Marcadores moleculares asociados a la calidad de la canal y la carne. Lic. Eileen Armstrong, MSc. PhD. Área Genética Facultad de Veterinaria

Transcripción

1 Marcadores moleculares asociados a la calidad de la canal y la carne Lic. Eileen Armstrong, MSc. PhD. Área Genética Facultad de Veterinaria

2 ADN molécula que contiene la información genética En TODAS las células del individuo (cromosomas). No cambia a lo largo de la vida del animal. Contiene los GENES. Gen: porción del ADN con la información necesaria para generar una determinada proteína. Genoma: conjunto de ADN (con todos los genes) de una especie.

3 SNP Polimorfismo de un solo nucleótido. Cambia una base del ADN. Genera variantes para un mismo gen. Pueden estar dentro de genes o en otras regiones del ADN. Marcador genético.

4 Se conocen ya varios genes y SNPs relacionados al desarrollo y metabolismo del músculo y tejidos asociados (adiposo, conectivo). Especialmente en bovinos, suinos y aves, pero también en ovinos. Línea de investigación en Área Genética de la Facultad de Veterinaria: genética molecular de la calidad de la carne bovina y ovina. Objetivos: contribuir a detectar esos genes y SNPs. analizar cómo interactúan y cómo se asocian a características productivas. posibilitar la selección de animales que tengan las mejores variantes genéticas.

5 Para eso se necesitan: muestras de ADN de los animales Mediante análisis estadísticos se detectan asociaciones datos productivos (peso vivo, área del ojo del bife, peso de canal, % de grasa, terneza, etc )

6 Proyecto Asociación de SNPs de genes candidatos con caracteres de calidad de la carne y la canal en ovinos Análisis de 30 SNPs en genes específicos (análisis primario) Mediante análisis estadísticos se detectan asociaciones Datos tomados de la Prueba de Progenie y Evaluación Genética Poblacional de Texel, así como de otras poblaciones ovinas. Proyecto en ejecución. Financiación: ANII

7 Animales: Raza TEXEL: 494 corderos (generaciones 2008, 2009 y 2010) 42 carneros 282 madres Otras razas y cruzas de razas carniceras: 546 corderos de EEMAC

8 Características medidas en los corderos: Pre faena: -ganancia diaria de peso -pesos a diferentes edades y peso final vivo -estado corporal -área del ojo del bife y espesor de grasa por ultrasonido Post mortem: -conformación de carcasa, medidas y compacidad -peso de la canal caliente y fría -dimensiones del L. dorsi y área del ojo de bife medidos en el rack -espesor de grasa subcutánea -peso cortes con hueso -terneza instrumental -panel de degustación (terneza, sabor, aceptabilidad) -ph -color de la carne y la grasa -cantidad de grasa intramuscular Base de datos muy valiosa para la investigación!

9 BANCO DE ADN Extracción de ADN genómico de sangre y músculo. Banco: en el Área Genética de F.Vet y en INIA 1322 muestras de ADN (en procesamiento) Además: muestras de carne congelada y en alcohol (respaldos). Cada muestra perfectamente identificada con el ID del animal y sus datos.

10 Genes a analizar en esta etapa CAPN1 (calpaína; proteólisis de fibras musculares, terneza) LEPTINA (hormona del apetito; engorde) GH y GHR (hormona de crecimiento y receptor; desarrollo corporal) CAST (calpastatina; proteólisis de fibras musculares, terneza) FABP9 (fatty acid binding protein 9; metabolismo lipídico y engorde) FABP4 (fatty acid binding protein 4; metabolismo lipídico y engorde) IGF1 (insulin growth factor 1; desarrollo corporal y engorde) GDF8 (growth differentiation factor 8; miostatina, desarrollo muscular) (entre otros) Selección de SNPs en estos genes, basándonos en datos de la secuenciación del genoma ovino.

11 Base de datos Genoma Ovino Genoma de referencia: Texel

12 Ya contamos con: Fenotipos (mediciones en los animales) Muestras de ADN de 814 animales (banco, el cual sigue aumentando) Próximamente: genotipado de SNPs en los genes mencionados en el total de muestras del banco y análisis estadísticos de asociación genotipo-fenotipo.

13 Resultados esperados: Detección de genes asociados a calidad de la carne y la canal ovina. Validación de marcadores (genes) presentes en kits comerciales. Posibilidad de implementar Selección Asistida por Marcadores para aumentar progreso genético.

14 Proyecciones Genotipado masivo del genoma (mismos animales del banco de ADN, con datos fenotípicos). Chip 700k (aprox SNPs; en construcción) Estudio global de genes asociados a calidad de la carne. Generar información útil para posible selección genómica? Objetivos finales: Mejorar calidad de la canal y la carne ovina. Aumentar valor agregado del producto y de los reproductores.

15 Asociación de SNPs de genes candidatos con caracteres de calidad de la carne y la canal en ovinos Facultad de Veterinaria INIA SUL Facultad de Agronomía Scottish Agricultural College Sociedad de Criadores de Texel del Uruguay Financiación: Fondo InnovAgro - Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII), INIA. Duración: febrero 2011 a febrero 2013.

16 gracias!!!