Uso de la Biología de Sistemas para caracterizar la corticorefractariedad en la colitis ulcerosa.

Tamaño: px

Comenzar la demostración a partir de la página:

Download "Uso de la Biología de Sistemas para caracterizar la corticorefractariedad en la colitis ulcerosa."

Juan Vega Suárez
hace 7 años
Vistas:

1 Uso de la Biología de Sistemas para caracterizar la corticorefractariedad en la colitis ulcerosa. Juan Naves; Violeta Lorén; Arce Garcia-Jaraquemada; Miriam Mañosa; Farah Kamberovich; Eduard Cabré; Josep Manyé; Eugeni Domènech

2 Colitis ulcerosa y glucocorticoides Los glucocorticoides (GC) son el tratamiento de elección de los brotes moderados y severos de colitis ulcerosa (CU). Sin embargo, alrededor de un 40% de pacientes presentará una respuesta inadecuada a los mismos. No conocemos completamente los mecanismos moleculares subyacentes responsables de esta refractariedad. Resultados previos de nuestro grupo de trabajo sugieren que existen diferencias en el transcriptoma de mucosa rectal de pacientes con CU Respondedores y Refractarios a GC.

3 Biología de Sistemas en Medicina La Biología de Sistemas emerge como una poderosa herramienta computacional, útil para la creación de modelos matemáticos a partir de información interdisciplinaria, que pueden describir el comportamiento y las interacciones de un sistema biológico complejo. En este sentido el estudio de la corticorefractariedad mediante Biología de Sistemas puede aportar nueva información para mejorar el manejo de la CU.

4 Objetivos del estudio Analizar en profundidad el transcriptoma (mirna y mrna) de tejido intestinal de pacientes con CU activa, antes y después de tratamiento con corticoides, mediante Biología de Sistemas.

5 Material y Métodos Brotes moderados y severos de CU Basal 3er día 7mo día Biopsias recto Esteroides 1mg/Kg/día Biopsias recto Esteroides 1mg/Kg/día Respondedores GC Montreal S0 o S1 Refractarios GC Montreal S2 o S3

6 Material y Métodos Brotes moderados y severos de CU Basal 3er día 7mo día Biopsias recto Esteroides 1mg/Kg/día Biopsias recto Esteroides 1mg/Kg/día Respondedores GC Montreal S0 o S1 Refractarios GC Montreal S2 o S3 24 pacientes Secuenciación mirna 30 muestras 13 respondedores 11 refractarios 48 muestras Microarrays RNAm 32 muestras

7 Material y Métodos Brotes moderados y severos de CU Basal 3er día 7mo día Esteroides 1mg/Kg/día Esteroides 1mg/Kg/día Respondedores GC Montreal S0 o S1 Biopsias recto Biopsias recto Refractarios GC Montreal S2 o S3 24 pacientes 13 respondedores 11 refractarios 48 muestras Secuenciación mirna 30 muestras Microarrays RNAm 32 muestras Estudio mediante Biología de Sistemas

8 Biología de sistemas Caracterización de Colitis Ulcerosa Caracterización de Glucocorticoides mir data RNAm data Creación Modelos Análisis de los modelos Listado de proteínas relevantes Proteínas mejor clasificadoras de grupos Proteínas diferenciales entre los grupos

9 Biología de sistemas Caracterización de Colitis Ulcerosa Caracterización de Glucocorticoides mir data RNAm data Creación Modelos Análisis de los modelos Listado de proteínas relevantes Proteínas mejor clasificadoras de grupos Proteínas diferenciales entre los grupos

10 Biología de sistemas Creación de Modelos Matemáticos Comparación Análisis de datos de microarrays RNAm diferencial (p-adj < 0.01) RNAm diferencial (p-adj < 0.05) R-pre NR-pre R-post NR-post Comparación Análisis de datos de secuenciación Potencial relación RNAm-miRNA Validada relación RNAm-miRNA R-pre NR-pre R-post NR-post

11 Biología de sistemas Creación de Modelos Matemáticos Disease caracterization CORTICOIDES A Complete target profile Datos biológicos y moleculares f z w D u M e S High throughput data c o COLITIS ULCEROSA

12 Biología de sistemas Creación de Modelos Matemáticos Disease caracterization CORTICOIDES A Complete target profile Datos biológicos y moleculares f z w D u M e S High throughput data c o Modelo RESPONDEDORES Modelo REFRACTARIOS COLITIS ULCEROSA

13 Biología de sistemas Caracterización de Colitis Ulcerosa Caracterización de Glucocorticoides mir data RNAm data Creación Modelos Análisis de los modelos Listado de proteínas relevantes Proteínas diferenciales entre los grupos Proteínas mejor clasificadoras de grupos

14 Biología de sistemas Mecanismos de respuesta a GC Modelo de respuesta Modelo de refractariedad CORTICOIDES CORTICOIDES COLITIS ULCEROSA COLITIS ULCEROSA

15 Biología de sistemas Mecanismos de respuesta a GC Modelo de respuesta Modelo de refractariedad CORTICOIDES CORTICOIDES Proteínas diferenciales entre los grupos COLITIS ULCEROSA Proteínas clasificadoras de grupos COLITIS ULCEROSA

16 Biología de sistemas Selección de proteínas relevantes Se seleccionaron 64 proteínas - Proteínas diferenciales entre grupos - Proteínas clasificadoras de grupos Se aplicaron filtros (2 de estos 3 criterios): 1) Proteínas diferenciales entre grupos 2) Proteínas buenas clasificadores de grupos 3) Proteínas detectadas en el análisis estadístico del transcriptoma - RNAm diferencial (p < 0,05) - Target de mir diferencialmente expresados Finalmente 18 proteínas pasaron los filtros

17 Selección de proteínas más relevantes Proteínas Diferencial entre modelos Clasificadora de modelos RNAm o mir diferencial Relacionada CU Relacionada GC B F W T U Y E D Q H K A X Z C O P J

18 Selección de proteínas más relevantes Proteínas Diferencial entre modelos Clasificadora de modelos RNAm o mir diferencial B Relacionada CU Relacionada GC F Autofagia W T U Regulación GR Y E D Q H K A X Z C O P J

19 Selección de proteínas más relevantes Proteínas Diferencial entre modelos Clasificadora de modelos RNAm o mir diferencial B Relacionada CU Relacionada GC F W T U Y E D Q H Inflamación K A X Z C O Angiogenesis Resistencia a GC P J

20 Selección de proteínas más relevantes Proteínas Diferencial entre modelos Clasificadora de modelos RNAm o mir diferencial B Relacionada CU Relacionada GC Nunca asociada a CU o GC F W T U Y E D Q H K A X Z C O P J

21 Conclusión La aplicación de Biología de Sistemas no solo refuerza el conocimiento actual sobre la corticorefractariedad en la CU, sino que redefine los mecanismos moleculares implicados, lo que hace posible la identificación de nuevas dianas terapéuticas y/o de biomarcadores.

22 Uso de la Biología de Sistemas para caracterizar la corticorefractariedad en la colitis ulcerosa. Juan Naves; Violeta Lorén; Arce Garcia-Jaraquemada; Miriam Mañosa; Farah Kamberovich; Eduard Cabré; Josep Manyé; Eugeni Domènech

Documentos relacionados

IX JORNADAS SOBRE E.I.I. EN SEVILLA (Enf. de Crohn y Colitis Ulcerosa) Sevilla 28 de noviembre del 2007

IX JORNADAS SOBRE E.I.I. EN SEVILLA (Enf. de Crohn y Colitis Ulcerosa) Sevilla 28 de noviembre del 2007 DEFINICIÓN DE GRUPOS DE PACIENTES Dr. Javier Romero Vázquez Hospital Universitario Virgen Macarena Sevilla INTRODUCCIÓN La Enf. de Crhon y la Colitis Ulcerosa son enfermedades inflamatorias intestinales