TEMA 6. NUCLEÓSIDOS, NUCLEÓTIDOS Y ACIDOS NUCLEICOS

Transcripción

1 TEMA 6. UCLEÓSIDS, UCLEÓTIDS Y ACIDS UCLEICS

2 Las bases nitrogenadas presentes en los ácidos nucleicos

3 9-b-Ribofuranosiladenina 9-b-Desoxiribofuranosiladenina 9-b-Ribofuranosilguanosina 9-b-Desoxiribofuranosilguanosina

4 1-b-Ribofuranosilcitosina 1-b-Desoxiribofuranosilcitosina 1-b-Ribofuranosiluracilo 1-b-Desoxiribofuranosiltimina

5 anti-deoxicitidina sin-deoxicitidina

6 idrólisis química en medio ácido Los mecanismos deben justificar las diferencias de velocidad observadas entre ribonucleósidos y desoxinucleósidos mayor velocidad menor velocidad Y las diferencias de velocidad observadas entre nucleósidos de bases púricas y de bases pirimídicas 2 2 mayor velocidad menor velocidad

7 idrólisis ácida de nucleósidos 2 R

8 R R

9

10 ucleótidos

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12 5 3

13 idrólisis alcalina suave de AR C 2-2 C - C 2 - C C C C C C 2 C 2-2 C C 2-2 C C C 2 - C

14 suave idrólisis ácida suave de un polidesoxiribonucleótido

15 Linus auling (March 1932). "The nature of the chemical bond. III. The transition from one extreme bond type to another". Journal of the American Chemical Society. Linus auling e received the obel rize in Chemistry in 1954 "for his research into the nature of the chemical bond and its application to the elucidation of the structure of complex substances" auling, L; Corey, RB (1951). "Configurations of olypeptide Chains With Favored rientations Around Single Bonds: Two ew leated Sheets". roceedings of the ational Academy of Sciences of the United States of America 37 (11): auling L, Corey RB (February 1953). "A roposed Structure For The ucleic Acids". roc atl Acad Sci U S A. 39 (2):

16 Rosalind Elsie Franklin Foto 51 Las notas manuscritas que deja Rosalind para sus conferencias no dejan lugar a duda: tenía muy claro lo que significaban las imágenes que había obtenido y sabía interpretarlas; tenía las claves del retrato de la molécula de AD, incluidas sus medidas. Dicen las anotaciones de Rosalind: «Conclusión. Una gran hélice en muchas de las cadenas, los fosfatos en el exterior, puentes fosfato-fosfato entre las hélices, interrumpidos por moléculas de agua. ay enlaces disponibles para proteínas» [...]

17 James Watson, Francis Crick, Maurice Wilkins y Rosalind Franklin. Fuente: undsci.berkeley.edu Watson, Crick y Wilkins consiguieron en 1962 el remio obel de Fisiología y Medicina por su trabajo en el descubrimiento de la estructura del AD, y aunque el nombre de Rosalind Franklin no se mencionó, ni se reconoció su contribución al descubrimiento de la estructura del AD, ésta fue al menos comparable a la que tuvieron los galardonados.

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23 Conformación de desoxirribosa Apareamiento de bases Giro a derechas Conformación del enlace glicosídico anti

24 Conformación de desoxirribosa Apareamiento de bases Giro a derechas Conformación del enlace glicosídico anti

25 Conformación de desoxirribosa irimidinas urinas Conformación del enlace glicosídico: sym purinas anti pirimidinas Apareamiento de bases Giro a izquierdas

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27 Secuencias que adoptan estructuras inusuales Secuencias palindrómicas: regiones de AD de doble hebra con secuencias de bases que se repiten en forma invertida entre ambas cadenas presentando doble simetría Son potenciales formadoras de: orquillas (AD simple hebra y AR) Estructuras cruciformes (AD duplex)

28 Secuencias que adoptan estructuras inusuales Repeticiones espejadas: regiones de AD de doble hebra que no tienen secuencias complementarias en la misma cadena. Se encuentran en moléculas de AD largas (varios miles e pares de bases)

29 Estructuras de 3 o 4 hebras: AD triplex y AD cuadruplex AD triplex: se presenta en segmentos polipirimidinicos y polipurunicos Apareamientos de bases aralelas Las hélices triplex son más estables a p ácido porque C tiene que estar protonada C + (pka en la hebra 7,5, pka normal 4,2) Antiparalelas

30 -AD: élice triplex en trayectos polipirimidina o polipurina Con repeticiones espejadas Repetición espejada (pertenece a la misma hebra)

31 Desnaturalización Las soluciones de AD nativo son muy viscosas a p 7 y 25ºC rápido lento Al aumentar temperatura o variar el p a situaciones extremas la viscosidad decrece abruptamente

32 Densidad de flotación

33 Efecto hipercrómico: Aumento de absorbancia a 260 nm que manifiesta una estructura bicatenaria al perder su estructura nativa o plectonémica

34 Estimación del porcentaje de pares de bases en función de la magnitud del efecto hipercrómico

35 Temperatura media de fusión: Temperatura a la cual se alcanza el 50 % de desnaturalización

36 Tm y complejidad del AD AD parcialmente desnaturalizado Las flechas indican regiones ricas en A=T

37 Estimación del porcentaje de pares de bases en función de Tm

38 Estructura secundaria de AR

39 tras bases nitrogenadas presentes en AR Las bases son modificadas en reacciones postranscripcionales

40 ARm 5 cap del AR m

41 ARt

42 Estructura tridimensional de un ARt

43 Estructura general y forma de unión un aminoácido al extremo 3 terminal de un AR t Aminoacil AR t sintetasas

44 ARr

45 Estructura secundaria de AR r bacterianos Algunos apareamientos encontrados en AR r

46 BIBLIGRAFÍA -BIQUIMICA. Albert L. LEIGER. 2da. Ed. Ediciones mega -RICIIS DE BIQUIMICA. Albert L. LEIGER. Ediciones mega - BICEMISTRY. Lubert STRYER 3 Edition Ed. Freemon -BIRGAIC CEMISTRY ermann Dugas. 3rd Edition Springer Verlang -BIQUÍMICA. D.y J. Voet Ed. mega -BIQUIMICA. Mathews, C and Van olde, K E. Ed. McGraw- ill Interamericana. Segunda edición RGAIC CEMISTRY. 2da. Edition.G.Marc LUD. Editorial Benjamin -RGAIC CEMISTRY. J. Mc MURRY. 3ra Edición Ed Interamericana -QUIMICA RGAICA. Francis Carey 3 Edicion Ed. Mc Graw ill. -RGAIC CEMISTRY J. Clayden,. Greeves, S. Warren, and. Wothers, 2000.xford University ress. -QUIMICA RGAICA. ESTRUCTURA Y FUCI. Vollhardt, and Schore,. Ed. mega. 3ra Edición, 2000.