Estructura y Fuentes del Sistemas de Información Geográfica BIOSIG

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1 Estructura y Fuentes del Sistemas de Información Geográfica BIOSIG Laboratorio Biología Evolutiva de Vertebrados Departamento de Ciencias Biológicas Universidad de los Andes Elaborado por: Carlos A. Pedraza

2 ESTRUCTURA Y FUENTES DEL SISTEMAS DE INFORMACIÓN GEOGRÁFICA BIOSIG 1 INTRODUCCIÓN. 3 ACCEDIENDO A LOS DATOS ESPACIALES 4 ESTÁNDAR PARA LA ORGANIZACIÓN DE ARCHIVOS EN EL EQUIPO DE DATOS (SIG) 4 DIRECTORIO DE ARCHIVOS GRÁFICOS 5 DIRECTORIO BASES 5 DIRECTORIO MXD 5 DIRECTORIO PROYECTOS EN USO 5 DIRECTORIO PROYECTOS TERMINADOS 7 DESCRIPCIÓN DE LA INFORMACIÓN BASE. 7 DIRECTORIO DAAC (DISTRIBUITED ACTIVE ARCHIVE FOR BIOGEOCHEMICAL DYNAMICS). 9 DIRECTORIO DMA (DEFENSE MAPPING AGENCY) 10 DIRECTORIO ETTER (MAPA DE GENERAL DE ECOSISTEMAS DE COLOMBIA 1998) 11 DIRECTORIO GOVINDASAMY_ET_AL_2003 (FUTURO CAMBIO CLIMATICO) 11 DIRECTORIO IAVH (INSTITUTO ALEXANDER VON HUMBOLDT) 12 DIRECTORIO LANDSAT (LAND + SATELLITE) 12 DIRECTORIO NATURESERVE 13 DIRECTORIO PMIP2000 (PALEOCLIMATE MODELLING INTERCOMPARISION PROJECT PHASE II) 13 DIRECTORIO POLITICO_ADMINISTRATIVO ESRI 14 DIRECTORIO SRTM (SHUTTLE RADAR TOPOGRAPHY MISSION) 14 DIRECTORIO WORLDCLIM (VARIABLES CLIMÁTICAS GLOBALES) 14 DIRECTORIO WWF (WORLD WILDLIFE FOUNDATION) 15 2

3 Introducción. Los conjuntos de datos contenidos en los sistemas de información geográfica permiten ser desplegados, analizados y presentados como resultados sobre mapas, documentos y otros productos. Estos productos obtenidos pueden ser desplegados con múltiples capas y otros tipos de información que interactúan y son analizados (i.e. análisis, modelamientos y consultas). La confiabilidad de los procesos y productos dependen en gran medida de la integridad de la información. Con la finalidad de mantener la integridad de la información almacenada y generada se organizó la información relacionada con los sistemas de información geográfica del Departamento de Ciencias Biológicas en una estructura que permite su almacenamiento y consulta manteniendo su integridad. Este documento describe la estructura en la que se encuentra almacenada la información espacial, y describe la información contenida para que los investigadores puedan conocer su utilidad. La información espacial se encuentra en los formatos de archivo de la casa comercial ESRI que para los archivos de puntos líneas y polígonos es Shapefile y en el caso de los archivos tipo raster (imágenes de satélite, modelos digitales de elevación del terreno, etc.) están en el formato GRID. Para la consulta, despliegue y análisis de la información espacial se sugiere el uso del programa ArcGis (Tabla 1), cuyo uso esta disponible para el Departamento de Ciencias Biológicas dentro del campus. Actualmente, se cuenta con la última versión ArcGis

4 Tabla 1. Requerimientos mínimos para el uso de ArcGis. Requerimientos mínimos Plataforma PC-Intel Sistema operativo Windows Vista (Ultimate, Enterprise, Business, Home Premium), Windows 2000, o Windows XP (Home Edition and Professional) Memoria virtual Procesador 1 GB RAM 1.6 GHz Accediendo a los datos espaciales Estándar para la organización de archivos en el equipo de datos (SIG) La función principal de el equipo SIG es la de almacenar toda la información correspondiente a BIOSIG que se ha adquirido, generado y que actualmente se encuentra en procesamiento. A continuación se presenta la estructura de los datos contenidos en SIG y que corresponden a seis carpetas. La estructura está basada en los estándares presentados en el documento Sistema de información espacial V 1.0 (Mateus-S et al. 2006). Al equipo SIG que contiene los datos espaciales se debe acceder por medio del explorador de Windows al equipo (Universi-575fe8) que se encuentra en el Grupo_trabajo, se debe crear una conexión de red a la carpeta SIG con el nombre de la conexión debe ser B:\. Para esto se debe navega ra través de la Red de Microsoft Windows a Grupo_trabajo, ubicar la carpeta SIG, botón derecho y seleccionar conectar a red. La conexión de red debe llamarse B:\. Esto es importante para que se puedan abrir los archivos de proyecto (.mxd) y se pueda enlazar a los archivos SIG depositados en el servidor de información. Una vez creada la conexión de red, se accede al programa ArcCatalog y en la barra de herramientas se oprime el botón de conectar a carpeta. En el diálogo de selección de carpeta se señala la conexión B:\ creada y se da aceptar. De esta manera se puede observar la ubicación de los datos espaciales, ver sus metadatos y tener una vista previa de éstos. 4

5 Directorio de archivos gráficos La carpeta archivos_graficos, contiene diferentes salidas gráficas producidas con la información contenida en las bases SIG, e.g. mapas para anexar a documentos, informes, artículos, etc. Los archivos gráficos se encuentran en formatos jpg y pdf. Estos archivos están disponibles para el uso de los usuarios. Directorio bases En la carpeta bases se encuentran los datos espaciales adquiridos de diferentes fuentes y que se encuentran disponibles en diferentes tipos de formato. En la sección Información Base SIG se describe en detalle la información base contenida y su estructura. Directorio MXD La carpeta mxd almacena los archivos de proyecto del programa ArcGis. Los archivos.mxd guardan información de las rutas a la información base y la forma en que ésta fue desplegada previamente por un usuario. Por ejemplo, en un proyecto con un área de estudio definido se quiere ver los tipos de ecosistemas naturales y la cercanía de estos a procesos antrópicos. La información de ecosistemas se despliega con colores de acuerdo a sus atributos de ecosistemas, sobre éstos se despliegan los centros poblados, carreteras y sistemas productivos. Cada una de estas capas de información se despliega en un orden definido y con símbolos y colores definidos por el usuario. Al crear un archivo mxd se guarda la información de cuáles capas fueron desplegadas, el orden del despliegue y la forma en que se representaron los atributos de los datos que el usuario inicialmente definió para la información. De esta manera, la información del proyecto se puede guardar para que en el futuro cualquier usuario en cualquier equipo del campus pueda desplegar la información sin necesidad de volver a llamar los archivos originales y definir las reglas para desplegar los datos. Directorio proyectos en uso En la carpeta proyectos en uso se almacena la información de los proyectos que se encuentran en curso y que son compartidos por diferentes usuarios. La información de los proyectos que no comparten usuarios debe almacenarse en equipos locales de los investigadores. Se sugiere que los proyectos locales 5

6 tengan la siguiente estructura de carpetas: archivos_graficos, mxd, bases, documentos, tablas, resultados y temporal. (Ver Figura 1) Figura 1. Estructura de los directorios BIOSIG. 6

7 Directorio proyectos terminados En esta carpeta se almacenan aquellos proyectos finalizados. La estructura interna de cada uno de los proyectos debe contener la estructura de directorios archivos_graficos, bases, tablas, mxd, tablas, resultados, documentos y temporal. La información contenida debe representar los resultados del proyecto, una vez revisados los archivos finales y haber eliminado los archivos temporales. Descripción de la información base. La carpeta base almacena información cartográfica básic y temática que es frecuentemente utilizada en proyectos. La información base proviene de la fuente primaria, por lo que en ningún caso la información contenida en este directorio debe ser modificada. La inclusion de información en este directorio debe hacerse previa verificación por parte de los administradores. A continuación se presenta una breve descripción de la información base contenida en BIOSIG, donde se especifica la ubicación en el equipo SIG, resumen general y la fuente de los datos. Los datos base de corresponden a información adquirida y almacenada por BIOSIG y que esta disponible para los usuarios. La información se encuentra contenida dentro del directorio Base y está organizada en carpetas nombradas por las instituciones fuente. Por ejemplo: IGAC, WORLDCLIM; IDEAM, etc. (Ver Figura 2). Actualmente, las bases de datos contienen información de 18 fuentes que ocupan 44 gigas de espacio en disco, en la que se encuentra in formación acerca de distribución de especies, variables climáticas, suelos, ecosistemas, cuerpos de agua, límites político administrativos, toponimias, etc. 7

8 Figura 2.Estructura de almacenamiento de las bases BIOSIG. 8

9 Directorio daac (Distribuited Active Archive for Biogeochemical Dynamics). El Oak Ridge National Laboratory Distributed Active Archive Center (ORNL DAAC) es financiado por la NASA y es fuente de datos y modelos biogeoquímicos y ecológicos. La información almacenada ha sido obtenida a partir de datos de campo, vuelos, satélites y modelos computarizados. Los datos y modelos varían de escalas locales a globales, y series temporales que varían de días a años. La base de datos y modelos de esta fuente es extensa, por lo que la información contenida en BIOSIG sólo corresponde a la información que se ha almacenado de acuerdo a los requerimientos de investigaciones. La información corresponde al Global Gridded Surfaces of Selected Soil Characteristics (IGBP-DIS), que es un grupo de siete variables descriptivas del suelo con cobertura global a una resolución de 5 arcos de segundo (10 km * 10 km). Los datos corresponden a las siguientes variables: la densidad de carbono en el suelo, la densidad total de nitrógeno, field capacity (es la cantidad de agua contenida en el suelo), wilting point (valor mínimo de húmedad que requiere la planta para no marchitarse), profile available water capacity, thermal capacity y bulk density. El formato de los datos es GRID ESRI y se encuentran en el sistema de coordenadas geográficas WGS84. Para mayor información, ver los archivos de texto asociados a cada una de las variables, los metadatos en la aplicación ArcCatalog y/o el archivo igbp-surfaces.html. Los datos se encuentran en la siguiente ubicación: B:\bases\daac\soil\IGBP-SurfaceProducts. Directorio dcw (Digital Chart of the World) La cartografía digital del mundo fue desarrollada por la US Defense Mapping Agency (DMA) la versión disponible es la obtenida a partir de vuelos realizados en 1993 a una escala de 1: con una cobertura global. En la cartografía disponible se encuentra la división política administrativa de los países, centros poblados, vías, cuerpos de agua, entre otras. Los datos están organizados en geodatabase por países, en el caso de Brasil se encuentra por estados (Ver Figura). Esta información es útil para la georeferenciación de localidades de registros biológicos y la generación de archivos gráficos. 9

10 Capas disponibles Tipo Nombre del archivo Límites internacionales Lineas PONET Centros poblados Poligonos PPPOLY Centros poblados Puntos PPPOINT Vías ferreas Lineas RRLINE Vías Lineas RDLINE Utilidades Lineas UTLINE Drenajes Lineas DNNET Drenajes Puntos DNPOINT Hipsografía Lineas HYNET Hipsografía Puntos HYPOINT Hipsografía Liineas HSLINE Coberturas Poligonos LCPOLY Coberturas Puntos LCPOINT Localidades oceanicas Puntos OFPOINT Localidades oceanicas Lineas OFLINE Fisiografía Lineas PHLINE Aeronauticas Puntos AEPOINT Localidades culturales Poligonos CLPOLY Localidades culturales Puntos CLPOINT Localidades culturales Lineas CLLINE Estructura de transporte Lineas TSLINE Estructura de transporte Puntos TDPOINT Vegetación Poligonos VGPOLY Los datos están en el sistema de coordenadas WGS84 y se encuentran en la siguiente ubicación B:\bases\dcw. Directorio dma (Defense mapping agency) Esta fuente contiene la cartografía digital para Colombia generada por el Departamento de defensa (DoD) de los Estados Unidos. El levantamiento de la cartografía digital dma fue realizado entre 1968 y La información disponible (con restricciones) en planchas TLM (Topographic line map) con una escala de 1: e intervalos de curvas de nivel de 80 metros. La información de las planchas se encuentra en varios cuadrantes que dividen a Colombia. Para visualizar las zonas que cubren cada uno de los cuadrantes se debe abrir el archivo de proyecto dma_colombia (B:\mxd\dma_colombia_100k.mxd). Esta información es útil para la georeferenciación de localidades de registros biológicos y la generación de archivos gráficos. 10

11 Los datos se encuentran en el sistema de coordenadas WGS84 y en la siguiente ubicación B:\bases\dcw. Los datos de las planchas dma requieren autorización para su uso, favor contactar a biosig@uniandes.edu.co Directorio etter (Mapa de general de ecosistemas de Colombia 1998) El Mapa General de Ecosistemas Colombianos publicado por Etter (1998) escala 1: , se basa en las coberturas vegetales para aproximarse a definir los diferentes ecosistemas de Colombia. En este mapa se utilizó el sistema de clasificación propuesto por Walter (1980), con aplicación al caso colombiano (Etter 1998). En este se tiene en cuenta primero la GeoBiosfera (Ecosistemas terrestres), luego utiliza el concepto de «BIOMA» para áreas homogéneas fueron ubicadas dentro de tipos generales de ecosistemas y dentro de los cuales se presentan diversos ecosistemas. En total Etter obtuvo 21 Biomas y 62 ecosistemas naturales a nivel nacional (IAvH 2004). Los datos se encuentran en el sistema de coordenadas WGS84 y en la siguiente ubicación B:\bases\etter\ecosistemas_1998. Directorio govindasamy_et_al_2003 (Futuro cambio climatico) Estos son los resultados de simulaciones de alta resolución a nivel global de un escenario de cambio climatico bajo un modelo de circulación atmosférica general CCM3 para el año Para mayor información a cerca del desarrollo de este producto ver el articulo B:\bases\govindasamy_et_al_2003\future_ccm3_model\govindasamy_et_al_200 3_high_resolution_simulations_global_change.pdf. La información de clima corresponde a las capas de precipitación promedio anual, temperatura promedio, temperatura maxima y minima anual para Colombia a una resolución de 10 Km. Los datos se encuentran en el sistema de coordenadas WGS84 y en la siguiente ubicación B:\bases\govindasamy_et_al_2003\future_ccm3_model\. Directorio hydro1k (HYDRO1K Elevation Derivate Database) Esta es una base de datos geográfica que contiene información topográfica derivada del modelo digital de elevación del terreno del mundo GTOP30 que se 11

12 encuentra a una resolución de 30 arcos de segundo. La información climática corresponde a las cuencas hidrográficas y los cuerpos de agua para Sur América. Las información para el resto del mundo esta disponible en la página web ( y se integrara a la base biosig según requerimientos. Los datos se encuentran en el sistema de coordenadas WGS84 y en la siguiente ubicación B:\bases\hydro1k\ Directorio IAvH (Instituto Alexander von Humboldt) El directorio iavh contiene información desarrollada por la unidad de SIG del Instituto Alexander von Humboldt (IAvH). Actualmente, se cuenta con el mapa de ecosistemas de los Andes colombianos año 2000 a una escala de 1: , obtenido a partir de la integración de coberturas, morfopedologia y clima. Los atributos que contiene el mapa de ecosistemas de los andes colombianos son tipo de bioma, bioma y ecosistema. (ver Rodríguez, N., Armenteras, D., Morales, M. y Romero, M. (2004). Ecosistemas de los Andes Colombianos. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Bogotá, Colombia. 155p.) Los datos se encuentran en el sistema de coordenadas WGS84 y en la siguiente ubicación B:\bases\iavh\ecos_andes_2000\ecos_andes_wgs84 Directorio LANDSAT (Land + satellite) El directorio LANDSAT contiene información a cerca de las imágenes se satellite disponibles y que han sido recopiladas en colaboración con el Laboratorio de Botánica y Sistemática y el Laboratorio de Ecología de Bosques Tropicales y Primatología. Este es uno de los principales productos del programa de observación de la tierra liderado por la NASA. El banco de imagenes es de cobertura global, sin embargo en la base disponible actualmente s se encuentran las imágenes disponibles para Colombia que van desde el año 1972 hasta el Los sensores utilizados obtienen información del espectro visible así como de infrarojo, también imagenes termales y pancromaticas. Las imagenes estan distribuidas en cuadrantes que estan distribuidos en path y rows para su ubicación, cada uno de los cuadrantes tiene un tamaño de 185 * 185 Km, y una resolución en la mayoria de las bandas 30 metros. En el caso del satellite L7 hay disponible una banda pancromática de resolución de 15 metros. 12

13 Para poder visualizar las imagenes disponibles para diferentes zonas y fechas para Colombia se debe abrir el archivo B:\mxd\landsat.mxd, el cual contiene los poligonos que corresponden a los cuadrantes de las imagenes, y los mapas municipales, de centros poblados y altitud. Con esta información el ususario ouede ubicar la zona de interes y observar los atributos de la información de los cuadrantes (archivo wrs2_poly) que contiene información a cerca de tipo de sensor utilizado para obtener la imagen, la fecha de adquisición de la imagen, nubosidad y la ubicación de la imagen en la estructura de BIOSIG. Para mayor información contactarse con biosig@uniandes.edu.co o entrar a la pagina del Global Land Cover Facility ( Directorio NatureServe El directorio natureserve contiene información a cerca de la distribución de sistemas ecologicos de Amerca Latina y el Caribe, así como de la distribución de de Anfibios, Aves y Mamíferos para el hemisferio occidental. El mapa de sistemas esta ubicado en: B:\base\natureserve\sistemas_ecologicos. En esta misma ubicación se puede encontrar la documentación que describe en detalle al producto. Los mapas de distribución de especies estructurados por grupos anfibios, aves y mamíferos, y dentro de cada grupos las distribuciones estan agrupadas por familias. La documentación de estos productos se encuentran en las carpetas de cada uno de los grupos. Anfibios: B:\base\natureserve\anfibios Aves: B:\base\natureserve\aves Mamíferos: B:\base\natureserve\mamiferos Directorio pmip2000 (Paleoclimate Modelling Intercomparision Project Phase II) Este directorio contiene información paleoclimática estimada a partir de modelos climaticos de hace años durante el ultimo máximo periodo glacial en el Pleistoceno (Paleoclimate Modeling Intercomparison Project: Las variables 19 variables climáticas tienen una extension que va desde el sur de Norte América y hasta el límite sur de Sur América y esta a una resolución de 5 Km por pixel. 13

14 Los datos se encuentran en el sistema de coordenadas WGS84 y en la siguiente ubicación B:\bases\pmip_2000 Directorio politico_administrativo ESRI Este directorio contiene los límites político administrativos de países, que están disponibles con la aplicación ArcView adquirida para el departamento. Los límites están distribuidos en las carpetas Africa, Americas, Asia, Mundo, Norte America y Sur America. Los datos se encuentran en el sistema de coordenadas WGS84 y en la siguiente ubicación B:\bases\politico_administrativo. Directorio SRTM (Shuttle Radar Topography Mission) Este directorio almacena productos e información derivada del proyecto Shuttle Radar Topographic Mission (SRTM). La información base corresponde al modelo digital de elevación del terreno para Colombia, esta información topográfica esta a un tamaño de pixel de 90 metros (B:\bases\srtm\dem_90) y otro remuestreado para un tamaño de pixel de 1 Km (B:\bases\srtm\dem_90). A partir del modelo digital de elevación del terreno se calcularon los mapas de pendiente y aspecto. Los datos se encuentran en el sistema de coordenadas WGS84. Directorio worldclim (Variables climáticas globales) Worldclim es una serie de información climáticas a nivel global, compuesta por 19 mapas en formato grid de variables continuas. Estas son útiles para el mapeo y el modelamiento espacial en programas GIS y otros. La generación de las variables estan descritas en Hijmans et al (articulo disponible en Las variables disponibles fueron calculadas a partir de datos climáticos obtenidos entre , para tres areas (Colombia, sur América y centro-sur América a una resolución de 1 Km 2 por pixel. Los nombres de cada una de las variables para cada uno las variables estan contenidos en el archivo: B:\bases\worldclim\ \variables.txt 14

15 Directorio wwf (World Wildlife Foundation) Este directorio contiene la cobertura que describe las 825 ecoregiones terrestres a nivel global definidas por WWF (2004). Las ecoregiones son unidades generales que contienen diferentes ensamblajes de comunidades naturales y especies cuyos límtes se acercan a los límites naturales que definian las comunidades antes del cambio de uso de la tierra. 15

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