TEMA 4 PRODUCCIÓN DE ENERGÍA EN LOS MICROORGANISMOS



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Transcripción:

TEMA 4 PRODUCCIÓN DE ENERGÍA EN LOS MICROORGANISMOS ATP PRODUCCIÓN DE ENERGÍA EN LOS MICROORGANISMOS. Principales fuentes de energía utilizados por los microorganismos. Importancia de los procesos metabólicos. OBJETIVOS ESPECÍFICOS Al finalizar el tema el estudiante podrá: 1. Señalar la importancia de los procesos de producción de energía de los microorganismos. 2. Clasificar los microorganismos de acuerdo con la fuente de energía y la fuente de carbono que utilizan y dar la definición de cada categoría. 3. Clasificar los microorganismos, según sus requerimientos de oxígeno y definir cada categoría. 4. Indicar los procesos de producción de energía de las diferentes categorías de microorganismos. 5. Explicar el efecto del oxígeno sobre las diferentes categorías de anaerobios. 6. Señalar la importancia de la vía glicolítica, la vía de las pentosas, el ciclo de Krebs, la cadena de transporte electrónico y la fosforilación oxidativa en los procesos de producción de energía de los microorganismos. 7. Comparar el rendimiento energético de los procesos fermentativo y respiratorio.

8. Destacar la importancia de los procesos metabólicos de los microorganismos en los métodos de aislamiento e identificación, aplicaciones industriales, deterioro microbiano y patogenicidad. Las fuentes de energía (compuestos químicos o luz) utilizadas por las diferentes clases de microorganismos y la forma como ellos las utilizan son muy variadas, pero cualquiera que sea el sustrato y el mecanismo bioquímico empleado por los microorganismos para su utilización, el objetivo final común es la obtención de energía, la cual es convertida en ATP, que es el mediador de muchas de las transferencias metabólicas de energía del catabolismo y el anabolismo. Las fuentes de elementos químicos y energía necesarias por los microorganismos para sintetizar sus compuestos bioquímicos deben estar disponibles en su ambiente y listos para ser usados. Las fuentes orgánicas incluyen un gran número de compuestos que van desde moléculas de 2 átomos de carbono hasta moléculas más complejas tales como el almidón, el cual contiene miles de átomos de carbono. Las fuentes inorgánicas incluyen el dióxido de carbono, sulfuro de hidrógeno y otras moléculas. Metabolismo Anabolismo (Síntesis) Compuestos orgánicos complejos Polisacáridos Lípidos Proteínas Catabolismo (Degradación) Energía Compuestos orgánicos simples Compuestos inorgánicos Calor ATP CLASIFICACIÓN DE LOS MICROORGANISMOS DE ACUERDO CON LA FUENTE DE 2

ENERGÍA Y DE CARBONO QUE UTILIZAN GRUPO FUENTE DE FUENTE DE EJEMPLO ENERGÍA CARBONO Fotolitotrofos Luz CO 2 Bacterias fotosintéticas Fotoorganotrofos Luz Compuestos orgánicos Purpurobacterias Quimiolitotrofos Oxidación de compuestos inorgánicos CO 2 Algunas bacterias Ej. Thiobacillus Quimioorganotrofos Oxidación de compuestos orgánicos Compuestos orgánicos La mayoría de las bacterias Dependiendo de la naturaleza del aceptor de electrones en el proceso de producción de energía, podemos dividirlos en procesos de: Fermentación Proceso de producción de energía en el cual compuestos orgánicos actúan como dadores y aceptores de electrones. No hay aceptor externo de electrones. Respiración 3

Proceso de producción de energía en el cual compuestos inorgánicos actúan como aceptores externos de electrones. Respiración aerobia El aceptor de electrones es el oxígeno. Respiración anaerobia El aceptor de electrones es un compuesto inorgánico diferente al oxígeno, por ejemplo: nitratos, sulfatos, carbonatos etc. CLASIFICACIÓN DE LOS MICROORGANISMOS CON BASE EN SU COMPORTAMIENTO FRENTE AL OXÍGENO 4

Aerobios estrictos Requieren oxígeno para poder vivir. Carecen de la capacidad para realizar fermentación. Por ejemplo Mycobacterium tuberculosis. Facultativos Pueden crecer con o sin aire, en ausencia de aire realizan procesos fermentativos y en presencia de aire cambian a un metabolismo respiratorio. Por ejemplo levaduras, enterobacterias. Microaerofílicos Crecen mejor en presencia de pequeñas cantidades de oxígeno, tienen metabolismo respiratorio. Por ejemplo Campylobacter fetus. Anaerobios aerotolerantes Pueden crecer con o sin oxígeno pero su metabolismo es siempre fermentativo. Por ejemplo Lactobacillus. Anaerobios estrictos No pueden crecer en presencia de oxígeno. Su metabolismo puede ser fermentativo en algunos, respiración anaeróbica en otros y ciertos grupos realizan fotosíntesis. Por ejemplo Clostridium botulinum. EFECTO DEL OXÍGENO SOBRE LOS ANAEROBIOS La sensibilidad al oxígeno se ha asociado con la carencia de la enzima superóxido dismutasa. Esta enzima detoxifica los radicales libres, potencialmente dañinos, formados en las células en presencia de oxígeno. La superóxido dismutasa parece estar presente en todos los microorganismos aerobios y en los anaerobios aerotolerantes pero no se ha encontrado en los anaerobios estrictos. 5

COENZIMAS Los procesos metabólicos de los microorganismos, al igual que los de los organismos superiores, son catalizados por una serie de enzimas, algunas de las cuales para su actividad requieren de la acción de cofactores (coenzimas). Ejemplos de estas coenzimas son las siguientes: COENZIMA Coenzima A TPP (Pirofosfato de Tiamina, Vitamina B 1 ) FUNCIÓN Transferencia de grupos acilo Transferencia de grupos derivados de una cetona o aldehído Biotina (Vitamina H) Transferencia de CO 2 Acido lipoíco NAD Transferencia de átomos de hidrógeno o de electrones NADP Derivados de la riboflavina (Vi tamina B 2 ) Ubiquinona (Coenzima Q) Naftoquinona Citocromos ATP Fosfato de piridoxal (Vitamina B 6 ) Tetrahidrofolato Cobamida (Vitamina B 12 ) Ferredoxinas Transferencia de fosfatos y de energía Transaminación y decarboxilación de aminoácidos. Racemización Transferencia de grupos de un carbono. Reducción Transferencia de grupos metilo y ciertas reducciones Reacciones que ocurren a bajo potencial redox Flavodoxinas CATABOLISMO DE LA GLUCOSA (VÍAS FERMENTATIVAS) 6

Vía Embden-Meyerhof (Glicólisis) REGENERACIÓN DEL NAD: (Papel clave del piruvato en la misma) Si la forma reducida del NAD en la vía glicolítica no se reoxidara en una reacción posterior del piruvato, la fermentación cesaría rápidamente, puesto que la cantidad de NAD en la célula es muy limitada. Los microorganismos han desarrollado una serie de vías que llevan a la realización de estas reoxidaciones, algunas de las cuales además producen ATP. 7

1. Láctica (Streptococcus, Lactobacillus) 2. Alcohólica (Muchas levaduras y algunas bacterias) 3. Ácido mixta (La mayoría de las enterobacterias) 4. Butanodiólica (Enterobacter) 5. Butírica (Clostridium) 6. Propiónica (Propionibacterium) Fermentación láctica Papel clave del piruvato en las principales fermentaciones Es un tipo de fermentación en la cual el ácido láctico es el producto principal de la fermentación de la glucosa. En ella las 2 moléculas de ácido pirúvico formadas en la glicólisis son reducidas por 2 moléculas de NADH para formar 2 moléculas de ácido láctico como producto final de la reacción, teniendo un rendimiento energético de 2 ATP por molécula de glucosa. Las bacterias que producen ácido láctico se denominan bacterias lácticas, si la producción de ácido láctico la realizan realizan por esta vía se denominan homolácticas. La fermentación láctica puede causar el deterioro de alimentos, pero el proceso puede utilizarse también para producir yogurt a partir de la leche, repollo ácido a partir de repollo fresco y encurtidos. Dos géneros importantes de las bacterias lácticas son Streptococcus y Lactobacillus. 8

Otras bacterias lácticas producen ácido láctico metabolizando la glucosa por vías diferentes a la glicólisis, a las cuales nos referiremos más adelante. Fermentación alcohólica Es un tipo de fermentación que es realizada por un amplio rango de hongos filamentosos (mohos) como Aspergillus, Mucor y Fusarium y hongos unicelulares (levaduras) como Saccharomyces. En esta fermentación el ácido pirúvico proveniente de la glicólisis es decarboxilado a acetaldehido en una reacción catalizada por la enzima piruvato decarboxilasa y TPP (Tiamina pirofosfato); el acetaldehido es reducido a etanol por una alcohol deshidrogenasa dependiente de NAD, resultando en la reoxidación del NADH 2 formado durante la glicólisis. La fermentación alcohólica por especies de Saccharomyces se ha usado para la producción de cerveza, vino y otras bebidas alcohólicas. El CO 2 producido por las levaduras es utilizado para el levantamiento de la masa del pan. 9

Fermentación ácido mixta Este es un tipo de fermentación que es usualmente llevada a cabo por miembros de la familia Enterobacteriaceae, incluyendo Escherichia coli, especies de Proteus, Salmonella y Shigella. En esta vía se forman ácidos acético, láctico, succinico y fórmico en diferentes proporciones que varían con el microorganismo y con las condiciones de cultivo. Los microorganismos que llevan a cabo esta fermentación dan positiva la prueba del rojo de metilo. Fermentación butanodiólica Este es un tipo de fermentación que es llevada a cabo por ciertos miembros de la familia Enterobacteriaceae por ejemplo: Klebsiella y Enterobacter. La glucosa es fermentada con la formación de 2,3 butanodiol y además se producen pequeñas cantidades de los productos formados en la vía ácido mixta. La cantidad de ácido producida es insuficiente para dar positiva la prueba del rojo de metilo. Los productores de butanodiol dan positiva la prueba de Voges Proskauer. 10

Fermentación butírica Este tipo de fermentación es realizada por ciertas especies de Clostridium en la que la glucosa es fermentada con la formación de ácido acético, ácido butírico, CO 2 y H 2. Fermentación propiónica Esta es una fermentación realizada por especies del género Propionibacterium en la cual los productos principales de la fermentación de la glucosa son los ácidos propiónico y acético. Esta es la fermentación mediante la cual se produce el queso suizo, el sabor peculiar se lo dan los ácidos y los huecos se deben a la gran producción de CO 2. 11

RESUMEN DE LOS DIFERENTES TIPOS DE FERMENTACIONES, QUE TIENEN COMO VÍA COMÚN LA GLICÓLISIS Fermentación Productos finales Rendimiento energético Láctica (Homoláctica) Ácido láctico 2 ATP/Glucosa Alcohólica CO 2 + Etanol 2 ATP/Glucosa Ácido Mixta (Fórmica) Ácido.fórmico (CO 2 +H 2 ) 3 ATP/Glucosa Etanol Ácido acético Butanodiólica Butanodiol 2 ATP/Glucosa Butírica Ácido butírico 2 ATP/Glucosa Butanol Acetona Isopropanol CO 2 Propiónica Ácido propiónico 3 ATP/1,5 Glucosa 12

ALTERNATIVAS A LA GLICÓLISIS (Vía de las pentosas, Vía de Entner-Doudoroff) Muchos bacterias tienen vías adicionales a la glicólisis para la oxidación de la glucosa. La vía alterna más común es la vía de las pentosas fosfato o vía fosfoglucónica, la cual opera simultáneamente con la glicólisis. Esta es una vía cíclica que proporciona una forma de degradar a los azúcares de 5 carbonos (pentosas) y también a la glucosa. Una característica importante de esta vía es que produce pentosas intemediarias importantes que actúan como precursores de los ácidos nucleicos y de ciertos aminoácidos. También es una fuente importante de la coenzima reducida NADPH a partir del NADP. Produce una ganancia neta de 1 molécula de ATP por cada molécula de glucosa. Como ejemplos de bacterias que utilizan esta vía tenemos: Bacillus subtilis, Escherichia coli y Streptococcus faecalis. Algunos microorganismos que utilizan esta vía pueden producir ácido láctico, CO 2 y etanol y se denominan heterolácticos para diferenciarlos de los que hacen la fermentación láctica (homoláctica) los cuales producen solamente ácido láctico. La Vía Entner Doudoroff es otra vía para la oxidación de la glucosa a pirúvico. De cada molécula de glucosa se producen 2 moléculas de NADPH y 1 molécula de ATP. Las bacterias que tienen las enzimas de esta vía pueden metabolizar la glucosa sin la glicólisis o la vía Entner-Doudoroff. Esta vía generalmente no se encuentra en las bacterias gram positivas, se encuentra en algunas bacterias gram negativas, es típica de las bacterias del género Pseudomonas. RESUMEN DE OTRAS FERMENTACIONES QUE NO TIENEN COMO VÍA COMÚN LA GLICOLISIS Vía Productos finales Rendimiento energético Heteroláctica (fosfoglucónica) Ácido láctico 1 ATP/Glucosa Etanol CO 2 Entner-Doudoroff Ácido pirúvico 1 ATP/Glucosa RESPIRACIÓN AERÓBICA 1. La glucosa es oxidada en la respiración aeróbica a través de la glicólisis y luego a través del ciclo de Krebs (Ciclo de los ácidos tricarboxílicos). 2. Como ya se discutió anteriormente la glicólisis es una secuencia de nueve pasos enzimáticos que convierten 1 molécula de glucosa en 2 de ácido piruvico, 2 NADH y 2 ATP. 3. El ácido pirúvico es decarboxilado para formar acetil-coa, NADH y CO 2. El ciclo de Krebs es una secuencia de reacciones catalizadas por enzimas que oxidan la acetil-coa a 2 CO 2 y generan 1 GTP, 1 FADH y 3 NADH. 4. El NADH y el FADH producidos en la via glicolítica (anaeróbicamente) son oxidados en la cadena de transporte de electrones. Durante ese transporte de electrones se produce ATP. 5. El sistema de transporte de electrones produce 3 ATP por cada NADH y 2 ATP por cada FADH oxidado por el oxígeno. 13

6. La respiración aeróbica en bacterias genera 38 moles de ATP por mol de glucosa oxidado a CO 2 y H 2 O SISTEMAS TRANSPORTADORES DE ELECTRONES Funciones Aceptar electrones del donante y transferirlos al aceptor. Conservar la energía que es liberada durante la transferencia de electrones mediante la síntesis de ATP. 14

FOSFORILACIÓN OXIDATIVA Es una reacción de formación de ATP en la cadena de transporte de electrones que sucede durante la transferencia de electrones desde un donante tal como el NADH a un aceptor como el oxígeno o el nitrato. CICLO DE KREBS COMPARACIÓN DEL RENDIMIENTO ENERGÉTICO DE LA FERMENTACIÓN Y LA 15

RESPIRACIÓN AERÓBICA Proceso Glicólisis Ciclo de Krebs Rendimiento total Fermentación 2 ATP No funciona 2 ATP/Glucosa Respiración aeróbica 2 ATP (Fosforilación a 2 ATP (Fosforilación a 38 ATP/Glucosa nivel de sustrato) nivel de sustrato) 6 ATP (Fosforilación 28 ATP (Fosforilación oxidativa) oxidativa) EFECTO PASTEUR Cuando microorganismos facultativos se están cultivando anaeróbicamente y se exponen al oxígeno, hay una inhibición del consumo de glucosa, esto es conocido como efecto Pasteur y refleja el incremento de rendimiento energético obtenido por el metabolismo respiratorio de la glucosa comparado con el obtenido por la fermentación de la glucosa. RESPIRACIÓN ANAEROBIA ACEPTORES DE ELECTRONES PRODUCTOS Nitrato (NO - 3 ) Nitrito (NO - 2 ) Óxido nitroso (N 2 O) Nitrógeno (N 2 ) Nitrito (NO 2 - ) Óxido nitroso (N 2 O) Nitrógeno (N 2 ) Sulfato (SO 4-2 ) Sulfuro (H 2 S) Hierro férrico (Fe +3 ) Hierro ferroso (Fe +2 ) Dióxido de carbono (CO 2 ) Metano (CH 4 ) INHIBIDORES DEL TRANSPORTE DE ELECTRONES Varias sustancias inhiben el transporte de electrones interfiriendo con la acción de los transportadores, algunos ejemplos: Monóxido de carbono: Se combina directamente con el citocromo terminal, citocromo oxidasa, impidiéndole su unión con el oxígeno. Cianuro (CN - ): Se une fuertemente al hierro del anillo porfirínico de los citocromos previniendo su oxido-reducción. Azida (N 3 - ): Se une fuertemente al hierro del anillo porfirínico de los citocromos previniendo su oxido-reducción. Cloratos (ClO 3 - ): Es un inhibidor específico de la reducción de los nitratos. ATP Sustrato 16 ATP NAD Aceptor electrónico derivado del sustrato Productos de fermentación FP ClO -

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BIBLIOGRAFÍA Black J. G. Microbiology. Principles and Explorations. Fourth Edition 1999 John Wiley & Sons, Inc. Davis, Dulbecco, Eisen and Ginsberg. Microbiology. Fourth Edition. J. B. Lippincott Company 1990. Madigan M.T, Martingo J. M. y Jack Parker. 2004. Décima Edición. Brock Biología de los Microorganismos Prentice Hall Ketchum Paul A. Microbiology. Concepts and applications. (1988) John Wiley and sons Prescott, Harley y Klein 1999 Microbiología. Cuarte edición. McGraw-Hill Interamericana Wiistreich and Lechtman. Microbiology. Fifth Edition. (1988) Macmillan Publishing Co. Tortora G. J., B. R. Funke and Ch. L. Case 2007. Introducción a la Microbiología 9 na Edición. Editorial Médica Panamericana. Yajaira Bastardo Magaly Pedrique de Aulacio Cátedra de Microbiología Facultad de Farmacia - Universidad Central de Venezuela Revisión 2008 ACTIVIDADES ADICIONALES Investiga sobre los medios de cultivo que contengan azida de sodio, indicando la fórmula, y el uso. Investiga el proceso de producción del yogurt y elabora un esquema. Investiga el proceso de producción del vino y elabora un esquema. Investiga el papel que juegan los microorganismos en el deterioro de productos farmacéuticos y da ejemplos. 18

Busca en un diccionario de inglés técnico la traducción al español de las palabras siguientes: Beer Bread Breakdown Cheese Chemoautotroph Electron carrier Energy sources Environment Fuel Krebs Cycle Olives Pathway Photophosphorilation Pickles Requirement Storage Substrate Sugar Vinager Wine 19