Precise Pathology Personalized Medicine

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1 FORO DE TRANSFERENCIA TECNOLÓGICA BIOTRANSFER Precise Pathology Personalized Medicine Granada, octubre 2014 Víctor González Rumayor Jefe de Proyectos Althia Health SL

2 INVESTIGACION EN DIAGNOSTICO Althia está dedicada a la investigación traslacional y al diagnóstico clínico del cáncer, lesiones precancerosas y enfermedades inflamatorias. Soluciones para la investigación de la firma molecular especifica del tumor, estudios de diagnóstico no-invasivo (exosomas y CTC) y uso de técnicas moleculares que definan la mejor terapia 2

3 Medicina Personalizada La transición de la Medicina Molecular a la Medicina Personalizada pasa por tener un conocimiento profundo de la biología de la enfermedad y por la incorporación de nuevos retos y tecnologías Herramientas para la integración y consolidación de la información clínica Soluciones Bioinformáticas Conveniencia Procesamiento automático de datos para diagnóstico y tratamiento Algoritmos de Inteligencia Artificial Objetividad Abordaje multidisciplinar y multicéntrico de la oncología Redes Colaborativas de Especialistas Universalidad DATOS INFORMACION CONOCIMIENTO ACCIÓN 3

4 Proyectos en medicina personalizada Organización estructurada de la información clínica y molecular Mejor estratificación del paciente oncológico a terapias más específicas INVESTIGADORES CLINICOS INVESTIGADORES BASICOS Ayudar a la mejor selección de las técnicas de diagnóstico, reduciendo gastos al sistema TECNICOS EN SISTEMAS DE INFORMACION Generar modelos predictores de seguimiento y de tratamientos con la mejor elección de la terapéutica ESPECIALISTAS EN MODELOS MATEMATICOS 4

5 Proyectos I+D PROYECTOS TITLE PARTICIPANTS OBJECTIVES AND RESEARCH AREA PATENT SITUATION Gliomas ALTHIA, IDIBELL Patient stratification through the applications of molecular and precise pathology FINAL REPORT US FINAL REPORT CAN OFFICIAL ACTIONS EU Lymphoma (DLBCL) ALTHIA, H Clinic Patient stratification through the applications of molecular and precise pathology OFFICIAL WRITING PROPOSAL (WO) TradionP ALTHIA, INDRA Lorgen Prototype expert system for diagnosis and personalized treatment in cancer patients UNDER DEVELOPMENT 5

6 PROYECTO TRADIONP ESTUDIO BASADO EN MEDICINA PERSONALIZADA MUESTRAS DE CÁNCER DE MAMA, COLORRECTAL Y PULMON DOS REGIMENES TERAPEUTICOS QUIMIO & RADIOTERAPIA TERAPIA BIOLOGICA Metilation (+400,000) Genotyping (+200,000) Base de datos 451 cáncer de mama (298 biopsias tumor) 330 cáncer Colorrectal (250 biopsias tumor) 150 cáncer pulmón Clínical Data, Images... (+15,000)

7 PROYECTO TRADIONP Terapias Datos pruebas biopsias Imágenes Informes mutaciones marcadores ESTUDIO RETROSPECTIVO SELECCIÓN DE PACIENTES DATOS CLINICOS CLAVES PROTOTIPO DE SISTEMA EXPERTO ALGORTIMOS DE COMBINACION E INFORMACION BBDD CON DATOS CLINICOS Y MOLECULARES ENTRELAZADOS COMITÉ CIENTÍFICO INFORMACION MOLECULAR DISEÑO DE ALGORITMOS BASE DATOS MULTIMODAL

8 PROYECTO TRADIONP SECUENCIAS GENES METILACION FISH DATOS CLINICOS >15,000 GENOTIPAJE (SNPs) BBDDS MULTIPLEX HISTOLOGIA PRECISA

9 08 Resultados Analíticas Histología Funcional Análisis histológico Multiplex Muestra ADN FISH Firma molecular del tumor Mutaciones de baja frecuencia en genes relevantes Identificación de mutaciones puntuales en secuenciación Presencia redundante de polimorfismos -SNPs Posiciones hipo/hipermetiladas en el ADN tumoral BBDD 9

10 PROYECTO TRADIONP COMBINATORIAL DATA DATOS CLINICOS DATOS EXPERIMENTALES HELP DESK MINERIA DATOS? SURVIVAL? RELAPSED? 2, 5, 10 YEARS? SISTEMA EXPERTO 10

11 PROYECTO GLIOMAS PTEN Probe CEN10 Probe Cirugia Radioterapia (RT) 3-4 w Quimioterapia temozolomide (TMZ) SELECCIÓN DE PACIENTES QUE RESPONDEN AL FARMACO, Y DE PACIENTES QUE DEBEN USAR TERAPIAS ALTERNATIVAS PTEN MEASUREMENT BY FISH LA MEDICINA PERSONALIZADA NOS PERMITEN UNA MEJOR ESTRATIFICACION DE PACIENTES USANDO TÉCNICAS SIMPLES

12 PROYECTO GLIOMAS 230 pacientes astrocitoma (GBM, AA, y otros) Base de datos con informacion clinica & patologica IF (EGFR, PTEN, Ki67) + FISH (EGFR, PTEN) Supervivenvia & recidiva (estudio retrospectivo) GBM/AA patients EGFR AMP/HP PTEN LOH 10% AMP.LOH.comb AA AMP.LOH.comb GBM AMP.LOH.comb ALL Survival OTHER (n=25) AMP & LOH<0.4 (n=10) p-value (log-rank): Survival OTHER (n=73) AMP & LOH<0.4 (n=40) p-value (log-rank): Survival OTHER (n=98) AMP & LOH<0.4 (n=50) p-value (log-rank): < Days from surgery Days from surgery Days from surgery PTEN/EGFR (FISH) 12

13 PROYECTO LINFOMA Diagnostico y pronostico integral para el Linfoma Difuso de Celulas B grandes(dlbcl) usando patología de precisión Objetivos Combinar técnicas de diagnostico IF Mplex y FISH para identificar un fenotipo sólido y asociado a la supervivencia 235 pacientes diagnosticado y tratados de Diffuse large B cell lymphoma (DLBCL) Datos clínicos de 153 pacientes tratados con rituximab CHOP, y seguidos durante 3 años. Análisis con 26 variables 3 Hospitales

14 PROJECT LYMPHOMA VEGF y BCL6 son marcadores predictivos de respuesta a las terapias en uso (R-CHOP) CMYC, MUM1 y posiblemente CD68, pueden ser relevantes basados en el estado de la variable IPI (international prognostic index) LA MEDICINA PERSONALIZADA NOS PERMITE ASOCIAR MARCADORES PARTICULARES A LA RESPUESTA ESPECIFICA DEL PACIENTE A LA TERAPIA EN USO.

15 R&D Translational Projects PROYECTOS EN DESARROLLO TITLE PARTICIPANTS OBJECTIVES AND RESEARCH AREA START ONCOEXPERT ADELIS Prostate Predict PRECISESADS ANXARECU idoctus INDRA, ALTHIA, LORGEN, MASTER, ERA7 ROVI, ALTHIA, VAXDYN BIOMEDAL BIONATURIS ALTHIA, Amadix, H Clinic, H. Vall d Hebron, H 12Oct System for better diagnosis and treatment Pharmacogenomics to aromatase inhibitor response in breast cancer Combination of protein markers and mirna April 2013 April 2013 October 2012 PROG&SALUD ALTHIA 22+ Tissue connective pathology Feb 2014 ALTHIA, Vall Anexine: predictor biomarker for d Hebron, IRB Lleida, Formune recurrent endometrial cancer edoctores, ALTHIA, Blueliv Plataforma ayuda detección temparana enfermedades infecciosas 15

16 PROYECTO PROSTATE PREDICT Pacientes Prostatectomizados Búsqueda de marcadores predictores microrna+proteinas Desarrollo de nuevos algoritmos de respuesta a recidivas. Identificación de nuevos marcadores in situ utilizando patología de sistemas o precisa. Modelos Predictivos que incluyan mirna y proteínas de potencial interés. STARTING Nov FINISH

17 PROYECTO ANXARECU Validación de Anexina 2 como biomarcador para recidiva de cáncer de endometrio. Validación proteica y transcriptómica (mrna) en biopsia y aspirado. Desarrollo de sistema predictivo no o mínimamente invasivo Desarrollo de algoritmos de integración Desarrollo de un dispositivo de microfluidica para aislamiento de CTCs y exosomas Exploración del potencial de Anxa 2 como diana terapéutica 17

18 PROYECTO idoctus Sistema de detección temprana de enfermedades infecciosas. Desarrollo de un modelo de análisis de datos microbiológicos basados en técnicas de Big Data Basado en un sistema de geolocalización de eventos de diagnóstico de enfermedades infecciosas Desarrollo de un nuevo sistema de recogida de datos basado en hacking ético Sistema de ayuda a la toma de decisiones mediante aplicaciones móviles con información on-line/ of-line. 18

19 PROYECTO PRECISESADS : IMI. EU-FP7 MOLECULAR RECLASSIFICATION TO FIND CLINICAL USEFUL BIOMARKERS FOR SYSTEMIC AUTOIMMUNE DISEASES. (lupus, artritis reumatoide, sindrome etc) Coordinador Marta Alarcón-Riquelme, Genyo Granada 24 partners de 6 diferentes países Europeos y 14 Hospitales Althia participa en Tissue based taxonomy and exosomes. 19

20 Nilo1 and Nilo2 antibodies Nilo1 and Nilo2 are hamster monoclonal antibodies directed against cell surface mouse neural stem cells. 13,5d embryo Olfactory bulb B: radial glia NILO1 SOX2 GFAP Vimentin Nestin, GFAP Vimentin EGFR Sox2 neurospheres (passage 5-6) IP immunization A: neuroblast NILO2 βiii Tub PSA-NCAM DCX DCX, PSA- NCAM, MUSH1, NG2, Tuj1 hamster hamster spleen cells X Balb/c myeloma X63.Ag8 HAT selection Flow cytometer Nilo1 identify human GBMderived neurosphere s Neurosphere cell growth inhibition

21 Nilo2 as a marker of brain damage Nilo2 identify neuroblast cells in the brain niches. This cells could be followed inside the brain moving into damaged areas TEM

22 Nilo1 a somatic stem biomarker 1 Neural tissue NSC neurosphere NSC Nilo1+, Sox2+ oligodendrocytes neuron s astrocytes Nilo1+ cells Early MSC progenitors 2 Nilo1+, Sox2+, CD29+, CD45- mature MSC Nilo1-, Sox2-, CD29+, CD45- adipocytes osteocyte s chondriocytes Bone marrow tissue 3 asymmetric division Nilo1 labeled 4 fraction of non responding cultures 0 1 Cells/well 100 0,1 Intestinal crypt f=1/

23 El futuro en I+D: áreas de interés Desarrollo de nuevos marcadores de diagnóstico dirigidos a la medicina personalizada Combinación e integración de ómicas para el desarrollo de algoritmos con capacidad predictiva Desarrollo de biosensores robustos que permitan la automatización de procesos diagnósticos Aplicación de TIC al desarrollo de sistemas expertos de soporte a la toma de decisiones Uso de marcadores de células stem somáticas en diagnóstico y terapia 23

24 El futuro en I+D Compartir información Cooperar Alianzas estratégicas 24

25 25

26 Projects granted by: 26

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