Santa Marta, Colombia.

Transcripción

1 Ing. Venus Lorena Rocha Laboratorio de Servicios de información, INVEMAR. Centro Regional de Entrenamiento temas marinos para Latinoamérica - OTGA-IODE-IOC-UNESCO venus.rocha@invemar.org.co CURSO ADMINISTRACIÓN DE DATOS BIOGEOGRÁFICOS (CONTRIBUYENDO AL USO DE OBIS) Santa Marta, Colombia.

2 En la página principal de OBIS se pueden encontrar 8 filtros, los cuales permiten buscar la información a través de: taxonomía de la especie, grupo de datos, país, sitios del patrimonio mundial marino, nombre común de la especie, nombre de la institución proveedora de los datos, Marine Areas Beyond National Jurisdiction (ABNJ) en español Áreas Marinas más allá de la Jurisdicción Nacional, Ecologically and Biologically Significant Areas (EBSA) en español Áreas Ecológicas y Biológicamente Significativas. PASO 1: Realizar el filtro por taxonomía por ejm: Millepora complanata A continuación se puede observar que por medio de este filtro obtendremos el Aphia ID, el total de los registros que se encuentran en OBIS, el estatus en la lista roja de especies, datos de la especie por país,además de su distribución espacial y sus correspondientes fotos entre otros datos complementarios.

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4 PASO 2: Realizar el filtro por Dataset search por ejm: INVEMAR, Universidad Simón Bolívar, Marine mammal records of Cuba. A continuación se puede observar que por medio de este filtro obtendremos una vision general en el q se tiene el total de los registros, especies y de taxa que se encuentran en OBIS, el nodo al que pertenece la institución el el conjunto de datos, un resumen que describe la información y su temporalidad,además de su distribución espacial y un gráfico de ocurrencias asociado a la temporalidad.

5 PASO 3: Realizar el filtro por Country statistics por ejm: Cuba, Argentina, Colombia, etc. Como se puede observar por medio de este filtro obtendremos una vision general en el q se tiene el total de los registros, especies y de taxa que se encuentran en OBIS, cuantas instituciones han hecho contribuciones, cuantas especies se encuentran en Lista Roja de Especies, cuantas como invasivas y el total de conjunto de datos

6 PASO 4: Realizar el filtro por Marine World Heritage Sites por ejm: Malpelo Fauna and Flora Santuary. Como se puede observar por medio de este filtro obtendremos una vision general en el q se tiene el total de los registros, especies y de taxa que se encuentran en OBIS, cuantas instituciones han hecho contribuciones, cuantas especies se encuentran en Lista Roja de Especies, cuantas como invasivas y el total de conjunto de datos, ademas de la localización geografica del área de protección, y graficos asociados al grupo taxonómico, entre otros items.

7 PASO 5: Realizar el filtro por Institute search por ejm: Marine and Coastal Research Institute Como se puede observar por medio de este filtro obtendremos una vision general en el q se tiene nombre completo de la institución, su acronimo, dirección e instituciones aliadas, además de su localización geográfica y el nombre del conjunto de datos que tienen registrados en OBIS. PASO 6: Realizar el filtro por ABNJ statistics (en español Áreas Marinas más allá de la Jurisdicción Nacional) por ejm: South Pacific, North Atlantic, South Atlantic. Como se puede observar por medio de este filtro obtendremos una vision general de los datos por año y grupo taxonómico, especies por grupo taxonómico, lista roja de espécies y espécies nuevas en esta área entre otras.

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9 PASO 6: Realizar el filtro por EBSA statistics (en español Áreas Ecológicas y Biológicamente Significativas) por ejm: South Pacific, North Atlantic, South Atlantic. Como se puede observar por medio de este filtro obtendremos una vision general de los datos por año y grupo taxonómico, especies por grupo taxonómico, lista roja de espécies y las contribuciones por instituciones, entre otros gráficos.

10 PASO 1: Abrir el siguiente Link de OBIS: Menú principal pagina OBIS Herramientas del mapa Herramientas de busqueda

11 PASO2: En el panel de herramientas de búsqueda realizar el filtro por especies, haciendo click sobre el espacio que dice (Haga clic para buscar y navegar por especies) en este caso buscar Millepora Complanata Tambien se puede realizar la busqueda escribiendo el nombre científico o común de la especie Millepora

12 PASO 3: En el panel de herramientas de búsqueda, hacer clic en la opción Mostrar resultados como se muestra a continuación en la gráfica: Posteriormente se abre la siguiente ventana, en la que se puede ver el detalle de los datos como. El número de registros, autor del conjunto de datos, especies relacionadas, gráfico y la pestaña donde se puede encontrar las opciones de Descarga:

13 Descarga de datos: Esta opción ofrece diferentes opciones de descarga en diferentes tipos de formato tal como; CSV (descarga un archivo de texto con los puntos de la consulta), WFS (Descargar un xml del servicio para ser consumido por cualquier software GIS si se deja la opción resumen se visualizarán los polígonos), WMS (es un Gráfico descargado en PNG) y KML (archivo de visualización en Google Earth). OBIS utiliza geoservicios para visualizar sus datos a través de WMS (para datos de rasterizado) o WFS (para datos vectoriales). Estos servicios pueden ser utilizados por aplicaciones GIS de escritorio o mapas en línea. WFS OBIS General La cuadrícula que se visualiza en los resultados del OBIS MAPPER son de los siguientes tamaños: 5 grados, 1 grado, 0,5 grados y 0,1 grados. Nota: El formato está relacionado con unidades (grados) sobre la superficie esferoidal terrestre es decir que aproximadamente: Un grado equivale a 111 kilómetros Visualización de datos e/png&srs=epsg:4326&layers=obis:dist_sp,obis:country&viewparams=where:valid_id=501083;c ount_column:nincl;table:dist_sp_5deg&bbox=-180,-90,180,90&width=480&height=256 Nota: para cambiar el tamaño de cuadrícula se ingresa dist_sp_5deg, dist_sp_1deg, dist_sp_05deg, dist_sp_01deg Para hacer filtro por especie se cambia el numero del valid_id= por el de la especie encontrada en la página de OBIS. Ejm millepora complanata

14 OCEAN DATA VIEWER Ofrece a los usuarios la oportunidad de ver y descargar una serie de conjuntos de datos espaciales que son útiles para informar las decisiones relativas a la conservación de la biodiversidad marina y costera. Estos datos provienen de instituciones científicas internacionalmente respetadas y de otras organizaciones que han acordado poner sus datos a disposición de la comunidad mundial con la esperanza de que estos datos apoyen y alienten la toma de decisiones informada que sustente la biodiversidad global y los servicios ecosistémicos. Ocean Data Viewer es principalmente un mecanismo para ver y descargar datos y no está destinado a ser utilizado para el análisis o para consultar datos. 1. En la página web Ocean Data Viewer se puede encontrar para descarga diferentes conjuntos de datos, como por ejemplo: Distribución mundial de pastos marinos o la distribución mundial de arrecifes de coral compilada por the UNEP World Conservation Monitoring Centre (UNEP-WCMC).

15 2. Para descargar los mapas en el Ocean Data Viewer se hace click en la opción que parece como (View dataset detail) y aparecerá la siguiente información. Antes de descargar el set de datos se puede verificar la siguiente información: Descripción, Citación, restricciones de uso y relevancia política. 3. Para realizar la descarga es necesario dar click en la opción Download y llenar el formulario que aparece para que los datos sean descargables. Posterior a esto llegara al mail proporcionado un mensaje en el que se encuentra un link de descarga, hacer click en el y se realizará la descarga automática de un archivo.zip con los datos (Shape).

16 En la página web NOAA (National centers for enviromental information) se puede encontrar para descarga diferentes conjuntos de datos, como por ejemplo:

17 WorldClim - Global Climate Data Free climate data for ecological modeling and GIS

18 Nuestra misión es ayudarle a imaginar cambios climáticos y ambientales a medida que ocurren en nuestro planeta. Aquí usted puede hojear y descargar imágenes de datos satelitales de la constelación de satélites del sistema de observación de la tierra de la NASA. Más de 50 diferentes datasets globales están representados con instantáneas diarias, semanales y mensuales, y las imágenes están disponibles en una variedad de formatos, incluyendo JPEG, PNG, Google Earth y GeoTIFF

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20 CARIBBEAN MARINE ATLAS (CMA2)

21 QGIS es un fácil de usar Sistema de Información Geográfica de código abierto (SIG) bajo la Licencia Pública General de GNU. QGIS es un proyecto oficial de la Fundación Geoespacial de Código Abierto (OSGeo). Se ejecuta en Linux, Unix, Mac OS X, Windows y Android y soporta numerosos vector, raster, y formatos de base de datos y funcionalidades. PASO 1: Descargar de la página web el software gratuito de QGIS en la versión más reciente

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23 Una vez instalado el software QGIS en el computador personal, buscar en el menú inicio el acceso directo para abrirlo Inicio de QGIS Desktop 1. Creación del proyecto

24 Instalación del plugin para cargar el mapa base 4. En la barra de herramientas ir a Complementos 5. Abrir Administrar e instalar complementos 6. Una vez abierto, hacer click en OpenLayersPlugin e instalar complemento.

25 7. Cuando se complete la instalación cerrar la ventana. 8. Terminada la instalación del complemento, por favor dirigirse en la barra de herramientas a la herramienta WEB 9. En Web Desplegar el menú de OpenStreetMap y dar doble click para abrir el mapa base

26 10. Lo que se carga es el mapa base que servirá para poder ubicar espacialmente los datos. 11. Zoom en la zona de interés

27 Cargue de los datos biológicos de OBIS VISUALIZACIÓN DE ARCHIVOS DESCARGADOS DE OBIS EN QGIS 12. Para WFS: Realizar el cargue de datos haciendo click en el ícono Añadir capa vectorial y abrirla, luego click en Explorar y seleccionar en el tipo de formato del archivo INTERLIS 2 para cargar el archivo WFS que se descargó previamente, y finalmente abrimos el archivo pero antes de finalizar el proceso se debe seleccionar el sistema de referencia: EPSG:4326 = WGS Visualización de la información OBIS asociada a Millepora Complanata

28 13. Para CVS: Realizar el cargue de datos haciendo click en el ícono Añadir capa de texto limitado y abrirla, luego click en Explorar como se ve a continuación en la figura y se abre el archivo CVS a través de este y se verifican que los siguientes campos: Coordenadas, sistema de referencia que debe se el correspondiente a: EPSG:4326 = WGS84. Visualización del cargue del archivo CVS clasificación por atributo

29 1. Para visualizar la información descargada anteriormente en QGIS, se utiliza la opción Añadir capa vectorial, luego Explorar y seleccionar en el tipo de formato del archivo Archivo Shape de ESRI (Shp), y finalmente abrimos el archivo.

30 Creación de un Mapa en QGIS 1. Cargue del mapa base 2. Cargue de las capas que se necesitan en formato, CVS o SHP 3. Realizar la clasificación por simbología de los puntos CVS (Si se requiere) 4. Abrir Nuevo diseño de impresión para crear el área de dibujo del mapa

31 5. En la pestaña de Diseño seleccionar la opción Añadir mapa nuevo 6. Luego se pueden agregar elementos al mapa como: escala, leyenda, imágenes y texto (Ej: Titulo del mapa). Se ajustan estos elementos al gusto y la necesidad del mapa.

32 7. Finalmente se obtiene el mapa en el formato que se requiera PDF, PNG a la resolución que sea necesaria.

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