Uso de programas libres en ciencia

Transcripción

1 Uso de programas libres en ciencia Miguel Sevilla-Callejo Paleo-IPE research group Jornadas IPErinas 2014 Instituto Pirenaico de Ecología CSIC 11 Diciembre 2014

2 mi trabajo en el IPE proyectos DINAMO y DINAMO2 secuencias lacustres interior peninsular asistencia técnica Paleo-IPE gestión BD repositorio de archivos centralizado análisis espacial y generación cartográfica de variables ambientales 2

3 Paleo-IPE sites ~50 registros 32 lagos Villarquemado Conquezuela 3

4 Paleo-IPE DB modelo lógico de la base de datos del equipo (lagos) 4

5 desde enero 2010 problemas y dificultades... equipo potente y SO mediocre dependencia de las licencias uso ya programas libres y de código abierto Firefox, QGIS, Zotero, Inkscape, LibreOffice, GIMP... instalo GNU/Linux (Ubuntu 10.10) pocos problemas al migrar... soy feliz :-) 5

6 software libre Free & Open Source Software (FOSS) fredoom to use, share, study & modify libertad para uso libertad para compartirlo libertad para examinar su código (cómo funciona)* libertad para mejorar su funcionamiento (su código)* * requiere ser de código abierto (Open Source) 6

7 importancia de FOSS en ciencia 23 FEBRUARY 2012 VOL 482 NATURE 485 7

8 método científico y FOSS reproducir y refutar las publicaciones científicas comunicar resultados convencer a los lectores de que son correstos el uso de programas de código abierto garantizan la transparencia de los resultados frente a las cajas negras de programas cerrados (privativos) 8

9 Quantum GIS FOSS desktop GIS datos vectoriales y ráster OGC (WMS, WFS, WCS...) BD espaciales generación de modelos producción cartográfica 9

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11 QGIS extensiones para todos los gustos GRASS DBManager procesamiento openlayers en crecimiento constante 11

12 QGIS Processing Toolbox algoritmos de procesamiento espacial GRASS SAGA GDAL/OGR R otros 12

13 QGIS Processing modeler heredero del modelador de SEXTANTE graphical modeler 13

14 bases de datos espaciales ventajas comparativas a viejos sistemas: rapidez, estabilidad, multiusuario... di adios a los chapefiles de ESRI principales sistemas libres SpatiaLite (SQLite) sistema de cliente/servidos en un archivo PostGIS (PostgreSQL) sistema tradicional de servidor y cliente 14

15 ejemplos de cartografía 15

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22 datos en abierto servicios OGC: WMS, WFS, WCS portales de descarga IDEE, IDEAragon... CNIG-IGN openstreetmap.org petición de datos... no te cortes! 22

23 Zotero gestión bibliográfica avanzada 23

24 Inkscape diseño vectorial 24

25 R & RStudio no comments... 25

26 otros programas libres programas de calidad listos para un entorno productivo Navegación web: Firefox Ofimática: LibreOffice Edición imágenes: GIMP Retoque fotográfico: Darktable y muchos más 26

27 GNU/Linux tal vez pienses que es esto... foto de theinfamousgdub en Flickr M. Sevilla-Callejo imagen de cool-retro-term 2014 en thefreecountry.wordpress.com 27

28 GNU/Linux pero en en realidad es esto: Linux Mint 17 Numix theme 28

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30 GNU/Linux y está dentro de esto... IBM Roadrunner Raspberry Pi Model A Google/LG Nexus 5 fotos de Wikipedia 30

31 curva de aprendizaje SE GEEK imagen de Bruno Oliveira en su Google+ 31

32 pero todo esto no es fácil... 32

33 tú solo no... con amigos si! gente con entusiasmo y ganas de aprender lista usuarios Linux IPE-CSIC amplia documentación en red soporte en comunidad cursos gratuitos 33

34 Gracias por la atención Presentación realizada con LibreOffice Impress 4.3 Licenciada bajo Creative Commons BY-SA se autoriza la copia, distribución y comunicación pública de la obra así como la realización de obras derivadas bajo las condiciones de reconocimiento (debe citarse siempre la fuente) y cuyos trabajos derivados se distribuyan con licencia igual o similar. 34