Transcripción y Procesamiento del RNA

Transcripción

1 Transcripción y Procesamiento del RNA

2 Transcripción Síntesis de RNA a partir de DNA DNA Transcripción Otros snrna, snorna, sirna, mirna RNA de transferencia trna RNA ribosomal rrna RNA mensajero mrna

3 Estructura química del RNA

4 RNA puede formar estructuras secundarias

5 Transcripción Solamente los segmentos de DNA que corresponden a genes son copiados a RNA Unade las dos cadenas de DNA es copiada a RNA Cadena codificante Cadena molde La secuencia de RNA es complementaria a la cadena molde e idéntica a la cadena codificante

6 RNA polimerasa procariotes RNAP holoenzima α 2 ββ σ 460 kda La RNA pol cubre aprox.60 nt 40 upstream y 20 downstream Gen Producto Función rpoa rpob 2 subunidades α (37kDa) Subunidad β(151kda) ensamblaje de las unidades Centro catalítico rpoc β (157kDa) Centro catalítico rpod σ (32-90kDa) Reconocimiento del promotor (especificidad)

7 Promotores bacterianos Promotor Secuencia -10 o caja Pribnow TATAAT Secuencia -35 TTGACAT

8 Secuencias conservadas en promotores de procariontes Promotor fuerte Promotor débil

9 Factores sigma σ Fac. σ Gen Masa (kda) Uso σ 70 rpod 70 general σ 32 rpoh 32 choque térmico σ 24 rpoe 24 choque térmico σ 54 rpon 54 nitrógeno σ 28 flia 28 flagelar

10 Etapas de la transcripción Iniciación Elongación Terminación

11 Reconocimiento y formación del complejo cerrado

12 Burbuja de 17pb

13 Elongación

14 Termino de la transcripción Terminadores intrínsecos

15 Termino de la transcripción Dependiente de Rho

16 Fidelidad de la transcripción Las RNA polimerasas no tienen actividad de edición por tanto son menos fieles

17

18 Transcripción en eucariotes Eucariotes tienen 3 tipos de polimerasas nucleares Tipos Localización Transcritos Copias/ cél I Nucleolo rrna 18S, 5.8S y 28S 40,000 II Nucleoplasma mrna 40,000 III nucleoplasma trna y rrna 5S 20,000 Todas las RNA polimerasas eucariotas son proteínas grandes en forma de agregados de 500 kdaó más. Generalmente tienen de 8 a 14 subunidades

19 Promotores eucariotes Caja TATA o caja Hogness -25 / -35 Elementos regulatorios URE Enhancers

20 Todas las RNA polimerasas requieren factores transcripcionales basales (TF)

21 Formación del complejo de iniciación RNApol II

22 Factores transcripcionales basales de RNA pol II

23 Polimerasa Promotor Factores transcripcionales basales RNA poli Notiene caja TATA UBF, SL1 RNA poliii Promotores internos TBP TF III A, TF III B y TF IIIC rrna5s TF III B y TF IIIC trna

24 También existen factores moduladores

25 PROCESAMIENTO POST-TRANSCRIPCIONAL DEL RNA

26 RNA ribosómico rrna Más abundante en la célula Principal componente de los ribosomas Procariotes 16S, 23S, 5S Eucariotes 18S, 28S, 5.8S, 5S RNA transferencia trna Más pequeño 75nt Transporta aminoácidos hasta el ribosoma Extremo 3 tiene el triplete característico CCA Independientemente del aminoácido que transporte

27 Procesamiento RNA transferencia y Eucariotes y procariotes ribosomal

28 Procesamiento RNA ribosomal procariote Metilación prerna 30S Región espaciadora II II II III II II III Corte específico RNasaIII, RNasaP y Rnasa E II II II III II II III Otras nucleasas II II II III II II III

29 Nucleolo Procesamiento RNA ribosomal eucariote 45S Región espaciadora II II II III II II III II II II III II II III II II II III II II III Los cortes son catalizados por RNAs pequeños del nucleolo snornas y proteínas del spliceosoma

30 Procesamiento RNA transferencia eucariote Cortes endonucleolíticos seguidos reacción de ligación

31 Procesamiento RNA transferencia Procesamiento del extremo 5 RNasaP Se encuentra en todos los organismos Ribonucleopoteína RNA (ribozima) 377 nt(actividad catalítica) Nucleasas RNasaD Procesamiento extremo 3 Nucleasas eliminan un grupo de bases RNasaD elimina nucleótidos restantes Proteína 20kDa

32 Procesamiento RNA transferencia trna nucleotidiltransferasa Transfiere la secuencia CCA característica de TODOS los trna maduros Metilacióno desaminación de bases Bases pseudouracilo y dihidrouracilo

33 Bases modificadas presentes en los trna

34 Capping Procesamiento mrna eucariote

35 Procesamiento mrna eucariote Poliadenilación 3

36 Procesamiento mrna eucariote Splicing Remoción de intrones

37 Procesamiento mrna eucariote Splicing Remoción de intrones

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39 Splicing alternativo

40 Resumen procesamiento mrna eucariote