GUÍA DOCENTE DE INGENIERIA DE LOS ACIDOS NUCLEICOS CURSO 2009/2010

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1 GUÍA DOCENTE DE INGENIERIA DE LOS ACIDOS NUCLEICOS CURSO 2009/200. DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA..Nombre.3. Código de la asignatura Ingeniería de los Ácidos Nucleicos Plan Código UNESCO.5.Curso académico Cuadro de texto (campo no obligatorio para grado).6. Ciclo formativo Licenciat ura.7. Curso de la Titulación.0. Utilización plataforma virtual (indicar modalidad).. Créditos ECTS Organización de las actividades I. ACTIVIDADES DEL ESTUDIANTE PRESENCIALES /ON LINE II. ACTIVIDADES NO PRESENCIALES DEL ESTUDIANTE (Trabajo Autónomo) 4º curso.8.tipo Optativa.9. Cuatrimestre Apoyo a la docencia 6 ECTS 6 LRU... Horas presenciales del estudiante Horas no presenciales del estudiante Actividades previstas para el aprendizaje y distribución horaria del trabajo del estudiante por actividad(estimación en horas) Sesiones de Teoría 9 Sesiones Prácticas 5 Seminarios (actividades dirigidas por el profesor) 5 Prácticas externas -- Primer cuatrimestre 05 Horas Tutorías individuales Tutorías colectivas Realización de pruebas de evaluación 4 Trabajo en grupo 30 Trabajo individual (preparación de exámenes, horas de estudio, consultas en aula virtual, realización de pruebas en aula virtual, etc) Organización de actividades (especialmente para asignaturas b-learning y e- learning) TOTAL HORAS DE TRABAJO DEL ESTUDIANTE DATOS DEL/ LA PROFESOR/A (este apartado será aportado por la OD) 2.. Nombre Francisco Javier Las Heras Vázquez 2.2. Departamento 2.3. Despacho 2.4. Horario de tutoría Química-Física, Bioquímica y Química Inorgánica =

2 2.5. Teléfono 2.8. Recursos Web personales (instituciona l) WebCt de la asignatura s 3. ELEMENTOS DE INTERÉS PARA EL APRENDIZAJE DE LA ASIGNATURA 3.. Justificación de los contenidos Los alumnos que cursen esta asignatura adquirirán la información y los conocimientos necesarios para manipular los ácidos nucleicos. Se estudiarán técnicas de corte y unión de ácidos nucleicos, amplificación y visualización de los mismos, creación de genotecas para la búsqueda de genes y secuenciación del ADN e introducción del material genético en organismos hospedadores Materia con la que se relaciona en el Plan de Estudios Bioquímica Biología Molecular Biotecnología molecular Experimentación en Bioquímica 3.4.Conocimientos necesarios para abordar la asignatura Haber cursado las asignaturas de: Bioquímica Biología Molecular 3.5. Requisitos previos recogidos en la memoria de la Titulación 4. COMPETENCIAS 4.. Competencias generales Competencias genéricas de la Universidad de Almería (grado y máster) Capacidad para resolver problemas Capacidad de análisis y síntesis 4.2. Competencias específicas desarrolladas Conocimiento de las diferentes técnicas de manipulación de los ácidos nucleicos (saber) Capacidad para reconocer y llevar a cabo buenas prácticas en el laboratorio (saber hacer). 2

3 5. OBJETIVOS/ RESULTADOS DE APRENDIZAJE.- Los alumnos adquieren los conocimientos para manipulación y visualización de los ácidos nucleicos, la realización de un clonado de un gen y la introducción de material genético en organismos hospedadores. 2.- Los alumnos trabajarán en grupo la realización de un clonado de un gen y su posterior verificación. 3.- Los alumnos realizarán ejercicios como clonados virtuales y búsqueda de genes en el banco de genes. 6. BLOQUES TEMÁTICOS, METODOLOGÍA Y PLANIFICACIÓN DE LAS ACTIVIDADES PREVISTAS Contexto Procedimientos y actividades Bloques temáticos Modalidades organizativas formativas Presencial On-line Bloque I Técnicas básicas en el análisis de los ácidos nucleicos. Preparación y manipulación Bloques temáticos Bloque II Clonación en Escherichia coli. Amplificación in Vitro. Mutaciones. PRACTICAS Sesiones de contenido teórico Sesiones de Grupo de trabajo Modalidades organizativas Sesiones de contenido teórico Sesiones de contenido práctico Sesiones de Grupo de trabajo Clase magistral participativa 6 Videos explicativos Evaluación de resultados Problemas Procedimientos y actividades formativas Presencial Contexto Clase magistral participativa 8 Seminarios 4 Videos explicativos 2 Tutorias 2 Evaluación de resultados 3 Introducción teórica 2 Debate Organización del trabajo Resolución de problemas Trabajo en el laboratorio 9 Sesión de evaluación Debate Problemas (esta tabla está anexada a la anterior, por tanto estos elementos corresponden a cada uno de los bloques temáticos) DESCRIPCIÓN DE TAREAS DEL ESTUDIANTE Y RECURSOS VIRTUALES QUE SE UTILIZARÁN EN LA ACTIVIDAD PARA ASIGNATURAS B-LEARNING Y E-LEARNING 3 On-line HORAS (previsión de actividades presenciales, en aula y de trabajo autónomo) Presenciales No presenciales Trabajo individual y en grupo

4 7. PROCEDIMIENTO DE EVALUACIÓN DE LAS COMPETENCIAS 7.. Criterios de evaluación Competencias Genéricas -Capacidad de análisis y síntesis: Se evaluará la capacidad para analizar y exponer tanto los conocimientos teóricos como los resultados obtenidos en el laboratorio de forma clara y concisa. Ser capaz de aplicar en un caso práctico las herramientas introducidas en la asignatura. -Capacidad para resolver problemas: Se evaluará la capacidad de análisis y síntesis del problema, la aplicación de los contenidos teóricos de la asignatura en la resolución del problema. En donde se requiera la aportación de un informe, éste debe desarrollarse aplicando el método científico donde se exponga la descripción del problema, el análisis y la resolución del mismo. Competencias Específicas: -Conocimiento de las diferentes técnicas de manipulación de los ácidos nucleicos Conocer los fundamentos, características y aplicaciones de las principales técnicas de investigación de la Tecnología de los Ácidos Nucleicos. -Capacidad para reconocer y llevar a cabo buenas prácticas en el laboratorio. Demostrar la habilidad para llevar a cabo la observación, seguimiento y utilización de técnicas de Biología Molecular, atribuyendo nuevas características a organismos hospedadores. Realizar trabajo experimental con organismos modificados Porcentajes de evaluación Porcentaje teoría: 60% Porcentaje prácticas: 20% Porcentaje seminarios: 0% Porcentaje ejercicios: 0% 7.2. Instrumentos de evaluación Informe de progreso. Pruebas, ejercicios, problemas. Observaciones del proceso. Valoración final de informes, trabajos, proyectos, etc. Pruebas finales (escritas u orales) Recomendaciones para la recuperación Los mismos que se han expuesto en los criterios de evaluación Mecanismos de seguimiento (se recogerán aquí los mecanismos concretos que los docentes propongan para el seguimiento de la asignatura) Asistencia obligatoria a las sesiones prácticas Asistencia a tutorías Asistencia y participación a seminarios Alta y acceso al aula virtual Participación en herramientas de comunicación Correo Ejercicios Entrega de los ejercicios solicitados Evaluación de las competencias adquiridas 4

5 8. BIBLIOGRAFÍA DE LA ASIGNATURA 8.. Bibliografía recomendada Libros en español: - Título: Bioquímica. Autor: J. D. Rawn. Editorial: McGraw-Hill Interamericana. Año: Título: Genes y Genomas. Autores: M. Singer y P. Berg. Editorial: Omega. Año: Título: Principios de manipulación genética. Autores: R. W. Old y S. B. Primrose. Editorial: Acribia. Año: Título: ADN Recombínate y Biotecnología. Autores H. Keuzer y A. Massey. Editorial: Acribia. Año: Título: Texto ilustrado de Biología Molecular e Ingeniería Genética. Autores: J. Luque y A. Herráez. Ediorial: Elsevier. Año: Título: Ingeniería Genética. Volumen I. Preparación, análisis, manipulación y clonaje de DNA. Autores: Julián Perea, Antonio Tormo y José Luís García. Editorial: Síntesis. Año: Título: Ingeniería Genética. Volumen II. Expresión de DNA en sistemas heterólogos. Autores: Julián Perea, Antonio Tormo y José Luís García. Editorial: Síntesis. Año: Libros en ingles: - Título: Molecular Cloning, a laboratory Manual. Autores: J. Sambrook, E. F. Fritsch y T. Maniatis. Editoral: Cold Spring Harbor Laboratory Press. Año: Título: Essential Molecular Biology, Vol. I. Autor: T. A. Brown. Editorial: IRL Press. Año: Título: Principles of Gene manipulation. Autores: R. W. Old y S. B. Primrose. Editorial: Blackwell Science. Año: 994 (5ª edición). - Título: Short Protocols in Molecular Biology. Autores: F. Ausubel, R. Brent, R. E. Kingston, D. D. Moore, J. G. Seidman, J. A. Smith y K. Struhl. Editorial: Willey. Año: 995 (3º edición). 3 volúmenes. - Título: Analysis of Genes and Genomes. Autor: R. J. Reece. Editorial: Wiley. Año: Direcciones Web

6 9. CONTENIDO DE LA ASIGNATURA 9.. BLOQUE I. Técnicas Básicas en el análisis de los ácidos nucleicos. Preparación y Manipulación. I.. Visión general de la obtención de ADN recombinante. I.2. Técnicas Básicas en el análisis de los ácidos nucleicos I. Preparación y análisis del ADN I.2.. Purificación de los ácidos nucleicos: ADN genómico y plasmídico. ARN total. I Visualización de los ácidos nucleicos: electroforesis en gel. Tipos. I Purificación de ácidos nucleicos desde geles. I.3. Técnicas Básicas en el análisis de los ácidos nucleicos II. Manipulación enzimática de los ácidos nucleicos. I.3.. Corte de los ácidos nucleicos: nucleasas. I.3... Exdonucleasas I Endonucleasas I Unión de los ácidos nucleicos. Tipos de Ligasa. I ADN polimerasas. I Fosofatasas y kinasas. I Transcriptasas inversas BLOQUE II. Clonación en Escherichia coli. Amplificación in Vitro. Mutaciones. PRACTICAS II.. Clonación en Escherichia coli. Vectores. II... Las células hospedadoras. II..2. Vectores plasmídicos. Plásmidos. II..3. Vectores derivados de bacteriófagos II..4. Vectores combinados de plásmidos y fagos. Cósmidos. II..5. Introducción de vectores en el huésped. Transformación. II.2. Clonación en Escherichia coli. Estrategias. II.2.. Genotecas genómicas. II.2.2. Genotecas ADN complementario (ADNc). II.2.3. Hibridación de los ácidos nucleicos con sondas. Southern. Northern. II.2.4. Técnicas de inmunoensayo. Creación de anticuerpos. II.2.5. Análisis funcional. II.2.6. Análisis por interacción. II.3. Clonación en Escherichia coli. Amplificación in vitro II.3.. Reacción en cadena de la Polimerasa (PCR): alternativa a la clonación. II.3... Descripción y componentes de la reacción. ADN polimerasas. termoestables: Taq polimerasa. II.3..2.Oligonucleotidos cebadores. II.3.2. Aplicaciones de la PCR: II Clonado de productos de PCR. II Genotecas mediante PCR. II Detección de enfermedades genéticas mediante PCR. II PCR a partir de ARNm (RT-PCR). II PCR en tiempo real. II.3.3. Secuenciación de los ácidos nucleicos. II.4. Creación de mutaciones II.4.. Mutaciones al azar. II.4... agentes mutagénicos. II Mediante enzimas no especificas. II Mediante PCR. II.4.2. Mutaciones en sitio específico: Mutagenesis dirigida. II Mediante oligonucleotidos. II Mediante mutagenesis de cassette. II Mediante PCR. 6

7 II.5. PRÁCTICAS II.5.. Aislamiento y purificación del plásmido pbbm3 para su utilización como vector de clonado. II.5.2. Amplificación del gen de la enzima Glutation S-transferasa por PCR y purificación del fragmento desde geles de agarosa. II.5.3. Corte del vector y del inserto con enzimas de restricción y ligado de los mismos para crear un plásmido recombinante. II.5.4. Introducción del plásmido recombinante en Escherichia coli para la producción de gran cantidad del fragmento clonado. 7