El código genético es universal y degenerado 64 posibles combinaciones de tripletes solo 20 aminoácidos
Las secuencias se pueden traducir en tres diferentes marcos de lectura
Los intermediarios entre los codones y los aminoácidos son los trna tienen una longitud de aproximadamente 80 nucleótidos
Interacción codón-anticodón la 3ª posición puede no aparear (hipótesis del bamboleo ) las bacterias tienen 31 diferentes trna los eucariontes tienen 48
El apareamiento en la tercera posición es laxo
Bases modificadas que se encuentran en los ARNt Pseudouracilos (ψ) 4 tiouridina 2 metilguanina 2 isopententenil adenina Dihidrouridina (D) Inosina
Las aminoacil trna sintetasas acoplan el aminoácido con la molécula de trna
Las aminoacil ARNt sintetasas tienen varios sitios importantes
Aminoacil-tRNA sintetasas
Existen diferentes interacciones entre las enzimas con sus trna s
Existe un mecanismo de corrección tanto para el trna como para el aminoácido
Aminoácidos similares pasan por un doble filtro
El crecimiento de la cadena polipeptídica es por adición del amino al grupo carboxilo
La traducción se realiza en los ribosomas
Ribosomas procariontes y eucariontes
Sitios de unión del trna al ribosoma
El ARNr juega un papel muy importante en la traducción
Interacciones con ARN de la subunidad chica del ribosoma permite un reconocimiento correcto
La síntesis de proteínas tiene 3 etapas
Factores de iniciación IF3 IF1 30S subunit Portion of 16S rrna The mrna binds to the 30S subunit. The Shine-Dalgarno sequence is complementary to a portion of the 16S rrna. IF3 IF1 5 Shine- Start Dalgarno codon sequence (actually 9 nucleotides long) 3 IF2, which uses GTP, promotes the binding of the initiator trna to the start codon in the P site.
trna fmet GTP IF2 IF3 IF1 Initiator trna 5 3 IF1 and IF3 are released. IF2 hydrolyzes its GTP and is released. The 50S subunit associates. trna fmet 70S initiation complex E P A 70S initiation complex This marks the end of the initiation stage 3
Interacción del ribosoma con el RNAm
Interacción con el ARNr 16S
En bacterias los mensajes policistrónicos tienen varios sitios de reconocimiento del ribosoma Shine-Dalgarno 5 AGGAGGU3
En bacterias existen dos aminoacil- trna para met El fmet-trna iniciador tiene características especiales En la mitad de los casos, la metionina es removida de la proteína Reconoce los codones AUG ó GUG
Solo el trna de inicio entra al sitio P
Factores de iniciación forman un complejo con los extremos del mensaje
Complejo de la subunidad pequeña y el trna de inicio
Complejo mensaje-ribosoma
Diferentes factores de iniciación están involucrados en eucariontes
En eucariontes el reconocimiento del codón de inicio es diferente Regla de Kozak
Proteínas adicionales requeridas para la traducción (factores de elongación) EF-Tu, EF-G bacterias EF1, EF2 eucariontes
El polipéptido se trasloca al aminoacil-trna La actividad de peptidil transferasa está asociada al ARNr 23S
La traslocación ocurre en dos pasos
Los dos factores de elongación tienen funciones distintas
El final de la traducción se marca con tres codones específicos (UAA, UAG, UGA) que no son reconocidos por ningún trna UAA ocre UAG ambar UGA UAA RF1 RF2 La peptidil transferasa cataliza la transferencia del péptido a una molécula de agua y el péptido se libera Factores de terminación
El factor de liberación eucarionte semeja a un trna
erf1 utiliza agua para hidrolizar el péptido
Los ribosomas se reciclan al final de la traducción
El papel de la hidrólisis de GTP Se hidrolizan 2 GTP s por cada aminoácido incorporado La hidrólisis promueve cambios conformacionales Cargado de trna con su aminoácido 1 ATP (2 enlaces) /Aa TRADUCCION Iniciación 1 GTP Elongación 2 GTP/ Aa Terminación 1 GTP
Comparación entre la traducción procarionte y eucarionte
Síntesis en polisomas
Regulación a nivel de la traducción
Inhibidores en la síntesis de proteínas se usan como antibióticos
Inhibidores de la síntesis de proteínas en eucariontes y en procariontes
Selenocisteína es introducida en el codón de paro UGA