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1 Capítulo 7 El modelo genético para caracteres cuantitativos Al seleccionar por caracteres de herencia simple la tarea del criador es identificar genotipos de individuos por loci de interés y seleccionar aquellos individuos con el genotipo más favorable. El trabajo del criador en la selección por caracteres poligénicos es más de lo mismo, excepto que identificar los genotipos no es posible, en cambio se trata de identificar el valor genético de los individuos para caracteres de importancia y seleccionar aquellos individuos con el mejor valor genético. El genotipo de un individuo para rasgos de herencia simple, a pesar de que no podemos verlo o palparlo es una cosa relativamente concreta. Sabemos por ejemplo que si un Labrador negro engendra cachorros chocolate y amarillo su genotipo para color de la capa es BbEe. El valor genético de un individuo por otra parte es una idea matemática abstracta, este nunca podrá ser medido directamente y siendo un concepto relativo su valor numérico depende del valor de cría de todos los otros individuos de la población. Para entender completamente valores de cría y otras nociones relacionadas se necesita un modelo matemático un marco conceptual en el cual colocar definiciones en una forma lógica y consistente. Ese modelo, el modelo genético para rasgos cuantitativos es el tema de este capítulo. Como su nombre lo sugiere, el modelo genético para caracteres cuantitativos está diseñado para ser usado con caracteres cuantitativos: caracteres en los cuales los fenotipos muestran una expresión continua (numérica). Pero en la práctica es utilizado con caracteres poligénicos en general. Los caracteres umbral (caracteres poligénicos cualitativos) no se expresan en forma continua y a primera vista no parecen ser buenos candidatos para un modelo cuantitativo. Pero se aplica el modelo para ellos de cualquier forma. Se describe cómo hacerlo en la sección final del capítulo. La rama de la genética que trata el modelo para caracteres cuantitativos y sus aplicaciones se denomina genética cuantitativa. Se refiere a: influencias sobre, medidas de, relaciones entre, predicciones genéticas para, y las tasas de cambio en caracteres que son o que pueden ser tratados como cuantitativos. genética cuantitativa: rama de la genética que se refiere a influencias sobre, medidas de, relaciones entre, predicciones genéticas para, y las tasas de cambio en caracteres que son o que pueden ser tratados como cuantitativos. El modelo Básico El modelo básico para caracteres cuantitativos se representa por la siguiente ecuación: P=µ+G+E Donde

2 P=al valor fenotípico o performance de un individuo para un carácter. µ= la media poblacional o el valor fenotípico medio para el carácter para todos los animales de la población. G= valor genotípico del individuo para el carácter. E= efectos ambientales sobre la performance del individuo para ese carácter. valor fenotípico: una medida de la performance para un carácter en un individuo (un registro de producción) media poblacional: el valor fenotípico medio de todos los individuos en una población. valor genotípico: los efectos de los genes de un individuo (individualmente y en combinación) sobre su performance para un carácter dado. efectos ambientales: efectos que factores externos (no genéticos) tienen sobre la performance animal. Un valor fenotípico es un registro de la performance individual de un individuo, es una medida de la performance propia de un animal para un rasgo específico. El valor genético se refiere a los efectos de los genes del individuo (individualmente o en combinación) sobre su performance para el carácter. A diferencia del valor fenotípico no es directamente medible. Los efectos ambientales están compuestos por todos los factores no genéticos que influencian la performance de un individuo para un carácter. El modelo básico presentado aquí es ligeramente diferente del más conocido modelo explicado en el capítulo 1. Ese modelo no incluye la media poblacional (µ). La razón para agregar la media es enfatizar que en mejoramiento animal los valores genotípicos, los efectos ambientales y todos los otros elementos del modelo discutidos en este capítulo son relativos (relativos a la población que está siendo considerada). No son absolutos. Su valor numérico depende de la performance media de la población y por lo tanto son expresados como desviaciones de la media poblacional. Ejemplos del modelo básico para caracteres cuantitativos son ilustrados esquemáticamente en la Figura 7.1. Los pesos al destete (valor fenotípico) para tres terneros están representados por la columna negra en la Figura. Esas columnas se extienden desde una línea que representa el peso promedio en la población (una media poblacional de 500 libras). La columna negra extendida por sobre la línea denota un peso promedio al destete por sobre la media y las columnas extendidas por debajo de la línea denotan pesos al destete menores que la media.

3 Las columnas grises y blancas en el fondo representan las contribuciones del genotipo y el ambiente para cada registro de performance. Ellas significan valores fenotípicos y efectos ambientales respectivamente. (Esto es un ejemplo hipotético utilizado para ilustrar. En la realidad, por supuesto, no podemos saber los valores genotípicos o efectos ambientales de un individuo. Lo único que podemos medir directamente es su valor fenotípico). Nótese que algunas de las columnas que representan los valores genotípicos y de efectos ambientales se localizan por arriba de la línea y otras por debajo. Y aquellas que están sobre la línea tienen un valor positivo y las que están por debajo negativo. Esto es porque esos valores están expresados como desviaciones de la media poblacional. Una desviación positiva significa mayor que la media y una negativa menor que la media. El ternero A por ejemplo, pesa 600 libras, un valor fenotípico por encima de la media. Su ventaja para peso al destete de 100 libras por sobre la media de los terneros es parcialmente debida a un valor genotípico superior a la media. El está genéticamente 30 libras por encima de la media para peso al destete. También ha tenido mejores efectos ambientales que la media, un valor de 70 libras, quizás porque su madre fue particularmente buena lechera. Los terneros B y C pesan 450 libras (50 por debajo de la media). El ternero B tiene un valor genético menor a la media y ha tenido un peor ambiente que el promedio. El ternero C por otro lado es genéticamente superior a la media pero se crió en un ambiente pobre, quizás se enfermo o su madre tenía muy poca leche.

4 El modelo básico para caracteres cuantitativos no es nada más que la representación matemática de cómo la performance de un individuo (P) es afectada por la genética (G) y el ambiente (E). Hay algunas características del modelo que son importantes recordar. Primero, el modelo representa las contribuciones genéticas y ambientales a un solo registro de performance de un solo animal. Para cada registro de performance existen (aunque no necesariamente observables) valores numéricos de P, G y E. Las ganancias de peso al destete en la Figura 7.1 son ejemplos. P, G y E son llamados valores, lo cual en el contexto del mejoramiento animal significa que son aplicados a individuos en una población. Hablamos de un valor fenotípico particular para la ganancia de peso en un ternero o de un valor fenotípico particular de una cerda para el tamaño de la camada. Segundo, estos valores son caracteres específicos. El valor fenotípico de una cerda no es genérico en ningún sentido- es su valor genotípico específicamente para el rasgo tamaño de camada. Tercero, debido a que G y E se expresan como desviaciones de la media, la media de los valores genotípicos y la media de los efectos ambientales a lo largo de toda la población son cero (cuando las desviaciones son sumadas en el proceso de sacar el promedio las desviaciones negativas cancelan las negativas, con lo que la suma de las medias son cero). En notación estadística una barra sobre la variable denota la media- entonces = =0 Finalmente G y E son considerados independientes. Esto significa que el genotipo de los animales no tiene influencia de los efectos ambientales y viceversa. El valor genotípico de un ternero para peso al destete por ejemplo es determinado en la concepción. Este valor no es afectado por el ambiente pre destete. Igualmente si todos los terneros en una población reciben tratamiento similar sin considerar su potencial genético para peso al destete, el ambiente pre-destete es independiente del valor genotípico. La asunción de la independencia de estos valores es necesario para mantener el modelo simple, y es una asunción cierta en la mayoría de los casos. Hay situaciones sin embargo donde la misma es violada. Por ejemplo las vacas lecheras con alto potencial genético para la producción de leche generalmente son mejor alimentadas que vacas con un bajo potencial, los caballos de carrera que se piensa que tienen un gran potencial genético frecuentemente reciben un mejor entrenamiento que la media. Un modelo tan simple como el modelo genético básico no encaja en estos casos. valor: (en mejoramiento genético) cualquier medida aplicada a un individuo en lugar de a una población. Son ejemplos el valor fenotípico, el valor genotípico, el valor de cría y los efectos ambientales. Valor de cría

5 En la selección para caracteres poligénicos los criadores tratan de elegir como padres a aquellos individuos con el mejor conjunto de genes, eso quiere decir aquellos individuos con mejor valor de cría. El valor de cría se define aquí como un valor como padre- el valor de un individuo como contribuyente de genes para la próxima generación. Pero el valor de cría no aparece en el modelo básico para caracteres cuantitativos (P=µ+ G+E). De hecho el único componente genético verdadero en el modelo es el valor genotípico (G). Usted entonces podría preguntar si los criadores deberían elegir como reemplazos aquellos individuos con el mejor valor genotípico. En otras palabras usted podría preguntar si valor de cría y valor genotípico son la misma cosa. La respuesta es no. Mientras el valor genotípico representa el efecto general de los genes de un individuo, el valor de cría representa solamente aquella parte del valor genotípico que puede ser transmitido de los progenitores a la progenie. Para un mejor entendimiento de cómo difiere el valor genotípico del valor de cría veremos un ejemplo hipotético que implica un solo locus. Asuma que el locus B es uno de los muchos que afectan el peso adulto o maduro. Hay dos posibles alelos en dicho locus: B y b. El efecto medio de cada gen B es incrementar el peso maduro en 10 gramos y el efecto medio en cada b es disminuirlo también en 10 gramos (estas cantidades pueden parecer pequeñas pero recuerde que el peso maduro es un carácter poligénico y los efectos individuales de los genes que afectan a dichos caracteres se piensa que son pequeños). Los efectos del gen de esos 10 gramos son conocidos como efectos independientes del gen. Ellos reflejan el valor de cada gen independiente de los efectos de los otros genes en el mismo locus (dominancia) y los efectos de los genes en otros loci (epistasis). En otras palabras, el efecto independiente de cada gen refleja el valor del gen heredado como lo mediríamos si consideráramos el gen aislado. El valor de cría de un animal para peso maduro es simplemente la suma de los efectos independientes de los genes en el locus B y todos los otros loci que afectan el peso maduro. Esto es porque: los progenitores transmiten una muestra de la mitad de sus genes a su progenie (un gen de cada par de cada locus). No transmiten ambos genes de un locus, tampoco transmiten (como regla) las combinaciones de genes exactas de los diferentes loci. El proceso mendeliano de segregación y distribución independiente de los genes evitan la herencia de las combinaciones de genes particulares presentes en los progenitores. Porque el valor de cría es el valor de un individuo como contribución de los genes a su progenie y porque las combinaciones de genes no son transmitidas, el valor de cría reflejaría solamente los efectos independientes de los genes y no el debido a las combinaciones de genes. El valor de cría de un animal es entonces solo la suma de los efectos independientes de todos los genes de ese animal sobre un determinado carácter. En nuestro ejemplo asumamos para hacerlo simple, que todos los genes que afectan al peso maduro excepto por el locus B son idénticos para todos los animales. Entonces el valor de cría para cada uno de los tres genotipos del locus B (BB, Bb y bb) son:

6 BV BB = 10+10=20 g BV Bb = 10+ (-10)= 0 g BV bb = (-10) = -20 g Los animales con el genotipo BB tienen el mayor valor de cría para peso maduro. Ellos pueden contribuir solo con un gen B a su progenie y éste gen tiene un efecto positivo sobre el peso maduro. Los animales con bb tienen el menor valor de cría para este carácter ya que ellos pueden contribuir solo con el gen b a su progenie y éste gen tiene un efecto negativo sobre el carácter. Los animales con genotipo Bb teniendo un gen de cada tipo tienen un valor de cría intermedio. La mitad de las veces ellos contribuirán con un gen B influenciando positivamente el peso maduro de la progenie y la otra mitad contribuirán con un gen b afectándolo negativamente. Ahora asumamos la dominancia del locus B. En otras palabras, los efectos de la combinación de genes heterocigotas en el locus B (Bb) sobre el peso maduro es exactamente la misma que aquella de la combinación homocigota dominante (BB). EL efecto general que los genes del individuo Bb tienen sobre el peso maduro del propio individuo un efecto que incluye los efectos independientes de ambos genes y el efecto de dominancia en el locus B no es diferente que el efecto general que los genes de Bb tienen sobre el peso maduro del individuo. Ambos individuos tienen el mismo valor genotípico. Como se mostro previamente, sin embargo, ellos no tienen el mismo valor de cría. Para simplificar, asumamos que para los genotipos homocigotas, el valor genotípico es igual que el valor de cría (estrictamente hablando esta afirmación no es cierta. Los valores genotípicos y los valores de cría son funciones de las frecuencias génicas en una población por lo tanto, la relación entre ellos es más complicada que la que se presenta aquí). Podemos construir la siguiente tabla Genotipo Valor de cría Valor genotípico BB 20 g 20g Bb 0 g 20g bb -20 g -20 g BB y Bb tienen posiblemente un peso maduro similar porque la combinación de genes de ambos tiene el mismo efecto sobre el peso maduro del individuo. Sin embargo, ellos no producirán descendencia con ese mismo peso maduro. La progenie de BB será en promedio más pesada. Los individuos homocigotas bb tendrán ellos mismos un peso maduro más bajo y también producirán una descendencia con peso maduro más bajo. Para resumir, el valor genotípico representa el efecto general de los genes de un individuo (individualmente y en combinación) sobre la propia performance del individuo para un

7 determinad carácter. Sin embargo, no todo el valor genotípico del animal es heredable. El valor de cría es la parte del valor genotípico de un individuo que es debida a los efectos independientes de los genes que pueden ser transmitidos de los progenitores a la progenie. Una forma alternativa (y útil) de entender la diferencia entre valore genotípico y valor de cría es pensar en el valor genotípico como el valor de los genes de un individuo sobre su propia performance, y valor de cría como el valor de los genes de un individuo sobre su progenie. Así como los valores genotípicos no son directamente medibles tampoco lo son los valores de cría. Sin embargo, podemos predecirlos utilizando datos de performance. Una predicción del valor de cría se conoce como un valor de cría estimado o EBV. valor de cría: el valor de un individuo como un padre genético. efectos independientes del gen: reflejan el valor de cada gen independiente de los efectos de los otros genes en el mismo locus (dominancia) y los efectos de los genes en otros loci (epistasis). valor de cría: es la parte del valor genotípico de un individuo que es debida a los efectos independientes de los genes que pueden ser transmitidos valor de cría estimado o EBV: una predicción del valor de cría Diferencia de progenie Un padre le pasa a sus crías una muestra de la mitad de sus genes y por lo tanto, una muestra de la mitad de los efectos independiente de esos genes sobre su progenie. Debido a que el valor de cría es la suma de los efectos de todos los genes del individuo que afectan a un carácter, un padre pasa en promedio la mitad de su valor de cría a su progenie. La mitad del valor de cría de los padres para un determinado carácter es nuestra expectativa de lo que es heredado del padre y es denominado diferencia de progenie (PD) o habilidad de transmisión. Otra forma de entender la diferencia de progenie es considerarlo el valor de cría esperado de una gameta producida por un individuo. Para cualquiera de las dos definiciones, La diferencia de progenie es un concepto muy práctico. Piense en ella como la diferencia esperada entre la performance media de la progenie de un individuo y la performance media de toda la progenie (asumiendo apareamientos al azar). Por ejemplo si un carnero particular tiene una diferencia de progenie de + 1,2 lb para peso de vellón sucio, y somos cuidadosos al elegir las hembras al azar (es decir, somos cuidadosas de aparearlo con cualquier tipo de hembras, no solo con aquellas que tienen pesos de vellón

8 sucio especialmente pesadas o livianos), podemos esperar que el vellón de su progenie sea un promedio de 1,2 lb más pesadas que el peso de vellón promedio. Como los valores de cría, las diferencias de progenie no son directamente medibles, pero se puede predecir partiendo de datos de performance. Tales predicciones son llamadas diferencias esperadas de progenie (EPDs), diferencias predichas (PDs) o habilidad de transmisión estimada (ETAs) y son comúnmente utilizadas para hacer comparaciones genéticas entre animales. Es muy importante entender que un individuo no transmite su diferencia de progenie (exactamente la mitad de su valor de cría) a toda su progenie. Un padre siempre pasa la mitad de sus genes, pero los genes transmitidos constituyen una muestra al azar de los genes del padre. Algunas muestras son mejores que otras, la Figura 7.2 representa la distribución del mérito genético probable de ser transmitida de un individuo a su progenie. En promedio la mitad de su valor de cría (su diferencia de progenie) es lo que se transmite. Usualmente, sin embargo, el muestro mendeliano causa que la mitad de la muestra de los genes de un padre transmite a su progenie varíe de la mitad del mérito genético (BV) de los genes del padre. Y es imposible controlar o predecir si una cría en particular heredará una muestra buena promedio o mediocre. diferencia de progenie (pd) o habilidad de transmisión: La mitad del valor de cría de un individuo la diferencia esperada entre la performance media de la progenie del individuo y la performance media de toda la progenie (asumiendo apareamientos al azar) diferencias de progenie esperadas (EPDs), diferencias predichas (PDs) o habilidad de transmisión estimada (ETAs): Una predicción de la diferencia de progenie. Figura 7.2 Propiedades aditivas de los valores de cría y las diferencias de progenie El valor de cría o diferencia de progenie de un animal para un determinado carácter es una función de los efectos independientes de los genes de un animal que influencian el carácter.

9 Independiente en este contexto, significa independiente de los efectos de otros genes. Debido a su independencia, estos efectos génicos son aditivos en el sentido que el valor de cría de un animal, la parte heredable de su valor de cría para un carácter, es simplemente la suma de los efectos independientes de todos los genes del animal que influencian el carácter. Por ejemplo, si un carácter fuera afectado por 5 (hipotéticos) loci, y si los efectos independientes de los genes del individuo para los 10 genes en esos loci fueran + 3,0, -0,6, +0,2, +4,2, -1,4, - 2,3, + 0,4, -0,1. + 0,9, y +1,5 unidades entonces el valor de cría del individuo para ese carácter sería 3,0 + (-0,6) +0,2 +4,2+ (-1,4)+ (- 2,3) + 0,4+ (-0,1) + 0,9 +1,5 = +5,8 unidades. Debido a su aditividad, los efectos independientes de los genes se suelen referir como los efectos aditivos de los genes. Similarmente, el valor de cría se suele referir como valor genético aditivo o simplemente valor aditivo. Si el efecto independiente de los genes es verdaderamente aditivo, entonces se destaca la razón de que el valor de cría de una progenie es solo la suma de los efectos independientes de los genes heredados de sus padres y los efectos independientes de los genes heredados de sus madres. Debido a que los efectos independientes de los genes heredados del padre comprende en promedio la mitad del valor de cría del padre, y que los efectos independientes de los genes heredados de la madre comprenden, en promedio, la mitad del valor de cría de su madre, entonces En otras palabras, el valor de cría de una progenie para un determinado carácter será en promedio, el promedio de los valores de cría de sus padres para el carácter. Esta relación tan simple como puede parecer, es la clave que nos permite predecir el valor de cría de los miembros de la siguiente generación basando nuestras predicciones en el valor de cría de sus padres. Por ejemplo, si el valor de cría estimado de un padrillo Quarter horse para el tiempo para correr un cuarto de milla es de -3 segundos, es decir 3 segundos más veloz que el promedio, y el valor de cría estimado para una hembra Quarter horse es de -1 segundo, entonces ( ) ( ) (Un sombrero ( ) sobre un valor indica una predicción de ese valor en este caso una predicción del valor de cría o un EBV). Esperaríamos que el promedio de la progenie de este apareamiento tenga un valor de cría de tiempo para correr un cuarto de milla de -2 segundos dos segundos más veloz que el promedio.

10 Existe una extensión aún más útil de este concepto: la performance propia de una progenie para un carácter será en promedio la performance media para el carácter más el promedio de los valores de cría de sus padres para ese carácter o En nuestro ejemplo del Quarter horse si la media de la población para el tiempo para correr un cuarto de milla fuera 20 segundos, entonces ( ) ( ) ( ) Esperaríamos que el promedio de la progenie de este apareamiento no solamente tenga un valor de cría de 2 segundos más veloz que el promedio, sino también que correrá 2 segundos más rápido que el promedio. Usted podría preguntar Qué hay de los efectos ambientales? Estos no afectarían la performance de la progenie? No deberían ser incluidos en esta ultima ecuación? La respuesta es sí para una cría individual, pero no para el promedio de muchas crías. Esto es porque algunas crías de un apareamiento dado experimentarán efectos ambientales negativos y otras efectos ambientales positivos, pero el promedio de los efectos ambientales será 0 los efectos positivos y negativos se cancelarán entre sí. De nuevo es importante entender que el promedio del valor de cría de los padres no determina el valor de cría o performance de toda la progenie de un apareamiento solo el promedio de la progenie. El muestreo mendeliano causa variación en el valor de cría de la progenie y las diferencias en los efectos ambientales causa una variación adicional en la performance de la progenie. Como se muestra en la Figura 7.3, sin embargo, el promedio del valor de cría de los padres puede ser utilizado para predecir el valor de cría de los hijos y sus performances. Aunque hay considerable variación en la progenie de cualquier apareamiento, la posibilidad de obtener progenie con valor de cría más alto y performance mucho mejores cuando se aparean padres con valor de cría superiores (b) que cuando se aparean padres con valores de cría inferiores (a). efectos aditivos de los genes: Efectos independientes de los genes valor genético aditivo o valor aditivo: valor de cría.

11 Valor de cría y selección Los valores de cría de los padres son el ingrediente clave que determina el valor de cría de la progenie y su performance. Claramente, si definiéramos el mejor animal en términos de valores de cría y pudiéramos conocer exactamente los valores de cría de los padres potenciales, la selección sería fácil simplemente elegiríamos aquellos individuos con los mejores valores de cría. Sin embargo en la vida real los verdaderos valores de cría son desconocidos y nosotros debemos utilizar predicciones de los valores de cría en su lugar. Debido a que la efectividad de la selección depende de la calidad de dichas predicciones mucha de la tecnología de mejoramiento animal involucra la predicción de los valores de cría o diferencias de progenie. El capítulo 11 de este libro se dedica a ese asunto. Para poner todo esto en perspectiva, considere el hecho de que los productores de reproductores no solamente venden animales, sino que también información acerca de ellos denominados predicción de valor de cría. Cuanto mayor y mejor la información más valor tiene el producto. VALOR COMBINATORIO DE LOS GENES El valor de cría es la parte del valor genotípico que puede ser transmitida de los padres a las crías. La porción restante del valor genotípico es denominada valor combinatorio de genes (GCV). El valor combinatorio de los genes es la parte del valor genotípico de un individuo para un carácter que se debe a los efectos de la combinación de genes dominancia y epistasis. Debido a que los genes individuales y no la combinación de genes, sobreviven a la

12 segregación y distribución independiente durante la meiosis, el valor de la combinación de los genes no puede ser transmitido de los padres a los hijos. Un valor de cría de un animal y el valor combinatorio de genes juntos constituyen su valor genotípico para un carácter. En forma de modelo Para un ejemplo numérico de cómo los efectos independientes de los genes y los efectos de la combinación de genes se relacionan con esta ecuación, considere el locus T un locus hipotético que afecta el tamaño de la camada en porcinos. Para simplificar asuma que los animales en este ejemplo son idénticos en todos los otros loci que influencian el tamaño de camada. Asuma también que el efecto independiente del gen T es + 0,1 lechones, el efecto independiente del gen t es -0,1 lechones y T es completamente dominante sobre t. Los valores de cría valores genotípicos y valor de combinaciones de genes para los tres genotipos del locus T se listan en la tabla 7.1. Debido a la completa dominancia en el locus T, los homocigotas dominantes TT y los homocigotas dominantes Tt tienen el mismo valor genotípico para tamaño de camada. Sin embargo, su valor de cría es diferente porque TT tiene mayores probabilidades que Tt de transmitir el alelo T favorable a su cría. La diferencia entre el valor genotípico y el valor de cría en los animales heterocigotas (G-BV) es el valor combinatorio, en este caso 0,2 lechones. En el ejemplo de locus T, el efecto de la combinación de genes se debe enteramente a la dominancia. Un ejemplo similar debido a la epistasis se podría mostrar con un ejemplo multi locus. Aunque en general se cree que la dominancia es la mayor causa de los efectos combinatorios de los genes, el valor combinatorio de genes es probablemente el resultado de complicadas relaciones de dominancia y epistasis entre genes. Los efectos combinatorios de los genes no son aditivos de la misma forma que los efectos independientes de los genes. No se puede simplemente sumar los efectos de la combinación de genes para determinar el valor combinatorio de un individuo. Eso es porque los efectos combinatorios de los genes en uno o más loci pueden depender de los genes presentes en otros loci más. De la misma manera el valor combinatorio de los genes no es aditivo en la misma forma que lo es el valor de cría. No se puede promediar el valor combinatorio de genes de los padres para predecir el valor combinatorio de las crías. Matemáticamente, Por su falta de aditividad, los efectos de la combinación de los genes comúnmente se denominan efecto no aditivo de los genes y el valor de la combinación de genes se suele referir como valor genético no aditivo o simplemente valor no aditivo. Un error común entre los estudiantes de mejoramiento genético es la noción de genes aditivos y no aditivos. Los genes no deben ser considerados de una u otra manera. Si un gen

13 tiene cualquier efecto sobre un carácter poligénico, este tiene un efecto independiente (aditivo). Si la expresión del mismo gen es también influenciada por la dominancia y/o epistasis el gen contribuye al efecto combinatorio de los genes (no aditivo). Es posible que algunos genes tengan una influencia enteramente aditiva sobre un carácter pero ningún gen puede ser enteramente no aditivo en su influencia sobre el carácter. Es mejor no pensar en los genes como aditivos o no aditivos. Piense en cambio en que los genes tienen efectos independientes y en muchos casos contribuyen a los efectos combinatorios de los genes. A diferencia de los valores de cría, los valores combinatorios de los individuos son raramente predichos. Esto es en parte porque el valor combinatorio de los genes es difícil de predecir pero mayormente porque la predicción de este valor combinatorio tiene escaso uso práctico. El valor combinatorio de genes no es después de todo transmitido de los padres a la progenie. El conocimiento de los valores de cría es de mucha ayuda en la selección mientras que el valor de la combinación de los genes no lo es. Esto no quiere decir que el valor combinatorio de los genes no sea importante. Por el contrario, el valor combinatorio de los genes de un individuo para un determinado carácter puede tener una gran influencia en su propia performance. Como veremos en el capítulo 18 el vigor híbrido y la depresión endogámica son solo nombres alternativos para valores de combinación de genes favorables y desfavorables. La importancia particular del valor combinatorio de los genes depende de si usted es un productor de reproductores o comercial. Los primeros comercializan potencial genético, por lo tanto el valor de cría es la primera preocupación de estos. Los productores comerciales comercializan performance, y el grado del valor de combinación de genes contribuye con esta. Por lo tanto el valor de la combinación de genes es importante para ellos. valor combinatorio de genes (gcv): es la parte del valor genotípico de un individuo para un carácter que se debe a los efectos de la combinación de genes (dominancia y epistasis.) y por lo tanto no puede ser transmitido de los padres a los hijos. efectos de la combinación de genes: El efecto de una combinación de genes, es decir efecto de dominancia o epistasis. efecto no aditivo de los genes: los efectos de la combinación de los genes valor genético no aditivo o valor no aditivo: valor de la combinación de genes. Tabla 7.1 Contribuciones de los efectos independientes de los genes y los efectos de la combinación de genes sobre el valor de cría (BV), valor genotípico (G) y valor combinatorio de los genes (GCV) en un locus hipotético T. a Genotipo BV G GCV(G-BV) TT 0,1 + 0,1 =0,2 0,2 0 Tt 0,1 +(-0,1) = 0 0,2 0,2 Tt 0,1 +(-0,1) =-0,2-0,2 0

14 a Como en el ejemplo anterior que involucraba al locus B y al peso maduro, se realizan asunciones simplificadoras para la claridad. Un nuevo modelo El modelo genético básico para caracteres cuantitativos puede ahora expandirse para incluir el valor de cría (BV) y el valor combinatorio de genes (GCV). Matemáticamente, Los pesos al destete de los tres terneros representados en la Figura 7.1 se muestran de nuevo en la Figura 7.4, esta vez con sus valores de cría hipotéticos y se incluye el valor combinatorio de los genes. El ternero (a) tiene el mayor peso al destete, pero note que la mayoría de su performance superior es debida tanto al ambiente o efecto genético que no pueden ser transmitidas a la cría. Si se desean pesos al destete altos, el mejor animal sería el ternero (c). A pesar de su performance mediocre este tiene el valor de cría más alto. El nuevo modelo para caracteres cuantitativos conserva muchas de las características del modelo base, como el valor genotípico, el valor de cría, y el valor combinatorio de genes son expresados como desviaciones positivas y negativas de la media poblacional. La media de los valores de cría y la media de los valores combinatorios en toda la población son por lo tanto 0. Así Además, el valor de cría y el valor combinatorio son considerados independientes del ambiente y entre ellos. Es muy posible tener animales altamente consanguíneos que sufran una seria depresión endogámica (valor de combinación de genes desfavorable) y aún así sean animales superiores para cría (valor de cría favorable). Igualmente, muchos animales cruza producen bien debido al vigor híbrido (valor combinatorio de los genes favorable) pero no son animales de cría particularmente buenos (valor de cría desfavorable).

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16 Una aplicación del nuevo modelo: Prueba de que el PD = La siguiente prueba ilustra las propiedades aditivas de los valores de cría; la independencia de BV,GCV y E; y la cancelación de las desviaciones cuando se promedian muchos registros. Considere un padre con valor de cría BVs y diferencia de progenie PDs. Si el padre es apareado con un gran número de hembras elegidas al azar de la población general, la performance promedio de su progenie ( ) debería ser Los valores combinatorios de los genes y los efectos ambientales son independientes de los valores de cría y en una gran población de progenie, las desviaciones positivas para estos valores deberían ser balanceadas por las desviaciones negativas. Así Si las madres son verdaderamente elegidas al azar de una población general, aquellas con valores de cría por encima del promedio deberían ser balanceadas con aquellas con valores de cría por debajo del promedio. El valor de cría promedio para las madres es por lo tanto 0. Entonces La diferencia de progenie del padre es simplemente la diferencia entre la performance promedio de su progenie y el promedio general de performance. Entonces Y en general,

17 HABILIDAD DE PRODUCCION El valor de cría es importante para la selección y el valor de combinación de genes es importante para su contribución en la performance animal. Para caracteres repetidos caracteres para los cuales los individuos poseen más de un registro de producción otro valor conocido como habilidad de producción (PA) es importante también. La habilidad de producción se refiere a la performance potencial de un individuo para un carácter repetido. Los siguientes caracteres son repetidos: producción de leche en las especies lecheras, producción de lana en las ovejas, la producción de gemelos en ovejas (como carácter de la madre, no del cordero), peso al destete en el ganado de carne (considerado como un carácter de la vaca, no del ternero) y habilidad para la carrera en caballos. En cada caso, la vaca, oveja o caballo individual comúnmente tiene más de un registro. La habilidad de producción para cada uno de estos caracteres representa el potencial del animal de producir leche, lana, gemelos, el peso al destete del ternero, o resultados en la carrera, respectivamente. El término habilidad de producción fue primero aplicado a la producción de leche en las especies lecheras. Se refería a la habilidad de un animal de manufacturar un producto leche. El término parece menos apropiado para otros caracteres en otras especies por ejemplo la habilidad para la carrera en caballos. El producto en este caso no es inmediatamente claro. Sin embargo, el concepto de habilidad de producción todavía es aplicable a los caballos; representa el potencial de un caballo para la carrera. caracteres repetidos: caracteres para los cuales los individuos poseen más de un registro de producción habilidad de producción (PA): se refiere a la performance potencial de un individuo para un carácter repetido. Efectos ambientales permanentes y temporarios La habilidad de producción es una función de todos aquellos factores que afectan permanentemente la performance potencial de un individuo. EL valor genotípico y sus componentes, el valor de cría y el valor combinatorio de los genes son determinados en la concepción. Y por lo tanto son afectados por los efectos permanentes. Algunas influencias ambientales también pueden afectar permanentemente la performance potencial. Por ejemplo, la nutrición del ternero es conocida por tener un efecto permanente en la habilidad de las vacas lecheras o de carne para producir leche. El entrenamiento de caballos jóvenes puede tener un efecto permanente en sus habilidades para la carrea en años posteriores. Los efectos ambientales que influencian permanentemente la performance de un animal para un carácter repetido son conocidos como efectos ambientales permanentes (Ep). La habilidad de producción es entonces

18 Y porque Entonces Note que la habilidad de producción no es puramente un valor genético ni puramente un valor ambiental; es una combinación de ambos. Muchos efectos ambientales no influencian permanentemente la performance potencial de un animal. Estos efectos temporarios, que influencian la performance de un animal una sola vez, pero no todas las veces, para la vaca de carne, la digestibilidad del forraje es un ejemplo de tal efecto ambiental temporario (Et). Una alta digestibilidad del forraje en los buenos años permite a una vaca producir mucha cantidad de leche y teneros pesados. La baja digestibilidad en malos años tiene el efecto opuesto. Sin embargo, el efecto de la digestibilidad del forraje es temporario. No influencia permanentemente a la habilidad de la vaca de producir terneros con altos pesos al destete. Un ejemplo análogo para los caballos de carrera es la condición de la pista. La condición de la pista en el día de la carrera (seca, embarrada, etc.) afecta a la performance del caballo en el día de la carrera, pero no tienen un efecto permanente sobre la habilidad para la carrera del caballo. Los efectos ambientales temporarios como este por lo tanto no son parte de la habilidad de producción. efectos ambientales permanentes (EP): efectos ambientales que influencia permanentemente la performance de un animal para un carácter repetido. efecto ambiental temporario (ET): un efecto ambiental que influencia a un solo registro de performance individual, pero no afecta permanentemente a la performance potencial del individuo para un carácter repetido. El modelo genético para caracteres repetidos EL modelo genético para un solo registro de performance de un individuo en un carácter para el cual los individuos típicamente tienen muchos registros puede ser escrito como: O La Figura 7.5 ilustra el modelo genético para caracteres repetidos. Se muestran esquemáticamente dos registros de dos vacas lecheras, Blessie y Flossie, para la producción de leche a los 305-días (medida en total de libras de leche producidas). Cada columna negra

19 en el primer plano representa un solo registro fenotípico. Las columnas en el segundo plano representan las contribuciones de los elementos del modelo genético para caracteres repetidos incluyendo la habilidad de producción para cada registro. El primer registro de lactación de Bessie es muy bueno, en parte por su habilidad de producción superior ( lb) y en parte por el efecto ambiental temporario favorable ( lb). Su segundo registro no es muy bueno. Su habilidad de producción no cambió es permanente pero un ambiente desfavorable (Et= lb) provocó que produzca menos leche. Flossie es una buena vaca desde el punto de vista genético (G= BV+ GCV= lb), pero un efecto ambiental permanente pobre (-4500 lb) ha provocado que sea una productora por debajo del promedio (PA = lb). A pesar de ello, un ambiente excelente en su primera lactación (Et= lb) le permitió lograr un registro superior al promedio.

20 Como hemos vistos en los modelos anteriores, los componentes del modelo genético para caracteres repetidos son expresados como desviaciones positivas o negativas de la media poblacional. El promedio de cada componente incluyendo la habilidad de producción a lo largo de una población completa es por lo tanto cero. Así Lo que es más, todos los componentes básicos. BV GCV. Ep y Et son considerados independientes entre sí. Un efecto ambiental temporario como la condición de la pista, por

21 ejemplo, no tienen nada que ver con el merito genético del caballo o con cualquier influencia ambiental permanente en la performance para la carrera del caballo. Igualmente, el ambiente permanente es asumido independiente del merito genético, a pesar de que en el caso de la carrera en caballos podría cuestionar esta asunción el mejor entrenamiento puede ser observado para aquellos caballos que se percibe que tienen el mayor potencial genético. Note que la habilidad de producción debería ser considerada independiente del grupo contemporáneo, pero no del valor de cría, el valor combinatorio de los genes y el efecto ambiental permanente. Debido a que la habilidad de producción es la suma de estos valores, no puede ser independiente de ellos. La importancia de la habilidad de producción Como una medida de la capacidad productiva, la habilidad de producción es de particular importancia para los productores comerciales. En una granja lechera comercial, por ejemplo, la habilidad de producción de las vacas combinadas con los efectos ambientales del manejo determinan justamente cuanta leche es producida para al venta. Y los granjeros lecheros típicamente alimentan a sus vacas de acuerdo a la habilidad de producción de cada vaca. Las predicciones de la habilidad de producción usualmente llamadas habilidades de producción más probables (MPPAs) son por lo tanto útiles y son comúnmente calculadas a partir de datos de performance. El MPPA de un animal, cuando es sumando a la media poblacional para un carácter, es una predicción del próximo registro del animal. Matemáticamente, Donde indica una predicción de la performance. No podemos predecir el próximo registro de un individuo exactamente porque nunca sabemos cuál será el efecto ambiental temporario en el registro. Sin embargo, podemos estar cerca, con una predicción de la habilidad de producción. La habilidad de producción es generalmente menos importante para los criadores de reproductores que para los productores comerciales. La preocupación principal de los criadores de reproductores, es siempre, el valor de cría. Sin embargo, no es inusual para un criador de reproductores seleccionar reemplazos en la base del potencial genético (EBVs o EPDs) y refugar los animales maduros malos productores en la base del MPPA. Los caballos de carreras proveen un buen ejemplo de cómo las predicciones del valor de cría y la habilidad de producción es usada de manera diferente. Si está decidiendo sobre que caballo apostar, la información más útil sería el MPPA para la habilidad en la carrera de cada caballo en la carrera. El caballo con el mejor MPPA debería tener la mejor habilidad de producción (es decir, la mejor probabilidad de ganar). Estaría apostando no solo al mérito genético del animal, sino también a su ambiente permanente su entrenamiento. Por el otro lado, si usted fuera dueño y acabara de retirar un caballo del stud, la pieza de

22 información más útil será el EBVC o EPD del caballo para habilidad para la carrera. EL valor de cría del semental, después de todo, determinara su último éxito como padre. habilidades de producción más probables (MPPAS): una predicción de la habilidad de producción. EL MODELO GENETICO Y LOS CARACTERES UMBRAL Los caracteres umbral fueron definidos en el capítulo 5 como caracteres poligénicos que no son continuos en su expresión, pero exhiben fenotipos categóricos. Un ejemplo de carácter umbral es la fertilidad (como una medida del éxito o fallo para la concepción). Se cree que la fertilidad está influenciada por muchos genes, y es por lo tanto un carácter poligénico. Pero con solo dos genotipos (preñada o no preñada), la fertilidad no es típicamente un carácter poligénico es un carácter umbral. Tenemos todas las razones para creer que los valores genotípicos, los valores de cría, el valor combinatorio de los genes, y los efectos ambientales para los caracteres umbral como la fertilidad son continuamente distribuidos (es decir, los animales pueden diferir en estos valores por muy pequeños incrementos.) Los caracteres umbral no son diferentes de los caracteres cuantitativos poligénicos en este aspecto. Pero los fenotipos para los caracteres umbrales no son expresados en escala continua, y eso crea un problema: Cómo puede P ser igual a cuando P puede tomar solo dos o pocos valores? Cómo podemos aplicar el modelo genético para los caracteres cuantitativos a los caracteres umbral? La respuesta es pensar sobre el carácter umbral como teniendo una escala continua subyacente. La escala subyacente para la fertilidad es ilustrada en la Figura 7.6. Es técnicamente incorrecto llamarla una escala fenotípica porque los fenotipos en los caracteres umbrales no son continuos. Esta escala a menudo es llamada escala de responsabilidad subyacente y puede pensar en la responsabilidad subyacente del animal para un carácter umbral como la suma de sus valores genéticos para un carácter (valores distribuidos continuamente) y su efecto ambiental para el carácter (también continua). El umbral es el punto en la escala de responsabilidad subyacente por encima de la cual los animales exhiben un fenotipo y por debajo de la cual exhiben otro. En la Figura 7.6 todos los animales a la izquierda del umbral (T) fallan en la concepción, y todos aquellos a al derecha del umbral conciben. Con el juego de manos provisto por la escala de responsabilidad subyacente ahora podemos aplicar el modelo genético para caracteres cuantitativos a los caracteres umbral. Podemos expresar los EBVs, EPDs, MPPAs, etc. Para estos caracteres en la escala de responsabilidad subyacente misma o en escalas continuas relacionadas que puedan ser más fáciles de entender.

23 umbral: es el punto en la escala de responsabilidad subyacente por encima de la cual los animales exhiben un fenotipo y por debajo de la cual exhiben otro

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