phytalert by MICROGAIA

Transcripción

1 NOVEDAD phytalert by MICROGAIA Kit para determinación de fitopatógenos usando qprc Los kit de determinación de fitopatógenos phytalert basados en la técnica de qprc, usan el ADN como base para la detección tanto de hongos como de bacterias. El análisis puede ser llevado a cabo en: - Suelo de cultivo - Agua de riego - Planta El mercado actual demanda alimentos que estén libres de pesticidas y/o productos químicos. Los productores necesitan: - Sistemas de monitorización rápidos y efectivos - Reducción en los costes de producción phytalert proporciona: - Una rápida, económica y eficiente determinación de un amplio rango de patógenos para cada cultivo. - Reducción en los costes de producción al usar solamente la cantidad de pesticidas necesaria. - Mejora en la calidad del producto final asociada a la menor cantidad de productos sanitarios usados. METODOS TRADICONALES - Usando técnicas como Elisa, PCR y cultivos en medios específicos, el analista busca las especies que sospecha que pueden estar presentes en la muestra. - Análisis individual por tipo de patógeno. - Se necesitan tantos análisis como fitopatógenos se buscan. La inversión en tiempo y dinero es importante. ANALISIS CON phytalert - Un solo análisis, más rápido y barato. - El patógeno causante de la enfermedad se determina a nivel de especie, llegando incluso en algunos casos a subespecie. VENTAJAS - Puede usarse en 3 escenarios - Suelo de cultivo - Agua de riego - Plantas - Precisión, exactitud y eficacia en la determinación de patógenos. - Gracias a la determinación del género y la especie, es posible actuar directamente sobre el microorganismo en cuestión. - Implica menos uso de fitosanitarios, dando como resultado cultivos medioambientalmente más sostenibles. - Permite el diagnóstico de laboratorio en un máximo de 6 horas (actualmente se necesitan 6 días) - Los resultados en tiempo real ayudan a tomar decisiones críticas más rápido. - Permitiendo la detección de estos microorganismos in el suelo y el agua de riego, obtenemos resultados antes incluso de plantar el cultivo.

2 NOVEDAD Flujo con phytalert 1. Extracción - Muestreo (suelo o sustrato, material vegetal o agua de riego - Extracción del ADN de las muestras 2. Screening - Análisis de los patógenos usando el kit multiespecífico phytalert - Los kits son de 15 muestras para determinar 24 patógenos diferentes. 3. Cuantificación de los patógenos - Usando kits monoespecíficos para cada patógeno, que contienen: - Primers y sonda para control interno. - ADN cuantificado del patógeno para la construcción de la curva de cuantificación. - ADN para control interno. Dos formatos diferentes dependiendo del análisis requerido Kit multiespecifico para cada cultivo Detección semicuantitativa del conjunto de patógenos (de acuerdo con su relevancia en el ataque a cada cultivo) Este kit contiene - Placa de 48 pocillos con primers y sonda para microorganismo junto con los primers y la sonda para control interno para cada pocillo. - Cada pocillo está preparado para la detección de un patógeno - El número de patógenos viene determinado por el cultivo - ADN para control interno (microtubo de 1,5 ml.) - BSA (ayudante para la reacción de qpcr) (microtubo de 1,5 ml.) Kit de cuantificación mono específico Kit para la identificación y cuantificación del número de copias de ADN/µl de microorganismo detectado Este kit contiene - Primers y sonda para el microorganismo patógeno detectado - Primers y sonda para control interno - ADN cuantificado del patógeno, para usarlo como control positivo y construcción de la recta de cuantifiación de copias de ADN/µl - ADN para control interno - BSA (ayudante para la reacción de qpcr) (microtubo de 1,5 ml.)

3 Kits de extracción y mastermixes: Articulo premix phytalert para kits monoespecíficos premix phytalert para kits multiespecíficos Kit de extracción phytalert para suelo suelo (10) Kit de extracción phytalert para suelo suelo (50) Kit de extracción phytalert para suelo planta (10) Kit de extracción phytalert para suelo planta (50) Referencia PMP0001 PMP0002 EPS0001 EPS0002 EPP0001 EPP0002 Equipamiento y material necesario no incluido en los kits phytalert Artículo Balanza semi-análitica BL 303 de 300 g de capacidad, resolución g Microcucharillas de pesaje Tijeras para prepicar las muestras de material vegetal Agitador Vortex Genie 2 Adaptador horizontal para 24 tubos e ml. Microcentrifuga para tubos de ml. Termobloque para tubos de ml. (para calentar de 65 a 80 ºC) Referencia GBL SPNS SCIS SI SIH GD DHDB DHDB- B Micropipetas volumen variable de µl Micropipetas volumen variable de µl Micropipetas volumen variable de µl Puntas con filtro µl Puntas con filtro µl Puntas con filtro µl Etanol para biología molecular (100 ml/kit de 50 extracciones) Limpiador de ADN (ADN-Exitus Plus) 250 ml. Termociclador MyGo Pro Microtubos de 1,5 ml. libres de DNAasas/RNAasas Congelador Campana limpia UV para biología molecular Tiras de 8 microtubos perfil bajo + tapas ópticas ( ud) Agua grado biología molecular A PTCMTGO GRD.0500 Consultar UVT-B-AR TI0754C A

4 KIT DE DETECCIÓN MULTIESPECIFICOS Tomate SPP0001 Colletotrichum spp. Pythium spp. (group 1) Thielaviopsis basicola Dydimella lycopersici Pythium spp. (group 2) Verticillium albo-atrum Fusarium oxysporum Pythium aphanidermatum Verticillum dahliae Fusarium solani Pythium ultimum Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis Olpidium brassicae * Rhizoctonia solani Erwinia carotovora ssp. carotovora Phytophthora spp. Sclerotinia sclerotiorum Pseudomonas corrugata Pyrenochaeta lycopersici race 1 Sclerotinia minor Ralstonia solanacearum Pyrenochaeta lycopersici race 2 Sclerotium rolfsii Pseudomonas syringae pv. tomato Lechuga SPP0002 Botrytis cinerea Pythium spp. (group 1) Sclerotium rolfsii Bremia lactucae * Pythium spp. (group 2) Stemphylium botryosum Colletotrichum spp. Septoria lactucae Verticillum dahliae Erysiphe spp. * Pythium aphanidermatum Olpidium brassicae * Fusarium oxysporum Pythium ultimum Erwinia carotovora ssp. carotovora Phytophthora spp. Rhizoctonia solani Pseudomonas cichorii Pyrenochaeta lycopersici race 1 Sclerotinia minor Pseudomonas marginalis Pyrenochaeta lycopersici race 2 Sclerotinia sclerotiorum Rhizomonas suberifaciens Pimiento/Berenjena SPP0003 Olpidium brassicae * Botrytis cinerea Sclerotinia sclerotiorum Pyrenochaeta lycopersici race 1 Colletotrichum spp. Thielaviopsis basicola Pyrenochaeta lycopersici race 2 Leveillula spp. * Verticillium albo-atrum Pythium spp. (group1) Fusarium oxysporum Verticillum dahliae Pythium spp. (group 2) Fusarium solani Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis Rhizoctonia solani Phytophthora spp. Erwinia carotovora ssp. carotovora Sclerotinia minor Phytophthora capsici Pseudomonas corrugata Sclerotium rolfsii Phytophthora parasitica Ralstonia solanacearum SPP0004 Acremonium cucurbitacearum Phytophthora spp. Olpidium bornovanus * Botrytis cinerea Podosphaera fusca * Rhizoctonia solani Colletotrichum spp. Pseudoperonospora cubensis Rhizopycnis vagum Dydimella bryoniae Pythium spp. (group 1) Sclerotinia sclerotiorum Fusarium oxysporum Pythium spp. (group 2) Verticillium albo-atrum Fusarium solani Pythium ultimum Verticillum dahliae Macrophomina phaseolina Pyrenochaeta lycopersici race 1 Erwinia tracheiphila Monosporascus cannonballus Pyrenochaeta lycopersici race 2 Fresa SPP0005 Alternaria spp. Phytophthora parasitica Rhizoctonia solani Botrytis cinerea Pythium spp. (group 1) Macrophomina phaseolina Colletotrichum spp. Pythium spp. (group 2) Sclerotinia sclerotiorum Colletrotrichum acutatum Pythium irregulare Verticillium albo-atrum Fusarium oxysporum Pythium ultimum Verticillum dahliae Phytophthora spp. Pyrenochaeta lycopersici race 1 Xanthomonas fragariae Phytophthora cactorum Pyrenochaeta lycopersici race 2 Rhizoctonia solani

5 KIT DE CUANTIFICACION MONOESPECIFICOS A Acidovorax avenae subs. Citrulli SPC0079 Acremonium cucurbitacearum SPC0001 Alternaria spp. SPC0002 Armillaria mellea SPC0003 C Cladosporium variabile SPC0072 Colletotrichum spp. SPC0006 Colletrotrichum acutatum SPC0007 Colletotrichum coccodes SPC0005 Colletotrichum dematium f. spinaciae SPC0074 Colletotrichum gloeosporioides SPC0075 Corynespora cassiicola SPC0008 Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis SPC0050 E Erysiphe spp.* SPC0011 Erwina atroseptica SPC0051 Erwinia carotovora ssp. Carotovora SPC0052 Erwinia tracheiphila SPC0053 L Leveillula spp. SPC0018 O Olpidium brassicae * SPC0064 Olpidium bornovanus * SPC0069 P Phoma exigua var. exigua SPC0078 Phytophthora spp. SPC0030 Phytophthora inundata SPC0023 Phytophthora cactorum SPC0024 Phytophthora capsici SPC0025 Phytophthora citrophthora SPC0026 Phytophthora cryptogea SPC0027 Phytophthora infestans SPC0028 Phytophthora parasitica SPC0029 Podosphaera fusca * SPC0031 Pseudomonas cichorii SPC0055 Pseudomonas corrugata SPC0056 Pseudomonas savastanoi pv. nerii SPC0061 Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi SPC0080 Pseudomonas syringae pv. Tomato SPC0054 Pseudomonas marginalis SPC0065 Pseudoperonospora cubensis SPC0032 Pyrenochaeta lycopersici Raza 1 SPC0033 Pyrenochaeta lycopersici Raza 2 SPC0034 Pythium spp. (grupo 1) SPC0036 Pythium spp. (grupo 2) SPC0037 Pythium aphanidermatum SPC0035 Pythium irregulare SPC0038 Pythium ultimum SPC0039 Pythium tracheiphilum SPC0066 *Microorganismo no cultivable B Botrytis cinerea SPC0004 Bremia lactucae * SPC0062 D Dydimella bryoniae SPC0009 Dydimella lycopersici SPC0010 F Fusarium spp. SPC0017 Fusarium oxysporum SPC0012 Fusarium oxysporum f. sp. cucumerinum SPC0076 Fusarium oxysporum f. sp. Melonis SPC0013 Fusarium oxysporum f. sp.lycopersici SPC0015 Fusarium oxysporum f. sp. radicis-cucumerinum SPC0077 Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici SPC0014 Fusarium solani SPC0016 M Macrophomina phaseolina SPC0019 Microdochium panattoniana SPC0063 Monilia spp. SPC0021 Monilia laxa SPC0020 Monosporascus cannonballus SPC0022 R Ralstonia solanacearum SPC0057 Rhizoctonia solani SPC0040 Rhizomonas suberifaciens SPC0067 Rhizopycnis vagum SPC0041 Rosellinia necatrix SPC0042 S Sclerotinia minor SPC0043 Sclerotinia sclerotiorum SPC0044 Sclerotium rolfsii SPC0045 Septoria lactucae SPC0068 Stemphylium botryosum SPC0046 T Thielaviopsis basicola SPC0047 V Verticillium albo-atrum SPC0048 Verticillum dahliae SPC0049 X Xanthomonas arboricola pv. puni SPC0059 Xanthomonas campestris pv. campestris SPC0081 Xanthomonas fragariae SPC0058 Xylella fastidiosa SPC0060