CROMOSOMA 4. 4pter. Sindrome Wolff-Hirschhorn Doble Fusión t(4;14) (p16;q32) [FGFR3/IGH]

Transcripción

1 CROMOSOMA 4 4pter Sindrome Wolff-Hirschhorn Doble Fusión t(4;14) (p16;q32) [FGFR3/IGH] Pintado Cromosómico Total 4 EN 4 Locus Específica 4q12 [PDGFRa] Simple Fusión 4q12 [FIP1L1-PDGFRa] Doble Fusión t(4;11)(q21;q23)[aff1/mll] 4qter

2 Sonda Sub-telomérica 4pter 4p 16.3 CTBP1 190KB SPON2 MGC21675 LOC FLJ35816 Sondas Sub-Teloméricas (STM): El telómero es el final de cada cromosoma eucariota. Dos de las principales funciones de un telómero son evitar la pérdida de DNA como consecuencia de la replicación y prevenir interacciones con los telómeros de otros cromosomas. Así, estas estructuras juegan un papel principal en el mantenimiento de la estabilidad cromosómica. Se ha propuesto que las aberraciones cromosómicas que involucran telómeros tienen consecuencias fenotípicas muy severas ya que contienen la mayor densidad génica del genoma. Es muy importante entonces detectar anomalías teloméricas para identificar los genes involucrados en estas patologías. LIVe ofrece un set completo de sondas sub-teloméricas que hibridan sobre regiones muy ricas en genes de los brazos p y q de cada cromosoma.

3 Sonda Microdeleción Wolff-Hirschhorn 4p q 12 W-H region I CTBP1 SPON2 MGC21675 LOC FLJ Kb W-H region II LETM1 WHSC1 La región crítica del Síndrome de microdeleción Wolf-Hirschhorn se encuentra en 4p16. El genotipo-fenotipo de este síndrome se correlaciona con el tamaño de la región delecionada (deleciones menores a 3.5Mb resultan en fenotipos sin malformaciones físicas (Zollino et al.). En el 95% de los casos estas microdeleciones pueden ser detectadas por FISH con sondas específicas. LIVe ofrece en su kit dos sondas que hibridan sobre regiones críticas de esta anomalía, aumentando notablemente la definición del análisis. Además, un control positivo hibrida sobre 4q12. -Am J Med Genet. 2000;94;254-61

4 Oncológica Doble Fusión t(4;14)(p16;q32) [FGFR3/IGH] 4p Kb FGFR3 Este rearreglo es encontrado en leucemia de células plasmáticas, mieloma múltiple, plasmacytoma y gammopatía monoclonal de significancia desconocida (MGUS). Si bien representa la segunda translocación más común del gen IGH (luego de t(11;14), es indetectable con técnicas de citogenética convencional por lo que es necesaria su búsqueda con sondas específicas. La sonda ODF4p14q genera señales de fusión dobles en presencia de esta translocación ya que hibrida completamente sobre ambos genes extendiéndose además en dirección 3 y Kb IGH 14q32

5 Sonda Enumeración 4 4q11-q Kb DCNL4_HUMAN D4S3255 SHGC Sondas de Enumeración (EN): Las sondas de Enumeración cromosómica son sondas de DNA específicas para regiones peri-centroméricas. Debido a que no involucran ningún tipo de secuencias satelitales su especificidad es muy alta aún en condiciones de baja astringencia. En interfases generan señales definidas y de menor tamaño que las clásicas sondas satelitales, disminuyendo notablemente la superposición de señales. Todas las sondas EN están disponibles en fluorocromo rojo o verde.

6 Locus específica 4q12[PDGFRa] 4pter 4q12 PDGFRa La sonda OLesp4q12 está específicamente diseñada para detectar alteraciones en el número de copias del gen PDGFRa. Estas alteraciones se han encontrado con cierta frecuencia en astrocitomas anaplásicos, astrocitomas, oligodendrogliomas y oligoastrocitomas. Al igual que el resto de las sondas LIVe, el kit incluye un Buffer de Hibridación modificado que permite obtener resultados con apenas 30 minutos de incubación a 45ºC y los reactivos necesarios para preparar la solución de montaje (antifade + DAPI). Este kit puede adquirirse en sus presentaciones de 5, 10 o 20 determinaciones. -Mol Cancer Res December ; 927 -Proc Natl Acad Sci U S A Feb 21;109(8):3041-6

7 Simple Fusión 4q12 [FIP1L1-PDGFRa] 4q12 FIP1L1 CHIC2 EN DESARROLLO PDGFRa

8 Doble Fusión t(4;11)(q21;q23)[aff1/mll] 4q Kb AFF1 El gen MLL puede translocarse con cualquiera de (aproximadamente) 70 partners en leucemia linfoide aguda, leucemia mieloide aguda y leucemia relacionada a terapia. La combinación mas frecuente es con el gen AFF1 generando la t(4;11)(q21;q23). La sonda ODF4q11q genera señales de fusión dobles en presencia de esta translocación ya que hibrid a completamente sobre ambos genes extendiéndose además en dirección 3 y Kb MLL 11q23 Sonda ODF4q11q sobre células normales

9 Sonda Sub-telomérica 4qter Sondas Telómero-Específicas (STM): El telómero es el final de cada cromosoma eucariota. Dos de las principales funciones de un telómero son evitar la pérdida de DNA como consecuencia de la replicación y prevenir interacciones con los telómeros de otros cromosomas. Así, estas estructuras juegan un papel principal en el mantenimiento de la estabilidad cromosómica. Se ha propuesto que las aberraciones cromosómicas que involucran telómeros tienen consecuencias fenotípicas muy severas ya que contienen la mayor densidad génica del genoma. Es muy importante entonces detectar anomalías teloméricas para identificar los genes involucrados en estas patologías. LIVe ofrece un set completo de sondas sub-teloméricas que hibridan sobre regiones muy ricas en genes de los brazos p y q de cada cromosoma. SHGC Kb D4S130 SHGC SHGC q35.2

10 Sonda Pintado Cromosómico Total 4 PCT4 Sonda de Pintado Cromosómico Total (PCT): Las sondas de pintado cromosómico total abarcan completamente el cromosoma blanco generando una señal de intensidad entre media-alta y alta. Estas sondas pueden ser mezcladas con cualquier otra sonda de LIVe sin que esto disminuya su intensidad o especificidad. Todas las sondas PCT están disponibles en fluorocromo rojo o verde. Al igual que el resto de las sondas LIVe, incluye un Buffer de Hibridación modificado que permite obtener resultados con apenas 30 minutos de incubación a 45ºC y los reactivos necesarios para preparar la solución de montaje (antifade + DAPI). Esta sonda puede adquirirse en sus presentaciones de 5, 10 o 20 determinaciones.