Tema 1. El análisis genético

Transcripción

1 Tema 1 El análisis genético

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3 Gen Genoma Genética Genómica Genómica estructural Genómica funcionall Mapas genéticos Mapas físicos EXPRESIÓN Transcriptoma Proteoma Interactoma FUNCIÓN Genética inversa

4 ANÁLISIS GENÉTICO FUNCION BIOLOGICA Gen o genes implicados Localización Cartografiado Función Interacciones

5 Análisis genético directo FUNCION Obtención de de mutantes Caracterización celular Caracterización bioquímica Caracterización fisiológica Caracterización genética Cuantos genes? Localización de de los los genes Interacción con con otros genes Aislamiento de de los genes Complementación Secuenciación Caracterización molecular DNA (GEN)

6 Análisis GENETICA genético INVERSA inverso DNA (GEN) Análisis informático de de la la secuencia Aislamiento anterior Homología Dominios funcionales Análisis funcional (mutantes) Remplazamiento RNA antisentido Mutaciones dominantes Sobreexpresión FUNCION

7 Tema 2 Cartografía genética. Marcadores moleculares

8 Marcador genetico: cualquier diferencia fenotípica controlada genéticamente Marcador molecular: cualquier diferencia en la secuencia de DNA que puede ser detectada técnicas moleculares Mapa genético: Serie ordenada de loci en un cromosoma, deducida por métodos genéticos (estudios de ligamiento)

9 Mapa genético del cromosoma Arroz Humanos

10 Mapa físico Genoteca de BAC/YAC Mapa

11 Mapa físico versus mapa genético

12 A Galileo lo excomulgaron por defender que no todo giraba en torno a nosotros, y ciertamente la grandeza del cosmos que hoy conocemos hace ridículo cualquier centralismo o protagonismo que se le quiera dar a nuestro planeta en el orden del universo. Pero en lo biológico la cosa cambia y muy pocos científicos si hay algunoadoptam posturas galileicas respecto a nuestra especie a las demás. El hombre es el centro del intrés biológico y en este contexto es donde se estudian las demás especies de la naturaleza, unas veces porque nos molestan y deseamos eliminarlas, otras poruqe no resultan agradables y las queremos a nuestro servicio, a veces como sucedaneo para conocer en ellas lo que no podemos estudiar en nosotros mismos. A Galileo lo excomulgaron por depender que no todo giraba en torno a nosotros, y ciertamente la grandeza del que hoy conocemos hace ridículo cualquier centralismo protagonismo que se le quiera dar a nuestro planeta en el orden del universo. Pero en lo biológico la cosa cambia y muy pocos de los científicos si hay alguno- adoptan posturas galileicas respecto a nuestra especie a las demás. El hombre es el centro del intrés biológico y en este contexto es donde se estudian las demás especies de la naturaleza, unas veces porque nos molestan y deseamos eliminarlas, otras poruqe no resultan agradables y las queremos a nuestro servicio, a veces como sucedaneo para conocer en ellas lo que no podemos estudiar en nosotros mismos.

13 Marcadores moleculares SNPs (Single-nucleotide polymorphism) RFLP (restriction fragment length polimorfism) RAPD (random amplified polimorfism DNA) AFLP (Amplified fragment length polimorfism) SSR (single sequence repeat) CAPS (cut amplified polimorfic sequence) CODOMINANTES CODOMINANTES NO CODOMINANTES CODOMINANTES CODOMINANTES CODOMINANTES SCAR (Sequenced characterised amplified regions)codominantes VNTR (variable number of tandem repeat) CODOMINANTES

14 Digestión restrictasas Hibridación PCR Secuenciación SNPs + RFLP + + VNTR + + RAPD + AFLP + + SSR + + CAPS + + SCAR + +

15 Hibridación n a. a. nucleicos + +

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17 Hemoglobina A Hemoglobina S Hemoglobina A Hemoglobina S

18 RFLP (Restriction fragment length polymorfism) Alelo A (Hemo A) Alelo a (Hemo S) RE RE RE RE RE RE RE GGCATGCGAATTCGCTA..GAATTG..ATTCCGTACGG CCGTACGCTTAAGCGAT..CTTAAC..TAAGGCATGCC Alelo A (Hemo A) RE RE RE GGCATGCGAATTCGCTA..GAATTC..ATTCCGTACGG CCGTACGCTTAAGCGAT..CTTAAG..TAAGGCATGCC Alelo a (Hemo S) Alelo A Alelo a AA Aa aa

19 Curvas Cot Porcentage de reasociacion Cot Altamente repetitiva Moderadamente repetitiva No repetida Porcentage de reasociacion Cot

20 Genoma Genes y secuencias relacionadas DNA extragénico DNAcodificante DNAno codificante DNA repetitivo DNA bajo nº copias Intrones Pseudogenes Fragmentos de genes Repeticiones en tandem Repeticiones dispersas Satélites Microsatélites Minisatélites Transposones Retrotransposones Retrovirus Secuencias de inserción

21 VNTR: Variable Number of Tadem Repeats RE RE

22 VNTRs (variable number tandem repeats)

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24 Microsatelites 5.CACACACACACACACACA 3 3.GTGTGTGTGTGTGTGTGTG 5

25 PCR

26 5 TAGAACATAAGGCCTA ATCTTGTATTCCGGAT GGAATGGCCATATGAT CCTTACCGGTATACTA 5 5 TAGAACATAAGGCCGG ATCTTGTATTCCGGCC GGAATGGCCATATGAT CCTTACCGGTATACTA 5 5 TAGAACATAAGGCCTA 3 - CCTTACCGGTATACTA -5 GGAATGGCCATATGAT SI 5 -TAGAACATAAGGCCTA-3 ATCTTGTATTCCGGAT CCTTACCGGTATACTA 5 5 TAGAACATAAGGCCGG GGAATGGCCATATGAT 3 - CCTTACCGGTATACTA -5 NO ATCTTGTATTCCGGCC 5 -TAGAACATAAGGCC TA-3 CCTTACCGGTATACTA 5

27 RAPDs: Random Amplified Polymorphic DNA A B A B

28

29 RAPD

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31 SNP (Single Nucleotide Polymorphism) A G C T A G C T A G C G A G C T

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