GENÓMICA: UNA NUEVA ERA EN LA MEJORA Y CONSERVACIÓN GANADERA? J.V. Delgado Universidad de Córdoba Presidente de la Red CONBIAND.

Transcripción

1 GENÓMICA: UNA NUEVA ERA EN LA MEJORA Y CONSERVACIÓN GANADERA? J.V. Delgado Universidad de Córdoba Presidente de la Red CONBIAND.

2 GESTIÓN GENÉTICA DE LAS POBLACIONES ANIMALES MEJORA GENÉTICA Población cerrada Cruzamientos SELECCIÓN: Objetivos y criterios CONSERVACIÓN GENÉTICA Diversidad genética de especies y razas

3 EVOLUCIÓN DE LOS MÉTODOS SELECTIVOS SELECCIÓN INTUITIVA SELECCIÓN CUANTITATIVA SELECCIÓN ASISTIDA POR MARCADORES Y GENÓMICA

4 NUEVA TENDENCIA MUNDIAL? AGRONEGOCIO AUTOABASTECIMIENTO GLOBALIZACIÓN

5 CONSECUENCIAS DE LA GLOBALIZACIÓN EN LA CIENCIA Cada vez hay menos ciencia pública y más ciencia privada. Cada vez lo fines de la ciencia son más comerciales y menos altruistas. Cada vez un único idioma es más dueño de la ciencia, el inglés.

6 CONSECUENCIAS DE LA GLOBALIZACIÓN EN LA CIENCIA Cada vez la divulgación de la ciencia está más controlada por unas pocas editoriales. Cada vez los investigadores son más evaluados por sus acciones de interés global y menos por su capacidad de solucionar problemas concretos.

7 CONSECUENCIAS DE LA GLOBALIZACIÓN EN LA CIENCIA Cada vez hay menos libertad de expresión científica. Cada vez se destinan más presupuestos nacionales de investigación al pago de costes privados de patentes. Cada vez hay menos presupuestos nacionales para proyectos de interés local y se busca la financiación con fondos público de consorcios científicos internacionales con fuerte participación privada.

8 CONSECUENCIAS DE LA GLOBALIZACIÓN EN LA CIENCIA En suma, cada vez la ciencia está menos al servicio de todos y más al interés de unos pocos, y especialmente en la cría animal.

9 NUEVAS HERRAMIENTAS ÓMICAS ENERGÍA ATÓMICA - + ÓMICAS

10 GENÓMICA, PROTEÓMICA, TRANSCRIPTÓMICA La Genómica estudia el genoma o patrimonio genético de los seres. La Proteómica estudia el proteoma que no es más que el acerbo proteico de los seres. La Transcriptómica se encarga del estudio del transcriptoma, que es el mensaje entre el gen y su expresión proteica, portado por el ARN mensajero

11 DESARROLLO DE LA GENÓMICA Descubrimiento de la doble hélice (Watson y Crack, 1953) como estructura arquitectónica del ADN Reacción en cadena de la polimerasa (Mullis y cols. 1986), mecanismo de obtener copias suficientes de fragmentos de ADN para ser analizadas Secuenciación, mecanismo para conocer de forma ordenada en los cromosomas, la estructura, la naturaleza y la localización de los genes Proyectos genomas conocimiento de los mapas genéticos de las especies

12 BASES DE LA GENÓMICA Genética Molecular para definir la estructura de los genes Estadística para relacionar estas estructuras con sus expresiones Bioinformática, para disponer de la capacidad de cálculo para analizar tan complejas bases de datos.

13 APORTACIONES DE LA GENÓMICA A LA CRÍA ANIMAL Ahora podemos leer directamente en el genoma, y no basarnos en nuestra intuición, o en aproximaciones estadísticas avanzadas (BLUP) para hacer selección. La relación causa-efecto entre los genes y su expresión esta perfectamente determinada, al menos en caracteres simples. La Selección Genómica se abre paso en caracteres cuantitativos complejos.

14 ALGO SOBRE LA PROTEÓMICA Se ha considerado como sinónimo de la Genómica, y en otros casos como parte de ella. Hoy se sabe que la relación gen-proteína varía con el tiempo y con los efectos ambientales, surgiendo la Epigenética, para explicarlo La Epigenética estudia las modificaciones en la expresión de genes, que son heredables. Con la regulación epigenética se puede observar como es la adaptación al medio ambiente dada por la plasticidad del genoma.

15 ALGO SOBRE LA TRANSCRIPTÓMICA También se consideró parte de la genómica La transcriptómica permite cuantificar el nivel de expresión de los genes, empleando técnicas para analizar miles de moléculas de ARNm al mismo tiempo.

16 ALGUNAS CONCLUSIONES PARCIALES Estas ciencias estudian todo el proceso de la vida, desde la información genética (genómica), hasta su expresión en proteínas (proteómica), pasando por la transmisión del mensaje por parte del ARNm (transcriptómica). Aparecen conceptos que resucitan el Lamarquismo, admitiendo la posibilidad de que la función haga al órgano, con la regulación epigenética del proceso. Estamos ante un nuevo mundo, o al menos ante una nueva era, que pone en nuestra manos unos métodos y una tecnología sin precedentes. Pero como está afectando esto a la cría animal?

17 REPERCUSIONES DE LAS OMICAS EN LA MEJORA Qué están haciendo ya las ómicas por nosotros?: Nos han permitido el acceso directo a las enfermedades genéticas. La lectura del gen anómalo en el genoma nos permite su identificación directa y su selección negativa. En enfermedades genéticas de naturaleza poligénica, los procedimientos se complican y tenemos que apoyarnos en la bioinformática para identificar los genotipos indeseables. La Farmacogenómica estudia la variabilidad de respuesta ante el medicamento entre unos pacientes y otros e intenta definir el tratamiento que mejor se ajuste a cada individuo en función de su estructura genética. Nutrigenómica

18 REPERCUSIONES DE LAS OMICAS EN LA MEJORA Qué van a hacer las ómicas por nosotros: Selección Asistida por Marcadores: Identificación de genes de acción mayor sobre un determinado carecer productivo y selección en su favor: Caseínas de la leche; Terneza y el marmoreo de la carne, Calpaina, Calpastatina y Leptina Selección Genómica: Introducen la información de decenas de miles de genes con efectos conocidos (chip), con todas sus variantes, generalmente basadas en mutaciones de un único nucleótido (SNP). La estadística y la bioinformática relacionan los fenotipos con la información genómica leída en el chip, aumentando la precisión de las estimaciones de los valores genéticos.

19 VENTAJAS ATRIBUIDAS A LA SELECCIÓN GENÓMICA Aumento de la fiabilidad Disminución del intervalo generacional Incremento del progreso genético Hasta ahora funciona en el Frisón Americano, pero sus resultados no han sido repetibles en otras razas y en otras condiciones.

20 REPERCUSIONES DE LAS OMICAS EN LA CONSERVACIÓN Nueva dimensión de la conservación, mantenimiento en genotecas de fragmentos de ADN concretos de gran interés para la conservación. No es necesario conservar ADN común o sin función. Se podrá conservar sólo animales o germoplasma portadores de genes concretos muy amenazados.

21 REPERCUSIONES DE LAS OMICAS EN LA CONSERVACIÓN Otra aplicación, será la selección genómica de los animales a conservar basada en su grado de biodiversidad. Sustituye a otros marcadores, como los microsatélites, como herramienta de la conservación: caracterización y relaciones filogenéticos entre poblaciones, trazabilidad e identificación individual, control genealógico, adscripción de individuos a poblaciones, etc.

22 ANÁLISIS CRÍTICO: MEJORA Desde que ILUMINA y otros desarrollaron la evaluación genómica de los Frisones americanos, han inundado los medios de comunicación con grandes presiones propagandísticas sobre lo que parece ser la panacea de la mejora y la conservación. Los investigadores, los técnicos y hasta los gobiernos lo creen. En casi todos los países desarrollados están en marcha, o en proyecto estudios masivos de selección genómica en sus razas más desarrolladas, especialmente bovinas.

23 ANÁLISIS CRÍTICO: MEJORA A mi esto me parece una locura: Los resultados de ILUMINA aun no se han demostrado repetibles en otras condiciones. En la mayoría de los países las deficiencias de los programas de selección que repercuten en la precisión de los VG están en factores como el control de rendimientos, la identificación, el control genealógico, la gestión de la información y la participación ganadera. ILUMINA es una empresa privada, es peligroso poner toda nuestra soberanía en mejora y conservación en manos privadas. Debemos desarrollar nuestros propios programas aun yendo más despacio. El esnobismo de la ciencia llega a tal punto que estos temas arrastran muchos de los escasos recursos de I+D+i, afectando a otros proyectos más tangibles.

24 ANÁLISIS CRÍTICO: CONSERVACIÓN El saldo de las aportaciones genómicas a la conservación es y será sin duda negativo: La mayor precisión de los valores genéticos incrementarán la respuesta genética a la selección, amentanda la pérdida de diversidad genética intraracial. La utilización de Chips genómicos, desviará presupuestos de la conservación hacia la mejora como consecuencia del marketing. Estos métodos competirán con otros ya implantadas como los microsatélites, generando una pérdida de la continuidad de las bases de datos ya existentes, las homologaciones entre laboratorios, etc, por la sustitución metodológica. Utilizar los Chips genómicos para estudios de biodiversidad, es como usar misiles para derribar pajarillos, hoy por hoy no es cierto que resulten más baratos, ni más eficaces. En el control genealógico, no aporta nada nuevo, sólo una mayor simpleza, pero nos genera una dependencia del Chip.

25 ANÁLISIS CRÍTICO: CONSERVACIÓN Creo sinceramente que con la implantación del Chip en la conservación quien único se beneficia es ILUMINA y demás empresas, por tanto recomiendo no sucumbir a los cantos de sirena propagandísticos a la hora de elegir la metodología molecular de apoyo a la conservación.

26 CUIDADO CON EL USO DE LAS HERRAMIENTAS GENÓMICAS M U C H A S G R A C I A S