FISH. Catálogo de sondas para Hibridación In Situ con Fluorescencia

Transcripción

1 FISH Catálogo de sondas para Hibridación In tu con Fluorescencia

2 NIMGenetics desarrolla productos genómicos que mejoran el diagnóstico clínico, el valor pronóstico y el manejo terapéutico, incrementando así la calidad de vida de los pacientes. En este contexto, lanzamos nuestro catálogo de productos (sondas de ADN y reactivos) para ensayos FISH (Hibridación In tu con Fluorescencia). Los ensayos FISH se realizan en Laboratorios de Genética, Anatomía Patológica o Hematología, entre otros, y se dirigen a identificar posibles alteraciones que afectan a un gen interés. En la práctica clínica, la elección de estos ensayos se debe a la rapidez y eficacia con la que detectan al gen candidato o sospechoso de intervenir en la enfermedad. Las sondas de ADN que se emplean para llevar a cabo estos ensayos están diseñadas en base al conocimiento de la secuencia del genoma humano. Por qué elegir las sondas de NIMGenetics? Asi nos diferenciamos Nuestras sondas de FISH, a diferencia de otros productos del mercado, están diseñadas desde una colección de oligonucléotidos de 80 pares de bases de longitud con cobertura en todo el genoma*. Basándonos en criterios científicos y clínicos, NIMGenetics ha generado a partir de esa colección, un catálogo único de sondas de FISH con doble y triple color que contienen de manera redundante el gen o la región de interés. Nuestras sondas se caracterizan por: 1. Alta Especificidad: al ser sondas generadas a partir de oligonucleótidos, y no de clones tipo BACs (Cromosomas Artificiales Bacterianos), entre otras ventajas, no contienen secuencias de ADN repetitivo por lo que ofrecen señales de alta especificidad que permiten una fácil interpretación. 2. Alta Precisión: las sondas están basadas en secuencias de pequeño tamaño (oligonucleótidos de 80 pares de bases) que permiten localizar reordenamientos con alta precisión, en comparación con la imprecisión de sondas obtenidas a partir de BACs que tienen de media un tamaño de pares de bases. 3. Alta Luminosidad: la introducción del marcaje durante el proceso de síntesis de la sonda hace que ésta adquiera un marcaje de alta luminosidad permitiendo una óptima visualización al microscopio. Por el contrario, las sondas procedentes de BACs tienen una menor intensidad al incorporar el marcaje mediante procesos enzimáticos posteriores a la síntesis. 4. Permanentemente Actualizadas: todos los nuevos avances científico-clínicos validados se plasmarán en la renovación y actualización automática del diseño de nuestras sondas, que estarán disponibles para nuestros clientes de forma inmediata. * Con el apoyo de Agilent Tech. Inc.

3 Qué servicios ofrecemos? 1. Catálogo orientado a Oncología y Onco-hematología (Médula ósea, sangre periférica y biopsias de Anatomía Patológica de material incluido en parafina). a. Sondas dirigidas a Gen o Alteración Única b. Kits de sondas por patología c. Sondas centroméricas y subteloméricas 2. Catálogo orientado para la Genética Clínica. a. Sondas dirigidas a Gen o Alteración Única b. Sondas centroméricas y subteloméricas Además, ofrecemos servicios como: 3. Crea tu propia sonda con tu propio gen y/o región de interés en tu propio formato/presentación. 4. Sondas pancentroméricas y panteloméricas (humanas y murinas) 5. Reactivos para FISH Sonda gen TP53 (señal roja). Centrómero Cr. 17 (señal verde) NIMGenetics diseña y valida las sondas NIMFISH, consiguiendo los más altos estándares de especificidad, precisión y luminosidad

4 Cómo te lo ofrecemos? Disponemos de varias opciones de trabajo con el objetivo de que el cliente obtenga el máximo rendimiento y eficacia. Por ello, ofrecemos, para todas nuestras sondas: 1. Presentación Lista para usar : Rápido y sencillo. Sondas y buffer conjuntamente optimizados y mezclados listos para su uso 2. Presentación Sonda + buffer de hibridación : Tú decides. quieres ser tú mismo quien realice la mezcla, este es tu formato. Además, dependiendo del número de veces que necesites utilizar nuestras sondas*, elige: 1. NIMFISH 10: Válido hasta para 10 usos. 2. NIMFISH 15: Utilízalas hasta 15 veces. Tumores SNC Región 1p36 (señal roja) Región 1q25 (señal verde) *Consultar con NIMGenetics para otros formatos.

5 ONCOLOGÍA - HEMATOLOGÍA Catálogo de sondas dirigidas a gen o alteración única CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color Funciona en FFPE NF-1001 IGH Breakapart NF-1002 BCL2 Breakapart NF-1003 ALK Breakapart NF-1003-CE ALK CE Breakapart NF-1004 ROS1 Breakapart NF-1004-CE ROS1 CE Breakapart NF-1005 RET Breakapart NF-1005-CE RET CE Breakapart NF-1006 TFE3 Breakapart NF-1007 ERG Breakapart NF-1008 FOXO1 (FKHR) Breakapart NF-1009 SS18 (SYT) Breakapart 3'-IGH 14q Verde 5'-IGH 14q Rojo 3'-BCL2 18q Rojo 3'-BCL2 18q Verde 3'-ALK 2p Rojo 5'-ALK 2p Verde 3'-ALK 2p Rojo 5'-ALK 2p Verde 3'-ROS1 6q Rojo 5'-ROS1 6q Verde 3'-ROS1 6q Rojo 5'-ROS1 6q Verde 3'-RET 10q Rojo 5'-RET 10q Verde 3'-RET 10q Rojo 5'-RET 10q Verde 3'-TFE3 Xp Rojo 5'-TFE3 Xp Verde 3'-ERG 21q Rojo 5'-ERG 21q Verde 3'-FOXO1 13q Rojo 5'-FOXO1 13q Verde 3'-SS18 18q Rojo 5'-SS18 18q Verde

6 CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color Funciona en FFPE NF-1010 EWSR1 Breakapart NF-1011 DDIT3 (CHOP) Breakapart NF-1012 MALT1 Breakapart NF-1013 BCL6 Breakapart NF-1015 C-MYC Breakapart NF-1016 MLL (KMT2A) Breakapart NF-1017 ETV6 Breakapart NF-1018 RARA Breakapart NF-1019 CBFB Inv(16)(p13.3q22) Breakapart NF-1020 BCL3 Breakapart NF-1021 CCDN1 Breakapart NF-1022 PDGFRB (5q33) Breakapart NF-2001 TP53 (p53) NF-2002 MET NF-2002-CE MET CE 3'-EWSR1 22q Rojo 5'-EWSR1 22q Verde 3'-DDIT3 12q Verde 3'-DDIT3 12q Rojo 3'-MALT1 18q Rojo 5'-MALT1 18q Verde 3'-BCL6 3q Rojo 5'-BCL6 3q Verde 3'-MYC 8q Verde 5'-MYC 8q Rojo 3'-MLL 11q Rojo 5'-MLL 11q Verde 3'-ETV6 12p Rojo 5'-ETV6 12p Verde 3'-RARA 17q Verde 5'-RARA 17q Rojo 3'-CBFB 16q Rojo 5'-CBFB 16q Verde 3'-BCL3 19q Rojo 5'-BCL3 19q Verde 5'-CCDN1 11q Rojo 3'-CCDN1 11q Verde 3'-PDFGRB 5q Rojo 5'-PDFGRB 5q Verde TP53 17p Rojo Chr17 Centrómero 436 Verde MET 7q Rojo Chr7 Centrómero 767 Verde MET 7q Rojo Chr7 Centrómero 767 Verde

7 CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color Funciona en FFPE NF-2003 del(5)(q31)/egr1 NF-2004 EGFR1 NF-2005 Her2 NF-2006 PTEN NF p/19q Codeletion NF-2009 MDM2 NF-2010 FGFR2 NF-2011 FGFR1 NF-2012 N-MYC NF-2013 CEP4/10/17 NF p/1q Myeloma NF-2015 CDKN2A del(9)(p21) NF-2016 IKZF1 NF-2017 del(13)(q14.3) EGR1 5q Rojo D5S630 5p Verde EGFR 7p Rojo Chr7 Centrómero 767 Verde HER2 17q Rojo Chr17 Centrómero 436 Verde PTEN 10q Rojo Chr10 Centrómero 676 Verde TPRG1L 1p Rojo ABL2 1q Verde ZNF443 19p Verde GLTSCR2 19q Rojo MDM2 12q Rojo Chr12 Centrómero 704 Verde FGFR2 10q Rojo Chr10 Centrómero 676 Verde FGFR1 8p Rojo Chr8 Centrómero 635 Verde MYCN 2p Rojo Chr2 Centrómero 448 Verde Chr4 Centrómero 613 Azul Chr10 Centrómero 676 Rojo Chr17 Centrómero 435 Verde CDKN2C 1p Verde CKSB1 1q Rojo CDKN2A 9p Rojo Chr9 Centrómero 367 Verde IKZF1 7p Rojo Chr7 Centrómero 767 Verde D13S319 13q Rojo Chr13 Centrómero 800 Verde

8 CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color Funciona en FFPE NF-2018 ATM ATM 11q Rojo del(11)(q22.3) Chr11 Centrómero 800 Verde NF-2019 D12Z3-CEP12 Chr12 Centrómero 704 Verde NF-2020 MYB, del(6)(q23) 3'-MYB 6q Rojo Chr6 Centrómero 265 Verde NF-2021 D9Z3/D15Z4 Chr9 Centrómero 367 Verde NF-2022 del(7)(q31)/ D7S486 7q Rojo D7S486 Chr7 Centrómero 767 Verde NF-2023 del(20)(q12) D20S108 20q Rojo Chr20 Centrómero 687 Verde NF-2024 CEP8 Chr8 CEP Centrómero 635 Rojo NF-2025 del(5)(q33)/csf1r CSF1R 5q Rojo D5S630 5p Verde NF-3001 ALK/EML4 Dual fusion ALK 2p Rojo EML4 2p Verde NF-3002 NCOA2/HEY1 Dual fusion NCOA2 8q Rojo HEY1 8q Verde NF-3003 IGH/CMYC Dual fusion MYC 8q Rojo NF-3004 IGH/BCL2 Dual fusion BCL2 18q Rojo NF-3005 IGH/CCND1 Dual fusion CCND1 11q Rojo NF-3006 IGH/MAF Dual fusion MAF 16q Rojo NF-3007 BCR/ABL1 Dual fusion BCR 22q Verde ABL 9q Rojo NF-3008 ETV6/RUNX1 (TEL/ ETV6 12p Rojo Dual fusion AML1) RUNX1 21q Verde NF-3009 TCF3/PBX1 Dual fusion PBX1 1q Rojo TCF3 19p Verde

9 CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color Funciona en FFPE NF-3010 PML/RARA Dual fusion NF-3011 RUNX1T1/RUNX1 (ETO/AML1) Dual fusion NF-3012 IGH/FGFR3 Dual fusion NF-3013 TMPRSS2/ERG Dual fusion NF-4001 NF-4002 TMPRSS2/ERG del(4)(q12) FIP1L1/CHIC2/ PDGFRA Tricolor Tri fusion PML 15q Rojo RARA 17q Verde RUNX1T1 8q Rojo RUNX1 21q Verde FGFR3 4p Rojo ERG 21q Verde TMPRSS2 21q Rojo 3'-ERG 21q Rojo 5'-ERG 21q Verde 5'-TMPRSS2 21q Azul FIP1L1 4q Verde CHIC2 4q Rojo PDGFRA 4q Azul ONCOLOGÍA - HEMATOLOGÍA Catálogo de kits de sondas por tipo de patología CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color Leucemia Linfática Crónica TP53 17p Verde TP53 (p53)/del(13)(q14.3) NF-5001 D13S319 13q Rojo ATM, del(11)(q22.3)/cep12 ATM 11q Verde Chr12 Centrómero 704 Rojo Mieloma Múltiple I 3'-IGH 14q Verde IGH Breakapart NF '-IGH 14q Rojo TP53 (p53) TP53 17p Rojo Chr17 Centrómero 436 Verde

10 CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color Mieloma Múltiple II TP53 (p53) TP53 17p Rojo Chr17 Centrómero 436 Verde IGH/CCND1 Dual fusion NF-5003 CCND1 11q Rojo IGH/MAF Dual fusion MAF 16q Rojo IGH/FGFR3 Dual fusion FGFR3 4p Rojo Mieloma Múltiple III TP53 (p53) TP53 17p Rojo Chr17 Centrómero 436 Verde IGH/CCND1 Dual fusion CCND1 11q Rojo NF-5004 IGH/MAF Dual fusion MAF 16q Rojo IGH/FGFR3 Dual fusion FGFR3 4p Rojo 1p/1q Myeloma CDKN2C 1p Verde CKSB1 1q Rojo ndromes Mielodisplásicos I EGR1 5q Rojo del(5)(q31)/egr1 NF-5005 D5S630 5p Verde del(7)(q31)/d7s486 D7S486 7q Rojo Chr7 Centrómero 767 Verde ndromes Mielodisplásicos II del(5)(q31)/egr1 EGR1 5q Rojo D5S630 5p Verde NF-5006 del(7)(q31)/d7s486 D7S486 7q Rojo Chr7 Centrómero 767 Verde CEP8 Chr8 Centrómero 635 Rojo del(20)(q12) D20S108 20q Rojo Chr20 Centrómero 687 Verde

11 GENÉTICA CLÍNICA Catálogo de sondas dirigidas a gen o alteración única CATÁLOGO NIM GEN / Región Diseño Gen Citobanda Tamaño (kb) Color Diagnóstico Prenatal RB1 13q Verde 13q14/21q22 DSCR8 21q Rojo NF-5007 Chr18 Centrómero 711 Azul CEP 18/X/Y ChrX Centrómero 587 Verde ChrY Centrómero 273 Rojo Síndromes de Microdeleción NF q11.2 DiGeorge TBX1 TBX1 22q Rojo Chr 22 Centrómero 668 Verde NF-2029 XIST (Xq13.2) XIST Xq Rojo Chr X Centrómero 587 Verde NF q11.2/D15S11 Prader Willi D15S11 15q Rojo Chr 15 Centrómero 265 Verde NF-2031 GABRB3/15q12 Prader Willi GABRB3 15q Rojo Chr 15 Centrómero 265 Verde NF-2032 KAL (Xp22.3) Kallman KAL1 Xp Rojo Chr X Centrómero 587 Verde NF-2033 YP11.3/SRY SRY Yp Rojo GENÉTICA CLÍNICA Catálogo de sondas centroméricas Cromosoma Diseño Centrómero CATÁLOGO NIM Color CEP1 NF-2035 Rojo/Verde Chr1 Subtelómero brazo p NF-2059 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2060 Rojo/Verde CEP2 NF-2036 Rojo/Verde Chr2 Subtelómero brazo p NF-2061 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2062 Rojo/Verde CEP3 NF-2037 Rojo/Verde Chr3 Subtelómero brazo p NF-2063 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2064 Rojo/Verde

12 Cromosoma Diseño Centrómero CATÁLOGO NIM Color CEP4 NF-2038 Rojo/Verde Chr4 Subtelómero brazo p NF-2065 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2066 Rojo/Verde CEP5 NF-2039 Rojo/Verde Chr5 Subtelómero brazo p NF-2067 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2068 Rojo/Verde CEP6 NF-2040 Rojo/Verde Chr6 Subtelómero brazo p NF-2069 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2070 Rojo/Verde CEP7 NF-2041 Rojo/Verde Chr7 Subtelómero brazo p NF-2071 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2072 Rojo/Verde CEP8 NF-2042 Rojo/Verde Chr8 Subtelómero brazo p NF-2073 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2074 Rojo/Verde CEP9 NF-2043 Rojo/Verde Chr9 Subtelómero brazo p NF-2075 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2076 Rojo/Verde CEP10 NF-2044 Rojo/Verde Chr10 Subtelómero brazo p NF-2077 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2078 Rojo/Verde CEP11 NF-2045 Rojo/Verde Chr11 Subtelómero brazo p NF-2079 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2080 Rojo/Verde CEP12 NF-2046 Rojo/Verde Chr12 Subtelómero brazo p NF-2081 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2082 Rojo/Verde CEP13 NF-2047 Rojo/Verde Chr13 Subtelómero brazo p NF-2083 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2084 Rojo/Verde CEP14 NF-2048 Rojo/Verde Chr14 Subtelómero brazo p NF-2085 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2086 Rojo/Verde

13 Cromosoma Diseño Centrómero CATÁLOGO NIM Color CEP15 NF-2049 Rojo/Verde Chr15 Subtelómero brazo p NF-2087 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2088 Rojo/Verde CEP16 NF-2050 Rojo/Verde Chr16 Subtelómero brazo p NF-2089 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2090 Rojo/Verde CEP17 NF-2051 Rojo/Verde Chr17 Subtelómero brazo p NF-2091 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2092 Rojo/Verde CEP18 NF-2052 Rojo/Verde Chr18 Subtelómero brazo p NF-2093 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2094 Rojo/Verde CEP19 NF-2053 Rojo/Verde Chr19 Subtelómero brazo p NF-2095 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2096 Rojo/Verde CEP20 NF-2054 Rojo/Verde Chr20 Subtelómero brazo p NF-2097 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF-2098 Rojo/Verde CEP21 NF-2055 Rojo/Verde Chr21 Subtelómero brazo p NF-2099 Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF Rojo/Verde CEP22 NF-2056 Rojo/Verde Chr22 Subtelómero brazo p NF Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF Rojo/Verde CEPX NF-2057 Rojo/Verde ChrX Subtelómero brazo p NF Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF Rojo/Verde CEPY NF-2058 Rojo/Verde ChrY Subtelómero brazo p NF Rojo/Verde Subtelómero brazo q NF Rojo/Verde

14 SONDAS DISEÑO ORIGINAL PARA FISH CATÁLOGO NIM Concepto Especificaciones Color NF-6000-X Disponibles según diseño del investigador Tamaño a elegir Formatos Variables NF-6001 Sonda PNA Pancentromérica Humana Marca todos los centromeros de todos los cromosomas Color Verde NF-6002 Sonda PNA Pantelomérica Humana Marca todos los telómeros de todos los cromosomas Color Verde NF-6003 Sonda PNA Pancentromérica Murina Marca todos los centromeros de todos los cromosomas Color Verde NF-6004 Sonda PNA Pantelomérica Murina Marca todos los telómeros de todos los cromosomas Color Verde Reactivos para FISH Muestras en Parafina CATÁLOGO NIM Concepto Formato NF-R1002 IQFISH Fast Hybridization Buffer tests NF-R1003 IQFISH Fast Hybridization Buffer 200x6 120-tests Reactivos para FISH Muestras de Citogenética CATÁLOGO NIM Concepto Formato NF-R1004 Hybridization Buffer 10-tests NF-R1005 Wash Buffer 1 500ml NF-R1006 Wash Buffer 2 500ml NF-R1007 Mounting Buffer without DAPI 10-tests NF-R1008 Mounting Buffer with DAPI 10-tests NF-R1009 FISH Hybridization Buffer and Mounting Buffer with DAPI 10-tests NF-R1010 FISH Hybridization Buffer and Mounting Buffer with DAPI 30-tests NF-R1011 FISH Hybridization Buffer and Mounting Buffer without DAPI 10-tests NF-R1012 FISH Hybridization Buffer and Mounting Buffer without DAPI 30-tests

15 INFORMACIÓN SOBRE FLUOROCROMOS Color Fluorocromo Especificaciones L.O. Excitación L.O. Emisión Rojo Orange Red 547 nm 565 nm Verde FITC 495 nm 517 nm Azul AQUA 429 nm 470 nm Sonda Deleción 5q31 Región 5q31 (señal roja) Región 5p15 control (señal verde) Sonda Breakapart Gen IGH 3 IgH (señal verde) 5 IgH (señal roja)

16 Parque Científico de Madrid Faraday, 7 (Campus de Cantoblanco) Madrid NIMGenetics es un centro de Diagnóstico Genético autorizado por la Consejería de Sanidad y Consumo de la Comunidad de Madrid, inscrito en el Registro correspondiente con el Nº CS Tel M info@nimgenetics.com