SISTEMA DE INFORMACIÓN MICROBIOLÓGICA DE ARAGÓN

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1 SISTEMA DE INFORMACIÓN MICROBIOLÓGICA DE ARAGÓN Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 1

2 INDICE 1 INTRODUCCIÓN pag 3 2 CARACTERÍSTICAS DEL SISTEMA pag Fuentes de información pag Circuitos de información pag Indicadores de calidad pag Variables a declarar y definición de registro pag Microorganismos implicados en los diagnósticos pag ANEXOS pag Anexo 1: Criterios diagnósticos de notificación Anexo 2: Microorganismos por categoría de transmisión Anexo 3: Muestras, criterios y técnicas Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 2

3 1. INTRODUCCION El Sistema de Información Microbiológica (SIM) es uno de los sistemas básicos de vigilancia junto con la notificación obligatoria de enfermedades y la notificación de situaciones epidémicas y brotes, y así viene recogido en la legislación tanto nacional como autonómica, en concreto en el Real Decreto 2210/1995, de 28 de diciembre, por el que se crea la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica, y en el Decreto 222/96 de 23 de diciembre del Gobierno de Aragón, por el que se regula la vigilancia epidemiológica en Aragón. El SIM viene funcionando desde 1979/1981 a nivel nacional y de forma voluntaria. En Aragón no existía hasta ahora un SIM propiamente dicho pero sí se realizaba una declaración semanal de tipo numérico por parte del Hospital Universitario Miguel Servet y el Hospital Clínico Universitario Lozano Blesa desde El SIM de Aragón viene a complementar a los sistemas de vigilancia ya existentes y su objetivo principal es recoger información detallada sobre patología infecciosa confirmada por laboratorio para aportar información específica para la vigilancia epidemiológica de las enfermedades transmisibles. Los objetivos específicos del SIM en Aragón son: 1. Estimar la magnitud y describir los patrones de presentación de la patología de causa infecciosa. 2. Monitorizar cambios en los agentes infecciosos. 3. Facilitar la investigación epidemiológica y de laboratorio y, por lo tanto, contribuir al conocimiento de la patología infecciosa en nuestro medio mediante la generación de hipótesis a través del estudio descriptivo de los datos. 4. Caracterizar y detectar brotes. Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 3

4 2. CARACTERISTICAS DEL SISTEMA El SIM de Aragón se ha desarrollado siguiendo las directrices y criterios contemplados en el SIM establecido por la Red Nacional de Vigilancia Epidemiológica, y adaptándolo a las circunstancias específicas que para Aragón han consensuado un grupo de trabajo formado por microbiólogos y epidemiólogos. 2.1 Fuentes de información Actualmente se reciben datos de: El laboratorio de microbiología del Hospital Universitario Miguel Servet, con extracción automática de las variables previstas. El Hospital Clínico Universitario a partir de 2013 extracción automatizada de las variables establecidas. El laboratorio de microbiología del Hospital de Alcañiz con la misma aplicación que el Hospital Universitario Miguel Servet. El laboratorio de microbiología del Hospital Ernest Lluch de Calatayud con trascripción por parte de los facultativos del servicio de microbiología a semejanza de la aplicación del laboratorio de microbiología del H. Miguel Servet y H. de Alcañiz. El laboratorio de microbiología del Hospital Royo Villanova que a partir del 12/05/2015 las declaraciones realizadas por el HUMS incluyen las del Hospital Royo Villanova. El laboratorio de microbiología del Hospital San Jorge de Huesca desde el 04/05/ Circuitos de información Los laboratorios notifican a la sección de Vigilancia Epidemiológica de la Dirección General de Salud Pública (DGSP) los diagnósticos microbiológicos consensuados para el SIM y que son el conjunto de una serie de agentes, en unas muestras concretas y mediante criterios diagnósticos predeterminados. (Ver Anexo 3) La periodicidad de envío es semanal en el Hospital Miguel Servet, Hospital de Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 4

5 Alcañiz, Hospital Clínico Universitario, Hospital Royo Villanova y Hospital San Jorge de Huesca. Se realiza previa encriptación de los datos para preservar la confidencialidad de los datos. La periodicidad en el Hospital de Calatayud es mensual. El envío se realiza con encriptación de los datos. La sección de Vigilancia Epidemiológica de la DGSP se encarga del almacenamiento, análisis y difusión de la información generada por los laboratorios. Con periodicidad semanal se envía información a las Subdirecciones Provinciales de Salud Pública de todos aquellos registros cuyo resultado microbiológico corresponda a una Enfermedad de Declaración Obligatoria (EDO). El objetivo es que los laboratorios de microbiología pasen a ser una fuente activa de información en las EDO. Con periodicidad trimestral, se realiza el envío de información al Centro Nacional de Epidemiología. Así mismo, con periodicidad trimestral se confecciona el Boletín del Sistema de Información Microbiológica, disponible en la página que se envía en formato electrónico a una lista de suscriptores predeterminada. La información incluida en el boletín consiste en: 1. Información microbiológica básica correspondiente a un trimestre determinado: tablas de frecuencias por gérmenes y: - mecanismo de transmisión. - semana epidemiológica/mes de aislamiento - edad de los pacientes - sexo, etc. 2. Información en cada boletín de un agente en concreto, bien debido a su frecuencia de aislamiento o a otras características reseñables. De dicho agente se analizará: - el tipo de muestra en el que se localiza con más frecuencia - el criterio diagnóstico - sexo y grupo de edad Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 5

6 3. Información sobre detección de Enfermedades de Declaración Obligatoria (EDO) a través del SIM 4. Alertas sanitarias nacionales e internacionales de agentes recogidos en el SIM. Está previsto incluir información sobre la susceptibilidad a antimicrobianos, variable que se recogerá en los siguientes 8 microorganismos: Campylobacter, Salmonella, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Virus influenza, Neisseria gonorrhoeae, y Mycobacterium tuberculosis. Además para completar los circuitos de retroalimentación la Sección de Vigilancia Epidemiológica de la DGSP, recibirá la información de ámbito nacional analizada desde el CNE, que reenviará igualmente a las secciones provinciales y laboratorios de microbiología, de forma aislada o incluida en el Boletín del Sistema de Información Microbiológica de Aragón. 2.3 Indicadores de calidad Los indicadores para monitorizar el adecuado funcionamiento del SIM son: Cobertura de declarantes por semana: (Nº de laboratorios declarantes en la semana/ total de laboratorios): >80%. Este indicador se comenzará a calcular cuando todos los laboratorios se hayan incorporado al SIM. Retraso de la notificación en tiempo oportuno: laboratorios que declaran en un tiempo > de 4 semanas sobre el plazo previsto/total de laboratorios: <20% Nº de boletines elaborados/año: 4 Cumplimentación adecuada de variables: >80% (Nº de variables cumplimentadas correctamente/total de variables) Cumplimentación adecuada de variables obligatorias: >95% (Nº de variables obligatorias cumplimentadas correctamente/total de variables obligatorias) Nº de envíos de datos al CNE en tiempo oportuno (+ del 90%) 2.4 Variables a declarar y definición de registro como diagnostico microbiológico ID registro CCAA Nombre Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 6

7 Apellido 1 Apellido 2 ID paciente: se recogerá o bien el código de identificación autonómico (CIA) o, en el caso de que no esté disponible, el número de historia clínica. Sexo Fecha de nacimiento Edad del paciente Tipo de edad: se recogerá si son años, meses o días. Fecha de recepción de la muestra Fecha de detección Semana epidemiológica de recepción Semana epidemiológica de detección* Código del laboratorio Agente*: 42 agentes de los que 16 son EDO ID prueba Criterio diagnóstico* Muestra analizada* Nivel de resistencia a fármacos En el caso del HCU y Hospital de Calatayud, se rellenan las variables anteriores excepto el nivel de resistencia a fármacos *Variables de cumplimentación obligatoria. Una vez han llegado los datos a la DGSP, se les añade la variable año para poder realizar correctamente el filtrado de la información. La unión de estas variables forma un registro que contiene: Información relativa al paciente Un agente infeccioso, de los 42 que hasta el momento se declaran. Los datos de una prueba microbiológica primaria: criterio, muestra y técnica (ver anexo 3). Una prueba secundaria, si la tuviera, con el mismo diagnóstico que la primaria. ES DECIR, LO QUE REALMENTE SE DECLARA NO ES SOLO LA PRESENCIA DE CUALQUIER MICROORGANISMO SINO LA PRESENCIA DE UN LISTADO DETERMINADO DE ESTOS EN UNAS DETERMINADAS MUESTRAS Y CON UN DETERMINADO CRITERIO DIAGNOSTICO, DE FORMA QUE EL CONJUNTO Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 7

8 CONFORMA UN DIAGNOSTICO MICROBIOLOGICO DE UN POSIBLE CASO DE ENFERMEDAD SUSCEPTIBLE DE SER VIGILADO. (Ver anexo1) 2.5 Microorganismos implicados en los diagnósticos microbiológicos. Los microorganismos a declarar en Aragón son 42 (ver anexo 2). De 34 de ellos se manda información al Centro Nacional de Epidemiología. Dichos microorganismos han sido seleccionados de acuerdo a los siguientes criterios: 1. Que provoquen, o puedan provocar, una morbilidad y/o mortalidad alta. 2. Que su vigilancia permita alertar de amenazas para la salud pública. 3. Que produzcan enfermedades para las que existen medidas preventivas eficaces y con las que se obtienen beneficios para la protección de la salud de la población. La lista puede y debe ser revisada con el objeto de incluir nuevos microorganismos que interese vigilar en un futuro. Los microorganismos, a semejanza de lo establecido en el SIM nacional, se han agrupado en los siguientes apartados: transmisión alimentaria e hídrica, enfermedades inmunoprevenibles, transmisión sexual/parenteral, transmisión respiratoria, enfermedades de origen medioambiental, importadas y emergentes y otros microorganismos. El listado de microorganismos de acuerdo a esta clasificación se muestra en el anexo 2. Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 8

9 ANEXO 1. CRITERIOS DIAGNOSTICOS DE NOTIFICACIÓN AL SIM BACTERIAS MICROORGANISMO CRITERIO DIAGNÓSTICO MUESTRA Bordetella Pertusis Exudado nasofaríngeo Detección de genoma Exudado nasofaríngeo LCR, biopsia cutánea, líquido articular, tejido cardíaco LCR, biopsia cutánea, líquido articular, tejido cardiaco Borrelia burgdorferi Detección IgM Seroconversión Detección IgG LCR Campylobacter spp. Heces, sangre Exudado uretral, exudado vaginal, exudado cervical, exudado rectal, úlcera genital, exudado conjuntival, exudado nasofaríngeo Chlamydia trachomatis Exudado uretral, exudado vaginal, exudado cervical, exudado rectal, por IFD úlcera genital, orina, exudado conjuntival Exudado uretral, exudado vaginal, exudado cervical, exudado rectal, úlcera genital, orina, exudado conjuntival Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo Chlamydophila pneumoniae Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo Detección IgM Seroconversión Aspirado bronquial, esputo Coxiella burnetii Aspirado bronquial, esputo, sangre, tejido Detección IgM por IFI Seroconversión Heces Escherichia coli verotoxigénico Heces Detección toxinas Heces Haemophilus influenzae Sangre, líquido articular, líquido pleural, líquido pericárdico, LCR Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 9

10 Sangre, líquido articular, líquido pleural, líquido pericárdico, LCR Leptospira interrogans Sangre, LCR, orina, líquido peritoneal Sangre, LCR, orina, líquido peritoneal Sangre, LCR, orina, líquido peritoneal Seroconversión Muestras respiratorias, Muestra estéril Orina, Muestras respiratorias, Tejido pulmonar Legionella Respuesta específica de anticuerpos Muestra clínica Título alto de anticuerpos Listeria monocytogenes Sangre, LCR, exudado nasofaríngeo, exudado conjuntival Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo, líquido pleural, biopsia pulmonar, LCR, sangre, orina, heces, lesión cutánea, líquido articular, líquido gástrico, líquido peritoneal, médula ósea, biopsia ganglionar, absceso, biopsia intestinal Mycobacterium tuberculosis Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo, líquido pleural, biopsia pulmonar, LCR, sangre, orina, heces, lesión cutánea, líquido articular, líquido gástrico, líquido peritoneal, médula ósea, biopsia ganglionar, absceso, biopsia intestinal Visualización Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo, líquido pleural, biopsia pulmonar, LCR, sangre, orina, heces, lesión cutánea, líquido articular, líquido gástrico, líquido peritoneal, médula ósea, biopsia ganglionar, absceso, biopsia intestinal Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo Mycoplasma pneumoniae Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo Seroconversión Exudado uretral, exudado vaginal, exudado cervical, exudado rectal, líquido peritoneal, líquido articular, orina, exudado nasofaríngeo Neisseria gonorrhoeae Exudado uretral, exudado vaginal, exudado cervical, exudado rectal, líquido peritoneal, líquido articular, orina, exudado nasofaríngeo Visualización Exudado uretral Neisseria meningitidis Sangre, LCR, líquido articular, petequia Sangre, LCR, líquido articular, petequia LCR Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 10

11 Visualización LCR Seroconversión por IFI Biopsia cutánea Rickettsia conorii Biopsia cutánea Biopsia cutánea Salmonella spp. Sangre, heces, biopsia intestinal, orina, LCR Salmonella typhi y S. paratyphi Sangre, heces, biopsia intestinal, orina, LCR Streptococcus agalactiae Sangre, LCR Sangre, LCR, líquido articular, líquido pleural, biopsia pulmonar, líquido pericárdico Streptococcus pneumoniae Sangre, LCR, líquido articular, líquido pleural, biopsia pulmonar, líquido pericárdico Sangre, LCR, líquido articular, líquido pleural, biopsia pulmonar, líquido pericárdico Streptococcus pyogenes Sangre, LCR, líquido articular, líquido pleural, biopsia pulmonar Vibrio parahaemolyticus Heces Yersinia spp Heces, sangre, biopsia intestinal VIRUS MICROORGANISMO CRITERIO DIAGNÓSTICO MUESTRA Heces, orina, aspirado bronquial, exudado nasofaríngeo, esputo, exudado conjuntival, LCR Adenovirus Heces, orina, aspirado bronquial, exudado nasofaríngeo, esputo, exudado conjuntival, LCR Heces, orina, aspirado bronquial, exudado nasofaríngeo, esputo, exudado conjuntival, LCR Seroconversión Enterovirus LCR LCR, sangre Dengue Detección IgM, sangre Seroconversión, sangre, sangre Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 11

12 Exudado uretral, exudado vaginal, exudado cervical, exudado rectal, úlcera genital, exudado nasofaríngeo Herpes simple Exudado uretral, exudado vaginal, exudado cervical, exudado rectal, úlcera genital, exudado nasofaríngeo Exudado uretral, exudado vaginal, exudado cervical, exudado rectal, úlcera genital, exudado nasofaríngeo Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo, líquido pleural, biopsia pulmonar Influenza Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo, líquido pleural, biopsia pulmonar Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial, esputo, líquido pleural, biopsia pulmonar Seroconversión Rotavirus Heces Heces Sangre, LCR Virus de la Fiebre del Nilo Sangre, LCR Detección IgM LCR, suero Detección IgG Heces, Hepatitis A Respuesta específica de anticuerpos Heces Respuesta específica de anticuerpos Hepatitis B Hepatitis C Respuesta específica de anticuerpos confirmada por un test diferente Muestra clínica Rubéola Muestra clínica Respuesta específica de anticuerpos, Saliva Título alto de anticuerpos Muestra clínica Sarampión Muestra clínica Respuesta específica de anticuerpos, Saliva por IFD Muestra clínica Parotiditis Muestra clínica Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 12

13 Virus respiratorio sincitial Respuesta específica de anticuerpos Seroconversión Muestra clínica, Saliva Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial Exudado nasofaríngeo, aspirado bronquial PARÁSITOS MICROORGANISMO Cryptosporidium Entamoeba Giardia Toxoplasma gondii CRITERIO DIAGNÓSTICO Visualización Visualización Visualización Detección IgA Detección IgM Detección IgG Heces, líquido duodenal, biopsia intestinal Heces Heces Heces, absceso Heces, absceso Heces, absceso Heces, líquido duodenal, biopsia intestinal Heces heces Sangre, LCR, orina Sangre, LCR, orina LCR MUESTRA Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 13

14 HONGOS CRITERIO MICROORGANISMO DIAGNÓSTICO Aspergillus Aspirado bronquial, sangre, LCR MUESTRA Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 14

15 ANEXO 2: MICROORGANISMOS SELECCIONADOS EN EL SIM DE ARAGÓN, POR CATEGORÍA DE TRANSMISIÓN a semejanza de lo establecido en el SIM nacional. Transmisión alimentaria e hídrica Bacterias Campylobacter spp. Escherichia coli verotoxigénico Salmonella spp. No Typhi ni Paratyphi Salmonella Typhi y Paratyphi Yersinia enterocolitica Leptospira interrogans Listeria monocytogenes Vibrio parahaemolyticus Virus Virus Hepatitis A* Parásitos Cryptosporidium sp Giardia lamblia Entamoeba hystolitica Enfermedades inmunoprevenibles Bacterias Haemophilus influenzae Neisseria meningitidis Bordetella pertusis* Virus Sarampión * Rubéola* Parotiditis* Transmisión sexual/parenteral Bacterias Chlamydia trachomatis Neisseria gonorrhoeae Virus Herpes simple Hepatitis B* Hepatitis C* Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 15

16 Respiratorias Bacterias Chlamydophila pneumoniae Mycoplasma pneumoniae M. tuberculosis, M.bovis, M. africanum, M. microtti Streptococcus pneumoniae Virus Virus Influenza Virus respiratorio sincitial Enfermedades de origen medioambiental, importadas y emergentes Bacterias Legionella* Coxiella burnetii Borrelia burgdorferi Rickettsia conorii Virus Virus de la Fiebre del Nilo Occidental Dengue Otros microorganismos Bacterias Streptococcus agalactiae Streptococcus pyogenes Virus Enterovirus Adenovirus Rotavirus Parásitos Toxoplasma gondii Hongos Aspergillus * Microorganismos de declaración exclusiva al SIM de Aragón Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 16

17 ANEXO 3: MUESTRAS, CRITERIOS Y TÉCNICAS CODIGO MUESTRA MUESTRA DESCRIPCION MUESTRA Aspirado bronquial: broncoaspirado, lavado broncoalveolar y cepillado bronquial Biopsia cutánea 003 Biopsia intestinal 004 Biopsia ganglionar 005 Biopsia gástrica 006 Esperma 007 Esputo 008 Exudado cervical 009 Exudado herida quirúrgica 010 Absceso 011 Exudado nasofaríngeo 012 Exudado rectal 013 Exudado uretral 014 Exudado vaginal 016 Heces 018 LCR 019 Lesión cutánea 020 Líquido articular 022 Líquido gástrico 023 Líquido pericárdico 024 Líquido peritoneal 025 Líquido pleural 026 Médula ósea 029 Úlcera genital 030 Exudado conjuntival 031 Orina 032 Otras 034 Saliva 035 Sangre 037 Sin especificar Biopsia otra 040 Biopsia pulmonar: bronquial, transbronquial, pulmonar, pleural y otras 041 Líquido duodenal 042 Petequia 043 Biopsia cardiaca Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 17

18 CRITERIO CODIGO CRITERIO DESCRIPCION CRITERIO Detección IgG Detección IgM 06 Detección toxina 07 Seroconversión o aumento del título de anticuerpos 08 Visualización 09 Detección IgA 10 Detección de anticuerpos 99 Sin especificar TECNICA CODIGO TECNICA DESCRIPCION TECNICA 01 Aglutinación 02 Cultivo 03 ELISA 04 Examen directo 05 Fijación complemento 06 Floculación 07 Inhibición hemaglutinación 08 Inmuno blotting 09 Inmunofluorescencia 10 Inmunofluorescencia directa 11 Inmunofluorescencia indirecta 12 Latex 13 Microaglutinación 14 Microscopía 15 Neutralización 16 PCR 17 Radioinmunoensayo 18 Sin especificar 19 Tinción 20 Western Blot 21 Hemoaglutinación 22 Inmunocromatografia 23 Otras técnicas de biología molecular Dirección General de Salud Pública. Sección de Vigilancia Epidemiológica. 18