Carmen M. Redondo Marey Unidad Oncología Genética. CHUVI 28 Septiembre 2012

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1 Carmen M. Redondo Marey Unidad Oncología Genética. CHUVI 28 Septiembre 2012

2 Herramientas en la web para el investigador. Gestores documentales (docs, netvibes)

3 Índice 1. Introducción Herramientas informáticas en investigación, en qué nos ayudan Ejemplos de herramientas 2. Gestores documentales Qué son? Tipos:. Netvibes y mashups. Herramientas colaborativas 3. Resumen 4. Bibliografía 3

4 Herramientas en la web para el investigador. Introducción. 1. Introducción - Qué son? Software general disponible en internet, muchas veces gratuito, que podemos usar/adaptar en nuestra investigación. - En qué nos pueden ayudar?. Búsqueda de información. Análisis de información y resultados del proyecto. Planificación de proyectos. Presentación de la información 4

5 1. Introducción: Búsqueda de información Búsqueda de información: - Bases de datos o portales bibliográficos: PubMed (MedLINE), OMIM, IME, Embase, SCOPUS, LILACS, Cochrane Plus, WHOLIS, Bibliosaúde, Web of Knowledge/Science - Bases de datos de proteínas, genes y rutas metabólicas: NCBI: CDD, Gene, UniGene EBI: UniProt, PDBe, Reactome KEGG: KEGG, KEGG Pathways - Encuestas: encuesta fácil, Lime Survey, SurveyMonkey - Gestores documentales: Netvibes 5

6 1. Introducción: Análisis de información y resultados. Análisis de información y resultados: - Programas estadísticos: EpiInfo, EpiDat, R - Programas gráficos: Gnuplot, Grace, Jmol, Vmd - Programas análisis información/resultados proteínas y genes: - proteínas: estructura 3D, función, dinámica, docking Blast, Pfam, NAMD, AutoDock - genes: Babelomics - Mashups - Gestores documentales: Herramientas colaborativas 6

7 1. Introducción: Gestión de proyectos y Presentación de resultados Gestión de proyectos: Openproj, Onepoint Community Server (cronogramas, gestión recursos, análisis de camino crítico) Presentación de información/resultados: - Gestores documentales: Herramientas colaborativas - Gestores de referencias EndNote, RefWorks, integrados en texto (Word, Latex) 7

8 2. Gestores documentales: netvibes, mashups y herramientas colaborativas 2. Gestores documentales - Qué son? Software que permite crear, capturar, organizar, almacenar y recuperar documentos - Tipos:. Netvibes y mashups. Herramientas colaborativas 8

9 2. Gestores documentales: Netvibes Netvibes: - universo de ventanas, portal de entrada - escritorio virtual que agrupa fuentes de información (de nuestro interés) que se actualizan frecuentemente (feeds) 9

10 2. Gestores documentales: Mashups Mashups: - Aplicación web que usa información de distintas fuentes relevantes (netvibes) para crear un nuevo servicio usando Servicios Web y APIs públicas. - HealthMap: mapa mundial de alertas epidemiológicas 10

11 2. Gestores documentales: Mashups GoPubMed: 11

12 2. Gestores documentales: Netvibes y Mashups PubMedReMiner: bioinfo.amc.uva.nl/human-genetics/pubreminer/ 12

13 2. Gestores documentales: Netvibes y Mashups Pubgle: guías de práctica clínica 13

14 Herramientas colaborativas: - Qué son? Herramientas disponibles en internet que permiten el trabajo en equipo sin tenernos que reunir físicamente. - En qué nos ayudan? 1. Crear y compartir documentos 2. Publicaciones colaborativas 3. Compartir calendarios de trabajo / lista tareas pendientes 4. Compartir enlaces y recursos web 5. Crear foros de comunicación 14

15 Herramientas colaborativas: - Son sencillas de usar (para algunas se necesita formación) - Se adaptan a nuestras necesidades (distintas tareas, personas con distintas habilidades informáticas, ) - Hay muchas para escoger - No dependen del ordenador/tablet/smartphone que tengamos ni de dónde estemos físicamente - Se usan en muchos entornos (sanidad, educación, empresas ) - Permite decidir quién puede ver/modificar los documentos 15

16 Entornos colaborativos: Espacio virtual con herramientas comunes que facilitan el intercambio de información, el trabajo colaborativo y la comunicación entre usuarios - Yahoo groups y Google groups: - GNOSS: - Wiggio:. Exigen tener cuenta de correo Yahoo o Google. Google ha eliminado algunas herramientas. Comunicación y compartir recursos. Enlace con redes sociales (Facebook, Twitter, etc.). Calendario, archivos, mensajes, foros, reuniones virtuales. Subgrupos de trabajo 16

17 Crear y modificar documentos: - Google Docs:. Crear nuevos documentos o compartir los ya existentes (doc, xls, odt, ods, csv, ppt, etc.). Compartir documentos, hojas de cálculo, presentaciones o formularios.. Necesitamos tener cuenta en Google. Varias personas pueden modificar el documento a la vez pero, sabemos quién ha cambiado qué y cuándo.. Diferentes permisos (lector, colaborador).. Publicar directamente el documento como web o blog. 17

18 Crear y modificar documentos: - Dropbox: - Zoho:. Guardar archivos en local para trabajar sin internet. Guardar archivos en la nube para acceder desde cualquier sitio. La versión local se sincroniza con la remota al conectarnos y así trabajamos siempre sobre la última versión del documento.. Si dos personas hacen cambios al mismo tiempo guarda las dos versiones y avisa. Revisar los cambios introducidos por otros. Exportar los textos a distintos formatos: doc, pdf, latex. Copia en local y copia en la nube. Presentación online colaborativa 18

19 Crear y modificar documentos: - Crocodoc: - Prezi:. Revisar y comentar documentos word, powerpoint, pdfs, imágenes, etc entre varias personas.. Crear una presentación online colaborativa - Etherpad:. Bloc de notas colaborativo - Lucidchart:. Crear diagrama de flujos o mapas de ideas - SkyDrive: (Microsoft). Compartir documentos con otros usuarios y entre equipos (ordenador, smartphone, tablet) de forma muy sencilla y rápida 19

20 Publicación colaborativa: Blogs. Publicación web que organiza sus contenidos cronológicamente. No exige saber programar. Integrar imágenes, vídeos, presentaciones, mashups. Eficaz para recoger las conclusiones de una reunión científica, divulgar resultados de investigación al público en general. Editar por varios autores internos y colaboraciones externas. es.wordpress.com 20

21 Publicación colaborativa: Blogs: 21

22 Publicación colaborativa: Wiki. Página web que se puede crear, borrar o modificar de forma interactiva, fácil y por cualquier usuario que acceda a ella (registrado). Debate sobre contenido/información de un tema. Cada uno aporta su conocimiento, experiencia. Tablón de anuncios. wiki.zoho.com Wikipedia, wiki de cursos, compañías (modificar desde intranet) 22

23 Publicación colaborativa: WikiHealth 23

24 Compartir calendarios y lista de tareas pendientes: - Google calendar:. Compartir calendario común con múltiples personas. Copia local sincronizada (para consultar sin estar conectados a internet). Ideal para: calendarios de reuniones, tareas de un proyecto, etc.. Acceder a los datos desde el móvil. Se necesita cuenta en Google para poder modificar el calendario, no para consultarlo. 24

25 Compartir calendarios y lista de tareas pendientes: - Doodle:. Muy sencilla de usar. Fijar reuniones, eventos. Elegir quién participa (invitamos por ). Muestra resumen actividad realizada 25

26 Compartir enlaces y recursos web: - Delicious:. Guardar los marcadores web de Favoritos para poderlos ver desde cualquier equipo desde el que nos conectemos.. Compartir nuestros marcadores con otros usuarios. Se integra en cualquier navegador (Explorer, Firefox) 26

27 Compartir enlaces y recursos web: - Diigo:. Compartir enlaces con un grupo de personas. Compartir notas, imágenes, capturas de pantallas, etc.. Más sencilla de usar que Delicious. Se integra en el navegador (Explorer, Firefox) 27

28 Foros de comunicación: - Vyew:. Webminars (seminarios web), presentaciones, reuniones de equipo, ayudar a clientes en tiempo real. Compartir documentos, imágenes, vídeos, presentaciones que se pueden modificar conjuntamente. Guardar la sesión como vídeo para verlo después. Comentarios en vivo o a través de chat, webcam para ver al participante que habla (si quiere). Visualizar el escritorio remoto del moderador. Se necesita tener Java y Flash instalado. 28

29 Foros de comunicación: - Skype:. Escribir, hablar o videoconferencia con varias personas a la vez. Muy sencillo de instalar y usar. Permite retomar conversaciones pasadas. Funciona en cualquier ordenador/smartphone. Permite compartir escritorio. Útil llamadas internacionales gratis. Envío de archivos 29

30 Resumen 3. Resumen 1. Las herramientas disponibles en la web ayudan al investigador en todas y cada una de las etapas de investigación. 2. Hay herramientas disponibles que se ajustan a nuestras necesidades, sólo hay que buscar!!! 3. Netvibes y mashups permiten agrupar fuentes de información que se actualizan rápidamente y extraer nuevo contenido. 4. Las herramientas colaborativas permiten el trabajo conjunto con otros sin tenernos que reunir físicamente 5. con los datos personales/pacientes: LOPD 30

31 4.Bibliografía ols.pdf 4. 31

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