Definición:Bioinformática

Transcripción

1 Bioinformática

2 Definición:Bioinformática La bioinformática es el estudio del contenido y flujo de la información en sistemas y procesos biológicos. Requieren el uso o el desarrollo de diferentes técnicas que incluyen: Informática Matemática aplicada Estadística ciencias de la computación inteligencia artificial química bioquímica para solucionar problemas, analizar datos, o simular sistemas o mecanismos, todos ellos de índole biológica y usualmente a nivel molecular.

3 Definición:Bioinformática El núcleo principal de estas técnicas se encuentra en la utilización de recursos computacionales para solucionar o investigar problemas sobre escalas de tal magnitud que sobrepasan el entendimiento humano. Herramientas matemáticas para extraer información útil de datos producidos por técnicas biológicas de alta productividad. Biólogos aprenden computación? Programadores aprenden biología? Formación de Bioinformáticos en Argentina.

4 En qué puede trabajar un Bioinformático? En el campo científico y empresario: - Desarrollo de medicamentos y vacunas - Modelización de especies - Desarrollo de estudios para análisis del genoma - Desarrollo estudios en modelización de los mecanismos de regulación de la expresión génica. En el campo de la Salud Pública: - Aplicación de métodos computacionales y matemáticos en inmunología y virología - Colaboración en estudios de biodiversidad - Elaboración de planes y políticas de salud - Participación en emprendimientos biotecnológicos

5 Cómo se puede hacer Bioinformática? Usar programas, sin escribirlos. Expertos en el uso de programas bioinformáticos. Escribir simples programas, cuando no haya nada para usar. Muchos biólogos quieren aprender a programar (hacer scripts). Escribir programas complejos y algortimos. Cuando ya no esta al alcance de cualquier programador básico. Programar lleva tiempo. Programación es un trabajo intensivo.

6 Par qué hacer Bioinformática? Razones cientificas. Cantidad de datos existentes Enorme cantidad de datos biológicos basicos. Genomas. Base de datos existente. Necesidad de manipular estos datos. Manejo de nuevos datos Nuevas herramientas. (microarrays, gene chips). Nuevas tecnologías.dato dinámico. Automatizar Ahorrar tiempo. Disminuir cantidad de errores.

7 Base de datos. Alineamientos de secuencias. Motivos. Filogenia. Estructura terciaria de proteínas Microarray.

8 Base de datos. Conjunto de datos pertenecientes a un mismo contexto y almacenados sistemáticamente para su posterior uso NCBI EMBL (European Molecular Biology Laboratory) Gran cantidad de datos compartidos en la web. Como manipular lo que me sirve.

9 Alineamientos de secuencias. Es una forma de representar y comparar dos o más secuencias de ADN o ARN o estructuras proteícas para resaltar zona de similitud, que podrían indicar relaciones funcionales o evolutivas.

10 Motivos. (motifs). Es un patrón de nucleotidos o aminoácidos, que tiene un rol biológico. Weblogo, una herramienta para la visualización de patrones en un conjunto de sucuencias alineadas. agctaaaggcttgcgaaggct agctaaaggcttgagaaggct agctcaaggcctgagaaagct agctaaaggcttgagagggct agctaaaggcttgagaaggct cgctaaaggcttgcgaatgct agcttaaggcttgagaaggct agctcaaggcttgagaaggct

11 Filogenia Determinación de la historia evolutiva de los organismos. Encontrar los lazos genealógicos entre organismos, reconstruyendo la relación evolutiva entre especies. Clasificación filogenética. Árbol filogenético.

12 Estructura terciaria (cuaternariavarias subunidades) de proteínas

13 Microarray (chip de DNA). Es una superficie sólida a la cual se unen una serie de fragmentos de ADN. Observar de forma casi instantánea la expresión de todos los genes del genoma de un organismo.