PROGRAMA DE ESTUDIOS DE PEDAGOGIA EN QUIMICA Y BIOLOGIA. Código de asignatura (Res ; 2005); (Res ; 2007)

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1 UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE FACULTAD DE QUIMICA Y BIOLOGIA PROGRAMA DE ESTUDIOS DE PEDAGOGIA EN QUIMICA Y BIOLOGIA Asignatura Bioquimica Requisitos Química Orgánica II Código de asignatura (Res ; 2005); (Res ; 2007) Departamento Biología Autor Claudio Vásquez G. Versión 2º Semestre 2008 TEL OBJETIVOS GENERALES DEL CURSO 1. Entender la estructura y función de las principales moléculas precursoras que constituyen la estructura celular 2. Adquirir los conocimientos necesarios para entender las propiedades de las enzimas, sus propiedades catalíticas y regulatorias 3. Adquirir los conocimientos básicos de Bioquímica (en términos teóricos), poniendo especial atención en el entendimiento de las principales rutas metabólicas y en como estas se integran para explicar en forma coherente el metabolismo general 4. Acercarse a los principios físico-químicos de las técnicas requeridas para la purificación y análisis de moléculas de interés bioquímico y sus propiedades (cromatografía, electroforesis, espectroscopia, etc.). 5. Conocer las herramientas informáticas al servicio de esta disciplina 6. Valorar el aporte fundamental de la bioquímica al desarrollo científicotecnológico. 7. Utilizar bibliografía seleccionada en el área, en idioma inglés. Objetivos metodológicos: 1. Manipular los aparatos relacionados con las técnicas de análisis de proteínas y ácidos nucleicos 2. Manipular la infraestructura general y específica de un laboratorio de investigación 3. Elaborar disoluciones, tampones y reactivos en general

2 UNIDADES TEMATICAS Estructura y catálisis 28 Bioenergética y metabolismo 28 Transmisión de la información 28 Evaluación 6 Las horas se contabilizan para un semestre de 15 semanas 90 horas en total lectivas, e incluyen las de laboratorio. BIBLIOGRAFIA 1. Nelson, D.L. and Cox, M.M. (2004). Lehninger Principles of Biochemistry, 4 th Edition. W H Freeman & Co. 2. Berg, J.M., Tymoczko, J.L. and Stryer, L. (2002). Biochemistry. 5 th Edition. W H Freeman & Co. EVALUACION Teoría: Se aplicará 3 Pruebas Específicas Programadas. Su promedio será ponderado en 50%. Laboratorio: Habrá desarrollo de experiencias de laboratorio, controles y presentación de informes. Ponderación del promedio de la nota de laboratorio: 50%. Para aprobar en la asignatura, se requiere que ambas notas sean a lo menos igual a 4.0. Si en la parte de teoría, el promedio fuese inferior a 4,0 el estudiante tendrá derecho a un examen, que será ponderado en un 40% y el promedio de las PEPs será ponderado en un 60%. Programa de clases teóricas A) ESTRUCTURA Y CATÁLISIS I. El Agua -Interacciones débiles en sistemas acuosos -Ionización del agua. Ácidos y bases débiles -Amortiguadores de ph en sistemas biológicos -El agua como reactante -Adaptación de los organismos vivos a ambientes acuosos II. Aminoácidos, péptidos y proteínas -Estructura y propiedades químicas de los aminoácidos -Péptidos y proteínas. Estructura y propiedades -Aislamiento y purificación de proteínas -Estructura covalente de las proteínas -Secuencias proteicas y evolución

3 III. Estructura tridimensional de las proteínas -Introducción a la estructura de las proteínas -Estructura secundaria -Estructuras terciaria y cuaternaria -Desnaturación y plegamiento de las proteínas -Actividad biológica y función de las proteínas IV. Las enzimas -Conceptos generales -Cómo actúan las enzimas -Cinética de reacciones enzimáticas -Mecanismos de reacciones enzimáticas -Regulación de la actividad de las enzimas V. Hidratos de carbono -Monosacáridos y disacáridos. Estructura, nomenclatura y propiedades -Polisacáridos -Glicoconjugados: Proteoglicanos, glicoproteínas y glicolípidos VI. Nucleótidos y ácidos nucleicos -Bases nitrogenadas, nucleósidos y nucleótidos. Estructura, nomenclatura y propiedades -Estructura de ácidos nucleicos. DNA y RNA -Propiedades químicas de los ácidos nucleicos -Síntesis química y secuenciación de DNA -Funciones bioquímicas de los nucleótidos VII. Lípidos -Lípidos de almacenamiento. Estructura, propiedades y nomenclatura -Lípidos estructurales de membranas -Función de lípidos: Hormonas esteroidales, vitaminas B) BIOENERGÉTICA Y METABOLISMO I. Principios de bioenergética -Introducción -Bioenergética y termodinámica -El ATP y la transferencia de grupos fosforilos -Reacciones REDOX biológicas II. Glicólisis, gluconeogénesis y la vía de las pentosas -Reacciones de la glicólisis y su regulación -Fermentación: Destinos del piruvato bajo condiciones anaeróbicas -Reacciones de la gluconeogénesis -Oxidación de la glucosa por la vía de las pentosas fosfato III. El ciclo del ácido cítrico

4 -Producción de acetil coenzima A -Reacciones del ciclo del ácido cítrico -Regulación del ciclo del ácido cítrico -El ciclo del glioxilato IV. Catabolismo de ácidos grasos -Digestión, movilización y transporte -Oxidación de ácidos grasos -Cuerpos cetónicos V. Oxidación de aminoácidos y el ciclo de la urea -Destinos metabólicos de los grupos amino -Excreción de nitrógeno y ciclo de la urea -Vías de degradación de aminoácidos V. Fosforilación oxidativa -Reacciones de transferencia de electrones en la mitocondria -Síntesis de ATP -Regulación de la fosforilación oxidativa VI. Biosíntesis de lípidos -Biosíntesis de ácidos grasos -Regulación de la biosíntesis de ácidos grasos VII. Biosíntesis de aminoácidos y nucleótidos -Introducción al metabolismo nitrogenado -Biosíntesis de aminoácidos -Moléculas derivadas de aminoácidos -Biosíntesis y degradación de nucleótidos C) TRANSMISIÓN DE LA INFORMACIÓN I. Genes y cromosomas -Elementos cromosomales -Sobreenrrollamiento del DNA -Estructura de los cromosomas II. Metabolismo de ácidos nucleicos. DNA y RNA -Replicación del DNA -Tipos de mutaciones -Reparación del DNA -Transcripción -Procesamiento del RNA -Síntesis de DNA y de RNA dependiente de RNA III. Metabolismo de proteínas

5 -El código genético -Biosíntesis de proteínas -Inhibidores de la traducción -Modificaciones postraduccionales, destino y degradación de proteínas IV. Regulación de la expresión génica -Principios de regulación de la expresión génica -Regulación de la expresión génica en procariotes (operón lac, operón trp -Regulación de la expresión génica en eucariotes a.- Teórico: Se realizarán tres pruebas en las fechas indicadas en el calendario cuya nota será promediada y constituirá el 50% de la nota final del curso. La materia de las pruebas es acumulativa. b.-trabajos Prácticos: Se evaluará cada informe cuyas notas junto a las notas de los controles serán promediadas y constituirán el 50 % de la nota final de la asignatura. c.-la aprobación de curso se obtiene cuando, en cada actividad (a y b), el promedio final es igual o superior a 4.0. d.-los alumnos que tengan aprobada la parte práctica del curso y cuya nota final en la parte teórica sea inferior a 4.0, tendrán derecho a rendir un examen escrito que incluirá todos los contenidos del curso y corresponderá al 40% de su nota final de teoría. Su nota de presentación al examen corresponderá al 60% y será la nota final obtenida en la parte teórica previo al examen. e.- Las normas de evaluación y aprobación son aquellas determinadas por el reglamento de la Universidad. ASISTENCIA El alumno debe cumplir OBLIGATORIAMENTE como mínimo un 80% de asistencia a las clases teóricas. Aquel que no cumpla con este requisito reprobará automáticamente la asignatura en forma inapelable. La asistencia a los trabajos prácticos de laboratorio es OBLIGATORIA; la inasistencia sin la debida justificación por parte de la Facultad, será motivo de reprobación de la actividad práctica. Los trabajos prácticos bajo ninguna circunstancia son recuperables, por lo que la inasistencia justificada no implica una nueva oportunidad para su realización y no podrá exceder un 25% del total de ellos.