CURSO CONSTRUCCIÓN DE REDES BIOLÓGICAS CON BASE EN DATOS GENÓMICOS
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- Arturo Suárez Acosta
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1 CURSO CONSTRUCCIÓN DE REDES BIOLÓGICAS CON BASE EN DATOS GENÓMICOS Coordinadora: LILIANA LÓPEZ KLEINE Docente Asociada del Departamento de Estadística Facultad de Ciencias, Sede Bogotá Introducción: La construcción de redes biológicas (génicas y de proteínas), es una herramienta de gran utilidad para la comprensión de los sistemas biológicos a nivel molecular. Existen muchos datos genómicos disponibles y además se generan continuamente. A pesar de tener estos datos disponibles, muchas veces los investigadores no tienen los conocimientos básicos ni conocen las herramientas adecuadas para su construcción. Por lo anterior, los temas del curso son de interés amplio para biólogos, genetistas, médicos y estadísticos que deseen conocer esta área del análisis de datos genómicos. General Objetivos: Capacitar estudiantes o profesionales que trabajen con datos genómicos y estén interesados en la construcción de redes biológicas.
2 Específicos Adquirir conocimientos básicos sobre la obtención y el uso de datos genómicos Aprender a utilizar herramientas estadísticas y computacionales para construir redes de coexpresión génica. Aprender a utilizar herramientas para construir redes metabólicas Sesión 1 (4h) Contenido 1. Introducción a la estadística genómica o Descripción de variables o Detección de datos atípicos o Medidas de similitud para variables categóricas y numéricas. Sesión 2 (4h) 2. Introducción a R 3. Introducción a Linux 4. Introducción a Perl Sesión 3 (4h) 5. Obtención de Datos Genómicos (KEGG, GEO del NCBI) 6. Construcción de matrices de similitud entre genes 7. Identificación del umbral de similitud y construcción de la red génica Sesión (4h) 8. Construcción de una red metabólica (4h)
3 Sesión 5 (4h). 9. Combinación de la red metabólica y de co-expresión (1h) 10. Visualización de la red con gephi (1h) 11. Conclusiones y presentación de estudios de caso (2h) Cronograma Fecha Día Sesión Horas 11/04/2015 Sábado /04/2015 Sábado /04/2015 Sábado /05/2015 Sábado /05/2015 Sábado 5 4 Total Horas 20 Duración La duración del curso será de 20 horas. Horario: Sábados de 9:00 a.m. a 01:00 p.m. Fecha de Inicio: abril 11 de 2015
4 Modalidad Presencial. Inversión y descuentos $ por persona Inscripciones Para legalizar su inscripción debe enviar al correo uniext_depest@unal.edu.co los siguientes documentos, en formato pdf: Copia de la consignación realizada o soporte del pago (legible). Fotocopia del documento de identidad ampliado al 150% En caso de inscripción de una empresa legalmente constituida deberá enviar: Formato Documento de Compromiso persona jurídica firmado por el representante legal, autorizado o delegado. Dicho formato deberá ser solicitado a través del correo electrónico uniext_depest@unal.edu.co. Formato Autorización y manejo de datos personales firmado por el representante legal, autorizado o delegado. Dicho formato deberá ser solicitado a través del correo electrónico uniext_depest@unal.edu.co. Copia Cámara de Comercio vigente (no mayor a 90 días). RUT. Cédula ampliada al 150% del representante legal de la empresa y de cada uno de los participantes.
5 Para entidades públicas, anexar además el certificado de disponibilidad presupuestal NOTAS: Se realizarán facturas única y exclusivamente a personas jurídicas y debe ser se solicitada el mismo día en que fue pagada la inscripción y con los documentos antes mencionados. Para las personas naturales, en caso de ser requerido, se expedirá una certificación de pago expedida por la Tesorería de la Facultad de Ciencias. certificación de pago expedida por la Tesorería de la Facultad de Ciencias. Formas de Pago: EFECTIVO: Consignación en el Banco Popular Cuenta de Ahorros a nombre del Fondo Especial Facultad de Ciencias No , bajo el código , y seguir las instrucciones para realizar el proceso de inscripción. Si la consignación es realizada por una entidad, el depositante será la empresa y relacionar en adjunto los nombres de los inscritos. PAGO ELECTRÓNICO: Acceder al link hacer el pago y seguir las instrucciones para realizar el proceso de inscripción. EMPRESAS: Enviar por correo electrónico a la dirección: uniext_depest@unal.edu.co los siguientes documentos, en formato pdf: Formato Documento de Compromiso persona jurídica firmado por el representante legal, autorizado o delegado. Dicho formato deberá ser solicitado a través del correo electrónico uniext_depest@unal.edu.co. Formato Autorización y manejo de datos personales firmado por el representante legal, autorizado o delegado. Dicho formato deberá ser solicitado a través del correo electrónico uniext_depest@unal.edu.co. Copia Cámara de Comercio vigente (no mayor a 90 días). RUT.
6 Cédula ampliada al 150% del representante legal de la empresa y de cada uno de los participantes. Para entidades públicas, anexar además el certificado de disponibilidad presupuestal. Certificación: Se otorgará Certificado de Asistencia a las personas que hayan cursado la totalidad de horas del curso.
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