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http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query.fcgi Helena Martín Rodero Biblioteca Facultad de Medicina helena@usal.es Sonia Martín Castilla Biblioteca E.U. Enfermería y Fisioterapia castilla@usal.es Salamanca, 21-25 de julio de 2008 http://sabus.usal.es/bib_virtual3

Definición PubMed- www.pubmed.gov Qué es PubMed? Sistema de búsqueda desarrollado y mantenido por el National Center for Biotechnology Informations (NCBI) de la National Library of Medicine (NLM).

Contenido PubMed proporciona acceso gratuito a: PubMed- www.pubmed.gov Medline: Base de datos referencial más importante de la NLM. Cobertura desde el año 1966 hasta el momento actual. OldMedline: referencias bibliográficas desde 1950 hasta 1965. Referencias bibliográficas de artículos publicados recientemente que están en proceso de ser indizados en Medline. Referencias bibliográficas proporcionadas por los editores que pueden o no ser incluidas en Medline. Artículos disponibles a texto completo en PubMed Central. Otras bases de datos del NCBI.

Status de las citas en PubMed PubMed- www.pubmed.gov [PubMed as supplied by Publisher] - Cita enviada directamente por el editor. [PubMed in process] Cita en proceso de ser indizada en Medline. [PubMed indexed for Medline] Cita indizada en Medline. [PubMed OLDMELINE] - Cita procedente de OLDMEDLINE. [PubMed] Cita que no es ni será indizada en Medline. [PubMed author manuscript in PMC] Cita de manuscrito ingresado directamente por el autor en PMC.

Contenido PubMed ofrece PubMed- www.pubmed.gov Diversas modalidades de búsqueda. Acceso al vocabulario controlado MesH. Posibilidad de almacenar y actualizar búsquedas a través de la aplicación My NCBI. Enlaces al texto completo de artículos. Acceso a otros sistemas de búsqueda de la NLM como ClinicalTrials.gov, MedlinePlus, NIH Clinical Alerts and Advisories, PubMed Central.

Crecimiento PubMed- www.pubmed.gov

Página inicial PubMed- www.pubmed.gov Acceso a bases de datos Menú de ayuda de PubMed. Servicios PubMed Formulario de búsqueda Funciones adicionales de búsqueda Otros recursos relacionados

Página inicial PubMed- www.pubmed.gov Servicios de búsqueda Ayuda, preguntas frecuentes, programas de instrucción, noticias Búsqueda por revista Búsqueda por terminología controlada MeSH Búsqueda por citas Búsqueda por citas Búsquedas por filtros metodológicos Búsquedas de recursos externos Servicio de almacenamiento de búsquedas Recursos relacionados

Para buscar en PubMed PubMed- www.pubmed.gov. 1. Definir la pregunta. 2. Conocer lenguaje de interrogación. 3. Conocer reglas básicas de sintaxis. 4. Elaborar estrategia de búsqueda.

Lenguajes de interrogación 1 Lenguaje natural = Palabras clave PubMed - Búsquedas 2 Lenguaje documental = Descriptores colon cancer MeSH Colonic neoplasms

Operadores booleanos Búsqueda bibliográfica AND = Y OR = O NOT = NO A intersección A A suma B B B exclusión

Operadores booleanos AND = Y eczema AND asthma PubMed - Búsquedas OR = O NOT = NO eczema OR asthma eczema NOT asthma En PubMed los operadores booleanos deben escribirse en mayúsculas. Son procesados de izquierda a derecha. Se puede cambiar este proceso utilizando paréntesis.

Caracteres de truncamiento PubMed - Búsquedas El truncado permite recuperar todos los términos que poseen la misma raíz. Caracteres de truncamiento *,?, $ Neurol* recupera Neurology Neurología Neurolepsia Neuroléptico, etc.. En PubMed el caracter de truncamiento es el *

Estrategia de búsqueda 1. Definir la consulta. Uso de botox en el tratamiento de la hiperhidrosis PubMed - Búsquedas 2. Identificar conceptos. 3. Traducir del lenguaje natural al lenguaje controlado (tesauro). 4. Interrogar la base de datos. 5. Analizar la pertinencia de los resultados. Botox, hyperhidrosis Botulinum toxin type A, hyperhidrosis Botulinum toxin type A AND hyperhidrosis

Redefinir una búsqueda Defecto de registros PubMed - Búsquedas Expandir la búsqueda

Redefinir una búsqueda Exceso de registros PubMed - Búsquedas Limitar la búsqueda

Cómo buscar en PubMed colon cancer PubMed - Búsquedas 1º 3º 2º Comprobar que PubMed esté seleccionado Introducir los términos de búsqueda Pulsar go o enter

Búsqueda básica Búsqueda de términos PubMed - Búsquedas Introducir la palabra o palabras dentro de la caja de búsqueda y pulsar el botón Go o la tecla Enter. Mapeo automático de términos El sistema recuperará los registros en los que encuentre correspondencia con el término Colon cancer

Búsqueda por términos Antiguo ATM PubMed - Búsqueda básica Antiguo mapeo automático

Búsqueda por términos Nuevo ATM PubMed - Búsqueda básica Nuevo mapeo automático de términos

Búsqueda básica Búsqueda de frases PubMed - Búsquedas Introducir la frase entre comillas y pulsar el botón Go o la tecla Enter. Cancela el mapeo automático de términos colon cancer PubMed buscará la frase en sus índices de frases.

Búsqueda por frases PubMed - Búsqueda básica Cancelado mapeo automático de términos

Búsqueda básica Búsqueda de un autor PubMed - Búsquedas Introducir el apellido del autor seguido de las iniciales del nombre. NO se utilizan signos de puntuación. Cabrera ME Tashiro Y

Búsqueda por autor Un autor Varios autores PubMed - Búsqueda básica

Búsqueda básica PubMed - Búsquedas Búsqueda de un título de revista Introducir el título de la revista o el título abreviado en la caja de búsqueda. Pathology International Pathol Int

Búsqueda por revista PubMed - Búsqueda básica Título completo Título abreviado

Búsqueda avanzada PubMed - Búsquedas Buscar por campos específicos. Limitar búsquedas. Buscar término MeSH. Combinar términos MeSH. Combinar estrategias de búsqueda.

Búsqueda por campos Búsqueda por campos PubMed - Búsqueda avanzada Introducir los términos directamente en la caja de búsqueda especificando entre [ ] la etiqueta de campo. Cancela el mapeo automático de términos Blood [jour] PubMed buscará por campos específicos (autor, título, revista, etc.)

Etiquetas de campo PubMed - Búsqueda básica Utilizando etiqueta de campo Utilizando etiqueta de campo

Búsqueda por términos MeSH PubMed - Búsqueda avanzada

Búsqueda por términos MeSH Para buscar por un tema o materia determinada en PubMed PubMed - Búsqueda avanzada 1º Seleccionar MeSH Database 2º Introducir el término en la caja de búsqueda y pulsar go

MeSH Database PubMed - Búsqueda avanzada MeSH = Medical Subjects Headings MeSH Vocabulario controlado de términos biomédicos que representan el contenido de cada artículo que se ingresa en la base de datos Medline.

MeSH Database PubMed - Búsqueda avanzada Seleccionar los términos MeSH para iniciar una búsqueda. Ver definiciones de los términos MeSH. Ver la jerarquía de los términos MeSH. Realizar estrategias de búsqueda en PubMed. Limitar la búsqueda por Major Topic o tema principal. Precisar la búsqueda mediante subencabezamientos MeSH.

Búsqueda estándar por términos MeSH PubMed - Búsqueda avanzada

Búsqueda combinada de términos MeSH PubMed - Búsqueda avanzada Búsqueda combinada de términos MeSH Introducir los términos que queremos combinar por separado.

Búsqueda combinada de términos MeSH PubMed - Búsqueda avanzada 2 1 3 1. Buscar primer término 2. Marcar término 3. Desplegar Send to 4. Seleccionar Search Box with AND 4

Búsqueda combinada de términos MeSH PubMed - Búsqueda avanzada 2 5 1 3 4 1. Buscar segundo término 2. Marcar término 3. Desplegar Send to 4. Seleccionar Search Box with AND 5. Pulsar PubMed Search

Utilización de subencabezamientos MeSH 1 1. Buscar término PubMed - Búsqueda avanzada 3 6 2 5 2. Expandir término 3. Marcar término 4. Marcar subencabezamiento 5. Seleccionar Send to search Box with AND 6. Pulsar PubMed Search 4

Utilización de subencabezamientos MeSH PubMed - Búsqueda avanzada

Funciones adicionales - Limits PubMed - Funciones adicionales Permite limitar las búsquedas bibliográficas atendiendo a los siguientes criterios : Búsqueda por autor (Search by author) Búsqueda por revista (Search Journal) Texto completo (Full text ) Fechas ( Entrez Date, Publication date) Humano o animal (Humans or animals) Género (Gender) Idiomas (Languages) Subtemas o Subgrupos (Subsets) Tipos de artículo (Article Types) Edades (Ages) Campo específico (All fields)

Limits PubMed - Funciones adicionales [2] Las fecha deben introducirse usando el formato yyyy/mm/dd [dp], por ej. 2000/06/03 [dp]. Para buscar entre dos fecha se insertan dos puntos, por ej. 1995:2000 [dp]

Funciones adicionales - Preview / Index PubMed - Funciones adicionales Conocer previamente el número de resultados de la búsqueda antes de visualizar las citas. Refinar la estrategia de búsqueda agregando uno o más términos de una sola vez. Agregar términos a la estrategia de búsqueda procedentes de un campo específico. Ver y seleccionar términos del Index para desarrollar estrategias de búsqueda.

Preview PubMed - Funciones adicionales Presenta con anticipación el número de resultados de las búsqueda antes de mostrar las citas. Sólo muestra las tres últimas búsquedas. Es posible combinar las búsquedas en Preview usando los operadores booleanos.

Preview PubMed - Funciones adicionales

Index PubMed - Funciones adicionales Permite ver listas de términos dentro de un campo determinado. Permite ver y seleccionar los términos del índice y agregarlos a la estrategia de búsqueda. Permite usar operadores booleanos.

Index PubMed- Funciones adicionales

Funciones adicionales - History PubMed Funciones adicionales Permite guardar las estrategias de búsqueda. Combinar búsquedas. Mostrar la hora de la búsqueda. Mostrar el número de citas recuperadas. Permite guardar hasta 100 búsquedas.

History PubMed - Funciones adicionales

Funciones adicionales - Details PubMed - Funciones adicionales Permite ver la estrategia de búsqueda tal como ha sido traducida por el mapeo automático de términos. Muestra los mensajes de error como faltas de ortografía o stopwords. Permite copiar la dirección URL de la estrategia de búsqueda y almacenarla en nuestro bookmark.

Clipboard PubMed - Funciones adicionales Permite guardar y ver más adelante las citas seleccionadas de una o más búsquedas. Permite clasificar, imprimir, guardar o enviar por correo electrónico las citas guardadas en el portapapeles. El número máximo de citas que se pueden guardar es de 500.

Clipboard PubMed - Funciones adicionales Si no se seleccionan las citas usando las casilla de la izquierda, PubMed guardará las primeras 500 citas. La información guardada se conserva 8 horas.

Clipboard PubMed - Funciones adicionales Para acceder a la información contenida en el portapapeles pulsar en la etiqueta Clipboard. Para suprimir las citas, marcar las casilla y seleccionar Clip remove del menú desplegable Send to.

Visualizar resultados - Display PubMed - Visualizar resultados Permite visualizar los resultados de la búsqueda Las citas en PubMed se muestran por defecto en formato abreviado Summary. El menú desplegable Display permite seleccionar otros formatos.

Summary PubMed - Formato de visualización El formato abreviado incluye: Nombre de autor/es. Título del artículo. Fuente. Identificador PMID. Marcador de status

Summary PubMed - Formato de visualización Artículo que no dispone de abstract o resumen. Artículo que dispone de abstract o resumen. Artículo a texto completo en la sede del editor. Artículo a texto completo gratuito disponible en PubMed Central.

Otros formatos PubMed - Visualizar reultados

Brief PubMed Formato de visualización El formato breve incluye: Autor. Primeras palabras del título. nº de identificación PMID.

Abstract PubMed - Formato de visualización El formato resumen incluye: Cita bibliográfica. Título. Lengua (no inglesa). Autor/es. Afiliación del autor/es. Resumen. Tipo publicación. nº de identificación PMID y Status Medline.

Citation PubMed - Formato de visualización El formato cita incluye: Cita bibliográfica. Título. Lengua (no inglesa). Autor/es. Afiliación del autor/es. Resumen. Tipos publicación. Términos MeSH. nº de identificación PMID y Status Medline.

Medline PubMed - Formato de visualización El formato Medline contiene: Cita bibliográfica completa. Etiquetas de campo.

Show PubMed - Visualizar resultados Por defecto PubMed muestra las 20 primeras citas por página. El menú desplegable Show permite modificar el número de resultados visualizados. Se pueden visualizar hasta 500 citas por página.

Sort by PubMed - Ordenar resultados Por defecto las citas se muestran de acuerdo a la fecha en que fueron ingresadas en la base de datos. Lo más reciente aparece primero. El menú desplegable sort organiza las citas por orden alfabético de autor, alfabético de revista o por fecha de publicación.

Send to PubMed - Enviar resultados El menú desplegable send to se utiliza para Imprimir citas (text). Enviar las citas a un fichero (file). Colocarlas en el portapapeles (clipboard). Enviarlas por correo electrónico (e-mail).

Send to PubMed - Enviar resultados Marcar las citas a imprimir y seleccionar text. Todas las citas serán imprimidas en una sola página. Marcar las citas que desea descargar en un archivo. Seleccionar file - El nº máximo de citas es de 10.000. Marcar las citas y seleccionar clipboard. Todas las citas serán guardadas en el portapapeles y dispuestas a imprimir, guardar en un disco, enviar por e-mail. Sólo se pueden guardar hasta un máximo de 500. Marcar las citas y seleccionar e-mail. Se pueden enviar hasta un máximo de 500 citas en texto simple.

Links PubMed- Otros recursos Las citas en PubMed tienen vínculos con: Artículos relacionados. El texto completo del artículo.

Links PubMed- Otros recursos

Journal Database PubMed- Servicios Permite buscar revistas indizadas en Medline Título completo. Título abreviado normalizado. ISSN (International Standard Serial Number. ID (nº de identificación NLM).

Journal Database PubMed- Servicios

Journal Database PubMed - Servicios

Citation Matcher PubMed - Servicios Permite encontrar la cita de cualquier artículo en la base de datos PubMed. Single citation Matcher Bath citation Matcher Localiza una cita individual a partir de los datos de la revista. Recupera los ID numbers de varios artículos simultáneamente.

Single Citation Matcher PubMed - Servicios

Clinical Queries PubMed - Servicios Buscador especializado que tiene incorporados filtros metodológicos para búsquedas clínicas. Search by Clinical Study Category. Finding Systematic Reviews. Medical Genetics Search.

Clinical Study PubMed - Clinical Queries Permite buscar citas correspondientes a 5 categorías específicas de estudios clínicos: Terapéutica Diagnóstico Etiología Pronóstico Guías de predicciones clínicas

Clinical Study PubMed - Clinical Queries Establece el campo de aplicación Scope Búsqueda específica, restringida Se recuperan menos artículos pero más relevantes. Búsqueda sensible, amplia Se recuperan más artículos relevantes pero también algunos menos relevantes.

Clinical Study PubMed - Clinical Queries

Haynes RB et al. Clinical Study PubMed - Clinical Queries

Systematic Reviews PubMed - Clinical Queries Esta búsqueda permite recuperar Revisiones sistemáticas. Meta-análisis. Revisiones de ensayos clínicos. Conferencias de consenso. Guías de práctica clínica.

Systematic Reviews PubMed - Clinical Queries

Medical genetics Recupera referencias relacionadas con la medicina genética PubMed - Clinical Queries Criterios de búsqueda

My NCBI PubMed - Servicios Permite guardar las estrategias de búsqueda para una actualización manual de los resultados. Permite la notificación de nuevos resultados mediante correo electrónico. Permite agrupar la recuperación de temas de su interés mediante el uso de filtros.

My NCBI PubMed - Servicios Sign In permite acceder a su archivo personal de My NCBI. Register Permite crear un archivo personal. Es un servicio gratuito y se puede acceder a través de internet.

Cómo acceder a My NCBI PubMed - Servicios En Register introducir los siguientes datos: Nombre de usuario. Contraseña (2 veces). Escoger una pregunta de seguridad y dar la respuesta. Dirección de e-mail (Opcional).

MY NCBI Archivar la estrategia de búsqueda PubMed - Servicios Una vez realizada la búsqueda pulsar Save Search. En Save Search se puede cambiar el título de la búsqueda. Se pueden recibir actualizaciones.

MY NCBI Archivar la estrategia de búsqueda PubMed - Servicios

MY NCBI Filtros PubMed - Servicios Se pueden usar hasta cinco filtros activos. Para visualizar los filtros de PubMed, pulsar el icono

MY NCBI PubMed - Servicios Browse nos permite ver opciones adicionales.

MY NCBI PubMed - Servicios

1 2 3 5 4 MY NCBI PubMed - Servicios

MY NCBI PubMed - Servicios

Nuevas funcionalidades PubMed Advanced search (Beta) PubMed - Servicios Formulario de búsqueda avanzada todavía en fase beta. Reúne en una sola página dos funcionalidades que ya existían por separado a través de las pestañas Limits e History.

Otras funcionalidades PubMed Citation sensor PubMed - Servicios Reconoce la combinación de términos de búsqueda característicos de las citas (nombres de autor, investigador, título de revista, volumen, número, fecha de publicación) y va a identificar esta combinación de términos con una o varias citas. Así, cuando introducimos los términos en la caja de búsqueda nos aparecerá sobre las referencias recuperadas un cuadro amarillo con uno o varios enlaces a las citas sugeridas.

Apéndice I Nombre del campo Abreviatura Descripción Affiliation [AD] Dirección y afiliación institucional del primer autor All Fields [All] Todos los campos Author [AU] Nombre del autor Issue [IP] Número de la revista en la que el artículo ha sido publicado Journal Title [TA] Título de la revista, título abreviado o ISSN Etiquetas de campo Language [LA] Idioma del artículo MeSH Major Topic [MAJR] Término MeSH que constituye el tema principal del art. MeSH Subheadings [SH] Describen un aspecto particular de un determinado tema o materia MeSH Terms [MH] Términos MeSH Pagination [PG] Número de la primera página del artículo Publication Date [DP] La fecha en la que se publicó el artículo Publication Type [PT] Tipo de publicación (Revisiones, ensayos clínicos, etc ) Subset [SB] Código para un conjunto determinado de revistas Text Words [TW] Palabras de texto contenidas en casi todos los campos Title Words [TI] Palabras contenidas en el título Title/Abstract [TIAB] Palabras y números incluidos en el título, resumen Volume [VI] Número del volumen de la revista en la que el art., ha sido publicado

Bibliografía Bibliografía Bravo Toledo, R, Campos Asensio C. Cómo hacer una búsqueda bibliográfica en internet. FMC2000; 7(5):307-9. Bravo Toledo, R. Todo lo que usted quería saber sobre MEDLINE y nunca se atrevió a preguntar. Disponible en: http://www.infodoctor.org/rafabravo/medline.htm González Guitián C, Sobrido Prieto, M. Buscar en Medline con Pubmed: Guía breve de uso. Disponible en: http://www.fisterra.com/recursos_web/no_explor/pubmed/060828_pubmed.pdf PubMed Basics. National Library of Medicine. Disponible en: http://nnlm.gov/training/resources/pmtri.pdf PubMed. Guía de consulta. Biblioteca de la Universidad Complutense de Madrid. Disponible en: http://www.ucm.es/bucm/servicios/doc5461.pdf PubMed Tutorial. Desarrollado por la National Library of Medicine. Disponible en: http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/

PubMed Interfaces alternativas AskMEDLINE - http://askmedline.nlm.nih.gov Interfaces alternativas

RELEMED - http://www.relemed.com Apéndice II Interfaces alternativas

Apéndice II PubMed Interact (SLIM V.2) - http://pmi.nlm.nih.gov/interact Interfaces alternativas

GoPubMed- http://www.gopubmed.org Apéndice II Interfaces alternativas

Hakia- http://pubmed.hakia.com Apéndice II Interfaces alternativas

Apéndice II Otras interfaces Interfaces alternativas Ali Baba- PubMed as a graph http://alibaba.informatik.hu-berlin.de/ PubFocus http://www.pubfocus.com HubMed PubMed rewired http://www.hubmed.org XplorMed http://www.ogic.ca/projects/xplormed

Bibliografía Bibliografía Muin M, Fontelo P, Liu F, Ackerman M. SLIM: an alternative web interface for MDLINE/PubMed searches a preliminry Study. BMC Med Inform Decis Mak. 2005; 5:37. Disponible en: http://biomedcentral.com/1472-6947/5/37 Muin M, Fontelo P. Technical development of PubMed Interact: an improved interface for MEDLINE/PubMed Search. BMC Med Inform Decis Mak. 2006;6: 36. Disponible en: http://www.biomedcentral.com/1472-6947/6/36 PubMed Interact Tutorial. http://pmi.nlm.nih.gov/interact/tutorial.html Doms, S, Schroeder M. GoPubMed: exploring PubMed with the Gene Ontology. Nucleic Acids Res. 2005;33 suppl.2: W783-W786. Disponible en: http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/33/suppl_2/w783

http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query.fcgi Helena Martín Rodero Biblioteca Facultad de Medicina helena@usal.es Sonia Martín Castilla Biblioteca E.U. Enfermería y Fisioterapia castilla@usal.es Salamanca, 21-25 de julio de 2008 http://sabus.usal.es/bib_virtual3