UNIDAD 3: FUNCIONES, VECTORES Y LISTAS EN R

Transcripción

1 UNIDAD 3: FUNCIONES, VECTORES Y LISTAS EN R Técnicas Inteligentes en Bioinformática Máster en Lógica, Computación e Inteligencia Artificial Dpto. Ciencias de la Computación e Inteligencia Artificial Francisco J. Romero Campero Universidad de Sevilla

2 CONTENIDOS 1. Concepto de función 2. Vecotres en R 3. Listas en R

3 CONCEPTO DE FUNCIÓN o R contiene una amplia variedad de funciones. o Entenderemos una función un procedimiento que implementa un algoritmo que recibe unos datos de entrada (argumentos), realiza unas transformaciones y devuelve un dato de salida. o Los datos de entrada y salida pueden ser opcionales.

4 CONCEPTO DE FUNCIÓN o La sintaxis para ejecutar una función en R es la siguiente: función(arg1, arg2,,argn) Por ejemplo: x <- abs(-2) print(x) log(8,2) o También podemos realizar composición de funciones, por ejemplo: x <- -2 log <- log(8,abs(x))

5 EL SISTEMA DE AYUDA DE R o R es un lenguaje que se compone de una amplia variedad de funciones. o Podemos obtener ayuda sobre un tema mediante la función help( funcion ) help( c ) help( mean ) o La función help.search( tema ) nos permite realizar una búsqueda aproximada. o La función apropos( tema ) nos devuelve un listado de palabras relacionadas. o El comando?? tema tiene el mismo efecto que help.search

6 TIPOS DE DATOS o Simples: Numéricos Lógicos Caracteres Cadenas o Compuestos Vectores Matrices Marcos de datos Listas

7 TIPOS DE DATOS o Simples: Numéricos Lógicos Caracteres Cadenas o Compuestos Vectores Listas Matrices Marcos de datos

8 VECTORES: constructores o Un vector es una concatenación de datos Todos los datos deben de ser del mismo tipo Si los datos son de distintos tipos, R realiza una transformación automática. Cada dato recibe un índice según el orden en el que se concatenó (comenzando por 1) Podemos acceder a cada dato por su índice. o Para crear un vector usamos la función c() Ejemplo: datos <- c(2,1,3,-1,10,0,0,1)

9 VECTORES: constructores o En R existen expresiones para generar sucesiones de números: 1: : : :(10-1) o También podemos usar las funciones seq y rep

10 VECTORES: constructores o Función seq > seq(10) #mismo efecto que 1: > seq(3,10) #mismo efecto que 3: > seq(1,10, by=3) #saltando de 3 en

11 VECTORES: constructores o Función rep > rep(1:4,2) #repetimos 1:4 dos veces > rep(1:4,each=2) #repetimos 1:4 dos veces, #intercalando el resultado.

12 VECTORES: accesores y modificadores o Acceso a datos: # esto es un comentario datos #vector completo datos[1] #primer dato datos[-4] #todo menos el cuarto dato datos[c(1,3,5)] #posiciones 1, 3 y 5 datos[3:5] #posiciones 3 a 5 v <- datos>1 #vector lógico con true en la #posición i sii datos[i]>1 datos[v] #posiciones con true en el vector v o De manera análoga, podemos modificar los datos: datos[1] <- 23

13 VECTORES: accesores y modificadores o Podemos nombrar los elementos de un vector: > v = c(45,43,56,48,51) > names(v) <- c( Lun, Mar, Mie, Jue, Vie ) > v Lun Mar Mie Jue Vie > names(v) [1] Lun Mar Mie Jue Vie

14 VECTORES: funciones relevantes o Podemos utilizar sobre vectores las operaciones aritmético-lógicas descritas en la sección anterior. o La operación devolverá otro vector con los resultados tras aplicar la operación elemento a elemento. v1 <- c(5,1,5) v2 <- c(2,1,3) v1 == v2 FALSE TRUE FALSE v1 + v v1 == 5 TRUE FALSE TRUE

15 VECTORES: funciones relevantes o Algunas funciones útiles con vectores: length() min(), max() sum() mean(), median() sort() unique() which(), which.max(), which.min() plot() o Usar la función help para más información.

16 VECTORES: funciones relevantes o La función length() devuelve el tamaño de un vector. v <- c(5,10,0,0,2) length(v) 5 o Las funciones min() y max() devuelven respectivamente el elemento mínimo y máximo de un vector. min(v) 0 max(v) 10

17 VECTORES: funciones relevantes o La función sum() suma todos los elementos de un vector sum(v) 17 o Las funciones mean() y median() calculan respectivamente la media y la mediana de los elementos de un vector mean(v) 3.4 median(v) 2

18 VECTORES: funciones relevantes o La función sort() ordena los elementos de un vector sort(v) o La función unique()devuelve un vector sin elementos repetidos unique(v)

19 VECTORES: funciones relevantes o La función which()recibe una expresión que devuelve un vector lógico y devuelve los índices true del vector lógico. v > 3 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE which(v>3) 1 2 o Así podemos conocer los índices de los elementos de un vector que cumplen una determinada propiedad.

20 VECTORES: funciones relevantes o Las funciones which.min() y which.max() devuelven respectivamente los índices de los elementos mínimo y máximo de un vector. which.min(v) 3 which.max(v) 2

21 VECTORES: funciones relevantes o Las funciones que se aplican sobre datos numéricos, lógicos, caracteres o cadenas, también se pueden aplicar a vectores de estos datos. El resultado será un nuevo vector tras aplicar la función elemento a elemento. v1 <- c(9,5,10) sqrt(v1)

22 VECTORES: funciones relevantes o Si aplicamos una operación sobre vectores de diferente tamaño, el vector más corto se recicla o Ejemplo: > d <- c(2,4) > e <- c(1,3,5,7) > d+e [1]

23 TIPOS DE DATOS o Simples: Numéricos Lógicos Caracteres Cadenas o Compuestos Vectores Listas Matrices Marcos de datos

24 LISTAS: constructores Una lista es una colección de elementos que pueden ser de distintos tipos y que generalmente están identificados por un nombre. Para crear una lista se utiliza la función list > Lst <- list(hombre = "Pedro", mujer = "María", casados = TRUE, número.hijos = 3, edad.hijos = c(4, 7, 9))

25 LISTAS: accesores y modificadores Para obtener los elementos de una lista se utiliza el operador $ > Lst$hombre [1] Pedro > Lst$casados [1] TRUE > Lst$edad.hijos [1] 4 7 9

26 LISTAS: accesores y modificadores Utilizando los corchetes [ ] y vectores podemos obtener sublistas. > Lst[c("hombre", "número.hijos")] $hombre [1] "Pedro" $número.hijos [1] 3

27 LISTAS: accesores y modificadores También podemos usar un vector de valores lógicos > Lst[c(TRUE, FALSE, FALSE, TRUE, FALSE)] $hombre [1] "Pedro" $número.hijos [1] 3

28 LISTAS: accesores y modificadores Podemos acceder por los índices de la siguiente forma: > Lst[c(1, 4)] $hombre [1] "Pedro" $número.hijos [1] 3

29 LISTAS: accesores y modificadores Podemos poner índices negativos para no obtener los datos correspondientes: > Lst[c(-2, -3, -5)] $hombre [1] "Pedro" $número.hijos [1] 3

30 This work is licensed under the Creative Commons Attribution- NonCommercial NoDerivs 3.0 Unported License. To view a copy of this license, visit Estas transparencias están basadas en el material docente desarrollado por Francisco J. Romero Campero e Ignacio Pérez Hurtado de Mendoza para la asignatura Informática Aplicada a la Bioquímica del Grado Conjunto en Bioquímica por la Universidad de Sevilla y la Universidad de Málaga (Andalucía Tech). Este trabajo está liberado bajo la licencia Creative Commons Attribution-NonCommercial NoDerivs 3.0 Unported License.