recursos Genéticos del CIAT Angela Marcela Hernández Taller: Estrategia de Bancos de Germoplasma Vegetal (BGV) de la Nación Colombiana v Junio 02 Julio, 2015 CORPOICA, Tibaitatá-Cundinamarca, Colombia
2 Agenda Rasgos generales del sistema de documentación actual para las colecciones del CIAT. Evaluación GRIN-Global en CIAT. Piloto de migración a GRIN-Global. Caso colección mundial de Yuca.
3 Conservación de germoplasma y sistema de documentación El conocimiento sobre las colecciones y su adecuado manejo se encuentran cimentados sobre un sistema de documentación que garantice el registro, accesibilidad y análisis de información
4 Rasgos generales del sistema de documentación actual para las colecciones del CIAT Características básicas para un sistema de información en bancos de recursos genéticos según Guía para la documentación de recursos genéticos - Painting, K. A.; Perry, M. C.; Denning, R. A. y Ayad, W. G.
5 Rasgos generales del sistema de documentación actual para las colecciones del CIAT Objetivos / Lineamientos Procesos Prioridades Sistema de Documentación
6 Accesiones Estándares MCPD (Multi Crop Passport Descriptors) ISO3 (ISO Country Definitions) Crop characterization descriptors Gestión de las colecciones International standards and procedures FAO, Bioversity International SMTA (Standard Material Transfer Agreement) guidelines Genebank handbook procedures
7 Familias de descriptores - Pasaporte -Caracterización -Morfológica -Molecular -Bioquímica -Evaluaciones (e.j. Reacciones a estrés biótico y abiótico, características nutricionales y tecnológicas) Datos sobre las accesiones Propósitos -Conocimiento sobre las colecciones -Curación de cultivo - Facilitar el acceso y visibilidad de las colecciones a los usuarios -Intercambiar información
8 Visibilidad y Acceso a las colecciones a través del sitio web Acceso a la información a través de un motor de búsqueda sobre la base de datos Solicitud de materiales en línea
9 Flujo de trabajo y procesos - Adquisición / Introducción - Regeneración / Multiplicación - Conservación(Inventario/monitoreo) - Viabilidad - Sanidad - Duplicados de seguridad - Distribución Datos sobre la gestión de las colecciones Propósitos - Establecer prioridades - Planeación de actividades - Tomar decisiones - Realizar reportes a los donantes y alta dirección
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11 Overview Documentation Internal System Information Visibility and access GRP Database Documentation / Images Server
12 Infraestructura tecnológica Unidad de Sistemas de información del CIAT Soporte y gestión de los servicios de TI: Data center Networking Databases Computers, laptops, printers Data backup Software licenses Carlos Meneses System Information Unit Manager Arturo Franco Database Manager for Research area
13 Evaluación de GRIN-Global Durante los últimos 10 años, el CIAT ha desarrollado un sistema de información "in-house. Tecnología de captura obsoleta para versiones Windows Implicaciones para implementar nuevos requerimientos de usabilidad (Soporte) Necesidad de evaluar una alternativa para adopción Piloto de evaluación para la colección in vitro de yuca
14 Desarrollar Adoptar Vs
15 Evaluación de GRIN-Global Piloto de pruebas 4 meses Colección in vitro de Yuca Migración de 2,934 accesiones con información básica de pasaporte CIAT Descriptor GG Field Name ACCESION ACCESION_NUMBER_PART1 TAXNO TAXONOMY_SPECIES_ID ORIGIN_COUNTRY GEOGRAPHY_ID BIOLOGICAL_STATUS IMPROVEMENT_STATUS_CODE ELEVATION ELEVATION_METERS LATITUDE LATITUDE LONGITUDE LONGITUDE
16 Evaluación de GRIN-Global Revisión del diccionario de datos de GRIN-Global Metadata del centro vs GG Establecer la infraestructura tecnológica requerida por GRIN-Global Base de datos, servidor, red Establecer un plan de migración de datos Poblar la base de datos con información básica Pasaporte, inventarios, evaluaciones Establecer criterios de evaluación de la herramienta Pruebas
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18 Matriz de Comparación Caracteristicas/Requerimientos Arquitectura del sistema Base de datos centralizada. Sistema basado en tecnología web, no requiera instalación en el computador. Sistema claramente definido en capas: acceso a datos, reglas de negocio, presentación. Administración Herramienta para la gestión del sistema. Gestión de usuarios del sistema. Permitir la definición de grupos de perfiles de usuarios. Permitir la gestión de permisos de usuarios sobre vistas de datos o módulos. Herramientas tipo wizard para la instalación y configuración del sistema. Permitir la importación de datos en bloque.
19 Matriz de Comparación Caracteristicas/Requerimientos Gestión de datos Soporte de los formatos de nombres de accesiones o nomenclaturas de la institución. Permitir la gestión de la información de pasaporte de las colecciones. Descriptores de pasaporte mínimos y estandarizados. Gestión de la información de taxonomía. Permitir la gestión de la información de sinónimos, colectas, caracterización, evaluaciones. Gestor de imágenes por material. Gestión de distribución y adquisición de material. Reportes. Manejo de inventarios, viabilidad, sanidad. Manejo de datos de producción/regeneración.
20 Matriz de Comparación Caracteristicas/Requerimientos Gestión de datos Seguimiento del flujo de operaciones/ tracking. Información de duplicados de seguridad de materiales. Flujo de operaciones para atender las solicitudes de material. Agregar nuevos descriptores. Herramientas de búsqueda de materiales por criterios. Información para auditoria. Reglas de distribución de material. Seguridad Cuentas de usuario, permisos de acceso.
21 Matriz de Comparación Caracteristicas/Requerimientos Usabilidad Amigable al usuario. Vistas de datos de acuerdo a procesos o grupos de datos. Soporte del idioma español. Exportación/importación de archivos Excel. Soporte Multiplataforma. Soporte técnico a requerimientos. Documentación. Escalabilidad Integración con otros sistemas. Vinculación con códigos de barras y dispositivos móviles de captura.
22 Resultados de la comparación Evaluation summary Features/requirement criteria GRIN-GLOBAL v1.8.3 CIAT GRP Information System System architecture/3 Good Satisfactory Administration/7 Outstanding Satisfactory Data management/35 Good Good Security/3 Good Good Usability/8 Satisfactory Satisfactory Support/6 Good Satisfactory Scalability/4 Unsatisfactory Good 5=Outstanding 4=Good 3=Satisfactory 2=Poor 1=Unsatisfactory NA=Not applicable
23 Piloto de migración a GRIN-Global Caso colección mundial de Yuca Duración: 1 año Objetivos: Desarrollar un piloto de migración de datos de la colección invitro de yuca Desarrollar estrategias de vinculación de las aplicaciones móviles existentes con GRIN-Global Grupo de trabajo Coordinador y asistente del banco de yuca (2 personas) Ingenieros de sistemas del área de documentación (2 personas)
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25 Piloto de migración a GRIN-Global Caso colección mundial de Yuca Análisis Comprensión de los procesos del laboratorio Identificación de los procesos del laboratorio Identificación de datos CIAT por procesos Análisis del Data Dictionary GG por procesos Mapeo de los datos Plan para procesos & Datos que no correlacionen Identificar tablas fuente y tablas destino Identificar datos a transformar Plan de migración Extracción y Transformación Diseño y desarrollo de scripts/herramientas para la extracción y migración Plan de pruebas y validaciones Transformación (Staging area) Validaciones Ejecución y Carga Ejecución y pruebas de validación Pruebas de usuario Pruebas y correcciones Carga Análisis Ejecución Extracción y transformación
26 Piloto de migración a GRIN-Global Caso colección mundial de Yuca Infraestructura requerida, servidor piloto Capacitación a los usuarios, taller dado por experto en GRIN-Global de Mayo en CIAT Carga de datos primarios: Pasaporte, georeferenciación, taxonomía Reuniones semanales para revisión de procesos y curatoria de datos En proceso desarrollo de scripts y herramientas para migración Documentación de los procesos de migración En proceso, inventarios, distribución, evaluaciones
27 Piloto de migración a GRIN-Global Caso colección mundial de Yuca Factores críticos identificados: Asimilación de la herramienta por parte de los usuarios de GG Comprensión del diccionario de datos de GG Procesos y datos bien definidos Comprensión de los procesos y flujos de trabajo por parte del grupo de IT a cargo de la migración Curatoria de la información Herramientas o plantillas para organizar y migrar los datos
28 Piloto de migración a GRIN-Global Caso colección mundial de Yuca Implicaciones con la implementación de GRIN-Global Inversión de adquisición de servidor y licencias para la BD (Microsoft SQLServer) Conectividad Sistema de copias de seguridad Administración y soporte de GG Helpdesk internacional: CIMMYT-GRINGlobal-International@cgiar.org
29 Gracias!
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