Situación y perspectivas. del empleo de. Marcadores Genéticos. Ing. Agr. Pablo M. Corva, PhD Facultad de Ciencias Agrarias Univ. Nac.
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- Veronica Arroyo Coronel
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1 Situación y perspectivas del empleo de Marcadores Genéticos Ing. Agr. Pablo M. Corva, PhD Facultad de Ciencias Agrarias Univ. Nac. Mar del Plata
2 El ADN es una estructura de una complejidad admirable Pero para nosotros, lo importante es que el ADN es una fuente de información
3 Particularidades del ADN Todas las diferencias genéticas de producción entre animales se deben a características de su ADN. Está presente en todos las partes del animal, a todas las edades. Tiene una gran variabilidad entre animales, ya sea entre o dentro de razas.
4 Particularidades del ADN Se mantiene en los productos animales (Ej: carne, leche). Se puede extraer, procesar y conservar en forma relativamente sencilla en el laboratorio.
5 Distintas especies, fenotipos parecidos, el mismo gen afectado (miostatina)
6 Aplicaciones Análisis de paternidad y seguimiento de productos ( trazabilidad ) Detección de portadores de genes favorables o desfavorables Selección asistida por marcadores (SAM)
7 El circuito de generación de información con ADN: Diagnóstico Recomendación Definición de variantes genéticas Toma y envío de Muestra (pelo, sangre, semen) Extracción y procesamiento del ADN
8 Aplicaciones Análisis de paternidad y seguimiento de productos ( trazabilidad ) Detección de portadores de genes favorables o desfavorables Selección asistida por marcadores (SAM)
9 Doble Músculo Cuernos Pelajes Defectos, Enfermedades
10 Análisis de un caso: En Septiembre de 1999, se detectaron casos de Acondroplasia (Ternero Bulldog ) en la progenie de Igale, un destacado toro Holstein francés El centro de I.A. y el INRA trabajaron en conjunto para desarrollar un marcador genético. Se identificaron 75 pares vaca-ternero afectados y se obtuvo ADN. Se posicionó a la mutación en el mapa genético del bovino. El test para distinguir portadores estuvo disponible en marzo de 2000.
11 CA-LILL STANDOUT CAVALIER PI *RC*TV WHITTIER-FARMS NED BOY PI *TD*TL*TV MILK-A-LONG SKOKIE DAWN PI SINGING-BROOK N-B MASCOT PI ET *TD*TL*TV IGALE MASC CAL-CLARK BOARD CHAIRMAN PI *TD*TL JACKBUILT CHAIRMAN MANDY PI *TL FISHER-PLACE M AMANDA PI ET CARLIN-M IVANHOE BELL PI *BL*CV*TD SOUTHWIND BELL OF BAR-LEE PI *CV*TD*TL GALEGEADE SOUTHWIND VALIANT NAOMA PI ET E-Z-ACRES STARLIGHT BACHELOR PI BALADE VENISE
12 CA-LILL STANDOUT CAVALIER PI *RC*TV WHITTIER-FARMS NED BOY PI *TD*TL*TV MILK-A-LONG SKOKIE DAWN PI SINGING-BROOK N-B MASCOT PI ET *TD*TL*TV IGALE MASC CAL-CLARK BOARD CHAIRMAN PI *TD*TL JACKBUILT CHAIRMAN MANDY PI *TL FISHER-PLACE M AMANDA PI ET CARLIN-M IVANHOE BELL PI *BL*CV*TD SOUTHWIND BELL OF BAR-LEE PI *CV*TD*TL GALEGEADE SOUTHWIND VALIANT NAOMA PI ET E-Z-ACRES STARLIGHT BACHELOR PI BALADE VENISE
13 Aplicaciones Análisis de paternidad y seguimiento de productos ( trazabilidad ) Detección de portadores de genes favorables o desfavorables Selección asistida por marcadores (SAM)
14 Disección de la variabilidad cuantitativa : Uno de los mayores desafíos para la genómica animal
15 Cómo explicamos las diferencias entre reproductores? Genética Variabilidad Total
16 Cómo explicamos las diferencias entre reproductores? Genes Conocidos Genética Variabilidad Total
17 Relación entre maduración y dureza de la carne (según el genotipo para Calpaína) RC (kg) 8,00 7,50 7,00 6,50 6,00 5,50 5,00 4,50 4,00 7,52 6,95 6,74 6,62 5,63 5,90 5,52 4,45 4, Días Postmortem CC CG GG Soria et al, 2006
18 Cuál es la situación: El conocimiento del genoma bovino progresa muy rápidamente. El número de marcadores con aplicación potencial en MGA crece en forma constante. La tecnología genómica va a tener un rol relevante en producción animal. Debemos adaptar la nueva tecnología a cada sistema de producción (cada especie y aún cada país).
19 Cuestiones pendientes: Cómo confirmar y cuantificar el efecto de un marcador en cada situación? Cómo interpretar los resultados de un test? Letras, puntaje, estrellas Hay varios sistemas distintos!
20 Cómo interpretamos la información:?? GeneSTAR Marb GeneSTAR Tnd TenderGENE - - IgenityL T/C NCBA Tndr3 - - LeanGene1 + + CAB/OSU Marb + - LeanGene2 + - MeanGene + + LeanGene3 + + Ov. Rate GrowGene A + + CalvEze + - GrowGene B - - Moser, 2005
21 Cuestiones pendientes: Cómo confirmar y cuantificar el efecto de un marcador en cada raza? Cómo interpretar los resultados de un test? Cómo integrar a los marcadores en la evaluación genética? Cómo ponderar el valor del marcador? (Ejemplos: varios marcadores a la vez, toro con mal genotipo y buena DEP, toros jóvenes o hembras con DEP imprecisa, etc.)
22 Los marcadores moleculares no van a remplazar a las DEPs Hay que utilizar marcadores moleculares junto con las DEPs Progenitores Progenie Fenotipos Pruebas de ADN Fenotipos Pruebas de ADN Fenotipos Pruebas de ADN DEPs ajustados por marcadores Evaluación del mérito genético más preciso Casas, 2005
23 Tres posibles escenarios: Seleccionar en base al número de copias favorables (0, 1, 2) del marcador. Luego considerar las DEP. Seleccionar en base a DEPs. Luego, según el número de copias favorables (0, 1, 2) del marcador. (Reduce el costo de análisis). Ponderar la información de marcadores y DEP con algún criterio económico: I = v 1 x DEP PDD + v 2 x DEP EGD + v 3 x G M
24 Cuestiones pendientes: Los tests deberían estar supervisados (avalados) por las respectivas Asociaciones? Los análisis deberían hacerse en forma particular, o las Asociaciones deberían tratar con cada Laboratorio? Si el marcador se usa sólo para probar, que consecuencias puede traer a largo plazo?
25 Hay factores que limitan una mayor difusión de la tecnología genómica: No tenemos todavía un conocimiento detallado sobre la magnitud de los efectos de algunos genes (correlaciones?) Todavía hay poco incentivo debido a las prácticas de comercialización (costo / beneficio) Estratificación de la producción Algunos tests son considerados caros (los precios tienden a bajar)
26 Qué podemos hacer: Conocer la tecnología Apoyar y contribuir a una valoración objetiva de los marcadores Conservar muestras de ADN Organizar un banco de datos (reproductores con genotipo conocido) Otras ideas?
27 Muchas Gracias!
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