Purificación de RNA IG 2010
|
|
- Carolina Belmonte Gutiérrez
- hace 8 años
- Vistas:
Transcripción
1 Purificación de RNA IG
2 Purificación de RNA Para qué sirve? Cómo se trabaja con RNA? Pasos generales: Homogeneizar células Purificar el RNA (total o no total, ej mrna) Cuantificar el RNA purificado Calidad del RNA 2
3 Purificación de RNA Para qué sirve? Cómo se trabaja con RNA? Pasos generales: Homogeneizar células Purificar el RNA (total o no total, ej mrna) Cuantificar el RNA purificado Calidad del RNA 3
4 Usos del RNA purificado Para identificar un RNA en particular, dentro de la población total de RNA de la célula Northern blot RPA (RNase protection assay) RT-PCR (transcripción reversa y posterior PCR) Otras cosas: traducción in vitro, construcción de cdna library, etc. 4
5 1- Northern blot La sonda es complementaria al RNA que se busca Es un método lento y semicuantitativo Se ve el tamaño del RNA de interés 5
6 2- RPA o ensayo de protección de ribonucleasas 1. La sonda es complementaria al RNA que se busca. Hibridación 2. Digestión con RNasa: degrada simple cadena, se protege RNA de interés (doble cadena con la sonda) 3. Corrida electroforética Más rápido y cuantitativo (relación 1 a 1 sonda-rna) que NB No se ve el tamaño del RNA de interés (depende de la sonda) 6
7 3- RT-PCR 1. Transcripción reversa (RT): de RNA a cdna 2. PCR: con primers específicos se puede amplificar una región de interés 3. Corrida electroforética El producto de PCR indica presencia del RNA de interés 7
8 Purificación de RNA Para qué sirve? Cómo se trabaja con RNA? Pasos generales: Homogeneizar células Purificar el RNA (total o no total, ej mrna) Cuantificar el RNA purificado Calidad del RNA 8
9 Manipulación del RNA El RNA es degradado por RNasas, que están por todos lados. Las RNasas son mucho más poderosas que las DNasas: Son termorresistentes en gral (autoclavar soluciona parcialmente) No requieren cationes divalentes (así que EDTA no tiene efecto, a diferencia de lo que pasa con DNAsas) 9
10 Manipulación del RNA Cómo vencer a las RNasas? Evitar la contaminación con RNasas: - trabajar con material libre de RNasas (autoclavar soluciones, material descartable especial, etc. - trabajar con guantes en todo momento Impedir (o disminuir) la acción de las RNasas: - utilizar inhibidores específicos - trabajar con rapidez y precisión y a veces en frío, especialmente cuando no hay inhibidores presentes 10
11 Dónde están las RNasas y cómo luchamos contra ellas? PROBLEMA 1. En uno. (Manos, saliva, etc) 2. Tips, epps, etc. 3. Agua y buffers 4. Superficies del labo (por presencia de bact, hongos, céls humanas, etc.) SOLUCIÓN 1. Guantes, trabajo prolijo 2. Todo RNasa-free 3. Agua mq autoclavada, o tratada con DEPC (DISCUTIR) 4. Evitar contacto, limpiar con soluciones comerciales (ej RNase zap de Ambion) o al menos con alcohol 11
12 Dónde están las RNasas y cómo luchamos contra ellas? (cont.) PROBLEMA 5. RNasas endógenas 6. Muestras RNA se contaminan o las RNasas copurifican 7. Plásmidos que se usan para transcripción in vitro 8. Pipetas contaminadas con RNasas SOLUCIÓN 5. Frío (hielo, congelar en N2 líq) y rápido 6. Usar inhibidores de RNasas (RNase-out de Invitrogen, etc) 7. Si en la mini/maxi prep se utilizó RNasa, usar proteinasa K y extracción con fenol cloroformo 8. Tener pipetas para RNA, aspirar alcohol, usar tips con filtro, etc. 12
13 Purificación de RNA Para qué sirve? Cómo se trabaja con RNA? Pasos generales: Homogeneizar células Purificar el RNA (total o no total, ej mrna) Cuantificar el RNA purificado Calidad del RNA 13
14 Purificación de RNA Para qué sirve? Cómo se trabaja con RNA? Pasos generales: Homogeneizar células Purificar el RNA (total o no total, ej mrna) Cuantificar el RNA purificado Calidad del RNA 14
15 Homogeneizar las células Es lo primero que hay que hacer para obtener RNA Tener en cuenta: la lisis libera RNasas endógenas y las pone en contacto con RNA endógenos. Además, hay RNasas exógenas Este paso es crítico para el rendimiento y la integridad del RNA obtenido. Entonces, hay que hacer una LISIS COMPLETA Y RÁPIDA Lisis lenta: RNasas endógenas se contactan con RNA endógeno Lisis incompleta: mucho RNA queda atrapado y baja rendimiento final 15
16 Homogeneizar las células Células o tejidos? Tejidos blandos o duros? Animal, vegetal, levaduras, bacterias? Lisis mecánica o enzimática? Por ej, algunos tejidos, como páncreas o bazo, son especialmente ricos en RNasas endógenas Lisis mecánica: con homogeneizador, vortex, sonicador, etc. Lisis enzimática (ej lisozima) para por ej bacterias o levaduras, normalmente seguido de lisis mecánica 16
17 Homogeneizar las células TEJIDOS: Tejidos frescos: procesar en frío y que no pasen más de 30 min. Ej RNA later (Ambion) mantiene el tejido fresco protegiendo al RNA Si no, congelar: problemas y ventajas (ej huesos). Mortero para pulverizar, temperatura baja. No descongelar. CÉLULAS en cultivo: En suspensión: centrifugar y resusp en sc desnat. Pegadas : lisis en placa o despegar células y lavar con PBS 17
18 Purificación de RNA Para qué sirve? Cómo se trabaja con RNA? Pasos generales: Homogeneizar células Purificar el RNA (total o no total, ej mrna) Cuantificar el RNA purificado Calidad del RNA 18
19 Purificación de RNA En condiciones desnaturalizantes fuertes que inactivan a las RNasas, por ej: tiocianato de guanidinio Agente caotrópico (desnaturaliza prots, DNA y RNA) poderosísimo LiCl SDS fenol El RNA está en riesgo antes de este paso (lisis celular), y después de este paso, pero no durante. 19
20 Purificación de RNA 1. Tiocianato de guanidinio y extracción con fenol-cloroformo 2. Tri-Reagent (Ambion. SIGMA), TRI-zol (Invitrogen), etc. Todos Tri. 3. RNeasy-kit (Qiagen): para RNA total 4. Purificación de mrna: Kits enteros ej bolitas o columnas con oligo dt pegado (SIGMA, Roche, Invitrogen, Agilent, Amersham, Ambion, etc) 20
21 Purificación de mrna El mrna representa 1-5 % del RNA total de la célula. Se elige purificar mrna para: Detectar RNAs que están en poquísima cantidad Sintetizar sondas para usar en arrays Generar libraries de cdna Eliminar trna y rrna aumenta 30 veces una señal de mrna Usar mrnas para esto permite que no se generen cdnas complementarios a rrna y trna, que diluyen lo que uno busca. 21
22 Purificación de RNA con guanidinio 1. Homogeneización/Lisis: Solución de tiocianato de guanidinio 2. Extracción RNA: extracción con fenol ácido y luego cloroformo:isoamílico 3. Precipitación RNA: fase acuosa a otro tubo, precipitar con isopropanol y lavar con etanol 75% 4. Solubilización RNA: resuspender el pellet de RNA en algo TRI-zol, Tri- Reagent y similares 22
23 Chomczynski & Sacchi Analytical Biochemistry, April 1987 Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction Nature Protocols, June 2006 QuickTime and a decompressor are needed to see this picture. 23
24 Cómo se separa el RNA? El medio ácido hace que el RNA quede en fase acuosa, el DNA en la interfase, y las proteínas desnaturalizadas en fase orgánica. Fenol ácido: ph 4,5 (fenol saturado en agua en vez de en Tris). Es crítico que sea ácido. CUIDADOS! (por la muestra y por uno) - Fenol:cloroformo:isoamílico 25:24:1, ph 7 o más en Tris: ác nucleicos quedan en fase acuosa (oxhidrilos negativos). Si es en 2 partes, primero fenol, y luego clorof:isoamílico 24:1 - Antioxidante en el fenol: discutir - Cloroformo afina la interfase y disuelve lípidos, y el alcohol isoamílico reduce espuma 24
25 Guardado del RNA purificado Este es el otro paso crítico, además de la lisis celular, que afecta el rendimiento y la integridad del RNA purificado Opciones para resuspender el pellet: Buffer TE (Tris-EDTA) EDTA 0,1 mm Agua libre de RNasas Agua tratada con DEPC (dietilpirocarbonato, inactiva RNasas porque hace modif. covalentes en -OH, -SH y -NH, pero DEPC es incompatible con Tris por ej y hay que eliminarlo autoclavando mín. 1 h y queda CO2 y etanol) Por poco tiempo: a -80 C (muy poco tiempo a -20 C) Por mucho tiempo: precipitando en alcohol 25
26 Purificación de RNA Para qué sirve? Cómo se trabaja con RNA? Pasos generales: Homogeneizar células Purificar el RNA (total o no total, ej mrna) Cuantificar el RNA purificado Calidad del RNA 26
27 Cuantificación del RNA Absorbancia a 260 nm (espectrofotómetro): Barato y fácil, pero proteínas, nucleótidos libres y DNA también absorben No medir RNA en agua sino en Tris ph neutrish 1 A 260 nm = 40 ug RNA/ml Fluorescencia (fluorómetro): ej RiboGreen (Invitrogen) se pega a ácidos nucleicos y emite fluorescencia Más caro pero contaminación por proteínas no afecta y es más sensible. Como no mide prots, se puede poner DNasa para medir sólo RNA 27
28 Purificación de RNA Para qué sirve? Cómo se trabaja con RNA? Pasos generales: Homogeneizar células Purificar el RNA (total o no total, ej mrna) Cuantificar el RNA purificado Calidad del RNA 28
29 Calidad del RNA: integridad RNA total: - Se puede chequear en un gel de agarosa nativo o desnaturalizante. - Idealmente se espera una relación 2 a 1 de rrna 28S respecto del 18S (menos que eso indica comienzo de degradación). - ALTERNATIVA A GEL: Agilent 2100 Bioanalyser Data (electroferograma) mrna: - Se puede chequear haciendo un Northern con sonda de housekeeping gene (ej actina o GAPDH). - No degradación se ve banda definida de tamaño correcto. 29
30 Calidad del RNA: contaminación Absorbancia a 260 nm vs Absorbancia a 280 nm (espectrofotómetro): Ácidos nucleicos absorben con pico en 260 nm y proteínas con pico en 280 nm Relación A260/A280 de 1,8 o más indica pureza. Menos de 1,6 indica presencia de proteínas contaminantes o trazas de fenol (ojo, absorbancia a 280 depende mucho del ph - la baja fuerza iónica aumenta A280- así que diluir en TE o Tris) Agilent 2100 Bioanalyser Data también da info sobre presencia de contaminantes 30
31 Qué haremos nosotros? Estudiar la inducción del gen p21 en células tratadas con un agente de daño al ADN (doxorubicina) P21 se induce por p53 Utilizaremos células HCT116 wt y mutadas para p53 Algunos grupos trabajarán con células wt (con y sin doxo) y otros con células mut (con y sin doxo) Preparar RNA de las células tratadas y no tratadas, hacer una RT, y hacer una real time PCR para levantar p21 31
32 Extracción de RNA IG 2010 Discutir protocolo pág 42 y 43: Modo de trabajar: guantes, cuidado, etc Solución D y acetato de sodio: se preparan y se guardan a temp amb Fenol saturado en agua: saturar!!!, guardar a 4C, CUIDADO! Clorof:isoamílico 49:1 ojo, se evapora! Vidrio, CUIDADO! No usamos agua DEPC para las soluciones sino agua mili Q autoclavada. Ojo Epps buenos (tapa, fenol) y RNase-free, tips, etc 32
33 Reacción de transcripción reversa: de RNA a cdna Se suele usar la enzima MMLV-RT tiene menor actividad RNasa H (degrada híbridos RNA- DNA) que otras RT. Esta actividad es una gran desventaja al utilizar primers de DNA Versiones mutantes ej Superscript (Invitrogen) más procesivas y que actúan a mayor temp, lo que desarma estruct secundarias) Primer para la RT Oligo-dT (reconoce mrnas) Primer específico para un mrna Hexámeros al azar dntps Inhibidor de RNasas 33
34 Transcripción reversa IG 2010 Discutir protocolo pág 44: Mezclar RNA total con dntps, oligo-dt Calentar a 65 C por 5 min: el calor desarma estructura secundaria del RNA Dejar unos minutos a temp ambiente: el oligo-dt se aparea con las colas de polia Agregar mix con buffer, DTT, RNAse-out (inhibidor de RNasa) y enzima MMLV-RT Reacción de RT 1 hora a 37 C Calentar a 70 C para terminar la reacción 34
35 -Fin- 35
DANAGENE RNA PURIFICATION KIT
DANAGENE RNA PURIFICATION KIT REF.0801.1 100 EXTRACCIONES REF.0801.2 500 EXTRACCIONES 1.INTRODUCCION Este kit permite la permite la obtención de ARN total a partir de cultivos celulares, tejidos animales,
Más detallesBioquímica III- 2009
Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata Bioquímica III- 2009 Trabajo Práctico Nro 4 Extracción de RNA y DNA bacteriano INTRODUCCIÓN El RNA es el ácido nucleico más abundante en la
Más detallesCUESTIONES. 1. Por qué la PCR convencional no es cuantitativa?
2º BIOQUÍMICA CUESTIONES 1. Por qué la PCR convencional no es cuantitativa? En la PCR convencional, la cuantificación del ADN de la muestra es complicada debido a que la eficacia de amplificación va disminuyendo
Más detallesReacción en cadena de la polymerasa (PCR)
Reacción en cadena de la polymerasa (PCR) 1 PCR Que es? Es una técnica in vitro diseñada para amplificar una región específica de DNA. Es extremadamente sensible, con la capacidad de amplificar millones
Más detallesMódulo 1 Biología Molecular Genética Molecular II 2009. Módulo 1. Amplificación de un fragmento de ADN genómico por PCR
Módulo 1 Amplificación de un fragmento de ADN genómico por PCR En este primer módulo se amplificará por PCR, mediante el uso de oligonucleótidos específicos, un fragmento de ADN genómico de Aspergillus
Más detallesEl Banco Nacional de ADN oferta un control de calidad de muestras de ADN y ARN.
PROGRAMA CONTROL DE CALIDAD DE MUESTRAS El Banco Nacional de ADN oferta un control de calidad de muestras de ADN y ARN. El programa completo de control de calidad de muestras de ADN y ARN engloba diferentes
Más detallesTRABAJO PRÁCTICO Nº 5: ÁCIDOS NUCLEICOS DESCRIPCIÓN DE LOS MÉTODOS A UTILIZAR
TRABAJO PRÁCTICO Nº 5: ÁCIDOS NUCLEICOS DOCENTES: Andrés Ciocchini, Gabriela Niemirowicz. DESCRIPCIÓN DE LOS MÉTODOS A UTILIZAR Purificación de ácido desoxiribonucleico (ADN) por partición diferencial
Más detallesMateriales para la secuenciación de ADN
Introduccion La Secuenciación Sanger es un método de secuenciación de ADN en el que el ADN diana se desnaturaliza y se hibrida con un cebador de oligonucleótidos, que se extiende entonces gracias a la
Más detalles37. Purificación de ácidos nucleicos
37. Purificación de ácidos nucleicos Mª José Prieto Álamo, Juan López Barea, Carmen Pueyo de la Cuesta Departamento de Bioquímica y Biología Molecular, Campus Universitario de Rabanales, Edificio Severo
Más detallesProtocolo de laboratorio para purificación manual de ADN a partir de una muestra de 0,5 ml
Protocolo de laboratorio para purificación manual de ADN a partir de una muestra de 0,5 ml Para la purificación de ADN genómico de todos los kits de colección Oragene y ORAcollect. Visite nuestro sitio
Más detallesPCR en Tiempo Real. Introducción
Introducción Página 1 de 6 Introducción general La reacción en cadena de la polimerasa, cuyas iniciales en inglés son PCR ("polymerase chain reaction"), es una técnica que fue desarrollada por Kary Mullis
Más detallesRT- PCR diagnóstica del Cotton leafroll dwarf virus (CLRDV) en plantas de algodón
RT- PCR diagnóstica del Cotton leafroll dwarf virus (CLRDV) en plantas de algodón La identificación rápida y precisa de los patógenos que afectan a los cultivos de interés agronómico es crítica para predecir
Más detallesTécnicas de Biología Molecular
Técnicas de Biología Molecular DNA I. Enzimas de restricción Análisis Las enzimas de restricción fueron aisladas de bacterias; su función natural es proteger contra DNA extraño II. Separación electroforética
Más detallesCURSO DE EXTENSIÓN TEÓRICO PRÁCTICO HERRAMIENTAS EFICIENTES PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LEVADURAS DE INTERÉS AGROINDUSTRIAL
LIBRO DE MEMORIAS 2 CURSO DE EXTENSIÓN TEÓRICO PRÁCTICO HERRAMIENTAS EFICIENTES PARA LA IDENTIFICACIÓN DE LEVADURAS DE INTERÉS AGROINDUSTRIAL Santiago de Cali, 23 al 28 de agosto de 2010 3 Libro de memorias
Más detallesDANAGENE SALIVA KIT. Ref.0603.4 50 Extracciones / Ref.0603.41 160 Extracciones
DANAGENE SALIVA KIT Ref.0603.4 50 Extracciones / Ref.0603.41 160 Extracciones 1.INTRODUCCION DANAGENE SALIVA Kit provee un método para la extracción de ADN genómico de alta calidad a partir de muestras
Más detallesEXTRACCIÓN Y PURIFICACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS
EXTRACCIÓN Y PURIFICACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS Consideraciones iniciales - Condiciones de limpieza y esterilidad - Peligrosidad de algunos reactivos usados en la purificación Fases - Rotura-homogeneización:
Más detallesCUANTIFICACIÓN DE ADENOSIN DESAMINASA (ADA)
CUANTIFICACIÓN DE ADENOSIN DESAMINASA (ADA) PROTOCOLO ADA FUNDAMENTO DEL METODO: La adenosindesaminasa (ADA) es una enzima del catabolismo de las purinas que cataliza la conversión de la adenosina en inosina
Más detallesDetección de patógenos en alimentos, utilizando la técnica de PCR, reacción en cadena de la polimerasa.
Detección de patógenos en alimentos, utilizando la técnica de PCR, reacción en cadena de la polimerasa. Lic. Esp. Mariano Diego Massari 1er Congreso Bioquímico Córdoba 2011 8ª Jornada de Actualización
Más detallesTécnicas moleculares.
Técnicas moleculares. DMTV Carolina Acevedo Curso de Microbiología 2015 SÍNTESIS IN VITRO DE UNA GRAN CANTIDAD DE COPIAS DE UN SEGMENTO DE ADN EXISTENTE EN UNA MUESTRA. O sea. Amplificamos en forma exponencial
Más detallesTecnología HaloPlex by Genycell Biotech España
Paneles de genes custom-made Tecnología HaloPlex by Genycell Biotech España SERVICIO NGS CLÍNICA HALO: OVERVIEW 1. DISEÑO DEL PANEL DE GENES Y DEL KIT DE CAPTURA 2. PREPARACIÓN DE LA MUESTRA EN EL LABORATORIO
Más detallesGuía Práctica 9. Producción de micelio en medio líquido para extracción de ADN. Micelio de hongos. Contenido
Guía Práctica 9 Micelio de hongos Producción de micelio en medio líquido para extracción de ADN Guillermo Castellanos, Experto en Investigación 2 Carlos Jara, Ing. Agr. M.Sc., Asociado en Investigación
Más detallesGUÍA PARA LA SECUENCIACIÓN AUTOMÁTICA DE DNA
Página 1 de 16 GUÍA PARA LA SECUENCIACIÓN AUTOMÁTICA DE DNA SERVICIO DE SECUENCIACIÓN-S.C.S.I.E. UNIVERSITAT DE VALÈNCIA Página 2 de 16 CONTENIDOS: 1.- Secuenciación automática de DNA 2.- Tipos de molde
Más detallesELABORACIÓN N DE MEZCLA PARA PCR. Raquel Asunción Lima Cordón
ELABORACIÓN N DE MEZCLA PARA PCR Raquel Asunción Lima Cordón PCR Polymerase Chain reaction (reacción en cadena de la polimerasa) Sintetizar muchas veces un fragmento de ADN PCR: simulación de lo que sucede
Más detallesMETODOLOGÍAS UTILIZADAS EN INVESTIGACIÓN BÁSICA Y APLICADA REACCION EN CADENA DE LA POLIMERASA (PCR)
METODOLOGÍAS UTILIZADAS EN INVESTIGACIÓN BÁSICA Y APLICADA REACCION EN CADENA DE LA POLIMERASA (PCR) Centro de de Microscopía Electrónica Facultad de de Ciencias Médicas Universidad Nacional de de Córdoba
Más detallesEn los programas de estudio para sus estudiantes los Aprendizajes incluidos en la actividad son:
INTRODUCCIÓN Recordemos que lo que define a un ser vivo entre otras funciones, es su función reproductiva, que permite que una especie se perpetúe en el tiempo, manteniendo las características de sus progenitores,
Más detallesNORMAS DE TRABAJO EN BIOLOGÍA MOLECULAR Y GUÍA DE PROBLEMAS HABITUALES Y SU SOLUCIÓN
NORMAS DE TRABAJO EN BIOLOGÍA MOLECULAR Y GUÍA DE PROBLEMAS HABITUALES Y SU SOLUCIÓN 1. PROCEDIMIENTOS BÁSICOS: En este apartado pretendemos detallar algunos factores muy importantes a la hora de realizar
Más detallesTÉCNICAS GENÓMICAS. 2) Cuantificación del número de virus presentes en muestras de sangre o suero: carga vírica
TÉCNICAS GENÓMICAS Utilidad/Objetivos: 1) Detección de microorganismos directamente en muestras clínicas identificando un fragmento específico del genoma del microorganismo concreto 2) Cuantificación del
Más detallesGUIA DE LABORATORIO PRACTICA 8 EXTRACCIÓN ADN PROGRAMA DE ENFERMERIA CURSO INTEGRADO DE PROCESOS BIOLOGICOS
GUIA DE LABORATORIO PRACTICA 8 EXTRACCIÓN ADN PROGRAMA DE ENFERMERIA CURSO INTEGRADO DE PROCESOS BIOLOGICOS Leidy Diana Ardila Leal Docente. INTRODUCCIÓN En esta práctica se va a realizar la extracción
Más detallesCódigo: IDX-016 Ver: 1 TOXO. Sistema para la detección de la presencia de ADN de Toxoplasma gondii. Reg. MSP 21205
Sistema para la detección de la presencia de ADN de Toxoplasma gondii Reg. MSP 21205 Valdense 3616. 11700. Montevideo. Uruguay. Teléfono (598) 2 336 83 01. Fax (598) 2 336 71 60. info@atgen.com.uy www.atgen.com.uy
Más detallesPCR. Componentes del PCR. PCR Polymerase Chain Reaction (Reacción en Cadena de la Polimerasa)
PCR PCR Polymerase Chain Reaction (Reacción en Cadena de la Polimerasa) Es una técnica de biología molecular descrita en 1986 por Kary Mullis. (Nobel de química en 1993) Necesidad de pruebas de diagnóstico
Más detalles5. DETECCION DE GENES DE VIRULENCIA MEDIANTE HIBRIDACIÓN CON SONDAS DE ADN
5. DETECCION DE GENES DE VIRULENCIA MEDIANTE HIBRIDACIÓN CON SONDAS DE ADN Materiales - Eppendorf de 1,5 ml estériles - Eppendorf de pared fina para PCR - Puntas de pipeta estériles desechables - Guantes
Más detallesAISLAMIENTO DE ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (DNA) GENÓMICO Y PLASMÍDICO
AISLAMIENTO DE ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (DNA) GENÓMICO Y PLASMÍDICO E l estudio del genoma de los seres vivos a sido uno d los principales objetivos de la Biología. Desde los trabajos de Mendel (1866),
Más detalles1. Título. Cuantificacion de ADN por espectrofluorometría mediante el uso de Quant- it PicoGreen dsaadnssay Kit (Invitrogen ).
1. Título. Cuantificacion de ADN por espectrofluorometría mediante el uso de QuantiT PicoGreen dsaadnssay Kit (Invitrogen ). 2. Finalidad. El presente documento describe el Procedimiento Normalizado de
Más detallesCLASE DE RESOLUCIÓN DE PROBLEMAS DE PCR LIC. BIOTECNOLOGÍA 2015
CLASE DE RESOLUCIÓN DE PROBLEMAS DE PCR LIC. BIOTECNOLOGÍA 2015 DEFINICIÓN PCR: Constituye la técnica más importante para amplificar ácidos nucleicos in vitro. Ambas hebras del DNA de interés son replicadas
Más detallesNMX-F-070-1964. MÉTODO DE PRUEBA PARA LA DETERMINACIÓN DE TIAMINA. THIAMINE DETERMINATION. TEST METHOD. NORMAS MEXICANAS. DIRECCIÓN GENERAL DE NORMAS.
NMX-F-070-1964. MÉTODO DE PRUEBA PARA LA DETERMINACIÓN DE TIAMINA. THIAMINE DETERMINATION. TEST METHOD. NORMAS MEXICANAS. DIRECCIÓN GENERAL DE NORMAS. ASUNTO Con fundamento en lo dispuesto en los Artículos
Más detallesEXTRACCIÓN DE ADN DE DISTINTAS MUESTRAS VEGETALES
EXTRACCIÓN DE ADN DE DISTINTAS MUESTRAS VEGETALES ABSTRACT The objective of the experiment is to extract DNA of different fruits and vegetables. On our case we developed three different experiments, the
Más detallesEXTRACCIÓN DE ADN (3)
EXTRACCIÓN DE ADN (3) PROCEDIMIENTO BÁSICO PARA FUENTES ALTERNATIVAS Muchos estudios de Biología Molecular comienzan con la extracción de ácidos nucleicos. La lisis celular libera las moléculas en una
Más detallesNuevos paneles de PCR Real Time: El diagnóstico molecular más rápido, fiable y eficaz
IDEXX VetLab Suite IDEXX SNAP Tests Laboratorio de Referencia IDEXX Nuevos paneles de PCR Real Time: El diagnóstico molecular más rápido, fiable y eficaz Obtenga respuestas definitivas con la IDEXX RealPCR
Más detallesLA REACCION EN CADENA DE LA POLIMERASA
LA REACCION EN CADENA DE LA POLIMERASA ADN super enrollado Secuencia Blanco Hebra de ADN ADN doble cadena Cromosoma Dra. Cristina Gutiérrez García Lab.. Virología a Molecular INHRR ESTRUCTURA DEL ADN.
Más detalles- Clonar un gen (molde ADN o ARN)
APLICACIONES PCR Aplicaciones de la PCR - Clonar un gen (molde ADN o ARN) - Secuencia conocida - Genes homólogos en especies próximas (primers degenerados) - Información de secuencia proteica (primers
Más detallesBIOLOGÍA GENERAL Y METODOLOGÍA DE LAS CIENCIAS TRABAJO PRÁCTICO Nº 2 GENÉTICA
BIOLOGÍA GENERAL Y METODOLOGÍA DE LAS CIENCIAS TRABAJO PRÁCTICO Nº 2 GENÉTICA Objetivos: Diferenciar los niveles de organización y compactación del material genético. Comprender los principios básicos
Más detallesCONTROL DE LA ACTIVIDAD CELULAR
CONTROL DE LA ACTIVIDAD CELULAR Sumario Las Moléculas de los Seres Vivos Control de la actividad celular 1. Las reacciones celulares básicas 2. El control de las reacciones celulares 3. Los modelos de
Más detalles39. Aislamiento y purificación del DNA de un plásmido recombinante
39. Aislamiento y purificación del DNA de un plásmido recombinante Aurora Galván Cejudo, Manuel Tejada, Antonio Camargo, José Javier Higuera, Vicente Mariscal, Emilio Fernández Reyes Departamento de Bioquímica
Más detallesAPLICACIÓN DE LA PCR: DIAGNÓSTICO DE PARÁSITOS
Prácticas docentes en la COD: 10-71 APLICACIÓN DE LA PCR: DIAGNÓSTICO DE PARÁSITOS FUNDAMENTO TEÓRICO La PCR es una técnica que permite llevar a cabo la síntesis in vitro de fragmentos de ADN. Está basada
Más detalles3. Conocimientos básicos
3. Coneixements bàsics 3. Conocimientos básicos 3.1. La descomposición del pescado Es bien sabido que el pescado y los productos del mar en general son alimentos que no se conservan fácilmente. Tan pronto
Más detallesWestern Blotting (o inmunotransferencia) es un procedimiento estándar de laboratorio que permite a
Introducción Western Blotting (o inmunotransferencia) es un procedimiento estándar de laboratorio que permite a los investigadores verificar la expresión de una proteína, determinar la cantidad relativa
Más detallesPROBLEMAS MÁS FRECUENTES Y POSIBLES SOLUCIONES
PROBLEMAS MÁS FRECUENTES Y POSIBLES SOLUCIONES NO SE PRODUCE REACCIÓN O ÉSTA DECAE POCO DESPUÉS DE COMENZAR No hay ADN o hay menos del necesario No hay cebador o la concentración es inferior a la necesaria.
Más detallesSÍNTESIS DEL ÁCIDO ACETIL SALICÍLICO
PRÁCTICA 10: SÍNTESIS DEL ÁCIDO ACETIL SALICÍLICO 1. INTRODUCCIÓN En esta práctica llevaremos a cabo un proceso sencillo de síntesis de un fármaco: la síntesis del ácido acetilsalicílico. El extracto de
Más detallesCUADERNO DE PRÁCTICAS GENETICA MOLECULAR HUMANA. Grado en Medicina
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR III FACULTAD DE MEDICINA UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID CUADERNO DE PRÁCTICAS GENETICA MOLECULAR HUMANA Grado en Medicina CURSO ACADÉMICO 2014/2015 INDICE
Más detallesProtocolos de secuenciación de ADN
1 Protocolos de secuenciación de ADN Introducción El método de secuenciación utilizado aquí es el desarrollado por Sanger en 1975. Este consiste en la incorporación de didesixinucleótidos marcados fluorescentemente
Más detalles5. MATERIALES Y MÉTODOS
5. MATERIALES Y MÉTODOS 5.1 Equipos Los siguientes termocicladores se emplearon para la amplificación por PCR: - Perkin Elmer, GeneAmp PCR System 2400. - Perkin Elmer, GeneAmp PCR System 9600. - Applied
Más detallesClonación molecular. Clonar significa hacer copias idénticas
INGENIERÍA GENÉTICA Clonación molecular Clonar significa hacer copias idénticas Este término originalmente fue aplicado al procedimiento de aislar una célula y permitirle reproducirse creando una población
Más detallesLIMPIEZA Y DESINFECCIÓN EN LA INDUSTRIA LÁCTEA
LIMPIEZA Y EN LA INDUSTRIA LÁCTEA LD EN LAS INDUSTRIAS DE ALIMENTOS La sanitización/higienización es un concepto general que comprende la creación y mantenimiento de las condiciones óptimas de higiene
Más detallesPARTE DE PRENSA. Alimentos seguros 1
PARTE DE PRENSA Alimentos seguros 1 Lavar, pelar, hervir y a comer tranquilos! Las bacterias también pueden contaminar y multiplicarse en los alimentos crudos. Por eso, es importante tener en cuenta algunas
Más detallesELECCIÓN DE PRODUCTOS
ELECCIÓN DE PRODUCTOS Los productos envasados deben estar en perfecto estado, rechazaremos los que estén abombados, mojados, abollados, abiertos o dañados. En el caso de productos congelados, es importante
Más detallesTaqMan GMO Maize Quantification Kit. Part No: 4481972
TaqMan GMO Maize Quantification Kit Part No: 4481972 1. Introducción Los organismos modificados genéticamente (OMG) se encuentran ampliamente distribuidos, siendo la soja y el maíz los vegetales que ocupan
Más detallesTécnicas descritas en el curso 7.28
Técnicas descritas en el curso 7.28 Técnica: Clase 1 Experimento de incorporación de dntps Ensayo de extensión del cebador Ensayo de unión en filtro Electroforesis en gel Análisis de ADN Helicasa Polaridad
Más detallesP.C.R. "Técnica de amplificación enzimática de secuencias específicas de DNA"
P.C.R. "Técnica de amplificación enzimática de secuencias específicas de DNA" Paso 1: Desnaturalización del DNA Paso 2: Hibridación de los "Primers" Paso 3: Extensión Paso 1: Desnaturalización del DNA
Más detallesPRÁCTICA Nº 5 REACCIONES DE POLIMERIZACIÓN. Objetivos
PRÁCTICA Nº 5 REACCINES DE PLIMERIZACIÓN bjetivos - Realizar un ejemplo práctico de reacción de polimerización por condensación: Preparación de un poliéster. Preparación de una poliamida. - Resaltar la
Más detallesIdentificación varietal en vid por técnicas de Biología Molecular. Lic. Luciana Garcia Lic. Carolina Chiconofri
Identificación varietal en vid por técnicas de Biología Molecular. Lic. Luciana Garcia Lic. Carolina Chiconofri OBJETIVO Desarrollar un banco de datos a partir de plantas de origen indudable y del uso
Más detallesPCR. Técnica inventada por Kary Mullis :1987. Premio Nobel 1993. Amplifica una ÚNICA secuencia a partir de una mezcla compleja de ADN
PCR PCR Técnica inventada por Kary Mullis :1987 Premio Nobel 1993 Amplifica una ÚNICA secuencia a partir de una mezcla compleja de ADN Aprovecha los requerimientos de la replicación Templete ADN Nucleótidos
Más detallesPROBLEMAS MAS FRECUENTES DURANTE LA SECUENCIACIÓN NO SE PRODUCE REACCION O ESTA DECAE POCO DESPUÉS DE COMENZAR
PROBLEMAS MAS FRECUENTES DURANTE LA SECUENCIACIÓN NO SE PRODUCE REACCION O ESTA DECAE POCO DESPUÉS DE COMENZAR Las causas pueden ser las siguientes: No hay ADN o se encuentra en muy baja concentración.
Más detallesSEPARACIÓN DE ALUMINIO A PARTIR DE MATERIAL DE DESECHO
Actividad Experimental SEPARACIÓN DE ALUMINIO A PARTIR DE MATERIAL DE DESECHO Investigación previa 1.- Investigar las medidas de seguridad que hay que mantener al manipular KOH y H SO, incluyendo que acciones
Más detallesPROCEDIMIENTO DE LABORATORIO PARA LA PRUEBA DE GENOTIPIFICACIÓN DEL VIH
PROCEDIMIENTO DE LABORATORIO PARA LA PRUEBA DE GENOTIPIFICACIÓN DEL VIH Blga. Gisely Hijar Guerra Coordinación del Laboratorio de Biotecnología y Biología Molecular. Responsable de los Procesos de la Prueba
Más detallesversus PCR en Tiempo Real PCR convencional no es cuantitativo
PCR convencional o PCR de punto final versus PCR en Tiempo Real PCR convencional no es cuantitativo S Lobos C - U de Chile 1 PCR clásico La cantidad de producto no está relacionada con la cantidad de DNA
Más detallesAblandamiento de agua mediante el uso de resinas de intercambio iónico.
Ablandamiento de agua por intercambio iónica página 1 Ablandamiento de agua mediante el uso de resinas de intercambio iónico. (Fuentes varias) Algunos conceptos previos: sales, iones y solubilidad. Que
Más detallesC A P Í T U L O 3 M A T E R I A L E S Y M É T O D O. Se ejecutaron varias pruebas para la inactivación de Escherichia Coli ATCC 25922 en agua
C A P Í T U L O 3 M A T E R I A L E S Y M É T O D O Se ejecutaron varias pruebas para la inactivación de Escherichia Coli ATCC 25922 en agua destilada utilizando Dióxido de Titanio dopado con Nitrógeno,
Más detallesBIOMOLÉCULAS: PROTEÍNAS
FICHA PARA EL DOCENTE Objetivos Introducir al alumno en los conceptos de aminoácidos y proteínas. Detallar los diferentes tipos de aminoácidos, sus funciones e importancia. Discutir nociones básicas acerca
Más detallesPCR a tiempo real. Sección de Biología Molecular, Servicio de Apoyo a la Investigación, Universidad de Murcia
PCR a tiempo real Sección de Biología Molecular, Servicio de Apoyo a la Investigación, Universidad de Murcia PCR a tiempo real (PCRrt) Aplicaciones: - Cuantificación de ácidos nucleicos (AQ). - Estudio
Más detallesPRACTICA Núm. 16 RECUENTO DE BACTERIAS MESOFILAS AEROBIAS EN AGUA PARA CONSUMO HUMANO
PRACTICA Núm. 16 RECUENTO DE BACTERIAS MESOFILAS AEROBIAS EN AGUA PARA CONSUMO HUMANO I. OBJETIVO Determinar la presencia de bacterias Mesófilas Aerobias en una muestra de agua potable por la técnica de
Más detallesvelocidades de movimiento mediante la aplicación de un campo eléctrico a través de una matriz porosa
INTRODUCCIÓN En general, la electroforesis es una técnica que separa las moléculas en base a sus diferentes velocidades de movimiento mediante la aplicación de un campo eléctrico a través de una matriz
Más detalles1 MATERIALES Y MÉTODOS
1 MATERIALES Y MÉTODOS El presente protocolo experimental contempla la amplificación del DNA de las bacterias y virus causantes de las ETS Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis y VPH mediante PCR
Más detalles3/22/2010. Iván Ferrer Rodríguez, PhD Catedrático. En el 1983, Kary Mullis dio a conocer la Técnica de reacción en cadena de la Polimerasa o PCR.
Iván Ferrer Rodríguez, PhD Catedrático En el 1983, Kary Mullis dio a conocer la Técnica de reacción en cadena de la Polimerasa o PCR. Síntesis "in vitro" de secuencias específicas de ADN son amplificadas.
Más detallesPROCEDIMIENTO DE EVALUACIÓN Y ACREDITACIÓN DE LAS COMPETENCIAS PROFESIONALES CUESTIONARIO DE AUTOEVALUACIÓN PARA LAS TRABAJADORAS Y TRABAJADORES
MINISTERIO DE EDUCACIÓN SECRETARÍA DE ESTADO DE EDUCACIÓN Y FORMACIÓN PROFESIONAL DIRECCIÓN GENERAL DE FORMACIÓN PROFESIONAL INSTITUTO NACIONAL DE LAS CUALIFICACIONES PROCEDIMIENTO DE EVALUACIÓN Y ACREDITACIÓN
Más detalles3. COMPONENTES. Tampón de electroforesis concentrado 2 x 50 ml 10 X (2 envases 500ml)
PCR SIMULADA Ref.PCR Simulada (4 prácticas) 1.OBJETIVO DEL EXPERIMENTO El objetivo de este experimento es introducir a los estudiantes en los principios y práctica de la Reacción en Cadena de la Polimerasa
Más detallesIII. Material genético. b. Composición y estructura del RNA.
III. Material genético b. Composición y estructura del RNA. RNA (ácido ribonucléico) Polímero de nucleótidos La pentosa de los nucleótidos es la Ribosa: en la posición 2' del anillo del azúcar hay un grupo
Más detallesMÉTODOS CROMATOGRÁFICOS: 1. Exclusión molecular 2. Intercambio iónico 3. Afinidad SSN
MÉTODOS CROMATOGRÁFICOS: 1. Exclusión molecular 2. Intercambio iónico 3. Afinidad SSN Propiedades de una proteína que son útiles para su purificación por cromatografía Peso molecular Carga iónica Hidrofobicidad
Más detallesLA ESTRATEGIA NACIONAL DE BOSQUES Y CAMBIO CLIMÁTICO
LA ESTRATEGIA NACIONAL DE BOSQUES Y CAMBIO CLIMÁTICO LA ESTRATEGIA NACIONAL DE BOSQUES Y CAMBIO CLIMÁTICO En palabras simples, el Cambio Climático es la modificación del clima que actualmente ocurre en
Más detallesPractica la genética Ficha didáctica del profesorado Bachillerato
Ficha didáctica del profesorado Bachillerato www.eurekamuseoa.es Extracción de ADN Cuál es la función de cada uno de los ingredientes utilizados para realizar la disolución tampón para la visualización
Más detallesMETABOLISMO CELULAR. Es el conjunto de reacciones químicas a través de las cuales el organismo intercambia materia y energía con el medio
METABOLISMO CELULAR Es el conjunto de reacciones químicas a través de las cuales el organismo intercambia materia y energía con el medio Reacciones Celulares Básicas. Los sistemas vivos convierten la energía
Más detallesPROTOCOLO DE EXTRACCIÓN DE MUESTRAS FRESCAS DE TEJIDO DE AVES PARA ESTUDIOS GENÉTICOS
PROTOCOLO DE EXTRACCIÓN DE MUESTRAS FRESCAS DE TEJIDO DE AVES PARA ESTUDIOS GENÉTICOS La mejor fuente de tejido fresco para la realización de estudios genéticos son los músculos. En el caso de aves la
Más detalles38. Purificación de ADN plasmídico y electroforesis del mismo en gel de agarosa
38. Purificación de ADN plasmídico y electroforesis del mismo en gel de agarosa José Luis Caballero Repullo, Enriqueta Moyano, Juan Muñoz Blanco Departamento de Bioquímica y Biología Molecular, Campus
Más detallesREACCIONES DE IONES METÁLICOS
Actividad Experimental 4 REACCIONES DE IONES METÁLICOS Investigación previa -Investigar las medidas de seguridad para trabajar con amoniaco -Investigar las reglas de solubilidad de las sustancias químicas.
Más detallesMezclado y Combinado. Molienda y Pulverizado. Tejido Homogeneización Lisis de la Célula. Agitación Vertical Única
Mezclado y Combinado Molienda y Pulverizado Tejido Homogeneización Lisis de la Célula Agitación Vertical Única Manipulación de Múltiples muestras desde 96 pocillos hasta tubos para centrífuga de 50 ml
Más detallesELECTROFORESIS EN GELES DE AGAROSA. Agustín Garrido. agugarrido@hotmail.com
1 ELECTROFORESIS EN GELES DE AGAROSA Agustín Garrido agugarrido@hotmail.com Introducción En este trabajo práctico se utilizó la técnica de electroforesis. Este proceso se basa en la migración de las moléculas
Más detallesFRAGMENTO OLIGO 5-3 Hebra SECUENCIA 5' - - > 3' TAMAÑO (pb) F1. hmtl 569 L AACCAAACCCCAAAGACACC hmth2982 H CTGATCCAACATCGAGGTCG
ANEXO 1 Protocolo para la PCR para la amplificación del mtdna en 10 fragmentos solapantes: Se prepara la siguiente mezcla: Tampón ( TRIS 100 mm, MgCl 2 12 mm, KCl 500 mm, ph 8,3): 10X dntps : 10 mm (cada
Más detallesDocumentos de la Red Nacional de Biobancos. Guía de protocolos utilizados para la obtención de ácidos nucléicos en biobancos
Documentos de la Red Nacional de Biobancos Guía de protocolos utilizados para la obtención de ácidos nucléicos en biobancos Septiembre 2012 Este documento ha sido elaborado con la participación de las
Más detallesDetección de IgE específica.
Detección de IgE específica. Una forma de identificar los alérgenos responsables de los síntomas alérgicos es la detección de anticuerpos IgE específicos frente a dichos alérgenos. Estos anticuerpos están
Más detallesEnzimas de restricción
BIOTECNOLOGIA Enzimas de restricción Endonucleasas que reconocen dianas específicas en el ADN Protegen a cada cepa de bacterias de otro ADN que no pertenece al sistema El ADN propio está protegido porque
Más detallesExtracción de DNA por el Método Adaptado de Drábek.
Extracción de DNA por el Método Adaptado de Drábek. El aislamiento de DNA constituye un paso esencial para la realización de estudios de tamizaje genético, análisis de polimorfismos genéticos, estudios
Más detallesTaqMan GMO Screening Kit. Part No: 4466334
TaqMan GMO Screening Kit Part No: 4466334 1. Introducción Los organismos modificados genéticamente (OMG) se encuentran ampliamente distribuidos, siendo la soja y el maíz los vegetales que ocupan mayor
Más detallesDETECCIÓN DE C. jejuni EN HAMBURGUESA DE POLLO POR PCR TRADICIONAL PRT-712.04-082
Página 1 de 5 1. OBJETIVO Detectar la presencia de Campylobacter jejuni en hamburguesa de pollo mediante técnica de PCR. 2. CAMPO DE APLICACIÓN Y ALCANCE Aplicar este procedimiento a muestras de hamburguesa
Más detallesPCR gen 18S ARNr humano
PCR gen 18S ARNr humano Ref.PCR18S 1.OBJETIVO DEL EXPERIMENTO El objetivo de este experimento es introducir a los estudiantes en los principios y práctica de la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR)
Más detallesRequisitos del semillero
Requisitos del semillero La tarea de la cama de siembra es proporcionar a la semilla las condiciones idóneas para una germinación rápida y uniforme. Esto requiere agua, aire, calor y un ambiente libre
Más detallesI. 15microlitros de agua esteril, perforar el pozo y diluir. II. Se tomaron 2 microlitros para la primera transformación.
23 de agosto 2007 Se comenzó la elaboración de la bitácora Medio LB Broth, Billar (Luria-Bertani) 25gr/litro Se preparó 500 mililitros agregando 12.5 gramos Se diluyó y esterilizó por autoclave Medio LB
Más detallesBiología Celular y Molecular. Guía de TP Nro. 3. Ensayos de proliferación, adhesión y migración celular in vitro.
Biología Celular y Molecular. Guía de TP Nro. 3 Ensayos de proliferación, adhesión y migración celular in vitro. Introducción La valoración de la proliferación celular y la citotoxicidad in vitro es, muchas
Más detallesExperimento con reactivos de la vida cotidiana!
Experimento con reactivos de la vida cotidiana Laura Martínez Martín- 1º Grado Genética - UAB Abril de 2015 1 Índice Introducción 3 Objetivos 3 Material. 3 Procedimiento 4 Explicaciones científicas del
Más detallesTraducido de Charles W. McMonnies Traducido y Adaptado por: Dr. Manuel Morión Grande. Avery C32011
! 1 SE TIENEN QUE FROTAR LAS LENTILLAS PA R A L I M P I A R L A S A N T E S D E GUARDARLAS EN SU ESTUCHE? Las investigaciones han mostrado que las lentillas deben ser frotadas y enjuagadas. Frotar y enjuagar
Más detallesEntender el funcionamiento de los relojes permitiría lidiar con ciertas patologías en humanos. 28 ACTUALIDAD EN I+D RIA / Vol. 41 / N.
28 ACTUALIDAD EN I+D RIA / Vol. 41 / N.º 1 Entender el funcionamiento de los relojes permitiría lidiar con ciertas patologías en humanos Abril 2015, Argentina 29 Relojes biológicos en plantas Ajustar el
Más detalles