Investigando el Genoma en Pacientes con Esquizofrenia
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- Andrea Carrasco Giménez
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1 Investigando el Genoma en Pacientes con Esquizofrenia Facultad de Medicina Universidad Castilla La Mancha Jornada de Investigación Hospital Universitario de la Ribera Alzira,23 de octubre de 2013 Dra. Janet Hoenicka Genética y Fisiopatología de los Trastornos Cerebrales y Mentales Programa de Enfermedades Raras y Genéticas CENTRO DE INVESTIGACIÓN PRÍNCIPE FELIPE
2 La Herencia Compleja de la Esquizofrenia: Genes & Ambiente GENES/ Origen evolutivo Plasticidad del DESARROLLO Crecimiento/Epigenética AMBIENTE donde vive
3 Individualidad de la vulnerabilidad está en los genes Variación Genoma Humano: Somos diferentes en un 0.1% Polimorfismos Genes SNPs Polimorfismos Genómicos CNVs Alelo 1... G A C C A C G A... Alelo 2... G A T A A C G A... Variantes genéticas de riesgo vs Variantes genéticas de protección
4 Efectos de las variantes en la función del genoma Proyecto Genoma Humano GH (2001/2003): Cuál es la secuencia de bases del GH? 3 x 10 9 PROTEÍNAS Proyecto ENCODE (ENcyclopedia Of DNA elements)(2012): Cómo funciona el genoma humano? REGIONES INTERGÉNICAS Las variaciones de nuestro genoma constituyen: 1. Vulnerabilidad en los individuos que enferman 2. Diferencias en respuesta farmacológica
5 Colaboración CIPF/Hospital 12 de Octubre/Hospital de La Ribera: Estudio de las bases moleculares de la psicosis Área de Gestión Clínica de Psiquiatría, Hospital Universitario 12 de Octubre, Madrid Dr. Miguel Ángel Jiménez-Arriero. Jefe del Área de Gestión Clínica de Psiquiatría Dr. Roberto Rodríguez-Jiménez. IP de varias líneas de investigación en psicosis Grupo de Estudio de Psicosis del Hospital Universitario 12 de Octubre. Servicio de Psiquiatría Hospitalaria, Hospital Universitario La Ribera, Alzira, Valencia Dr. Tomás de Vicente. Jefe de Servicio de Psiquiatría. Grupo de Estudio de Psicosis del Hospital Universitario La Ribera. Centro de Investigación Príncipe Felipe, Valencia Dra. Janet Hoenicka. Programa de Enfermedades Raras y Genéticas Laboratorio de Genética y Fisiopatología de los Trastornos Cerebrales y Mentales Objetivos: 1.Estudio de pacientes con psicosis, valorando y correlacionando variables clínicas, de función cognitiva, de neuroimágen y genéticas analizando la evolución a lo largo del tiempo 2.Cartografiado genético de familias con esquizofrenia
6 Colaboración Hospital 12 de Octubre/Hospital de La Ribera/CIPF 1. Reclutamiento de pacientes Hospital 12 de Octubre/Hospital La Ribera 1. Diagnóstico 2. Criterios de exclusión/inclusión 3. Edad de inicio 4. Antecedentes familiares de trastornos mentales 5. Toma de muestra para extracción de ADN (Formulario de muestras y CI) 6. Variables clínicas, función cognitiva, neuroimágen 2. Estudios Genéticos Centro de Investigación Príncipe Felipe 1. Selección de la estrategia de análisis molecular 2. Extracción del ADN 3. Análisis Genéticos: Laboratorio El Servicio de Genómica y Genética Traslacional (SGGT) 3. Identificación de correlaciones Estudio de asociación de genes candidatos a rasgos y endofenotipos de la Esquizorenia Estudios Genómicos de familias con Esquizofrenia
7 Estudios de Asociación de Genes Candidatos : rasgos clínicos y endofenotipos se asocian a variaciones genéticas frecuentes Estudio genético de asociación Compara las frecuencias de los alelos de un polimorfismo genético en dos poblaciones definidas por un rasgo (casos/controles) Análisis de polimorfismos de un gen particular Pacientes Controles Genes asociados a rasgos y endofenotipos: Marcadores Genéticos
8 Estudios genómicos: Enfermedades frecuentes se asocian a variaciones genéticas raras Método Base Conclusiones en Esquizofrenia Análisis de secuenciación masiva Estudio de CNVs Copy number variation Tecnología alto rendimiento: análisis de regiones, genomas, exomas Identificación de polimorfismos, mutaciones, deleciones Compara cambios genómicos en pacientes y controles (100Kb o menor) Comparative Genome Hybridization (CGH) Gen SHANK3, KIF17, NRXN1 Aumento de mutaciones de novo 1. CNVs raras en múltiples regiones, CNV polimórficas NO se asocian 2. Contribución alta (7-20) /1000 casos 4. NO específicas para esquizofrenia (22q11.2; 15q13.3; 16p11.2; 1q21.1 y NRXN1) 5. Genes implicados en el neurodesarrollo 6. De novo CNVs
9 Estudios genómicos: Formas familiares se asocian a variaciones genéticas raras Array de CGH I Familia con Esquizofrenia I.1 I.2 Servicio de Genómica y Genética Traslacional SGGT Centro de Investigación Príncipe Felipe II III II.1 II.5 II.2 II.3 II.4 III.1 III.2 III.3 III.4 Genes causantes de Enfermedad
10 Investigación clínica: Rasgos Y Endofenotipos Hospital Universitario La Ribera Hospital Universitario 12 de Octubre Interacción Beneficio mutuo Investigación básica: Identificar Genes Implicados Centro de Investigación Príncipe Felipe Pacientes Investigación Molécula Psiquiatría clínica Psiquiatría molecular
11 Gracias!
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