CARTERA DE SERVICIOS. (6ª edición) SERVICIO DE MICROBIOLOGÍA

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1 Página 1 de 30 CARTERA DE SERVICIOS (6ª edición) SERVICIO DE MICROBIOLOGÍA La cartera de servicios detallada a continuación se presenta en el formato histórico, empleado en la primera versión de fecha 10/10/04 y en sus posteriores revisiones. Esta revisión corresponde a la 6ª edición de la Cartera de Servicios.

2 Página 2 de 30 ELABORADO REVISADO Y APROBADO Jefe de Servicio Nombre/Firma Fecha Nombre/Firma Fecha Manuel Omeñaca Ana Isabel López 10/11/14 María José Revillo 10/11/14 Edición Fecha ALCANCE MODIFICACIONES /10/04 Edición inicial 02 17/01/06 Primera Revisión 03 30/04/08 Segunda Revisión (adenovirus en muestras s) 04 16/04/09 Tercera Revisión Modificar el tiempo de respuesta de Cultivo de virus, 14 días PCR de HSV,CMV;VVZ;VEB;VH6 ( 2 días) Carga viral de VHB ( 7 dias). PCR enterovirus en LCR ( 2 dias) Exudado de lesiones superficiales ( 5 días) s óseas y biopsias invasivas (7-10 días) Hongos dermatofitos 25 días Suprimir 3 pruebas reumáticas y PCR de VHC Añadir Serología de la enfermedad de Chagas Investigación de Schistosoma en orina Examen KOH en muestras hematológicas Investigación de metapneumovirus en muestras s Investigación de Ureaplasma y Micoplasma en muestras urogenitales y s 05 17/06/13 Modificar técnica Pneumocystis jirovecii Citomegalovirus Mycobacterium tuberculosis complex Micobacterias no tuberculosas Mycobacterium tuberculosis intra-complex de la sensibilidad de micobacterias no tuberculosas de la sensibilidad de M. tuberculosis a antibacterianos de 1ª línea Coxiella burnetti IgG e IgM Enterovirus Papilomavirus detección de alto riesgo Papilomavirus, genotipado 16,18,45 Chlamydia trachomatis Clostridium difficile (toxina) Borrelia burgdorferii (Lyme) Modificar tiempo de respuesta Borrelia burgdorferii (Lyme)

3 Página 3 de 30 Brucella Enterovirus Hongos dermatofitos Borrelia burgdorferi (ELISA) Brucella Hepatitis B, antígeno e (HbeAg) Hepatitis B, antígeno superficie (HbsAg) Treponema pallidum Yersinia enterocolitica (03 y 09 separadas) Yersinia pseudotuberculosis Toxoplasma gondii Trichinella spiralis Citomegalovirus Epstein Barr Epstein-Barr EBNA Hepatitis A Hepatitis D Herpes simple tipo 2 Herpes simple tipo 6 Parotiditis Sarampion Varicela Zoster Modificar muestra Mycobacterium tuberculosis complex Añadir Poliomavirus: carga viral de virus BK por PCR-TR Poliomavirus: detección de virus JC por PCR-TR Meningitis por Listeria Meningitis bacteriana del niño: E.coli+S.agalactiae Meningitis bacteriana del adulto: Haemophilus+S.pneumoniae Secuenciación 16S Secuenciación ITS Identificación de bacterias mediante espectrometría de masas Detección metalobetalactamasa Detección de carbapenemasa Tinción Auramina Micobacterias: resistencias a Rifampicina e Isoniacida Papilomavirus, genotipado 16,18,45 Gripe A Gripe A nueva Subtipado gripe: H1, H3, H Gripe B Gripe C Parainfluenza 1 Parainfluenza 2 Parainfluenza 3 Parainfluenza 4 Adenovirus respiratorio sincitial A,B Coronavrirus 229E Coronavirus OC43 respiratorio sincitial A respiratorio sincitial B Rinovirus

4 Página 4 de 30 Enterovirus Sarampion Rubeola Parvovirus B19 Herpes simplex, Varicela zoster (PCR-TR) Epstein-Barr carga viral (PCR-TR) Suprimir Citomegalovirus, antigenemia Coxiella burnetti (Fiebre Q) por Fijación de Complemento (F de C) Mycoplasma pneumoniae por F de C Pruebas reumaticas: Anti Dnasa B Adenovirus por F de C Citomegalovirus por F de C Influenza A por F de C Influenza B por F de C Leptospira por aglutinación Parainfluenza 1 por F de C Parainfluenza 2 por F de C Parainfluenza 3 por F de C Parotiditis por F de C Respiratorio sincitial (VRS) por F de C Sarampión por F de C Papillomavirus detección y cualificación de bajo riesgo HTLV 2 Astrovirus Mycobacterium avium/intracellulare complex Mycobacterium kansasii de la sensibilidad de M. tuberculosis a antibacterianos de 1ª línea en medios sólidos Hepatitis A cuantificada post-vacunación automatizada Herpes simple tipo 1 IgG automatizado 06 27/10/14 Se incluye el nº de edición de la cartera de servicios en el título. Se indican mediante un asterisco (*) las determinaciones incluidas en el alcance de la acreditación. Se indica en el apartado de consideraciones, y se añade enlace al alcance de acreditación. Se sustituye etest por tiras en la tabla 2.4 Pruebas de sensibilidad antibiótica. COPIA nº 1 asignada al Servicio de Microbiología Este documento es propiedad del Servicio de Microbiología del Hospital Universitario Miguel Servet. La información en él contenida no podrá reproducirse total ni parcialmente sin autorización escrita del Responsable. Las copias no registradas no se mantienen actualizadas a sus destinatarios.

5 Página 5 de 30 Esta cartera de servicios tiene la finalidad de proporcionar al solicitante información de los servicios ofrecidos en el Servicio de Microbiología del Hospital Universitario Miguel Servet. Con el fin de ayudar en la interpretación de su contenido se aportan algunas definiciones, junto con consideraciones internas. Nos comprometemos a mantener permanentemente actualizado este documento a partir de las necesidades y sugerencias manifestadas por nuestros clientes, así como a partir de la evolución de la ciencia y de la tecnología. Por ello, establecemos cauces de comunicación eficaz con los clientes que permitan recoger y trasladar sus recomendaciones a nuestros servicios. Definiciones: Servicio: Resultado que ofrece el Laboratorio a requerimiento de sus diversos clientes. : Prueba o conjunto de pruebas de tipo físico, químico o biológico que conducen a un resultado. La determinación puede constituir un servicio por sí misma. Una determinación puede estar constituida por una o varias pruebas. Técnica: Forma genérica de realizar una determinación y obtener el resultado de la misma entre posibles alternativas y que refiere a equipamiento, método o materiales utilizados. Método: Modo de hacer un ensayo sistemáticamente y con un orden

6 Página 6 de 30 Consideraciones 1. Se pretende aportar las posibilidades del Servicio de Microbiología respecto a la realización de servicios y determinaciones. 2. Se pretende, igualmente, trasladar los plazos de tiempo necesarios para la realización de cada servicio o determinación. 3. Tiempo máximo de determinación es el plazo en que el solicitante tendrá el informe con el resultado final de cada servicio. En el caso de varios servicios solicitados, este tiempo puede estar condicionado por la combinación de los mismos o por el resultado parcial obtenido de algunos de los servicios solicitados. 4. El valor de este plazo se ha establecido atendiendo a la mayoría de las muestras analizadas, pudiendo darse desviaciones en muestras concretas. 5. Los tiempos reflejados en el documento hacen referencia al momento de la expedición del informe por parte del Servicio de Microbiología. Para algunos destinatarios este plazo puede verse incrementado en función de la organización de la distribución. 6. En la valoración de los plazos se consideran días hábiles. 7. Se indica, mediante asterisco, las determinaciones incluidas en el alcance de acreditación (disponible en: 8fb4ac8f1546)

7 Página 7 de 30 ÍNDICE 1. SERVICIO DE TÉCNICAS DIAGNÓSTICAS 1.1 EXÁMENES DIRECTOS 1.2 DETECCIÓN DE ANTÍGENOS MICROBIANOS 1.3 MICROBIOLOGÍA MOLECULAR 1.4 CULTIVOS 1.5 DETECCIÓN DE ANTICUERPOS 2. SERVICIO DE LABORATORIO DE REFERENCIA 2.1 IDENTIFICACION ANTIGENICA 2.2 IDENTIFICACION BIOQUIMICA 2.3 OTRAS DETERMINACIONES 2.4 SENSIBILIDAD ANTIBIOTICA 3. SERVICIO DE INTERCONSULTAS 4. SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCIÓN NOSOCOMIAL 5. SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCIÓN DE LA COMUNIDAD 6. OTROS SERVICIOS 7. OTRAS ACTIVIDADES

8 Página 8 de SERVICIO DE TÉCNICAS DIAGNÓSTICAS 1.1 Exámenes directos EXÁMENES EN FRESCO Exámenes en Fresco: Bacterias respuesta (días) Chancro sifilítico Genitales <1 Exudados Exámenes en Fresco: Hongos respuesta (días) Examen con KOH Pelo, piel, uña 3 Hongos Examen KOH s hematológicas <1 Hongos Exámenes en Fresco: Parásitos respuesta (días) Examen en fresco Parásitos o fragmentos Heces, Vómicas, Parásitos Ectoparásitos Larvas (miasis) Estructuras parasitarias, 1 Otras muestras Schistosoma Orina, Biopsia 2 Orina Trichomonas Vaginales 1 Exudados Test de Graham (Oxiuros) Papel de celo 1 Parásitos

9 Página 9 de 30 Tinciones respuesta (días) Tinción Gram* Todas 1 Todas Tinción Tinta china LCR 1 Hemocultivos Tinción Ziehl-Neelsen* Todas 1 Micobacterias Tinción Auramina* Todas 2 Micobacterias Tinciones parasitarias Tinción ácido resistente Cryptosporidium, Cyclospora, Isospora Heces, s, biliares. respuesta (días) 2 Parásitos Tinción Microsporidium Heces 2 Parásitos Gota gruesa Plasmodium Sangre (EDTA) 2 Parásitos Microfilarias Sangre (EDTA), ojo <2 Parásitos Leihsmania Biopsia de piel, Raspados,Punción medular 2 Parásitos 1.2 Detección de antígenos microbianos Detección de antígenos: Bacterias Clostridium difficile (toxina) Heces 2 Gastrointestinal Haemophilus influenzae b LCR 1 Hemocultivos Helicobacter pylori Heces 1 Gastrointestinal Legionella pneumophila Orina 1 Respiratorio Neisseria meningitidis LCR 1 Hemocultivos Streptococcus pneumoniae Orina 1 Respiratorio LCR Hemocultivos Detección de antígenos: Hongos Aspergillus fumigatus Suero 3 Serología

10 Página 10 de 30 (antígeno galactomanano) Cryptococcus neoformans LCR/suero 1 Hemocultivos Pneumocystis (carinii) jiroveci Respiratorio 2 Respiratorio Detección de antígenos: Parásitos Técnica Entamoeba histolytica ELISA Heces 2 Parásitos Plasmodium spp ICT Sangre con EDTA 1 Parásitos T.cruzi (Chagas) ICT Suero 7 Serología Detección de antígenos: Adenovirus Heces, Respiratoria 1 Hepatitis B, antígeno e Suero Serología (HbeAg)* Hepatitis B, antígeno Suero 2 Serología superficie (HbsAg)* Hepatitis D* Suero Serología Influenza (Gripe) tipo A* Respiratoria 1 Influenza (Gripe) tipo B* Respiratoria 1 Metapneumovirus* Respiratoria 1 Parainfluenza 1* Respiratoria 1 Parainfluenza 2* Respiratoria 1 Parainfluenza 3* Respiratoria 1 Respiratorio sincitial * Respiratoria 1 Rotavirus* Heces 2 Gastrointestinal VIH (antígeno p24)* Suero 1 Serología

11 Página 11 de Microbiología Molecular Técnica Tiempo para realización determinación (días) Borrelia burgdorferi PCR Suero 4 Chlamydia trachomatis Citomegalovirus carga viral (cuantificación)* Detección metalobetalactamasa Detección de carbapenemasa Epstein-Barr (carga viral) neurotropos (Herpes simplex, Varicela, CMV, Herpes 6,Epstein-Barr) Herpes simplex, Varicela Zoster PCR-RT Ex. Uretral, cervical, ocular PCR-RT Plasma, LCR PCR-Múltiple Aislado 4 PCR-Múltiple Aislado 4 PCR-RT PCR PCR-RT LCR, plasma, suero LCR, suero, plasma, orina, muestras s, vesículas. Plasma,suero, LCR, humor vítreo, lesiones vesiculares Herpes 7 PCR LCR, plasma. 4 Herpes 8 PCR LCR, suero, plasma, orina, muestras s, vesículas. Enterovirus PCR-RT LCR, plasma. 1 Hepatitis B virus carga viral (cuantificación)* Hepatitis C virus carga viral (cuantificación)* Área funcional Biología Molecular Biología molecular Tipado molecular bacteriano Tipado molecular bacteriano Biología molecular Biología Molecular Biología molecular Biología Molecular Biología Molecular Biología Molecular PCR Suero, plasma Serologia PCR-RT Suero Biología Molecular

12 Página 12 de 30 Técnica Hepatitis C virus (genotipo) Leishmania PCR, lipa PCR Suero, amplicón Sangre total, plasma Tiempo para realización determinación (días) 15 4 Área funcional Biología Molecular Biología Molecular Meningitis bacteriana del niño: E.coli+S.agalactiae PCR-RT LCR 2 Hemocultivos Meningitis bacteriana del adulto: PCR-RT LCR 2 Hemocultivos H.influenzae+S.pneumoniae Meningitis por Listeria PCR-RT LCR 2 Hemocultivos Mycobacterium tuberculosis complex* Mycobacterium tuberculosis complex* Mycobacterium tuberculosis intra-complejo* Micobacterias no tuberculosas* Micobacterias: resistencias a Rifampicina e Isoniacida Papilomavirus detección de alto riesgo* Papilomavirus, genotipado 16,18,45* Pneumocystis jirovecii Poliomavirus: carga viral virus BK Poliomavirus: detección virus JC Secuenciación 16S Secuenciación ITS VIH, carga viral (cuantificación)* VIH (determinación de resistencia a antivíricos) Amplificación Hibridación Hibridación reversa Hibridación reversa Hibridación reversa Hibridación reversa Hibridación molecular Hibridación molecular PCR-Nested Todas menos sangre Micobacterias Aislado Micobacterias Aislado Micobacterias Aislado Micobacterias Todas menos sangre endocervical endocervical s s PCR-RT Plasma, suero 21 PCR-RT Plasma, suero 21 PCR+secuen ciacion PCR+secuen ciación PCR, tiempo real Aislado Aislado Plasma, LCR Micobacterias Tipado molecular fúngico Biología Molecular Biología Molecular Tipado molecular bacteriano Tipado molecular bacteriano Biología Molecular PCR Secuenciación Plasma, LCR 30 Biología Molecular

13 Página 13 de 30 Técnica Gripe A PCR-Múltiple Gripe A nueva PCR-Múltiple Subtipado gripe: H1, H3, H PCR-Múltiple Gripe B PCR-Múltiple Gripe C PCR-Múltiple Parainfluenza 1 PCR-Múltiple Parainfluenza 2 PCR-Múltiple Parainfluenza 3 PCR-Múltiple Parainfluenza 4 PCR-Múltiple Adenovirus PCR-Múltiple respiratorio sincitial A,B PCR-Múltiple Coronavrirus 229E PCR-Múltiple Coronavirus OC43 PCR-Múltiple respiratorio sincitial A PCR-Múltiple respiratorio sincitial B PCR-Múltiple Rinovirus PCR-Múltiple Enterovirus PCR-Múltiple Sarampion PCR-Múltiple Frotis oral, orina Rubeola PCR-Múltiple Frotis oral, orina Parvovirus B19 PCR-Múltiple Frotis oral, orina Tiempo para realización determinación (días) 14 Área funcional

14 Página 14 de Cultivo Cultivo muestras de Aparato Genital y Urinario s genitales Exudados: vaginal, endocervical, uretral, 5 Exudados de pene, de glande s genitales Aspirado endometrial Exudados s genitales de gestantes Exudado vaginal, anal 4 Exudados (Cribado Streptococcus agalactiae) Orina (Urocultivo) Micción media, orina de uréter, aspiración suprapúbica, punción sonda vesical, punción renal, nefrostomía. 3 Urocultivos Semicuantitativos: Estudio de prostatitis Semen, líquido prostático, orina 4 Urocultivos Cultivo: Heces Coprocultivo (Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter, Aeromonas) Heces, hisopo rectal 4 Gastrointestinal

15 Página 15 de 30 Cultivo muestras Epidemiología Controles de esterilidad Control de portadores (SARM*, Bacilos Gram (-) multiresistentes, Salmonella, enterococos vancomicina resistentes...) Unidades formadoras de colonia Control bacteriológico Ambientales Material clínico 5 Epidemiología Exudado nasal, inguinal... Heces... 4 Epidemiología Agua de dialisis 5 Epidemiología Hemoderivados negativo 15 contaminado o positivo Epidemiología Cultivo muestras Exudados Biopsias Renal, cutánea Pulmonar -14 Exudados Hemocultivos Respiratorio Exudado de lesiones profundas y abscesos con búsqueda de anaerobios Heridas profundas, absceso pulmonar, cerebral, mamario, mediastínico, hepático, renal... Exudados Hisopos periféricos de recién nacido, Exudado conjuntival, ótico, nasal, faríngeo y umbilical 1-3 Hemocultivo Exudado de lesiones superficiales sin búsqueda de anaerobios Heridas y lesiones superficiales 5 Exudados s óseas Punción/aspiración con aguja fina (PAAF) Esternal, vertebral, tibial, cubital, femoral, radial...injertos e implantes óseos Renal, Hepática, Pulmonar y Ganglionar 7-10 Exudados -14 Exudados Respiratorio

16 Página 16 de 30 Cultivo: Hemocultivos y catéteres Catéteres y otros dispositivos Alimentación parenteral, conexiones de catéter diálisis (Semicuantitativos: Maki) peritoneal 5 Hemocultivos Hemocultivo convencional* Sangre 8 Hemocultivos Hemocultivo de infección específica: endocarditis, Sangre 15 Hemocultivos brucelosis, micosis* LCR LCR 3 Hemocultivos Líquidos orgánicos estériles Sinovial, ascítico, biliar, mediastínico, pericárdico, peritoneal, CAPD... Hemocultivos, Cultivo s Respiratorio s s (cultivo convencional) s s estériles s s (cuantificado)* s s vías altas u otorrinolaringológicas Esputo, esputo inducido, aspirado bronquial, aspirado traqueal, Líquido pleural, PAAF pulmonar, biopsia Aspirados bronquiales lavado broncoalveolar cepillo telescopado esputo mucoviscidosis EPOC bronquiectasias Exudado nasal, faríngeo, ótico Punción/aspiración de senos 5 3 Respiratorio Respiratorio Respiratorio Respiratorio s oculares Exudado conjuntival 3 Respiratorio Raspado corneal, s oculares humor vítreo, humor Respiratorio acuoso Cultivo Bacterias especiales Actinomyces Pleural, conjuntival, abscesos 14 Respiratorio, Exudados

17 Página 17 de 30 Bordetella Ex. nasofaríngeo (pernasal) (toma en el laboratorio) Respiratorio Aspirado nasofaríngeo E. coli O:157 H:7 Heces 4 Gastrointestinal Helicobacter Mucosa gástrica 10 Gastrointestinal Legionella s s 10 Respiratorio Micobacterias* Nocardia Ureaplasma, Micoplasma Biopsias, huesos, LCR, sangre, líquidos orgánicos, piel, orina, esputo, jugo gástrico.. s s, abscesos s urogenitales, Aspirado bronquial Negativos 80 Positivos Micobacterias Respiratorio, Exudados Respiratorio, Exudados, Urocultivos Vibrio cholerae Heces 4 Gastrointestinal Cultivo Hongos Hongos: levaduras s s, genitales y otras 7 Exudados, Hemocultivos, Hongos, Respiratorio Hongos: Miceliales s s y otras 21 Hongos Hongos dermatofitos* Pelo, piel, faneras Hongos Blastomyces dermatitidis, Cladophialophora bantiana, Coccidioides immitis, Histoplasma capsulatum, Paracoccidioides brasiliensis Otros s s Biopsias LCR Heces Hongos en relación con Centro Nacional de Microbiología Cultivo Parásitos Parásitos (larvas de nematodos) Parásitos (Amebas de vida libre) Heces 6 Parásitos s oculares 6 Parásitos Parásitos (Trichomonas) s urogenitales Exudados

18 Página 18 de 30 Cultivo Adenovirus s s, conjuntivales 14 Citomegalovirus Sangre completa orina, s Enterovirus (Echovirus, Coxsackie virus, Enterovirus, Poliovirus) Faríngea, heces, liq. pericárdico, LCR 14 Herpes simplex 1 y 2 Frotis lesiones, líquido vesicular, muestras s. biopsia cerebral Parainfluenza virus 1, 2 y 3 Asp. nasofaríngeo faríngeo 14 Parotiditis virus Saliva, faríngeo 14 Respiratorio sincitial virus Asp. nasofaríngeo, faríngeo 14 Rinovirus Asp. nasofaríngeo, faríngeo 14 Sarampión virus Faríngeo, orina 14 Varicela-zoster virus Líquido vesicular LCR. 21 de la gripe (Influenza virus A y B)* Asp. Nasofaríngeo F. faríngeo Detección de anticuerpos Detección de anticuerpos Bacterias Técnica Tipo de muestra Bartonella henselae IFI Suero 7 Serología Bartonella quintana IFI Suero 7 Serología Borrelia burgdorferii (Lyme) ELISA Suero/LCR 7 Serologia Borrelia burgdorferii (Lyme) Brucella Western-Blot Suero/LCR 7 Serologia Aglutinación, Coombs, Rosa de Bengala. Suero/LCR 3 Serología

19 Página 19 de 30 Técnica Tipo de muestra Chlamydia pneumoniae ELISA Suero 7 Serología Chlamydia psittaci ELISA Suero 7 Serología Coxiella burnetti (Fiebre Q fase I y fase II) IFI Suero 7 Serología Coxiella burnetti IgG e IgM ELISA Suero 7 Serología Legionella pneumophila (serogrupos 1 a 8) IFI Suero 7 Serología Mycoplasma pneumoniae Técnica rápida(igm) Suero 1 Serología Rickettsia conorii(igg) IFI(IgG) Suero 4 Serología Treponema pallidum (no treponémicos)* RPR, VDRL SueroLCR 2 Serología Treponema pallidum Ac totales Suero/LCR (treponémicos)* (automatizada) Suero 2 Serología Suero/LCR Treponema pallidum FTA IgG (treponémicos)* Suero 5 Serología Treponema pallidum (treponémicos)* Yersinia enterocolitica (03 y 09 separadas) Yersinia pseudotuberculosis ELISA IgM Suero 7 Serología Aglutinación Suero 3 Serología Aglutinación Suero 3 Serología Detección de anticuerpos Parásitos Técnica Tipo de muestra Entamoeba histolytica IFI Suero 7 Serología Hidatidosis Echinococcus Hemaglutinación Suero 7 Serología granulosus Leishmania infantum IFI Suero 7 Serología Taenia solium (cisticercosis) ELISA Suero/LCR 10 Serología Toxoplasma gondii* IgG total automatizada Suero/LCR 2 Serología Toxoplasma gondii* IgG IFI Suero/LCR 7 Serología Toxoplasma gondii* IgM Automatizada Suero 3 Serología Toxoplasma gondii* Avidez Automatizada Suero 7 Serología Toxoplasma gondii* IgA ELISA Suero 7 Serología

20 Página 20 de 30 Técnica Tipo de muestra Trichinella spiralis ELISA(IgG) Suero 10 Serología T.cruzi (Chagas) ICT Suero 7 Serología T.cruzi (Chagas) ELISA(IgG) Suero 7 Serología

21 Página 21 de 30 Detección de anticuerpos Técnica Tipo de muestra Citomegalovirus* IgG Automatizada Suero 2 Serología Citomegalovirus* IgM Automatizada Suero 2 Serología Epstein Barr* IgM Automatizado Suero 2 Serología Epstein barr* IgG Automatizada Suero 2 Serología Epstein-Barr EBNA IgG Automatizada Suero 7 Serología Hepatitis A* IgM Automatizada Suero 2 Serología Hepatitis A* IgG Automatizada Suero 2 Serología Hepatitis B Diagnóstico* Automatizada Suero 3 Serología Hepatitis B Preoperat. Precat. Embarazo etc* Hepatitis B* Automatizada Suero 2 Serología Cuantificación post-vacuna automatizada Suero 2 Serología Hepatitis C* IgG automatizada Suero 2 Serología Hepatitis C* Dot Blot (IgG Ac frente a proteínas) Suero 7 Serología Hepatitis D* IgG o IgM ELISA Suero 10 Serología Herpes simple total* IgG Automatizado Suero 2 Serología Herpes simple total* IgM Automatizado Suero 2 Serología Herpes simple tipo 2 IgG (ELISA) Suero 7 Serología Herpes simple tipo 6 IgG (ELISA) Suero 7 Serología Herpes simple tipo 6 IgM (ELISA) Suero 7 Serología HTLV,1-2 IgG ELISA Suero Serología Parotiditis IgG (ELISA) Suero 7 Serología Parotiditis IgM ELISA Suero 7 Serología Parvovirus IgG IFI Suero 7 Serología Parvovirus IgM IFI Suero 7 Serología Rubéola* IgG automatizada Suero 2 Serología Rubéola* IgM automatizada Suero 2 Serología Sarampión IgG (ELISA) Suero 7 Serología Sarampión IgM ELISA Suero 7 Serología Varicela Zoster IgG (ELISA) Suero 7 Serología Varicela Zoster IgM (ELISA) Suero 7 Serología VIH 1,2,O* Automatizado Suero 2 Serología VIH( Ac frente a proteínas VIH-1+2)* Western Blot (IgG) Suero 7 Serología VIH Antígeno* Semiautomatizada Suero 3 Serología VIH ( Ac frente a proteínas VIH-2)* Western Blot (IgG) Suero 7 Serología

22 Página 22 de 30 Automatizada IFI: ELISA: WB (Western Blot): RPR VDRL: FTA IgG Técnica rápida: Quimioluminiscencia y derivados (electroquimioluminiscencia) Inmunofluorescencia Indirecta (manual) Enzimoinmunoensayo (manual) o semiautomatizada Ac frente a las proteínas específicas (semiautomatico) Ac no específicos de Treponema (manual) Inmunofluorescencia Indirecta con Ag treponémico (manual) Aglutinación en pocillo preparado comercial (manual)

23 Página 23 de 30 2 SERVICIO DE LABORATORIO DE REFERENCIA TÉCNICAS DIAGNÓSTICAS 2.1 Pruebas de identificación antigénica Técnica Tipo de muestra Bordetella pertussis Aglutinación Aislado 1 Respiratorio Escherichia coli 0157 Aglutinación Aislado 1 Gastrointestinal Haemophilus influenzae Aglutinación Aislado 1 Respiratorio Legionella pneumophila Aglutinación Aislado 1 Respiratorio Listeria monocytogenes Aglutinación Aislado 1 Hemocultivos Neisseria meningitidis Aglutinación Aislado 1 Hemocultivos Salmonella Aglutinación Aislado 1 Gastrointestinal Shigella Aglutinación Aislado 1 Gastrointestinal Streptococcus Aglutinación Aislado 1 Exudados agalactiae Estreptococo betahemolítico Aglutinación Aislado 1 Todas (C, D, E, F,G) Mycobacterium tuberculosis complex Inmunocromatografía Aislado 1 Micobacterias 2. 2 Pruebas de identificación bioquímica u otros métodos Identificación bioquímica de bacterias* Identificación de bacterias mediante espectrometría de masas* Identificación de otras micobacterias distintas de M. tuberculosis (convencional) Identificación de hongos filamentosos (convencional) Identificación de hongos levaduriformes (convencional) Identificación de Entamoeba histolytica Identificación de virus por inmunofluorescencia directa, a partir de monocapa Cepa tras aislamiento respuesta (días) Aislado 2 3 Aislado, Hemocultivo positivo 2 3 Todas Todas Aislado 15 Micobacterias Aislado 15 Aislado 3 Todas Todas Parásito 1 Parásitos Aislado 1

24 Página 24 de 30 Cepa tras aislamiento respuesta (días) Identificación de virus por otras técnicas Aislado Otras determinaciones Estudios epidemiológicos en Micobacterias Técnica RFLP, Spoligotyping Cepa tras aislamiento Área funcional Aislado 15 Micobacterias Identificación de Micobacterias* PRA (PCR) Aislado Micobacterias 2. 4 Pruebas de sensibilidad antibiótica Técnica Cepa tras aislamiento Antibiograma por difusión* Difusión disco placa Aislado 2 Todas Detección de ß-lactamasa Disco Aislado 1 Todas de la CMB Microdilución en caldo Aislado 3 Todas de la CMI de antibióticos en caldo* Microdilución Aislado 2 Todas de la CMI de antibióticos por difusión con tiras * de la sensibilidad de Nocardia de la sensibilidad de M. tuberculosis a antibacterianos de 1ª línea en medios líquidos fluorometricos (automatizada) de la sensibilidad de micobacterias no tuberculosas por difusión de la sensibilidad de micobacterias no tuberculosas por difusión con E-test de la sensibilidad de micobacterias no tuberculosas de la sensibilidad a antifúngicos por difusión en agar Difusión en placa Aislado 2 Todas Área funcional Difusión Aislado 4 Respiratorio Medio líquido automatizado Difusión en placa Difusión en placa Microdilución en caldo Difusión en placa Aislado 10 Micobacterias Aislado 3 Micobacterias Aislado 3 Micobacterias Aislado Micobacterias Aislado 3 Todas

25 Página 25 de 30 (hongos levaduriformes) de la CMI de antifúngicos por microdilución en caldo (manual o automatizada) (hongos levaduriformes) de la CMI de antifúngicos por difusión con E- test (hongos levaduriformes) de la CMI de antifúngicos por difusión con E- test (hongos filamentosos) de la sensibilidad a antivíricos en VIH Técnica Cepa tras aislamiento Microdilución Aislado 3 Todas Difusión Aislado 3 Todas Difusión Aislado 10 Todas PCR Sangre con EDTA 30 Área funcional Biología Molecular

26 Página 26 de SERVICIO DE INTERCONSULTAS Tipo respuesta (días) Preventivas 1 Todas Diagnósticas 1 Todas Terapéuticas 1 Todas Interpretación y valoración de los informes microbiológicos 1 Todas

27 Página 27 de SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCION NOSOCOMIAL 1. Colaboración en la implantación de programas de vigilancia y control de la infección hospitalaria. 2. Colaboración en el diseño, control y evaluación de la profilaxis antimicrobiana. 3. Colaboración en el diseño, control y evaluación de la política de antimicrobianos. 4. Colaboración en la detección e intervención en brotes epidémicos. 5. Detección y colaboración en la prevención de la aparición de microorganismos con resistencia de especial riesgo clínico. 6. Participación en la Comisión de Infecciones del Hospital. 7. Estudio de la prevalencia de la resistencia a los antimicrobianos en el hospital.

28 Página 28 de SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCION DE LA COMUNIDAD 1. Informes de aislamientos con significado epidemiológico. 2. Información de la prevalencia de la patología infecciosa en la comunidad. 3. Colaboración en la prevención de las enfermedades transmisibles en la comunidad. 4. Colaboración en la elaboración de protocolos.

29 Página 29 de OTROS SERVICIOS 1. Obtención de muestras especiales 2. Envío de muestras a laboratorios de referencia 3. Informes epidemiológicos 4. Informes estadísticos 5. Informes de gestión 6. Archivo y custodia de muestras biológicas y aislamientos microbianos

30 Página 30 de OTRAS ACTIVIDADES 1. Formación postgraduada - Residentes - Residentes de otros hospitales 2. Formación personal técnico 3. Programa de Formación Continuada 4. Participación institucional en Comisiones Clínicas hospitalarias 5. Línea de investigación consolidada en Mycobacterias con varios proyectos de investigación en desarrollo 6. Protocolos microbiológicos: De diseño propio Participación en estudios multicéntricos Protocolos clínicos hospitalarios