Salmonella entérica serotipo Typhi, Semana epidemiológica 38, 2011.

Transcripción

1 Salmonella entérica serotipo Typhi, Semana epidemiológica 38, 211. Este reporte considera los casos confirmados de Salmonella Typhi recibidos hasta la semana 38, que finaliza el sábado 24 de septiembre 211. La estadística de casos obtenidos en la semana 38 se completa ulteriormente, debido al desfase de tiempo variable que puede transcurrir entre el momento entre que se obtiene la muestra y el momento en que esta muestra es recibida por el ISP. La referencia temporal de los casos presentados a continuación se refiere a la fecha de obtención de los mismos. INTRODUCCION Salmonella Typhi es el agente etiológico de fiebre tifoidea, enfermedad que se caracteriza por fiebre alta, cefalea, compromiso del estado general, anorexia. El estreñimiento es frecuente en adolescentes y adultos, la diarrea puede ocurrir en niños. La bacteria se adquiere a través del consumo de alimentos o aguas contaminadas, contacto directo con heces contaminadas, el periodo de incubación es de una a 3 semanas. Aproximadamente el 1% de las personas no tratadas pueden permanecer como portadoras por 2 a 3 meses. El Instituto de Salud Pública es el Laboratorio Nacional y de Referencia para Salmonella y le corresponde según decreto de Notificación Obligatoria D.S 158/24 confirmar los aislamientos de Salmonella realizados por los laboratorios clínicos públicos y privados del país. DIAGNOSTICO DE LABORATORIO El laboratorio de Referencia recibe los aislamientos con diagnóstico presuntivo de Salmonella provenientes de los laboratorios del país, a los cuales se le realiza la confirmación de especie y subespecie mediante caracterización bioquímica. Una vez confirmados como Salmonella se procede a su tipificación serológica, identificando antígenos somáticos y flagelares para determinar la serovariedad según Esquema de Kauffmann-White.

2 TENDENCIA Tabla 1: Evolución de la distribución de casos confirmados de Salmonella Typhi según diagnóstico de ingreso, Instituto de Salud Pública, Chile, (*). FIEBRE TIFOIDEA ENFERMEDAD DIARREICA AGUDA DIAGNOSTICO SINDOME FEBRIL OTROS DIAGNOSTICOS SIN DIAGNOSTICO TOTAL (*) (*) Semanas epidemiológicas 1 a 38.

3 Figura 1: Evolución de la distribución de casos confirmados de Salmonella Typhi según diagnóstico de ingreso, Instituto de Salud Pública, Chile, (*). Numero de casos comfirmados (*) FIEBRE TIFOIDEA ENFERMEDAD DIARREICA AGUDA SINDOME FEBRIL OTROS DIAGNOSTICOS SIN DIAGNOSTICO (*) Semanas epidemiológicas 1 a 38.

4 Figura 2: Número de casos confirmados acumulados de Salmonella Typhi por servicio de Salud de procedencia, Instituto de Salud Pública, Chile, 211 (*). numero de casos confirmados Servicios de Salud hasta semana 35 hasta semana 38 (*) Semanas epidemiológicas 1 a 38. Nota: la procedencia de obtención de la cepa y su ubicación geográfica a través del Servicio de Salud correspondiente, no coinciden necesariamente con la residencia del caso.

5 Figura 3: Evolución de la distribución de casos confirmados de Salmonella Typhi según procedencia, Instituto de Salud Pública, Chile, (*). 1 8 Numero de Casos Ambulatorio Hospitalizado Sin dato (*) Semanas epidemiológicas 1 a 38.

6 TENDENCIA 211 (semanas epidemiológicas 1 a 38). Tabla 2: Distribución de casos confirmados de Salmonella Typhi según diagnóstico de ingreso, servicio de Salud y tramo etario, Instituto de Salud Pública, Chile, 211 (*). FIEBRE TIFOIDEA ENFERMEDAD DIARREICA AGUDA SINDOME FEBRIL Rangos etarios <2 años 2-14 años años 3-44 años años 6-74 años 75 años y + SIN DATO Total SS DEL MAULE 2 2 SS M.ORIENTE 1 1 Total SS CONCEPCION SS METROPOLITANA CENTRAL SS METROPOLITANA OCCIDENTE 1 1 SS METROPOLITANA ORIENTE 1 1 SS METROPOLITANA SURORIENTE 1 1 SS VIÑA DEL MAR-QUILLOTA 1 1 Total SS ARAUCANIA SUR 1 1 SS CONCEPCION SS METROPOLITANA CENTRAL 1 1 SS METROPOLITANA NORTE SS METROPOLITANA OCCIDENTE SS METROPOLITANA ORIENTE SS VIÑA DEL MAR-QUILLOTA 1 1 Total SIN DIAGNOSTICO SS ANTOFAGASTA 1 1 SS ARAUCANIA SUR 1 1 SS CONCEPCION 2 2 SS COQUIMBO 1 1 SS DE RELONCAVI 2 2 SS METROPOLITANA CENTRAL SS METROPOLITANA NORTE SS METROPOLITANA OCCIDENTE SS METROPOLITANA ORIENTE SS METROPOLITANA SURORIENTE 1 1 SS TALCAHUANO SS VALDIVIA 1 1 SS VIÑA DEL MAR-QUILLOTA 2 2 Total OTROS DIAGNOSTICO SS METROPOLITANA CENTRAL 1 1 Total 1 1 TOTAL (*) Semanas epidemiológicas 1 A 38. Nota: la procedencia de obtención de la cepa y su ubicación geográfica a través del Servicio de Salud correspondiente, no coinciden necesariamente con la residencia del caso.

7 Tabla 3: Distribución de casos confirmados de Salmonella Typhi según diagnóstico de ingreso, procedencia y tramo etario, Instituto de Salud Pública, Chile, 211 (*). FIEBRE TIFOIDEA ENFERMEDAD DIARREICA AGUDA SINDOME FEBRIL OTROS DIAGNOSTICOS Rangos etarios <2 años 2-14 años años 3-44 años años 6-74 años 75 años y + sin dato Total Hospitalizado Total Ambulatorio Hospitalizado Total Ambulatorio Hospitalizado Total Ambulatorio 1 1 Total 1 1 SIN DIAGNÓSTICO Ambulatorio Hospitalizado Sin Dato 2 Total TOTAL (*) Semanas epidemiológicas 1 A 38. Figura 4: Distribución de casos confirmados de Salmonella Typhi por diagnóstico de ingreso y procedencia, Instituto de Salud Pública, Chile, 211(*) numero de casos FIEBRE TIFOIDEA ENFERMEDAD DIARREICA AGUDA SINDOME FEBRIL OTROS DIAGNOSTICOS SIN DIAGNOSTICO Total Diagnóstico inicial Hospitalizado Ambulatorio SIN DATO (*) Semanas epidemiológicas 1 a 38.

8 Canal Endémico acumulado 25-21: Tabla 4: Número acumulado de casos confirmados de Salmonella Typhi por semanas epidemiológicas y canal endémico acumulado 25-21, Instituto de Salud Pública, Chile, 211 (*). CANAL ACUMULADO SEMANA P25 P5 P (*) Semanas epidemiológicas 1 a 38

9 Figura 5: Canal endémico acumulado y número acumulado de casos confirmados de Salmonella Typhi, Instituto de Salud Pública, Chile, 211 (*) NUMEROS DE CASOS SEMANAS EPIDEMIOLOGICAS 211 P25 P5 P75 (*) Semanas epidemiológicas 1 a 38. Al realizar el análisis de frecuencias acumuladas se observa que el número acumulado de casos confirmados de Salmonella Typhi se encuentra por encima de la mediana acumulada. Esto indica que, en lo que va del año, el número de casos confirmados comienza a ubicarse en zona de alerta a contar de la semana 35. Por lo demás, al realizar el análisis de frecuencias por semana epidemiológica (sin acumular), en 211 se manifiesta un aumento sostenido del número de casos confirmados a partir de la semana 32, lo que indica la situación de brote.

10 Identificación de Brote en semanas epidemiológicas 32 a 37. Tabla 5: Número de casos confirmados de Salmonella Typhi por semanas epidemiológicas y canal endémico 25-21, Instituto de Salud Pública, Chile, 211 (*). SEMANA P25 P5 P TOTAL (*) Semanas epidemiológicas 1 a 38.

11 Figura 6: Canal endémico y número de casos confirmados de Salmonella Typhi por semana epidemiológica, Instituto de Salud Pública, 211 (*) Numero de casos Semanas epidemilógicas 211 P25 P5 P75 (*) Semanas epidemiológicas 1 a 38.

12 Seguimiento del Brote agosto-septiembre 211 Semanas epidemiológicas 31 a 38: 24 CASOS CONFIRMADOS en el país, de los cuales 19 fueron enviados por Servicios de Salud de la Región Metropolitana. 5% de los casos hospitalizados. Tabla 6: Distribución de casos confirmados de Salmonella Typhi por servicio de salud y procedencia, Instituto de Salud Pública, Chile, 211 (*). PROCEDENCIA DE OBTENCIÓN DE LA CEPA AMBULATORIO HOSPITALIZADO SIN DATO Total AGOSTO SS METROPOLITANA CENTRAL SS METROPOLITANA NORTE SS METROPOLITANA OCCIDENTE 3 3 SS METROPOLITANA SURORIENTE 1 1 Total SEPTIEMBRE SS CONCEPCION 1 1 SS METROPOLITANA CENTRAL SS METROPOLITANA NORTE SS METROPOLITANA OCCIDENTE SS METROPOLITANA SURORIENTE 1 1 SS TALCAHUANO 2 2 SS VIÑA DEL MAR-QUILLOTA Total TOTAL (*) Semanas epidemiológicas 31 a 38. Nota: la procedencia de obtención de la cepa y su ubicación geográfica a través del Servicio de Salud correspondiente, no coinciden necesariamente con la residencia del caso.

13 Figura 7: Distribución de casos confirmados de Salmonella Typhi por servicio de salud y procedencia, Instituto de Salud Pública, Chile, 211 (*) NUMERO DE CASOS SERVICIOS DE SALUD AMBULATORIO HOSPITALIZADO SIN DATO (*) Semanas epidemiológicas 31 a 38.

14 Tabla 7: Distribución de casos confirmados de Salmonella Typhi por Servicio de Salud y tramos etarios, Instituto de Salud Pública, 211 (*). GRUPOS ETARIOS 2-14 años años 3-44 años años sin dato TOTAL AGOSTO SS METROPOLITANA CENTRAL SS METROPOLITANA NORTE 2 2 SS METROPOLITANA OCCIDENTE SS METROPOLITANA SURORIENTE 1 1 Total SEPTIEMBRE SS CONCEPCION 1 1 SS METROPOLITANA CENTRAL SS METROPOLITANA NORTE 2 2 SS METROPOLITANA OCCIDENTE SS METROPOLITANA SURORIENTE 1 1 SS TALCAHUANO SS VIÑA DEL MAR-QUILLOTA 2 2 Total TOTAL (*) Semanas epidemiológicas 31 a 38. Nota: la procedencia de obtención de la cepa y su ubicación geográfica a través del Servicio de Salud correspondiente, no coinciden necesariamente con la residencia del caso. Tabla 8: Recuento comparativo de casos confirmados de Salmonella Typhi, Chile y Región Metropolitana, (*) semanas 1 a 38 semanas 1 a 38 semanas 31 a 38 semanas 31 a 38 Chile Región Metropolitana (*) 21: Semanas epidemiológicas 31 a 38: entre el 1/8/21 y el 25/9/21; 211: semanas epidemiológicas 31 a 38: entre el 31/7/211 y el 24/9/211.

15 Figura 8: Número de casos confirmados de Salmonella Typhi, Instituto de Salud Pública, Chile, comparación agosto-septiembre 21 y agosto septiembre 211 (*). Número de casos confirmados en semanas epidemiológicas 31 a Servivios de Salud con casos confirmados (*) 21: Número de casos confirmados entre el 1/8/21 y el 25/9/21 (semanas epidemiológicas 31 a 38) ; 211: número de casos confirmados entre el 31/7/211 y el 24/9/211 (semanas epidemiológicas 31 a 38). Figura 9: Número de casos confirmados de Salmonella Typhi EN REGION METROPOLITANA, Instituto de Salud Pública, Chile, 21 y 211 (*). Número de casos confirmados en semanas epidemiológicas 31 a M.SURORIENTE M.NORTE M.CENTRAL M.OCCIDENTE M.SUR Servicios de Salud con casos confirmados (*) 21: Número de casos confirmados entre el 1/8/21 y el 25/9/21 EN REGION METROPOLITANA (semanas epidemiológicas 31 a 38) ; 211: número de casos confirmados entre el 31/7/211 y el 24/9/211 EN REGION METROPOLITANA (semanas epidemiológicas 31 a 38).

16 Análisis de clonalidad de Cepas de Salmonella Typhi recibidas en el ISP en 211. El Laboratorio de Genética Molecular en conjunto con el Laboratorio ETA, mantiene una vigilancia molecular activa desde el año 28 de Salmonella Typhi. A través de ella se ha demostrado un alto grado de polimorfismo de esta bacteria durante este periodo. Este año se han analizado por Electroforesis de Campo Pulsado (PFGE) 61 cepas de Salmonella Typhi. En este estudio hasta la semana epidemiológica 38 se han detectado 35 clones diferentes. Sin embargo entre la semana epidemiológica 32 a la 38 se identificó un nuevo clon denominado 73, en 15 cepas aisladas de 13 pacientes de la Región Metropolitana y 2 del Servicio de Salud de Viña del Mar-Quillota. Este hallazgo es importante, ya que en la vigilancia realizada desde el año 28, no se había detectado un patrón genético idéntico en un alto número de pacientes. Tabla 9: Distribución del número de casos confirmados de Salmonella Typhi por Servicio de Salud y clones identificados por PFGE (*), Instituto de Salud Pública, Chile, 211(**). Clones de Salmonella Typhi identificados por PFGE en casos confirmados por el ISP, 211. Servicio de Salud Otros Clon 73 Clon 18 Clon 15 Clon 23 clones No tipificados Total de casos Antofagasta 1 1 Coquimbo 1 1 Viña-Quillota M.Norte M.Occidente M.Central M.Oriente M.Sur M.Suroriente 2 2 Del Maule 2 2 Concepción Talcahuano Araucanía Sur Valdivia 1 1 Llanchipal 2 2 Casos no aún tipificados (***) 3 Total País Fuente: Instituto de Salud Pública de Chile, Laboratorio de Genética Molecular, 211. (*) PFGE: Electroforesis de Campo Pulsado. (**) Hasta el 24/9/211 (semanas epidemiológicas 1 a 38). (***) Casos recibidos por el ISP en la semana 38, aún no tipificados.

17 Figura 1: Distribución de los casos confirmados de Salmonella Typhi por semana epidemiológica y clones identificados por PFGE (*), Instituto de Salud Pública, Chile, 211 (**). 8 7 Número de cepas confirmadas Semanas epidemiológicas 211 Otros clones clon 73 clon 15 clon 18 Clon 23 Fuente: Instituto de Salud Pública de Chile, Laboratorio de Genética Molecular, 211. (*) PFGE: Electroforesis de Campo Pulsado. (**) Casos tipificados hasta el 28/9/211.

18 Figura 11: Análisis Filogenético de las cepas de casos confirmados de Salmonella Typhi, Instituto de Salud Pública, Chile, 211(*). Fuente: Instituto de Salud Pública de Chile, laboratorio de Genética Molecular, 211. (*) Casos tipificados hasta el 28/9/211. Comentarios: El incremento de casos de Fiebre Tifoidea observado en Región Metropolitana a contar de la semana 32, se explican por el clon 73. Es imperioso poder identificar las muestras ambientales contaminadas con Salmonella Typhy y poder determinar en ellas el o los clones. Como laboratorio de referencia disponemos de nueva tecnología para ponerla a disposición en las investigaciones de brotes epidémicos.