PRINCIPIS DE BIOQUÍMICA I BIOLOGIA MOLECULAR Objectiu: unificar conceptes. PROGRAMA: 1) Conceptes bàsics: DNA recombinant, transformació, clonació, vector. 2) Recombinació de DNA in vitro: tall i unió de molècules de DNA, enzims per a la manipulació d àcids nuclèics (enzims de restricció i lligasses). 3) Vectors de clonació: plàsmids, bacteriòfags, còsmids i YACS. 4) Clonació i aillament de gens: genoteques genòmiques i de cdna, marcatge d àcids nucleics, hibridació d àcids nucleics, altres estrategies de cribatge (doble híbrid, expressió funcional...). 5) Anàlisi de gens clonats: Southern, Northern, PCR, Seqüenciació del DNA: mètode de Sanger, seqüenciació automàtica. 6) Recombinació de DNA in vivo: inserció i substitució a llevat. Transgènia a animals superiors. 7) Expressió de gens clonats: caset d expressió, expressió a E.coli, expressió a cèl.lules de insecte, expressió a cèl.lules de mamífer. Teràpia gènica. BIBLIOGRAFIA Introduction to Genetic Analysis. 7th ed. Griffiths, Anthony J.F.; Miller, Jeffrey H.; Suzuki, David T.; Lewontin, Richard C.; Gelbart, William M. New York: WH Freeman and Co; c1999. Molecular Cell Biology. 4th ed. Lodish, Harvey; Berk, Arnold; Zipursky, S. Lawrence; Matsudaira, Paul; Baltimore, David; Darnell, James E. New York: WH Freeman and Co; c1999. Genomes. 2nd ed. Brown, T. A. Oxford, UK: BIOS Scientific Publishers, Ltd 2002. Human Molecular Genetics 2. 2nd ed. Strachan, Tom and Read, Andrew P. Oxford, UK: BIOS Scientific Publishers Ltd; 1999. Ingeniería Genética y transferencia Génica. Marta Izquierdo Rojo; Editorial Pirámide Madrid, 2001
PROGRAMA: 1) Conceptes bàsics: DNA recombinant, transformació, clonació, vector. 2) Recombinació de DNA in vitro: tall i unió de molècules de DNA, enzims per a la manipulació d àcids nuclèics (enzims de restricció i lligasses). 3) Vectors de clonació: plàsmids, bacteriòfags, còsmids i YACS. 4) Clonació i aillament de gens: genoteques genòmiques i de cdna, marcatge d àcids nucleics, hibridació d àcids nucleics, altres estrategies de cribatge (doble híbrid, expressió funcional...). 5) Anàlisi de gens clonats: Southern, Northern, PCR, Seqüenciació del DNA: mètode de Sanger, seqüenciació automàtica. 6) Recombinació de DNA in vivo: inserció i substitució a llevat. Transgènia a animals superiors. 7) Expressió de gens clonats: caset d expressió, expressió a E.coli, expressió a cèl.lules de insecte, expressió a cèl.lules de mamífer. Teràpia gènica.
PROGRAMA: 1) Conceptes bàsics: DNA recombinant, transformació, clonació, vector. 2) Recombinació de DNA in vitro: tall i unió de molècules de DNA, enzims per a la manipulació d àcids nuclèics (enzims de restricció i lligasses). 3) Vectors de clonació: plàsmids, bacteriòfags, còsmids i YACS. 4) Clonació i aillament de gens: genoteques genòmiques i de cdna, marcatge d àcids nucleics, hibridació d àcids nucleics, altres estrategies de cribatge (doble híbrid, expressió funcional...). 5) Anàlisi de gens clonats: Southern, Northern, PCR, Seqüenciació del DNA: mètode de Sanger, seqüenciació automàtica. 6) Recombinació de DNA in vivo: inserció i substitució a llevat. Transgènia a animals superiors. 7) Expressió de gens clonats: caset d expressió, expressió a E.coli, expressió a cèl.lules de insecte, expressió a cèl.lules de mamífer. Teràpia gènica.
PROGRAMA: 1) Conceptes bàsics: DNA recombinant, transformació, clonació, vector. 2) Recombinació de DNA in vitro: tall i unió de molècules de DNA, enzims per a la manipulació d àcids nuclèics (enzims de restricció i lligasses). 3) Vectors de clonació: plàsmids, bacteriòfags, còsmids i YACS. 4) Clonació i aillament de gens: genoteques genòmiques i de cdna, marcatge d àcids nucleics, hibridació d àcids nucleics, altres estrategies de cribatge (doble híbrid, expressió funcional...). 5) Anàlisi de gens clonats: Southern, Northern, PCR, Seqüenciació del DNA: mètode de Sanger, seqüenciació automàtica. 6) Recombinació de DNA in vivo: inserció i substitució a llevat. Transgènia a animals superiors. 7) Expressió de gens clonats: caset d expressió, expressió a E.coli, expressió a cèl.lules de insecte, expressió a cèl.lules de mamífer. Teràpia gènica.
CRE-RECOMBINASE A Cre recombinase ataacttcgtata gcatacat tatacgaagttat loxp B loxp loxp Excision of a loxp flanked region loxp
Cloning vector Size of insert Standard high copy number plasmid Bacteriophage λ insertion Bacteriophage λ replacement Cosmid PAC (P1 artificial chromosome) BAC (bacterial artificial chromosome) YAC (yeast artificial chromosome) 0-10 kb 0-10 kb 9-23 kb 30-44 kb 130-150 kb up to 300 kb 0.2-2.0 Mb
PROGRAMA: 1) Conceptes bàsics: DNA recombinant, transformació, clonació, vector. 2) Recombinació de DNA in vitro: tall i unió de molècules de DNA, enzims per a la manipulació d àcids nuclèics (enzims de restricció i lligasses). 3) Vectors de clonació: plàsmids, bacteriòfags, còsmids i YACS. 4) Clonació i aillament de gens: genoteques genòmiques i de cdna, marcatge d àcids nucleics, hibridació d àcids nucleics, altres estrategies de cribatge (doble híbrid, expressió funcional...). 5) Anàlisi de gens clonats: Southern, Northern, PCR, Seqüenciació del DNA: mètode de Sanger, seqüenciació automàtica. 6) Recombinació de DNA in vivo: inserció i substitució a llevat. Transgènia a animals superiors. 7) Expressió de gens clonats: caset d expressió, expressió a E.coli, expressió a cèl.lules de insecte, expressió a cèl.lules de mamífer. Teràpia gènica.
Tejido Ovocitos Xenopus Ensayo mrna H 2 O mrna Selección por tamaño A B C D H 2 O A B C D Sintesis cdna 1 2 3 4 5 6 H 2 O 1 2 3 4 5 6 Aislamiento de clones únicos
PROGRAMA: 1) Conceptes bàsics: DNA recombinant, transformació, clonació, vector. 2) Recombinació de DNA in vitro: tall i unió de molècules de DNA, enzims per a la manipulació d àcids nuclèics (enzims de restricció i lligasses). 3) Vectors de clonació: plàsmids, bacteriòfags, còsmids i YACS. 4) Clonació i aillament de gens: genoteques genòmiques i de cdna, marcatge d àcids nucleics, hibridació d àcids nucleics, altres estrategies de cribatge (doble híbrid, expressió funcional...). 5) Anàlisi de gens clonats: Southern, Northern, PCR, Seqüenciació del DNA: mètode de Sanger, seqüenciació automàtica. 6) Recombinació de DNA in vivo: inserció i substitució a llevat. Transgènia a animals superiors. 7) Expressió de gens clonats: caset d expressió, expressió a E.coli, expressió a cèl.lules de insecte, expressió a cèl.lules de mamífer. Teràpia gènica.
PROGRAMA: 1) Conceptes bàsics: DNA recombinant, transformació, clonació, vector. 2) Recombinació de DNA in vitro: tall i unió de molècules de DNA, enzims per a la manipulació d àcids nuclèics (enzims de restricció i lligasses). 3) Vectors de clonació: plàsmids, bacteriòfags, còsmids i YACS. 4) Clonació i aillament de gens: genoteques genòmiques i de cdna, marcatge d àcids nucleics, hibridació d àcids nucleics, altres estrategies de cribatge (doble híbrid, expressió funcional...). 5) Anàlisi de gens clonats: Southern, Northern, PCR, Seqüenciació del DNA: mètode de Sanger, seqüenciació automàtica. 6) Recombinació de DNA in vivo: inserció i substitució a llevat. Transgènia a animals superiors. 7) Expressió de gens clonats: caset d expressió, expressió a E.coli, expressió a cèl.lules de insecte, expressió a cèl.lules de mamífer. Teràpia gènica.
RECOMBINACIÓN IN VIVO
HOMOLOGOUS RECOMBINATION homology X selection marker homology X targeting construct gene of interest double homologous recombination selection marker inactivated gene
egg ZYGOTE fertilized egg sperm BLASTOCYST 32-64-cell stage inner cell mass (ICM) Embryonic Stem cells: culture genetic manipulation reintroduce in host-embryo
CRE-LOXP: TISSUE-SPECIFIC GENE INACTIVATION (only one floxed allele indicated, should be homozygous or other allele otherwise inactivated)
PROGRAMA: 1) Conceptes bàsics: DNA recombinant, transformació, clonació, vector. 2) Recombinació de DNA in vitro: tall i unió de molècules de DNA, enzims per a la manipulació d àcids nuclèics (enzims de restricció i lligasses). 3) Vectors de clonació: plàsmids, bacteriòfags, còsmids i YACS. 4) Clonació i aillament de gens: genoteques genòmiques i de cdna, marcatge d àcids nucleics, hibridació d àcids nucleics, altres estrategies de cribatge (doble híbrid, expressió funcional...). 5) Anàlisi de gens clonats: Southern, Northern, PCR, Seqüenciació del DNA: mètode de Sanger, seqüenciació automàtica. 6) Recombinació de DNA in vivo: inserció i substitució a llevat. Transgènia a animals superiors. 7) Expressió de gens clonats: caset d expressió, expressió a E.coli, expressió a cèl.lules de insecte, expressió a cèl.lules de mamífer. Teràpia gènica.
ATG Needs to be in frame TAA T7 promoter Affinity tag cdna Insert in an expression plasmid NH 4 Purify fusion protein via affinity tag Common affinty tags are be 6X-His & GST both protein will bind reversibly with high affinty and specificty to a particular chromatography resin
Transfection Liposome Electroporation
Vectors amb promotors induïbles Tet-inducible, two component system. CMV Promoter Tet r-vp16 activation domain +Tet Ras