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Transcripción

1 Pliego de prescripciones técnicas que rigen el concurso abierto convocado por el Servei de Salut de les Illes Balears para el suministro e instalación de una plataforma de proteómica para la Unidad de Proteómica del Área de Investigación y Docencia del Hospital Universitario Son Espases

2 ÍNDICE 1. Objeto 2. Especificaciones técnicas mínimas

3 1.- OBJETO El presente Pliego de Prescripciones Técnicas (en adelante PPT) tiene por objeto el describir las características técnicas de los equipos que conforman una plataforma de proteómica que deberán ser suministrados, montados e instalados en la Unidad de Proteómica del Área de Investigación y Docencia del Hospital Universitario Son Espases (en adelante HUSE), dependiente del Servei de Salut de les Illes Balears (en adelante SSIB). 2.- ESPECIFICACIONES TÉCNICAS MÍNIMAS 1. Prescripciones técnicas generales La empresa adjudicataria deberá instalar el equipamiento contratado, en la Unidad de Proteómica del Área de Investigación del Hospital Son Espases. El IB- SALUT se reserva el derecho de variar la ubicación del equipamiento en función de sus necesidades. Todos los gastos derivados de la instalación y adecuación del equipamiento contratado será a cargo de la empresa adjudicataria Las empresas licitadoras deberán incluir en su oferta el equipamiento informático y auxiliar necesario para el manejo adecuado de los equipos de proteómica, especificando sus características técnicas Las empresas adjudicatarias facilitarán, cuando proceda, el middleware y el software necesario para el correcto manejo de los equipos ofertados, especificando en su oferta sus características técnicas. Las licencias del software y del middleware que se oferten pasarán a ser propiedad del IB-SALUT Las empresas adjudicatarias deberán realizar la formación del personal técnico y facultativo que vaya a utilizar los equipos, aportando la documentación adecuada para impartir la formación en papel y en formato electrónico. En concreto:

4 Se ofertará un curso de formación inicial, de una duración no menor a 4 días (2 días para el escáner de fluorescencia, 1 día para la cámara de documentación, y 1 día para el resto de equipos) en un período máximo de 3 semanas tras la entrega e instalación de los equipos. Este curso deberá realizarse en el mismo lugar de instalación de los equipos Se ofertará un curso de formación avanzado, de una duración no menor a 3 días, dentro de un período no superior a 6 meses tras el curso de formación inicial. Este curso deberá realizarse en el mismo lugar de instalación de los equipos La empresa adjudicataria deberá facilitar toda la documentación técnica del equipo instalado, así como las fichas de seguridad de los mismos si procede. 2. Prescripciones técnicas particulares. A. Espectrofotómetro para pequeños volúmenes i. Espectrofotómetro para análisis UV/visible de muestras de pequeño volumen. Debe ser capaz de medir absorbancia en muestras de hasta 0.5 µl. ii. Rango mínimo de absorbancia: nm. iii. No debe requerir de ningún material fungible específico para realizar la lectura de las muestras (pipetas, cubetas, etc.). iv. Debe poder hacer barridos espectrales. v. Con una precisión de longitud de onda de mínimo 2 nm. vi. Con una precisión de absorbancia de (con paso óptico de 1 mm). vii. Con lámpara de Xenón y detector tipo CCD. viii. Tiempo de lectura: 5 s. ix. Debe incorporar software para la cuantificación de ácidos nucleicos y proteínas y el cálculo de los ratios de pureza. x. Debe incorporar manual de instrucciones. B. Sistema completo de Western blotting para geles pequeños i. Debe permitir el uso tanto de geles ensamblados manualmente como geles pre-cast.

5 ii. Debe incluir el sistema de ensamblaje completo con accesorios (vidrios, peines, electrodos, etc.). El sistema de ensamblaje debe ser rápido y sencillo, permitiendo realizarlo sin que ocurran pérdidas de gel antes de su polimerización. iii. Debe permitir correr simultáneamente como mínimo 2 geles de aproximadamente 10x8 cm, y de un grosor de 1 mm. iv. Debe incluir un módulo integrable de transferencia húmeda en cubeta. v. Debe incluir una fuente de alimentación adecuada tanto para la electroforesis como la transferencia húmeda (mínimo 500V, 400mA, 75W). 1. Programable. 2. Con temporizador. 3. Sistema de seguridad en caso de sobretensión y cortocircuito con desconexión automática. 4. Mínimo 2 salidas en paralelo para conexionar hasta dos equipos. 5. Sistema de reanudación automática en caso de corte de corriente. C. Sistema de Isoelectroenfoque i. Sistema programable de isoelectroenfoque de proteínas en gel con gradientes de ph inmovilizados, que debe permitir voltajes de hasta V con control de temperatura por Peltier de entre al menos 10 y 25ºC. Debe trabajar con bandejas de enfoque para realizar la primera dimensión que permita la carrera simultánea de hasta 12 tiras de IPG de distintos tamaños entre 7 y 24cm en 12 carriles. Debe admitir tiras y geles de diferentes tamaños. ii. Debe incluir todos los componentes necesarios para el procesamiento de las muestras (rehidratación, equilibrado, etc.). iii. Debe incluir un software de control que permita una fácil programación y registro de los parámetros del proceso. iv. Debe incluir una cubeta para desarrollar las tiras de la primera dimensión, con todo el material necesario para montar y correr hasta dos geles simultáneamente de tiras de hasta 24 cm. Debe permitir el uso de geles pre-cast o ensamblados por el usuario. v. El sistema debe garantizar la reproducibilidad y uniformidad que requiere la técnica. vi. Fuentes de alimentación de corriente, voltaje o potencia constante adecuadas para los sistemas proporcionados. vii. Sistema de refrigeración por baño termostatizado para electroforesis de ADN y proteínas.

6 D. Sistema para la captación, análisis y documentación de imágenes de fluorescencia y quimioluminiscencia, así como de imágenes de tinciones colorimétricas i. Capaz de realizar documentación y análisis de cualquier aplicación quimioluminiscente, tanto en geles como membranas, así como fluorescencia UV para la detección de marcadores como Bromuro de etidio. ii. Capacidad de realizar capturas con ajustes automáticos optimizados. iii. Características mínimas de la cámara de quimioluminiscencia: 1. Videocámara CCD de 16 bits refrigerada mediante sistema Peltier de 2 fases de 1.4 Mp mínimo y chip de resolución mínima de 2048x1472, tamaño de píxel de 11 µm. 2. Lente de alta sensibilidad con apertura máxima del diafragma f Corrección de homogeneidad en campo de visión. 4. Enfoque automático controlado mediante el software. 5. Transiluminación UV para la detección de EtBr 6. Sensibilidad mínima para quimioluminiscencia: rango de picogramos de la proteína a detectar. 7. Sensibilidad para bromuro de etidio: rango de ng de DNA 8. Rango dinámico: Lineal al menos en cuatro órdenes de magnitud. 9. Sistema que permita la reducción del ruido en exposiciones prolongadas. 10. El equipo deberá permitir tiempos mínimos de integración de al menos 1/100 s y máximos de exposición de al menos 60 minutos. 11. Debe permitir combinación de píxeles ( binning ) para reducir el tiempo de exposición. 12. Tamaño máximo de muestras: Mínimo 25x35cm. 13. Estación de trabajo multiusuario basada en Windows 7. a. Ordenador basado en microprocesador de última generación,, con las prestaciones adecuadas para soportar el software de adquisición y análisis de imágenes. 14. Software de control y adquisición de imagen del equipo incorporado al PC que permita el control total de las funciones de la cabina, cámara y zoom. a. El software de adquisición de imagen debe permitir la automatización de la captura. 15. Software de análisis y cuantificación de imágenes.

7 a. Debe permitir el análisis de geles 1D, dot blots, microplacas, y recuento de colonias. b. Se proporcionará un mínimo de una licencia de análisis para trabajo offline. c. Se suministrará sin cargo alguno, durante el período de garantía, las actualizaciones del software recomendadas por el fabricante y se impartirá formación para su uso. 16. Manuales E. Escáner de fluorescencia para el análisis de geles de proteínas mediante la técnica DIGE. Escáner de fluorescencia para el análisis de geles y membranas de DNA, RNA y Proteínas mediante fluorescencia. El escáner debe permitir la adquisición de imágenes de alta calidad de geles bidimensionales marcados con distintos productos fluorescentes, incluido el sistema DIGE, y debe producir imágenes de alta resolución para diversos formatos de geles y membranas así como imágenes multicanal para los geles DIGE. i. Descripción: Sistema de imagen para la detección de proteínas en gel mediante DIGE con mínimo tres líneas de láser internas de gran sensibilidad a aproximadamente las siguientes longitudes de onda: 488 nm (azul), 532nm (verde), y 633nm (rojo). ii. Filtros de emisión: El equipo presentará flexibilidad en la elección de filtros de emisión y excitación con la finalidad de permitir trabajar con distintos tipos de marcadores fluorescentes. El equipo deberá tener como mínimo los siguientes filtros de emisión para trabajar con DIGE: nm para trabajar con el fluorocromo Cy nm para trabajar con el fluorocromo Cy nm para trabajar con el fluorocromo Cy5. iii. Óptica: Deberá permitir escanear muestras a nivel de la superficie del escáner o elevando el plano focal (+ 3mm) para geles entre cristales (sandwich gels) como los geles DIGE. La oferta deberá incluir las guías u otros componentes necesarios para este tipo de escaneo. iv. Sistema de detección: El sistema de detección deberá constar de dos Tubos Fotomultiplicadores, además deberán ser regulables para ajustarse a la sensibilidad requerida para cada muestra. v. Resolución: La resolución será seleccionable desde 1000µm de tamaño de píxel para escaneados rápidos de cara al ajuste los parámetros de trabajo, hasta 10µm para escaneos de máxima resolución.

8 vi. Sensibilidad: detección de hasta 1ng/banda para BSA en gel de acrilamida y tinción con Sypro Ruby, 100 amol fluoresceína con láser 488 nm, 200 amol para láser 532 nm y 200 amol Cy5 para el láser 633 nm. vii. Iluminación: Deberá incluir herramientas que permitan asegurar una homogeneidad en la iluminación >95% en toda la superficie de la muestra. viii. Área: Gran área de escaneo que permita trabajar a la vez con 2 geles de dimensiones 20 x 25 cm (Área total) ix. Rango dinámico: El sistema deberá ser capaz de trabajar a un gran rango dinámico lineal de cómo mínimo 5 órdenes de magnitud con menos de un 7,5% de desviación estándar relativa a lo largo de todo el rango dinámico. x. El formato de los datos adquiridos por el escáner deberá ser de 16 bits, con una exactitud de 0,15 % xi. La digitalización de las imágenes obtenidas debe ser en un formato compatible con la mayoría de paquetes de software de análisis. xii. La bandeja de escaneo debe permitir el análisis de diferentes formatos de muestras, incluyendo geles de agarosa y poliacrilamida, membranas, geles DIGE, así como microplacas, placas de petri y portaobjetos de vídrio. xiii. Estación de trabajo multiusuario basada en Windows 7. a. Ordenador basado en microprocesador de última generación,, con las prestaciones adecuadas para soportar el software de adquisición y análisis de imágenes. xiv. Licencia de software para adquisición de imágenes y posterior análisis que permita la selección automática de la fuente de excitación y el filtro de emisión necesario. 1. El software de control del escáner deberá permitir la selección del tamaño del píxel, además de la selección de las longitudes de onda de excitación y emisión, con distintos filtros para evitar interferencias. 2. Debe permitir el ajuste del nivel de exposición para optimizar la sensibilidad. 3. El rango dinámico de los datos deberá alcanzar los 16 bits/píxel. 4. El software de control del escáner deberá ser compatible con el sistema operativo Windows Con herramientas de análisis para cuantificación y cálculo de peso molecular de bandas, spots, microplacas, dot-blots, western blots. Permitirá también el cálculo de superficies, perímetros y distancias.

9 xv. Licencia de software para análisis bidimensional totalmente integrado con el software para la adquisición y el análisis de imágenes para realizar análisis de expresión diferencial comparando 2 o más imágenes de geles y que permita trabajar con cualquier imagen. 1. Debe permitir la cuantificación y comparación de las manchas de proteína en geles bidimensionales tradicionales, realizando automáticamente la correspondencia entre distintos geles de un mismo experimento, con opciones de calibración y normalización que permitan la comparación de la abundancia de proteína en una mancha a lo largo de diferentes geles. 2. Deberá incorporar un análisis estadístico para validar las diferencias cuantitativas y permitir la automatización de tareas repetitivas en el manejo de grandes volúmenes de datos. 3. Deberá ser capaz de analizar geles DIGE mediante un protocolo de co-detección, y deberá contar con una interfase común tanto para geles DIGE como tradicionales. xvi. Manuales de instrucciones y mantenimiento El jefe de la Central de Compras Pedro Novás Rodríguez