PLIEGO DE PRESCRIPCIONES TÉCNICAS PARA LA CONTRATACIÓN DE UN SERVICIO DE GENOTIPADO MASIVO EN ENFERMDADES ALÉRGICAS MEDIANTE PROCEDIMIENTO ABIERTO

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1 PLIEGO DE PRESCRIPCIONES TÉCNICAS PARA LA CONTRATACIÓN DE UN SERVICIO DE GENOTIPADO MASIVO EN ENFERMDADES ALÉRGICAS MEDIANTE PROCEDIMIENTO ABIERTO No sujeto a regulación armonizada Página 1 FUNDACIÓN PÚBLICA ANDALUZA PARA LA INVESTIGACIÓN DE MÁLAGA EN BIOMEDICINA Y SALUD (FIMABIS) Expediente: Título: CONTRATACIÓN DE UN SERVICIO DE GENOTIPADO MASIVO EN ENFERMEDADES ALÉRGICAS Categoría: Categoría 8 Anexo II TRLCSP. CPV: Servicios de laboratorio de investigación Código Seguro de verificación:. Permite la verificación de la integridad de una ID. FIRMA ws051.juntadeandalucia.es PÁGINA 1/8

2 Índice I. CONDICIONES ESPECÍFICAS... Error! Marcador no definido. 1. Objeto del contrato Objetivos del servicio Presupuesto de licitación y valor estimado del contrato Precio del contrato y forma de pago Ejecución y Características Técnicas del Servicio Duración del contrato Criterios de adjudicación Página 2 Código Seguro de verificación:. Permite la verificación de la integridad de una ID. FIRMA ws051.juntadeandalucia.es PÁGINA 2/8

3 1. Objeto del contrato. El contrato al que se refiere el presente documento tiene por objeto la realización de la fase 1 del estudio de asociación en muestras de ADN de individuos españoles con rinitis mediante la determinación simultánea de la variación en, al menos, loci polimórficos debidos a cambios de la base (SNPs) e inserciones/deleciones (indels) sencillas en el marco del proyecto Mecanismos genéticos involucrados en el desarrollo de rinitis alérgica local y endofenotipos asociados (el Proyecto, en adelante), dirigido por la Dra. María Paloma Campo Mozo, del Distrito Sanitario de Málaga. El Proyecto está financiado por el Fondo de Investigaciones Sanitarias, con referencia FIS- PI12/00900, en virtud de resolución del Director del Instituto de Salud Carlos III de 20 de diciembre de 2012 se aprueba la propuesta definitiva de resultados de la convocatoria 2012 de concesión de ayudas del subprograma de proyectos de investigación salud, dentro de la acción estratégica de salud, Esta ayuda está asimismo cofinanciada por el FEDER, Programa Operativo de Economía Basada en el Conocimiento ( ) de acuerdo con el Reglamento (CE) nº 1083/2006 del Consejo de 11 de julio de 2006, por el que se establecen las disposiciones generales relativas al Fondo Europeo de Desarrollo Regional, al Fondo Social Europeo y al Fondo de Cohesión. Página 3 2. Objetivos del servicio. El estudio del Proyecto pretende profundizar en el análisis genético de la rinitis alérgica local (RAL) y en la relación de las variantes de riesgo identificadas con endofenotipos relevantes. Nuestro grupo posee una amplia experiencia en el diagnóstico, fenotipado y obtención de datos objetivos de respuesta inflamatoria al alergeno en sujetos RAL, y cuenta con una amplia serie de casos adecuadamente caracterizada y almacenada en el Biobanco del Hospital Carlos Haya, que forma parte de la RETICS de Biobancos Hospitalarios (RetBioH). Para la consecución de los objetivos propuestos, se realizará un estudio de asociación de ambito genómico (GWAS) de RAL mediante una aproximación en dos fases. El diseño consistirá en el genotipado de casos y controles, en los que un subconjunto de muestras serán genotipadas en la fase 1 utilizando una plataforma de alto rendimiento y el resto de muestras serán genotipadas en la fase 2 para los polimorfismos de mayor significación. En la fase 1 se realizará el genotipado de, al menos, medio millón de polimorfismos de todo el genoma en muestras de sujetos diagnosticados de RAL y se compararán con datos de controles españoles. La segunda fase consistirá en la replicación de aquellas variantes más significativas (aproximadamente 50) en muestras independientes de casos de rinitis y controles disponibles en nuestro laboratorio (Laboratorio de Investigación, Hospital Regional de Málaga) de los que existe información clínica y pruebas cutáneas a aeroalérgenos. Código Seguro de verificación:. Permite la verificación de la integridad de una ID. FIRMA ws051.juntadeandalucia.es PÁGINA 3/8

4 3. Presupuesto de licitación y valor estimado del contrato. El presupuesto máximo de licitación asciende a CUARENTA Y UN MIL CUATROCIENTOS DOS EUROS ( ) IVA excluido. Página 4 El valor estimado del contrato, calculado conforme al art. 88 TRLCSP, coincide con el presupuesto máximo de licitación, no previéndose la posibilidad de prórroga del contrato. 4. Precio del contrato y forma de pago. El precio del contrato será el que resulte de la adjudicación del mismo e incluirá como partida independiente el importe del IVA. En el precio del contrato se considerarán incluidos los demás tributos, tasas y cánones de cualquier índole que sean de aplicación, así como todos los gastos que se originen para el adjudicatario como consecuencia del cumplimiento de las obligaciones contempladas en el presente documento. El precio del contrato se calculará a tanto alzado. El precio del presente contrato no será objeto de revisión. El precio se abonará previa presentación de factura, de conformidad con lo que se establezca en el contrato, a la entrega de los resultados, verificada la conformidad del servicio con las condiciones ofertadas, conforme al procedimiento que se establezca en el contrato. El contratista tiene derecho al abono del precio convenido, con arreglo a las condiciones establecidas en el contrato. El plazo de pago será el que se establezca en el contrato con un máximo de 60 días a partir de la recepción del servicio o de la verificación de la entrega, de conformidad con la Ley 3/2004, de 29 de diciembre, por la que se establece en medidas de lucha contra la morosidad en las operaciones comerciales. 5. Ejecución y Características Técnicas del Servicio. La ejecución del contrato se hará a riesgo y ventura del contratista y se ajustará a lo establecido en su clausulado y en los documentos, de acuerdo con las instrucciones que para Código Seguro de verificación:. Permite la verificación de la integridad de una ID. FIRMA ws051.juntadeandalucia.es PÁGINA 4/8

5 su interpretación FIMABIS dé al contratista. El contratista será responsable de la calidad técnica de los trabajos que desarrolle y de las prestaciones y servicios realizados, así como de las consecuencias que se deduzcan para FIMABIS o para terceros, de las omisiones, errores, métodos inadecuados o conclusiones incorrectas en la ejecución del contrato. El servicio de genotipado masivo para la realización de la fase 1 del estudio de asociación en muestras de ADN de individuos españoles con rinitis mediante la determinación simultánea de la variación en, al menos, loci polimórficos debidos a cambios de la base (SNPs) e inserciones/deleciones (indels) sencillas se prestará en las condiciones que se especifican a continuación: ESPECIFICACIONES TÉCNICAS DEL SERVICIO: Página 5 Determinación simultánea de, al menos, polimorfismos distribuidos por todo el genoma mediante la utilización de menos de 0,5 microgramos de ADN a una concentración no superior a 20 nanogramos por microlitro procedente de sangre, saliva, o de reacciones de amplificación genómica. El genotipado deberá realizarse utilizando un sistema con procesamiento completamente automatizado (hibridación, tinción, lavado y escaneado) que minimice posibles errores y garantice homogeneidad en la ejecución del proyecto. Deben obtenerse genotipos reproducibles al 99% para un mínimo de 95% de los loci contenidos en la plataforma y de las muestras del estudio. Debe utilizarse una plataforma optimizada para determinar la variación genética en poblaciones europeas en todo el rango de frecuencias alélicas 1%. Debe utilizarse una plataforma cuyo contenido esté basado en información del Proyecto 1000 Genomas, además de en la fase II del Proyecto HapMap, que permita una cobertura eficiente de la variación genética del genoma completo. Debe acreditarse, al menos, 6 años de experiencia en el uso de tecnologías de genotipado de alto rendimiento y de, al menos, 1 año de experiencia con la tecnología ofertada, con la que previamente se hayan analizado un mínimo de 1000 muestras. RESULTADOS ENTREGABLES: Los resultados se entregarán en un plazo máximo de 28 días naturales a contar desde la recepción de las muestras. Código Seguro de verificación:. Permite la verificación de la integridad de una ID. FIRMA ws051.juntadeandalucia.es PÁGINA 5/8

6 Los resultados se proporcionarán bien físicamente, mediante el envío de discos duros externos a la dirección que se indique en el contrato, bien otorgando acceso telemático a un servidor externo donde se hallen depositados los resultados. Dicho acceso será efectivo desde la fecha de entrega de los resultados y durante un período mínimo de un año a contar desde la fecha de entrega. Como resultados se entregarán aquellos que representen las intensidades de cada alelo (como puede ser ficheros CEL) o similares. OFERTA TÉCNICA La oferta técnica que los licitadores deben presentar describirá de forma clara la forma en que será prestado el servicio, de forma tal que permita comprender y verificar el cumplimiento de las especificaciones técnicas requeridas y su mejor ajuste al objetivo del Proyecto. La oferta comprenderá, al menos, los siguientes apartados: - Número de muestras para el estudio genómico para las que se prestará el servicio según presupuesto. - Acceso a genotipos de un número igual o superior al de casos de muestras control españolas genotipadas mediante la misma plataforma. - Especificaciones técnicas de la plataforma propuesta y su mejor ajuste a las necesidades del servicio. - Calidad y fiabilidad esperada de los resultados en atención a los controles de calidad propuestos y en base a la plataforma técnica utilizada. - Mejoras (opcional). Página 6 6. Duración del contrato. El contrato comenzará su vigencia a partir del día de su firma. Su duración será la adecuada para garantizar la correcta prestación del servicio de conformidad con la descripción técnica del mismo. No se prevé la posibilidad de prórroga. 7. Criterios de adjudicación. Para la determinación de la oferta económicamente más ventajosa se utilizarán los siguientes criterios de adjudicación, indicados por orden decreciente de ponderación en el total máximo de 100 puntos: Código Seguro de verificación:. Permite la verificación de la integridad de una ID. FIRMA ws051.juntadeandalucia.es PÁGINA 6/8

7 1. Oferta Económica: máximo 60 puntos. La oferta económica, que deberá ser presentada conforme al anexo III del PCP (aportada en el sobre número 3) será valorada con una puntuación máxima de 60 puntos. Para la obtención de la valoración se utilizará la siguiente fórmula: Página 7 ( B A) P 1 = * N A Donde P es la puntuación que corresponderá a la oferta que se valora, N son los puntos o porcentaje máximo para dicho criterio, A es la oferta más baja presentada y B la oferta del licitador que se valora. Únicamente se valorarán las ofertas económicas presentadas conforme al anexo III del PCP. 2. Oferta técnica: máximo 30 puntos. La propuesta técnica (aportada en el sobre número 2) será valorada con un máximo de 30 puntos, teniendo en cuenta los siguientes criterios, según el conocimiento actual de la técnica y los objetivos del Proyecto en el marco del cual se necesita el servicio: Número de muestras para el estudio genómico para las que se prestará el servicio según presupuesto: máximo de 12 puntos. Acceso a genotipos de un número igual o superior al de casos de muestras control españolas genotipadas mediante la misma plataforma: máximo de 6 puntos. Especificaciones técnicas de la plataforma propuesta y su mejor ajuste a las necesidades del servicio: máximo 6 puntos. Calidad y fiabilidad esperada de los resultados en atención a los controles de calidad propuestos y en base a la plataforma técnica utilizada: máximo 6 puntos. Se valorarán no sólo los controles de calidad que ofrece la propia plataforma de genotipado, siempre que se realicen en el mismo centro donde se realice el proyecto de genotipado, sino también la implantación de controles adicionales. 3. Mejoras técnicas evaluables NO conforme a la aplicación de fórmulas: máximo 6 puntos. (Opcional). En caso de ofertar mejoras, únicamente se valorarán las mejoras que no supongan un Código Seguro de verificación:. Permite la verificación de la integridad de una ID. FIRMA ws051.juntadeandalucia.es PÁGINA 7/8

8 aumento del precio ofertado. Serán objeto de valoración sólo aquellas mejoras relacionadas con aspectos que incidan directa o indirectamente en la calidad del servicio y de los resultados esperados. Entre otras: asesoramiento en la preparación de las muestras y tras la obtención de genotipos; acceso a genotipos del mayor número posible de controles genotipados mediante la misma plataforma; cuantificación previa de las muestras de ADN y determinación de la integridad del material. Las mejoras deben estar detalladas como tales en un apartado de la oferta técnica (que se aportará en el sobre número 2). 4. Mejora evaluable conforme a la aplicación de fórmula matemática: plazo de entrega de resultados: máximo 4 puntos. (Opcional). Página 8 De forma opcional, los licitadores podrán ofertar una mejora relativa al plazo de entrega de resultados (se aportará en el sobre número 3) que no podrá suponer aumento de precio. Obtendrá la máxima puntuación para este criterio, aquella empresa que presente el menor plazo de cumplimiento de la obligación de entrega de resultados, teniendo como máximo 28 días naturales. Para la ponderación de este criterio se utilizará la siguiente fórmula: 28 - D P = * 4 M Donde P es la puntuación que corresponderá a la oferta objeto de valoración. D es el número total de semanas ofertadas para la ejecución del servicio y M es la mayor reducción de plazo presentada de entre todas las ofertas. Las mejoras relativas al plazo de entrega se ofertarán utilizando el modelo del Anexo IV del PCP. Código Seguro de verificación:. Permite la verificación de la integridad de una ID. FIRMA ws051.juntadeandalucia.es PÁGINA 8/8