ANÁLISIS ESPACIAL, SISTEMAS DE INFORMACIÓN GEOGRÁFICA Y ELABORACIÓN DE MAPAS EPIDEMIOLÓGICOS EN SALUD PÚBLICA

Transcripción

1 ANÁLISISESPACIAL,SISTEMASDEINFORMACIÓN GEOGRÁFICAYELABORACIÓNDEMAPAS EPIDEMIOLÓGICOSENSALUDPÚBLICA Unadelasprimerasaplicacionesdelanálisisespacialepidemiológicotuvolugarenel1832,cuandoelgeógrafo CharlesPicquetutilizóunmapapararepresentarelporcentajedemuertesporcólera(porcada1.000habitantes) enlosdistritosdeparís. AunquefueJohnSnow,consideradoelpadredelaepidemiología,elprimeroqueutilizóunrudimentariosistemade informacióngeográficacomoapoyoalatomadedecisiones,enel1854,paralocalizarelorigencausantedelbrote decóleradelondres:unpozodeaguaeneldistritodelsoho. El primer GIS (Graphical Information System), como tal, fue el desarrollado por Roger Tomlinson, en el 1962, en Canadá,paralagestióndelosrecursosnaturalesdelpaís(tiposyusosdelsuelo,agricultura,silvicultura,...). ResultanindiscutibleslanecesidadylasaplicacionesdelossistemasdeanálisisespacialenlaEpidemiologíayen lasaludpúblicaengeneral,aportandofuncionalidadesderecoleccióndedatos,almacenamiento,análisisy visualizacióndelosmismos,conelpropósitodesimplificarypotenciarlascapacidadesdeanálisisdelasituación, vigilanciadelasalud,apoyoatomadedecisiones,soportealasactividadesdeprevenciónypromocióndelasalud, monitoreodedesigualdades,evaluacióndelimpactodelasintervencionespoblacionais,deteccióndeclusters,... LaDirecciónGeneraldeSaludPúblicaproponelautilización,siemprequeseaposible,deherramientasde softwarequeseansencillasdemanejoyquenoseanintrusivasconelsistemainformático,queseanportables, multiplataformay,además,defuentesabiertasygratuitas.paraeltemaconcretodelosanálisisespacialesen epidemiologíaylossistemasdeinformacióngeográfica,seproponenlarealizacióndeloscálculosnecesariosen losprogramashabitualesparaestastareas(epidat,rcommander,libreofficecalc,openepi,...)ylautilización del software QGIS ( Parafacilitarelusodesoftwareepidemiológico,estaDirecciónGeneraldesarrollóunproyectollamado BioStatFLOSS ( software(portable,libreygratuito)parawindowsdentrodelcualpodemosencontrarlaaplicaciónqgis,listapara usar(sinnecesidaddeinstalación).másinformación aquí. Comocomplemento,enlapropiawebdeladireccióngeneral( se encuentra un repositorio de mapas que sirven de base cartográficaparalostrabajosdeanálisisespacio -temporaldelosdatosepidemiológicos,degaliciaydeotras zonasgeográficas. Veamos,enunosejemplos,cómoutilizaríamoselQGIS.Enelprimerejemplorepresentaremosciertosdatos, coloreadosporayuntamientos.enelsegundoejemplo,comprobaremoscómogeocodificardireccionespostales (obtener las coordenadas) con QGIS. EJEMPLO 1: Creacióndeunmapadevalores(calculadospreviamente)porayuntamientos LanzamoselBioStatFLOSSyelegimoselbotónQGIS.Esperamosaquesecargueelprograma. UnavezqueelQGISestáoperativo,tendremosuncontornodetrabajosimilaraeste:

2 Cargamoslacapageográficaquenecesitemosparalarepresentacióndenuestrosdatos(enestecasoelmapade ayuntamientos de Galicia). Nota:Enelcasodenodisponerdeunacapadelímitesadministrativosporayuntamientos(enformatoSHP)se puededescargardelawebdesaludpública( Una vez que tenemos la capa SHP en nuestro equipo solo hay que localizar la carpeta correspondiente en el "panel del explorador" del QGIS, pinchar dos veces (doble clic) en el fichero SHP correspondiente (en este caso, en el fichero "Concellos_IGN_fusion_Oza_Cesuras.SHP" CargadalacapadeAyuntamientos,tendríamosuncontornodetrabajosimilaraeste:

3 Observamos que, ahora, tenemos la capa cargada en el "panel de capas" Automáticamenteelprogramaleasignóuncolor(lila,enestecaso)almapa.Cambiaremosesecolorparadejarlo enblanco(yasíquenospermitacargarotracapaporencimadeestaenlaquecolorearemoslosdatosque queremos representar). Paracambiarelcolordefondodelmapanossituaremosconelpunteroencimadelnombredelacapa (Concellos_IGN,enestecaso)enelpaneldecapasyledaremosalbotónderechodelratón(yapareceráunmenú contextual) como este: Seleccionamoselitem"propiedades"yapareceráunaventana: EnlaquedeberemosseleccionarelapartadoESTILOdelmenúdelaizquierda:

4 Ahílepodremoscambiarelcolor(enelapartado"color",seleccionandoelcolorblancoqueeselquequeremos utilizar) Obtendremos el siguiente mapa:

5 Unavezquetenemoslacapageográficacargadaenlascondicionesidóneas,procederemosaincluirunacapa con los datos que necesitamos para representar lo que pretendemos. Enestecasoconcreto,consisteenunahojadecálculoenformatoODSdeLibreOfficequepasaremosaincluir como una nueva capa en nuestro proyecto. Paraeso,vamosalaopciónde"capa"delmenúdelQGISy,en"añadircapa"seleccionamoslaopción"Add spreadsheetlayer"(quenospermiteañadirunacapaenformatodehojadecálculoxls,xlsxuods). Aparece una ventana semejante a esta

6 enlaquepodremoselegirelfichero(ods,enestecaso)ylahojadecálculoacargar(encasodequetuviéramos varias).además,muestraunaprevisualizacióndelosdatos. Nota:Encasodequenoaparezcalaopcióndeañadirunacapadehojadecálculo"Addspreadsheetlayer", deberemos instalar un complemento llamado "Spreadsheet Layers" desde el administrador de complementos (opción"complementos"delmenú)quepermitelaimportacióndeficherosdehojadecálculo(excel,libreoficce, OpenOffice,...) como una nueva capa. Una vez cargados estos datos, tendremos una nueva capa cargada (que podremos observar en el "panel de capas") Asítendremosdoscapascargadas,unageográficayotradedatos. Elsiguientepasoesuniresasdoscapasparaquelosdatosquetenemosenlacapadelahojadecálculo coincidanconelayuntamientocorrespondientedelacapageográficadeayuntamientos. Parahaceresto,enelpaneldecapas,nossituamosencimadelnombredelacapaSHPy,conelbotónderecho, hacemosclicyseleccionamoslaopción"propiedades".unavezquesemuestralaventanadediálogo correspondiente,vamosalaopción"uniones"(dellistadodelaizquierda)ypresionamosenelsímbolodel"+"para crearlaunióndeestacapashpconlacapadedatosarepresentar.

7 YyapodemosdarleaOKyvolveralaventanaprincipaldelprograma(enlaqueapareceelmapa,todavíasin colorear). Vamos,ahoraacolorearelmapasegúnnuestroscriterios(porelvalordeunodeloscamposdelatabladedatos unidaalacapashp).abrimos,denuevo,laventanadediálogodepropiedadesdelacapashp(botónderecho encimadelnombredelacapa,enelpaneldecapas,yclicenpropiedades)yvamosalaopcióndeestilo: Segúneltipodevaloresdelcampoquequeremosrepresentar,podremoselegirentretresopciones, fundamentalmente: - Símboloúnico Unsolocolorparatodoelmapa - Categorizado Uncolorparacadavalordistintodelcampoarepresentar - Graduado Coloresporintervalospreviamentedefinidos,enelrangodevaloresdelavariable. En este caso, queremos representar un color para cada valor distinto de la variable elegida, por lo que optaremos porlaopcióndeestilo Categorizado: Seleccionamos "categorizado" en el primer desplegable, en el campo columna elegimos el valor a representar (en estecasoelcamposellama"zona")yledamosalbotónde"clasificar"paraquecalculeloscoloresparacadauno de los valores (distintos) de esa variable (de ese campo).

8 Unavezrealizadoesteproceso(despuésdecambiarloqueprecisemosencuantoacolores,parámetros,...), presionaremoselbotónokyobtendremoselmapadeseado. Encasodequequeramosañadirlealgunaetiqueta(porejemplo,enestecasopodríamosetiquetarlosnombreso loscódigosdelosayuntamientos -o los valores representados-) tendremos que volver a abrir las propiedades de la capa (en el Panel de Capas) y seleccionar el apartado "Etiquetas". Seleccionamos "Mostrar etiquetas para esta capa",indicamoselcampoquequeremosqueaparezcaenlaetiqueta(enesteejemploelcódigodelayuntamiento) y presionamos OK. Y obtendremos el mapa deseado:

9 EJEMPLO 2: GeocodificaciónenQGIS ParageocodificarenQGIStenemoslaopcióndeutilizarelpluginMMQGIS.Elprimerpasoseráinstalarelplugin: DesdeQGISvamosalmenúsuperiorComplementos>Administrareinstalarcomplementos.Buscamosel complemento MMQGIS y los instalamos. ElcomplementoMMQGISnospermitegeocodificarvariasdireccionesalmismotiempo.Sóloesprecisocrearun archivoenformatocsv(conlacodificaciónutf -8). PodemoscrearelarchivoCSVpartiendodeunahojadecálculo.Crearemosellistadodedireccionescon,porlo menos,lossiguientesnombresdecolumna:address(direccióncompleta),city(ciudad),state(comunidad AutónomaenelcasodeEspaña),Country(país). Guardamos el archivo como texto delimitado por comas (CSV). ElsiguientepasoesabrirestearchivoCSVconuneditordetexto(cómo Notepad++ por ejemplo) para modificar sucodificaciónautf -8 : Guardamos los cambios y vamos a QGIS. Parainiciarelprocedimiento,hacemosclicenelmenúsuperiorMMQGIS>Geocode>GeocodeCSVwithGoogle/ OpenStreetMap: Acontinuaciónseabreunaventanaconlosparámetrosquedebemosintroducirpararealizarlacodificaciónconun servicioweb.losparámetrosaingresarserán: Input CSV File: ruta del archivo CSV. En UTF-8!. AddressField,CityField,StateFieldyCountryField:serellenaránautomáticamente,yaqueelnombre coincide. Web Service: OpenStreetMap / Nominatim (o Google Maps). OutputShapefile:larutayelnombredelacapaquesecreará. NotFoundOutputList:larutayelnombredelarchivoCSVquesecrearáconlasrutasnocodificadas.

10 Aceptamos y esperamos unos segundos para ver el resultado: NOTA:Paracualquierduda,sugerenciaocomentariorelacionadoconlautilizacióndelQGIScomoSistemade InformaciónGeográficaenSaludPúblicaodelpropioBioStaFLOSS,puedecontactaratravésdel soporte.epilinux@sergas.es