CATÁLOGO DE CITOGENÉTICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR

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1 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 1 de 18 CATÁLOGO DE CITOGENÉTICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR

2 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 2 de 18 INDICE Cariotipo en sangre periférica Cariotipo en líquido amniótico Cariotipo en restos abortivos Cariotipo en biópsia corial Estudio básico de aneuploidias en sangre periférica Estudio básico de aneuploidias en líquido amniótico Estudio básico de aneuploidias en restos abortivos Estudio básico de aneuploidias en saliva o mucosa geniana Estudio de microdeleciones del cromosoma Y Consentimiento informado

3 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 3 de 18 CARIOTIPO EN SANGRE PERIFERICA Muestra: mínimo 2.5 ml de sangre en un tubo de heparina de litio (tapón verde) Criterios de rechazo que impiden el procesamiento de la muestra: muestra de sangre sin identificar o ilegible, muestra en tubo incorrecto, muestras y petición con datos no coincidentes, muestras estropeadas (tubo roto o derramado) Criterios que originan una anotación u observación en el informe de resultado: muestra con poco volumen, muestra hemolizada, muestra ictérica, muestra coagulada. Conservación: refrigerada. Tiempo de respuesta: 40 dias en caso de muestras rutinarias 7 días en caso de muestras urgentes Método analítico: Cultivo celular de la muestra. Análisis microscópico de metafases obtenidas. Significado clínico: Prueba encaminada a detectar anomalías numéricas de todos los cromosomas y anomalías estructurales que superen un tamaño de 10 MB. Tipo de informe: Numero de metafases estudiadas Cariotipo informado Estudio citogenetico Facultativo responsable Fotografia representativa del caso Informe provisional: En caso de demora en el resultado o ampliación del estudio por parte de Genética se emitirá un informe provisional para el conocimiento del facultativo peticionario.

4 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 4 de 18 Envio del informe definitivo: Peticiones procedentes del Área Oeste: Al facultativo peticionario en el Hospital o en los Centros de Salud. Peticiones procedentes de otros Hospitales de la CCAA de Castilla y León: a través de la web interna de Sacyl a la persona encargada por el Jefe de Servicio de Análisis Clínicos de cada Hospital. El resultado citogenetico se conserva en el programa de información del laboratorio recogido junto con el dia de emisión del informe definitivo. Modificacion de informes: Se abrirá la petición en el sistema de información del laboratorio en caso que estuviera cerrada, se desvalidara el informe haciendo click sobre el circulo de color morado situado en la parte superior izquierda del informe, se harán las modificaciones pertinentes validando el informe en el circulo color verde claro. Se notificara telefónicamente a los facultativos implicados, clínicos y licenciados especialistas del Servicio de Análisis Clínicos. Limitaciones de la técnica: Falta de crecimiento celular (consumo de medicamentos, ausencia de linfocitos en la muestra enviada), mosaicos en bajo grado, contaminación de cultivos, alteraciones no visibles por citogenética convencional, mala calidad de las metafases.

5 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 5 de 18 CARIOTIPO EN LIQUIDO AMNIOTICO Muestra: 20 ml en 2 tubos de 10 ml. El estudio se realizara independientemente de la cantidad de liquido remitida. Criterios de rechazo que impiden el procesamiento de la muestra: muestra de líquido sin identificar o ilegible, muestra en tubo incorrecto, muestras y petición con datos no coincidentes, muestras estropeadas (tubo roto o derramado) Criterios que originan una anotación u observación en el informe de resultado: muestra con poco volumen, muestra hemolizada, muestra ictérica, muestra coagulada. Conservación: temperatura ambiente (no refrigerar nunca). Tiempo de respuesta: el tiempo de respuesta recomendado por la Sociedad Española de Ginecología y Obstetrica debe ser inferior a 21 días en un cariotipo que no precise de estudios adicionales. Método analítico: Cultivo celular de la muestra. Análisis microscópico de metafases obtenidas. Significado clínico: Prueba encaminada a detectar anomalías numéricas de todos los cromosomas y anomalías estructurales que superen 10 MB. Tipo de informe: Numero de metafases estudiadas Numero de cultivos independientes analizados Cariotipo informado Estudio citogenético Facultativo responsable Fotografia representativa del caso

6 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 6 de 18 Informe provisional: En caso de demora en el resultado o ampliación del estudio por parte de Genética se emitirá un informe provisional para el conocimiento del facultativo peticionario. Envio del informe definitivo: Peticiones procedentes del Área Oeste: Al facultativo peticionario en el Hospital o en los Centros de Salud. Peticiones procedentes de otros Hospitales de la CCAA de Castilla y León: a través de la web interna de Sacyl a la persona encargada por el Jefe de Servicio de Análisis Clínicos de cada Hospital. El resultado citogenetico se conserva en el programa de información del laboratorio recogido junto con el dia de emisión del informe definitivo. Modificacion de informes: Se abrirá la petición en el sistema de información del laboratorio en caso que estuviera cerrada, se desvalidara el informe haciendo click sobre el circulo de color morado situado en la parte superior izquierda del informe, se harán las modificaciones pertinentes validando el informe en el circulo color verde claro. Se notificara telefónicamente a los facultativos implicados, clínicos y licenciados especialistas del Servicio de Análisis Clínicos. Limitaciones de la técnica: Falta de crecimiento celular, mosaicos en bajo grado, contaminación de cultivos, alteraciones no visibles por citogenética convencional, mala calidad de las metafases.

7 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 7 de 18 CARIOTIPO EN RESTOS ABORTIVOS Muestra: Tejido Muestras adicionales que podrían ser requeridas: muestra de sangre materna 2.5 ml de sangre en un tubo EDTA-K3 (tubo tapón morado) Criterios de rechazo que impiden el procesamiento de la muestra: muestra sin identificar o ilegible, muestra en tubo incorrecto, muestras y petición con datos no coincidentes, muestras estropeadas (tubo roto o derramado), características morfológicas de la muestra procedentes de muestra materna Criterios que originan una anotación u observación en el informe de resultado: muestra escasa. Conservación: temperatura ambiente Tiempo de respuesta: un mes siempre que se produzca crecimiento celular Método analítico: Cultivo celular de la muestra. Análisis microscópico de metafases obtenidas. Significado clínico: Prueba encaminada a detectar anomalías numéricas de todos los cromosomas y anomalías estructurales que superen 10 MB. Tipo de informe: Numero de metafases estudiadas Numero de cultivos independientes analizados Cariotipo informado Estudio citogenetico Facultativo responsable Fotografia representativa del caso

8 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 8 de 18 Informe provisional: En caso de demora en el resultado o ampliación del estudio por parte de Genética se emitirá un informe provisional para el conocimiento del facultativo peticionario. Envio del informe definitivo: Peticiones procedentes del Área Oeste: Al facultativo peticionario en el Hospital o en los Centros de Salud. Peticiones procedentes de otros Hospitales de la CCAA de Castilla y León: a través de la web interna de Sacyl a la persona encargada por el Jefe de Servicio de Análisis Clínicos de cada Hospital. El resultado citogenetico se conserva en el programa de información del laboratorio recogido junto con el dia de emisión del informe definitivo. Modificacion de informes: Se abrirá la petición en el sistema de información del laboratorio en caso que estuviera cerrada, se desvalidara el informe haciendo click sobre el circulo de color morado situado en la parte superior izquierda del informe, se harán las modificaciones pertinentes validando el informe en el circulo color verde claro. Se notificará telefónicamente a los facultativos implicados, clínicos y licenciados especialistas del Servicio de Análisis Clínicos. Limitaciones de la técnica: Falta de crecimiento celular (decalaje superior a 1 semana entre ausencia de latido cardiaco y realización de legrado), mosaicos en bajo grado, contaminación de cultivos, alteraciones no visibles por citogenética convencional, mala calidad de las metafases.

9 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 9 de 18 CARIOTIPO EN VELLOSIDAD CORIAL Muestra: Vellosidad corial en medio de transporte específico Criterios de rechazo: no existen ya que la vellosidad corial se realiza en consulta de ginecología con presencia de personal cualificado en la técnica de la Unidad de Citogenetica, Conservación: temperatura ambiente Tubo o contenedor adicional: tubo de polipropileno con EDTA-K 3 (tapón morado, tubo hemograma) de 3.5 ml. Muestra mínima de 1 ml de sangre materna para comprobar trazabilidad y que la muestra de biopsia no coincide al 100% con muestra materna. Tiempo de respuesta: un mes siempre que se produzca crecimiento celular. En ocasiones no se produce crecimiento celular, posible contaminación con material de origen materno. Método analítico: Cultivo celular de la muestra. Análisis microscópico de metafases obtenidas. Significado clínico: Prueba encaminada a detectar anomalías numéricas de todos los cromosomas y anomalías estructurales que superen 10 MB. Tipo de informe: Numero de metafases estudiadas Numero de cultivos independientes analizados Cariotipo informado Estudio citogenetico Facultativo responsable Fotografia representativa del caso Informe provisional: En caso de demora en el resultado o ampliación del estudio por parte de Genética se emitirá un informe provisional para el conocimiento del facultativo peticionario.

10 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 10 de 18 Envio del informe definitivo: Peticiones procedentes del Área Oeste: Al facultativo peticionario en el Hospital o en los Centros de Salud. Peticiones procedentes de otros Hospitales de la CCAA de Castilla y León: a través de la web interna de Sacyl a la persona encargada por el Jefe de Servicio de Análisis Clínicos de cada Hospital. El resultado citogenetico se conserva en el programa de información del laboratorio recogido junto con el dia de emisión del informe definitivo. Modificacion de informes: Se abrirá la petición en el sistema de información del laboratorio en caso que estuviera cerrada, se desvalidara el informe haciendo click sobre el circulo de color morado situado en la parte superior izquierda del informe, se harán las modificaciones pertinentes validando el informe en el circulo color verde claro. Se notificara telefónicamente a los facultativos implicados, clínicos y licenciados especialistas del Servicio de Análisis Clínicos. Limitaciones de la técnica: Falta de crecimiento celular, mosaicos en bajo grado, contaminación de cultivos, alteraciones no visibles por citogenética convencional, mala calidad de las metafases, contaminación con material de origen materno, presencia de mosaicismos confinados a placenta en los que es necesario confirmación con amniocentesis en segundo trimestre.

11 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 11 de 18 ESTUDIO BASICO DE ANEUPLOIDIAS Muestra: Liquido amniótico (no es necesario tubos adicionales a los requeridos para el cariotipo), conservación a temperatura ambiente. Muestra: Sangre periférica (tubo de 3.5 ml en EDTA-K3, tubo tapon morado), conservación refrigerado. Muestra: Restos abortivos (tubo/frasco esteril) en suero fisiológico o medio si esta disponible y en cantidad suficiente, conservación a temperatura ambiente. Muestra: Vellosidad corial (tubo/frasco esteril) con medio de transporte especifico proporcionado por Genética, conservación a temperatura ambiente. Imprescindible que la muestra llegue en el dia de la extracción al Hospital Universitario Río Hortega y aviso previo telefónico a la Unidad. La muestra no se debe extraer sin el conocimiento previo por parte de Genetica y la naturaleza de las pruebas que se deben realizar. Muestra: Líquidos biológicos, saliva o mucosa geniana (envase esteril o torunda seca), conservar en el refrigerador. Criterios de rechazo: muestra sin identificar. Criterios de rechazo que impiden el procesamiento de las muestras: muestra de sangre sin identificar o ilegible, muestra en tubo incorrecto, muestras y petición con datos no coincidentes, muestras estropeadas (tubo roto o derramado) Criterios que originan una anotación u observación en el informe de resultado: muestra con poco volumen, muestra hemolizada, muestra ictérica, muestra coagulada. Extracción de ADN: realizado en la unidad a partir de las muestras anteriormente mencionadas Tiempo de respuesta: horas en caso urgente y aviso previo, en caso contrario, 5 dias Método analítico: Hibridación molecular con amplificación cuantitativa fluorescente (QF-PCR).

12 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 12 de 18 Significado clínico: Prueba encaminada a la detección de las aneuploidias mas comunes autosomicas y sexuales, adicionalmente contiene dos marcadores para la detección verdadera del síndrome de Turner. El ensayo incluye 6 marcadores para el cromosoma 21, 5 marcadores para el 18, 5 marcadores para el 13 y 10 marcadores para X/Y. Tipo de informe: Numero de copias para cada cromosoma estudiado Interpretación Facultativo responsable Informe provisional: En caso de demora en el resultado o ampliación del estudio por parte de Genética se emitirá un informe provisional para el conocimiento del facultativo peticionario. Envio del informe definitivo: Peticiones procedentes del Área Oeste: Al facultativo peticionario en el Hospital o en los Centros de Salud. Peticiones procedentes de otros Hospitales de la CCAA de Castilla y León: a través de la web interna de Sacyl a la persona encargada por el Jefe de Servicio de Análisis Clínicos de cada Hospital. El resultado citogenetico se conserva en el programa de información del laboratorio recogido junto con el dia de emisión del informe definitivo. Modificacion de informes: Se abrirá la petición en el sistema de información del laboratorio en caso que estuviera cerrada, se desvalidara el informe haciendo click sobre el circulo de color morado situado en la parte superior izquierda del informe, se harán las modificaciones pertinentes validando el informe en el circulo color verde claro. Se notificara telefónicamente a los facultativos implicados, clínicos y licenciados especialistas del Servicio de Análisis Clínicos.

13 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 13 de 18 Limitaciones de la técnica: Solo se estudian los cromosomas mencionados, los mosaicos no son detectados por debajo del 40%, contaminación de la muestra por células maternas (líquido amniótico), muestra procedente de la madre (caso de restos abortivos y vellosidad corial). Muestras adicionales requeridas: En caso de encontrar un hallazgo cromosómico susceptible de una IVE por causa cromosomica se solicitara muestra de sangre materna (EDTA-K3) para realizar estudio de trazabilidad y comprobar que al menos uno de los alelos estudiados para cada cromosoma es de origen materno.

14 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 14 de 18 ESTUDIO AMPLIADO DE ANEUPLOIDIAS Muestra: Liquido amniótico (no es necesario tubos adicionales a los requeridos para el cariotipo), conservación a temperatura ambiente. Muestra: Sangre periférica (tubo de 3.5 ml en EDTA-K3, tubo tapon morado), conservación refrigerado. Muestra: Restos abortivos (tubo/frasco esteril) en suero fisiológico o medio si esta disponible y en cantidad suficiente, conservación a temperatura ambiente. Muestra: Vellosidad corial (tubo/frasco esteril) con medio de transporte especifico proporcionado por Genética, conservación a temperatura ambiente. Imprescindible que la muestra llegue en el dia de la extracción al Hospital Universitario Río Hortega y aviso previo telefónico a la Unidad. La muestra no se debe extraer sin el conocimiento previo por parte de Genetica y la naturaleza de las pruebas que se deben realizar. Muestra: Líquidos biológicos, saliva o mucosa geniana (envase esteril o torunda seca), conservar en el refrigerador. Criterios de rechazo: los mismos que para el estudio básico de aneuploidias. Extracción de ADN: realizado en la unidad a partir de las muestras anteriormente mencionadas Tiempo de respuesta: horas en caso urgente, en caso contrario, 5 dias Método analítico: Hibridación molecular con amplificación cuantitativa fluorescente (QF-PCR) para los cromosomas 15, 16 y 22. Significado clínico: Los estudios citogeneticos de abortos involuntarios son muy recomendables, incluso en el caso del aborto espontaneo en primer lugar. Las anomalías cromosómicas mas frecuentemente observadas implican los cromosomas 13, 15, 16, 18, 21, 22 y X.

15 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 15 de 18 Tipo de informe: Numero de copias para cada cromosoma estudiado Interpretación Facultativo responsable Informe provisional: En caso de demora en el resultado o ampliación del estudio por parte de Genética se emitirá un informe provisional para el conocimiento del facultativo peticionario. Envio del informe definitivo: Peticiones procedentes del Área Oeste: Al facultativo peticionario en el Hospital o en los Centros de Salud. Peticiones procedentes de otros Hospitales de la CCAA de Castilla y León: a través de la web interna de Sacyl a la persona encargada por el Jefe de Servicio de Análisis Clínicos de cada Hospital. El resultado citogenetico se conserva en el programa de información del laboratorio recogido junto con el dia de emisión del informe definitivo. Modificacion de informes: Se abrirá la petición en el sistema de información del laboratorio en caso que estuviera cerrada, se desvalidara el informe haciendo click sobre el circulo de color morado situado en la parte superior izquierda del informe, se harán las modificaciones pertinentes validando el informe en el circulo color verde claro. Se notificara telefónicamente a los facultativos implicados, clínicos y licenciados especialistas del Servicio de Análisis Clínicos. Limitaciones de la técnica: Solo se estudian los cromosomas mencionados, los mosaicos no son detectados por debajo del 40%, contaminación de la muestra por células maternas (líquido amniótico), muestra procedente de la madre (caso de restos abortivos y vellosidad corial).

16 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 16 de 18 ESTUDIO DE MICRODELECIONES DEL CROMOSOMA Y Muestra: Sangre periférica (tubo de 3.5 ml en EDTA-K3, tubo tapon morado), conservación refrigerado. Criterios de rechazo que impiden el procesamiento de la muestra: muestra de sangre sin identificar o ilegible, muestra en tubo incorrecto, muestras y petición con datos no coincidentes, muestras estropeadas (tubo roto o derramado) Criterios que originan una anotación u observación en el informe de resultado: muestra con poco volumen, muestra coagulada. Tiempo de respuesta: 1 semana Extracción de ADN: realizado en la unidad a partir de las muestras anteriormente mencionadas Método analítico: Hibridación molecular con amplificación cuantitativa fluorescente (QF-PCR). Significado clínico: El análisis del cromosoma Y en hombre con azoospermia o oligozoospermia severa ha identificado tres regiones en la zona de eucromatina en el brazo largo del cromosoma Y que están delecionados frecuentemente en falos espermatogenicos inexplicados. Tipo de informe: Interpretación Facultativo responsable Envio del informe definitivo: Peticiones procedentes del Área Oeste: Al facultativo peticionario en el Hospital o en los Centros de Salud. Peticiones procedentes de otros Hospitales de la CCAA de Castilla y León: a través de la web interna de Sacyl a la persona encargada por el Jefe de Servicio de Análisis Clínicos de cada Hospital. El resultado citogenetico se conserva en el programa de información del laboratorio recogido junto con el dia de emisión del informe definitivo.

17 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 17 de 18 Modificacion de informes: Se abrirá la petición en el sistema de información del laboratorio en caso que estuviera cerrada, se desvalidara el informe haciendo click sobre el circulo de color morado situado en la parte superior izquierda del informe, se harán las modificaciones pertinentes validando el informe en el circulo color verde claro. Se notificara telefónicamente a los facultativos implicados, clínicos y licenciados especialistas del Servicio de Análisis Clínicos.

18 LABORATORIO DE CITOGENÉTICA Página 18 de 18 CONSENTIMIENTO INFORMADO Se recuerda la necesidad de disponer de consentimiento informado por parte del facultativo peticionario para la realizacion de los estudiós geneticos contenidos en el presente catálogo. Este consentimiento se puede remitir junto con la muestra o ser custodiado por el facultativo peticionario. En caso de envio a la Unidad de Citogenetica del HURH este serà escaneado junto con el resguardo de peticion y se accederá a el prèvia peticion a esta Unidad en caso que fuera necesario.