La Plataforma de Bioinformática tendrá los siguientes objetivos generales:

Transcripción

1 Plataforma de Bioinformática La Plataforma de Bioinformática tendrá los siguientes objetivos generales: 1) Generar un modelo de colaboración e integración de grupos de bioinformática, que se complementen en cuanto a disciplinas científicas, dominio de tecnologías informáticas, y se organicen en cuanto a capacidad y aprovechamiento de recursos de almacenamiento y procesamiento. 2) Consolidar la institucionalidad de la Bioinformática como disciplina al interior del ámbito científico y la percepción de su utilidad para el sector privado. 3) Articular e integrar a la Plataforma de Bioinformática con el resto de las Plataformas que así lo requieran. 4) Generar RRHH especializados en Bioinformática para satisfacer la creciente demanda de profesionales en el área. 5) Generar y favorecer la conectividad entre grupos de investigación que utilicen y desarrollen herramientas y servicios bioinformáticas, así como también favorecer la conectividad de dichos grupos con el sector privado, en vistas a generar un ámbito de interacción entre los sectores académico, público y empresarial. 6) Desarrollar herramientas de software y servicios bioinformáticos para su aprovechamiento por el sector de I+D y por el sector privado, incluyendo el desarrollo y mantenimiento de bases de datos biomédicas con información local y regional que puedan ser ofrecidas como servicios En base a estos objetivos, la Plataforma de Bioinformática tendrá los siguientes objetivos específicos: 1) Conformar una red de nodos de bioinformática distribuida geográficamente, con capacidad de almacenamiento, procesamiento y conectividad, que preste servicios a las Plataformas, a los grupos de I+D y al sector privado en base a recursos humanos expertos. 2) Desarrollar un modelo de organización, administración y gestión de la red que permita entre otros: asignar prioridades de investigación y de servicios, desarrollar un esquema de complementariedad de los nodos entre sí en cuanto a capacidad de almacenamiento y procesamiento, controlar y distribuir adecuadamente la carga de trabajo al interior de la red para evitar colapsar las estructuras, integrarse a las capacidades locales públicas y privadas, etc. 3) Definir las estrategias de interconectividad física y lógica entre los nodos de la red, y entre los nodos de la red y los centros de I+D que requieran los servicios de la red. 4) Desarrollar recursos humanos expertos en bioinformática de perfiles diversos, entre otros especialistas en: desarrollo, administración y búsqueda en bases de 1

2 datos biomédicas y en minería de datos, desarrollo de software para genómica, proteómica y biología estructural, modelización molecular y simulación de sistemas biológicos, desarrollo de herramientas y servicios bioinformáticos, computación distribuida (grid y cloud computing), etc. 5) Articularse e integrarse a las Plataformas que así lo requieran, para apoyar y potenciar los diversos grupos que se desarrollan actualmente en bioinformática proveyendo entre otros: desarrollo de herramientas y algoritmos, desarrollo, mantenimiento y búsqueda en base de datos, optimización de programas y algoritmos, facilidades de hardware, estructura organizativa, etc. 6) Desarrollar y prestar servicios de bioinformática como los mencionados en el párrafo anterior, orientados a los grupos de investigación de I+D y al sector privado, incluyendo además servicio de análisis y procesamiento de datos, así como también capacitación y entrenamiento en estas metodologías. 2

3 Plataforma de Células Madre Reprogramadas La Plataforma de Células Madre Reprogramadas tendrá los siguientes objetivos generales: 1) Desarrollar en Argentina el campo disciplinar de la reprogramación y diferenciación celular con vistas a su transferencia clínica y al sector productivo. 2) Desarrollar recursos humanos capacitados en el campo de la reprogramación y diferenciación celular. 4) Desarrollar y prestar servicios de reprogramación y diferenciación celular ajustados a estándares nacionales e internacionales de calidad. 5) Desarrollar masa crítica en Argentina entre los grupos de investigación en I+D y el sector privado que utilicen y apliquen técnicas de reprogramación y diferenciación celular. 6) Intensificar la cooperación científica internacional en el campo de la Terapia Celular. En base a estos objetivos generales, la Plataforma de Células Madre Reprogramadas tendrá los siguientes objetivos específicos: 1) Desarrollar y prestar servicios de producción de Células Madre Reprogramadas para uso en terapias regenerativas aplicadas a seres humanos bajo condiciones de Buenas Prácticas de Manufacturas. 2) Desarrollar y prestar servicios de producción de Células Madre Reprogramadas orientados a los grupos de investigación del I+D y a la industria farmacéutica, que incluyen entre otros servicios: generación de modelos de estudio in vitro de enfermedades, generación de modelos celulares de testeo de toxicidad de drogas, cultivo primario de células a reprogramar; chequeo de viabilidad y no contaminación; reprogramación y diferenciación, amplificación y /o generación de líneas estables; testeo de drogas; ensayos de toxicidad y funcionales, controles de calidad, etc. 3) Consolidar el acuerdo de colaboración con Brasil (PROBITEC), desarrollando proyectos colaborativos y actividades de capacitación y entrenamiento, en el campo de la reprogramación y diferenciación celular. 4) Desarrollar, a fines de alcanzar el estado del arte en esta disciplina, acuerdos de asesoramiento, capacitación, entrenamiento y cooperación con otras plataformas internacionales con funciones similares. 3

4 Plataforma de Genómica La Plataforma de Genómica tendrá los siguientes objetivos generales: 1) Integrar las capacidades instaladas de genómica actuales, equipando, coordinando y manteniendo en funcionamiento una red de centros de investigación destinada a ofrecer servicios de genómica de alta tecnología. 3) Aumentar las capacidades de análisis de los centros de genómica mediante la adquisición, adaptación y/o consolidación de equipamiento de alto rendimiento y sus correspondientes instalaciones. 4) Favorecer la adopción de metodologías de avanzada en forma temprana que permitan abordar problemas experimentales de manera novedosa. 5) Desarrollar servicios para el estudio integral del genoma de los seres vivos (la información genética) y el transcriptoma (los genes expresados) de los seres vivos, tanto para el sector público como el privado, en las áreas de salud y agrobiotecnología, accesibles para el sistema de I+D+i y para el sector privado. 6) Desarrollar usuarios de tecnologías genómicas al interior del sistema de I+D de Argentino. 7) Generar recursos humanos expertos, lograr continuidad de los mismos, y optimizarlos mediante el entrenamiento coordinado al interior de la red. 8) Desarrollar capacidades en Bioinformática, y articular con la Plataforma de Bioinformática. En base a estos objetivos generales, la Plataforma de Genómica tendrá los siguientes objetivos específicos: 1) Desarrollar servicios de secuenciación, microarreglos (microarrays) y custommade microarrays, incluyendo entre otros servicios de: secuenciación de alto rendimiento, análisis de expresión de genes (transcriptómica y exómica); análisis de variación del número de copias; análisis de variaciones en regiones específicas del genoma, análisis de pequeños ARN; análisis de metilación de ADN; inmunoprecipitacion de cromatina; impresión automatizada de chips a partir de genomas completos o parciales, etc. Estos servicios deben ser diferencialmente superadores respecto a la oferta de servicios internacionales similares, para lograr demanda por parte de usuarios nacionales. 2) Desarrollar servicios de procesamiento y análisis bioinformático de datos genómicos (de manera independiente o en articulación con la Plataforma de Bioinformática). 3) Desarrollar un esquema de gobernabilidad de la red que logre ejecutividad y representatividad de las decisiones, así como también estrategias administrativas, de gestión y de provisión de los servicios. 4

5 4) Diseñar una estrategia colectiva de provisión de equipos e insumos y de negociación con los proveedores de equipamiento se secuenciación y microarreglos, para lograr una adecuada relación entre especificidad y redundancia de equipos, a fin de sostener los servicios frente a caídas temporarias. Esta estrategia incluye la definición de una política común de compra de equipos y de un mix adecuado de proveedores, así como también acuerdos competitivos de servicios post-venta. 5) Definir una estrategia de desarrollo de capacidades en Bioinformática, en colaboración con la Plataforma de Bioinformática. 6) Capacitar y entrenar recursos humanos expertos, incluyendo el entrenamiento de recursos humanos adaptados a los estándares de seguridad y calidad del trabajo en pirosecuenciación. 7) Entrenar a grupos de I+D interesados en metodologías de análisis y procesamiento de datos genómicos de modo que en una primera etapa se ofrezca el servicio, y que luego las diferentes instituciones se encuentren en condiciones de implementar por sí mismas estas metodologías. 5

6 Plataforma de Materiales La Plataforma de Materiales tendrá los siguientes objetivos generales: 1) Establecer un ámbito multidisciplinario integrado que promueva el desarrollo de nuevas técnicas de diagnóstico y pronóstico de enfermedades. 2) Promover el diseño y empleo de biomateriales, el diseño de nano-dispositivos para la liberación controlada de drogas con fines terapéuticos, y el desarrollo de métodos de gran especificidad y selectividad y gran poder de resolución espacial y temporal para el diagnóstico de enfermedades y para estudiar dosificación y mecanismos de acción de drogas. 3) Lograr desarrollar modelos in vivo, in vitro e in silico para estudiar mecanismos de dosificación y de acción de medicamentos, así como el diagnóstico, pronóstico y tratamiento de enfermedades. 4) Establecer un centro informático de procesamiento de los datos obtenidos con los métodos desarrollados en el objetivo anterior En base a estos objetivos, la Plataforma de Materiales tendrá como objetivo específico brindar servicios de: 1) Diseño, modelado y síntesis de materiales biocompatibles y de sistemas de dosificación de drogas, así como el estudio de sus mecanismos de acción y efectos. 2) Desarrollo de métodos de diagnóstico en base a espectrometrías e imágenes con gran poder de resolución, como por ejemplo espectrometría de masas, análisis por imágenes de tiempo de vida de fluorescencia, imágenes funcionales de la acción de medicamentos para la detección de disfunciones metabólicas y para avanzar en el diagnóstico precoz. 3) Análisis de niveles de acción de drogas. 4) Prueba de formulaciones farmacéuticas especiales. En tanto los laboratorios requieran asesoramiento e información sobre formulaciones propias, que se aparten de los ensayos tradicionales necesarios para la validación comercial. 5) Medición de la actividad biológica, ensayada y/o validada con tecnologías propias de la plataforma, de nuevos agentes o drogas con potencial terapéutico. 6