Laboratorio de Paralelismo

Transcripción

1 Laboratorio de Paralelismo Prácticas OpenMP En el directorio de trabajo LPAR de tu cuenta mlapxx tienes cuatro programas que hay que procesar en paralelo utilizando OpenMP. En el caso de los ejercicios 1.A 1.C, se trata de bucles sencillos de paralelizar, y el objetivo es medir la eficiencia de la ejecución paralela en la máquina que tenemos disponible. El ejercicio 2 es más complejo; es un conjunto de bucles y funciones que hay que analizar y decidir la manera más conveniente de paralelizarlos. El objetivo es conseguir el mayor speed-up posible. En los casos en los que se desea obtener el tiempo de ejecución, conviene repetir la ejecución del programa unas cuantas veces (5 por ejemplo) y promediar los resultados y obtener la desviación típica, ya que puede haber una cierta dispersión en las medidas de tiempos (en caso de que algún resultado se diferencie claramente del resto, no tomarlo en cuenta). Los programas incluyen variables, funciones, etc. como ayuda, pero puedes modificarlos en lo que quieras (manteniendo la semántica, claro). No olvides añadir #include <omp.h> al principio de los programas openmp. Como resultado de estos ejercicios, hay que redactar un informe con los resultados obtenidos (numéricos y gráficos, programas ), explicando de manera razonada el comportamiento que se observa. El trabajo es para cada grupo y forma parte de la evaluación de la asignatura; si el grupo es de dos alumnos, recuerda que no se trata de que cada uno haga la mitad de los ejercicios, sino de hacerlos entre los dos. Se valorarán las soluciones propuestas, los resultados obtenidos y la explicación de los mismos, así como la calidad (estructuración, redacción, explicaciones, gráficos ) del propio informe. Estos son los ejercicios a trabajar: Ejercicio 1.A pi.c El programa calcula el valor de la integral de 4 / (1+x 2 ) entre 0 y 1, que da como resultado π, mediante la suma del área de una serie de trapecios que cubren el área bajo la curva. El resultado se aproxima más al valor de π cuantos más trapecios se sumen, que es un parámetro que pide el programa. El objetivo es medir el tiempo de ejecución del programa en función del número de threads utilizados, de 1 a 8. Utiliza, por ejemplo, de iteraciones (sumas). El reparto del bucle es estático consecutivo. Dibuja las curvas del tiempo de ejecución y speed-up que se obtienen e interprétalas adecuadamente. Ejercicio 1.B tgrano.c En este caso hay que obtener los tiempos de ejecución del programa en paralelo y en serie, en función del tamaño del vector que se procesa (lo pide el programa), por ejemplo para tamaños 1, 10, 100, 1.000, , , Hay que trabajar con 4 threads y scheduling estático consecutivo. Dibuja el tiempo de ejecución y el speed-up en relación al caso serie, en función del tamaño del vector.

2 Ejercicio 1.C matriz.c Se trata de un bucle de tres dimensiones para multiplicar dos matrices. Paraleliza cada uno de los bucles y mide en cada caso el tiempo de ejecución obtenido usando 4 threads y scheduling estático. Explica los resultados. Ejercicio 2 e2.c El programa e2.c contiene un grupo de bucles y funciones que trabajan con matrices y vectores, sin que representen una aplicación en concreto. El objetivo del ejercicio es aplicar diferentes técnicas de paralelización de bucles para conseguir ejecutar el programa en el menor tiempo posible, es decir, obtener el mayor speed-up posible. La metodología que recomendamos aplicar es la siguiente: -- Mide el tiempo de ejecución de cada bucle y/o función del programa serie (sin considerar la inicialización y la impresión de resultados). De esta manera se obtiene un perfil aproximado de qué puntos del programa son los más adecuados para paralelizar. Por ejemplo, se puede añadir al comienzo de cada función, bucle, grupo de ellos, etc., que se desee temporizar algo similar a lo siguiente: gettimeofday(&t0, 0); [código que se quiere temporizar] gettimeofday(&t1, 0); Esta función, que viene con el programa, imprime el tiempo transcurrido entre t0 y t1: TrazaTiempo("T1",&t0,&t1); En todo caso, puedes usar cualquier otra función y de la manera que te resulte más cómoda. -- Intenta paralelizar los bucles y funciones, uno a uno, y mide el speed-up que vayas consiguiendo en cada trozo. Probablemente habrá que aplicar estrategias diferentes en función del bucle, las dependencias, el reparto de datos, etc. -- Comprueba que los resultados obtenidos son coherentes con la ejecución serie del programa. Para ello, al finalizar el programa se imprimen los resultados del mismo (primeros y últimos 10 elementos de los vectores y de la matriz, productos escalares, histograma, etc.). Una manera sencilla de comprobar resultados es, por ejemplo, dejar los resultados de la ejecución en un fichero (xxx > datos), y comparar luego ambos casos, serie y paralelo, utilizando el comando diff. -- Tras probar diferentes alternativas y en función de los resultados obtenidos, toma las decisiones más adecuadas para paralelizar el programa en su conjunto, y obtén finalmente el speed-up global. Como resultado final, el informe de resultados debe recoger el código con que se ejecuta cada bucle, el tipo de técnica que se ha aplicado para paralelizarlo y por qué, y los resultados obtenidos tiempo de ejecución en serie, tiempo de ejecución en paralelo, y el speed-up tanto para cada parte como para el programa completo. Justifica todas las decisiones que tomes y los comportamientos observados.

3 Ejercicio 1.A: pi.c /********************************************************************************** Calculo de PI (programa serie) integral de 1/(1+ x*x) de 0 a 1 = arctg x = pi/4 Pide el numero de intervalos para sumar la integral **********************************************************************************/ #include <stdio.h> #include <sys/time.h> #define PI25D main () struct timeval t0, t1; tej; int i, num_iter, nthr=0; paso, x, sum = 0.0, pi = 0.0; printf("\n Numero de iteraciones? "); scanf("%d", &num_iter); #ifdef _OPENMP #pragma omp parallel nthr = omp_get_num_threads(); #endif gettimeofday(&t0, 0); paso = 1.0 / () num_iter; for (i=0; i<num_iter; i++) x = (i + 0.5) * paso; sum = sum / (1.0 + x*x); pi = sum * paso; gettimeofday(&t1, 0); printf("\n Valor de PI con %d sumas = %1.12f", num_iter, pi); printf("\n Error = %.7f (x10a-9)\n", fabs(pi - PI25D)* ); tej = (t1.tv_sec t0.tv_sec) + (t1.tv_usec t0.tv_usec) / 1e6; printf("\n Tej. (%d threads) = %1.3f ms\n\n", nthr, tej*1000);

4 Ejercicio 1.B: tgrano.c /********************************************************************************** tgrano.c Ejemplo para ver el efecto del tamaino de las tareas (grano) en el tiempo de ejecucion **********************************************************************************/ #include <stdio.h> #include <sys/time.h> #define N // tamaino maximo del vector float A[N]; main () struct timeval t0, t1; tej; int i, j, tam_vec, nthr=0; printf("\n Tamaino del vector a procesar ---> "); scanf("%d", &tam_vec); for (i=0; i<tam_vec; i++) A[i] = 1; #ifdef _OPENMP #pragma omp parallel nthr = omp_get_num_threads(); #endif gettimeofday(&t0, 0); for (i=0; i<tam_vec; i++) for (j=1; j<=1000; j++) A[i] = (A[i]*A[i] + 1) * (A[i]*A[i] - 1) + (j%2); gettimeofday(&t1, 0); tej = (t1.tv_sec t0.tv_sec)+ (t1.tv_usec t0.tv_usec) / 1e6; printf("\n\n Tej.(%d threads) = %f ms\n\n", nthr, tej*1000);

5 Ejercicio 1.C: matriz.c /********************************************************************************* matriz.c Ejemplo para analizar las alternativas de paralelizacion de bucles anidados Producto de dos matrices C = A * B *********************************************************************************/ #include <omp.h> #include <stdio.h> #include <sys/time.h> #define N 200 main () struct timeval t0, t1; tej; int nthr=0; int i, j, k; float A[N][N], B[N][N], C[N][N], temp; #ifdef _OPENMP #pragma omp parallel nthr = omp_get_num_threads(); #endif for (i=0; i<n; i++) for (j=0; j<n; j++) A[i][j] = 1.0; B[i][j] = 1.0; // valores inciales cualesquiera gettimeofday(&t0i, 0); for (i=0; i<n; i++) for (j=0; j<n; j++) temp = 0.0; for (k=0; k<n; k++) temp = temp + A[i][k] * B[k][j]; C[i][j] = temp; gettimeofday(&t1, 0); tej = (t1.tv_sec t0.tv_sec) + (t1.tv_usec t0.tv_usec) / 1e6; printf("\n Tej. (%d threads) = %1.3f ms \n", nthr, tej*1000); printf("\n Test del producto C(20,65) = %1.3f\n\n", C[20][65]);

6 Ejercicio 2: e2.c /********************************************************************************** e2.c Ejercicio de paralelizacion OMP --- por hacer --- **********************************************************************************/ #include <omp.h> #include <stdio.h> #include <sys/time.h> // Declaracion de constantes y variables #define N #define N #define N #define N #define N #define N #define N #define PIXMAX 10 struct timeval t0, t1; int i, j, k; sum, x, pe1, pe2, pe3; int histo[pixmax], imagen[n4][n5]; A[N1], B[N1], C[N1], E[N1]; D[N2][N3]; H[N6], J[N6], N[N6]; M[N7], P[N7], R[N7]; // RUTINAS AUXILIARES // Procedimiento que saca por pantalla el tiempo (en milisegundos): pt1-pt0 // junto con el string pasado por parametro: ptexto void TrazaTiempo(char * ptexto, struct timeval *pt0, struct timeval *pt1) tej; tej = (pt1->tv_sec pt0->tv_sec) + (pt1->tv_usec pt0->tv_usec) / 1e6; printf("%s = %10.3f\n",pTexto, tej*1000); // Funcion que calcula el producto escalar de dos vectores del tamaino // especificado ProductoEscalar ( *V1, *V2, int lvec) int i; pe = 0.0; for(i=0; i<lvec; i++) pe = pe + V1[i] * V2[i]; return(pe);

7 // Tres procedimientos que sacan por pantalla el contenido de las variables // globales correspondientes void SacarImagen() //Variable global imagen[n4][n5] int i, j; for(i=0; i<10; i++) for(j=0; j<10; j++) printf("%1d",imagen[i][j]); printf("\n"); printf("\n"); void SacarVector( *V, int L1, int L2) int i; for (i=l1; i<l2; i++) if(i%5==0) printf("\n"); printf("%12.2f ",V[i]); printf("\n"); void SacarMatrizD() //Variable global D[N2][N3] int i, j; for (i=0; i<10; i++) for (j=0; j<10; j++) if(j%5==0) printf("\n "); printf("%12.2f ",D[i][j]); printf("\n"); printf("\n\n");

8 // PROGRAMA PRINCIPAL main () //Inicializacion de vectores for(i=0; i<n1; i++) A[i] = 0.0; B[i] = ()(N1-i+2); C[i] = 1 / 10.0; E[i] = 0.0; for(i=0; i<n2; i++) for(j=0; j<n3; j++) D[i][j] = 6.0; for(i=0; i<n4; i++) for(j=0; j<n5; j++) if(i%3) imagen[i][j] = (i+j) % PIXMAX; else imagen[i][j]= (i+i*j) % PIXMAX; for(i=0; i<n6; i++) H[i] = 1.0; J[i] = 6.0; N[i] = 3.0; for(i=0; i<n7; i++) M[i] = 3.0; P[i] = 4.0; R[i] = 5.0;

9 //Comienza la ejecución // bucle 1 for(i=1; i<(n1-1); i++) x = B[i] / (B[i] + 1.0]; A[i] = (x + B[i] + 1.0) / ; C[i] = (A[i] + C[i-1] + C[i+1]) / 3.0; E[i] = x * x / (x * x + 1.7); // bucle 2 sum = 0.0; for(i=3; i<n2; i++) for(j=0; j<n3; j++) D[i][j] = D[i-3][j] / x + E[i]; if (D[i][j] < 6.5) sum = sum + D[i][j]/100.0; // bucle 3 for(i=0; i<pixmax; i++) histo[i] = 0; for(i=0; i<n4; i++) for(j=0; j<n5; j++) histo[imagen[i][j]] = histo[imagen[i][j]] + 1; // bucle 4 for(i=2; i<n6; i++) H[i] = 3.5 / (7.0/N[i-1] + 2.0/H[i]); N[i] = N[i] / (N[i]+2.5) / N[i]; J[i] = (H[i-1]/N[i-2] + 3.5/H[i-1]) / (H[i-1] + N[i-2]); // bucle 5 for(i=4; i<n7; i++) M[i] = M[i] * P[i-4]; R[i] = M[i-4] * R[i]; P[i] = (R[i] - P[i]) / 2.0; // 3 funciones pe1 = ProductoEscalar(C,E,N1); pe2 = ProductoEscalar(H,J,N6); pe3 = ProductoEscalar(P,R,N7);

10 // resultados finales: se imprimen los primeros y los ultimos 10 elementos // de cada vector, el histograma de la imagen y los valores de x, sum, // y los productos escalares. printf("a-> "); SacarVector (A, 0, 10); SacarVector (A, N1-10, N1); printf("c-> "); SacarVector (C, 0, 10); SacarVector (C, N1-10, N1); printf("e-> "); SacarVector (E, 0, 10); SacarVector (E, N1-10, N1); printf("h-> "); SacarVector (H, 0, 10); SacarVector (H, N6-10, N6); printf("j-> "); SacarVector (J, 0, 10); SacarVector (J, N6-10, N6); printf("n-> "); SacarVector (N, 0, 10); SacarVector (N, N6-10, N6); printf("m-> "); SacarVector (M, 0, 10); SacarVector (M, N7-10, N7); printf("p-> "); SacarVector (P, 0, 10); SacarVector (P, N7-10, N7); printf("r-> "); SacarVector (R, 0, 10); SacarVector (R, N7-10, N7); printf("d->\n"); SacarMatrizD(); printf("el histograma de la imagen es:\n"); for (k=0; k<pixmax; k++) printf("%9d", k); printf("\n"); for (k=0; k<pixmax; k++) printf("%9d", histo[k]); printf("\n\n"); printf("x = %18.2f\n", x); printf("sum = %18.2f\n", sum); printf("c*e = %18.2f\n", pe1); printf("h*j = %18.2f\n", pe2); printf("p*r = %18.2f\n", pe3);