FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE TECNOLOGÍA MÉDICA ASIGNATURA: MICROBIOLOGÍA CLÍNICA

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1 PROGRAMA FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD CARRERA DE TECNOLOGÍA MÉDICA ASIGNATURA: MICROBIOLOGÍA CLÍNICA PROFESOR ENCARGADO DOCENTES : Sra. Rosalba Urbina : Sra. Ema del Canto IDENTIFICACION DE LA ASIGNATURA Código : TEM 1030 Curso al que se imparte : Tercer Año Semestre en que se imparte : 2do. Semestre Año académico : 2005 Prerrequisitos : Microbiología Básica, Biología Molecular Calidad : Obligatorio Carácter : Teórico - Práctico Régimen : Semestral Número de sesiones semanales : 9 Teóricas: 2 Prácticas: 7 Número de horas académicas semanales : 18 DESCRIPCION DE LA ASIGNATURA El curso tiene como propósito formar un profesional especializado en Microbiología Clínica, con una sólida formación científica que le permita conocer y comprender los aspectos biológicos de los microorganismos en salud y como agentes de enfermedad, sus interrelaciones con el hombre y el ambiente, prevenir su acción, realizar diagnóstico microbiológico y participar en el control de las enfermedades infecciosas prevalentes y emergentes que ellos producen.

2 OBJETIVOS GENERALES Al finalizar el curso los alumnos deberán: - Analizar los microorganismos desde el punto de vista sistemático, relacionándolos entre sí. - Analizar las características morfológicas, nutricionales, metabólicas, de reproducción, antigénicas y genéticas de los principales agentes de enfermedades infecciosas. - Identificar y caracterizar los mecanismos de patogenicidad microbiana, sus variaciones y la respuesta del huésped frente a la agresión de los diversos agentes patógenos. - Desarrollar métodos de diagnóstico microbiológico en la identificación de microorganismos de importancia clínica. - Realizar e interpretar métodos microbiológico en la identificación de micoorganismos de importancia clínica. - Desarrollar la capacidad de escuchar activamente a sus docentes y a sus pares. - Valorar la influencia trascendental de los microorganismos en la vida del hombre. - Valorar y desarrollar una conducta ética en sus actividades como futuro profesional. - Valorar la importancia del rol que desempeña el Tecnólogo Médico en un laboratorio de Microbiología en la prevención, diagnóstico y enfoque terapéutico de los agentes de enfermedades infecciosas. OBJETIVOS ESPECIFÍCOS I UNIDAD: BAERIOLOGÍA CLÍNICA Al término de la primera unidad el alumno será capaz de: - Conocer y comprender la sistemática bacteriana con el fin de clasificar, identificar y nominar las bacterias agentes de enfermedades infecciosas. - Identificar las bacterias que forman parte de la microbiota comensal y valorar su importancia en la relación huéped parásito. - Reconocer las características morfológicas, fisiológicas y antigénicas de las diversas especies bacterianas de importancia clínica. - Analizar la patogenia de las bacterias causantes de las principales enfermedades infecciosas en Chile. - Identificar los principales grupos de bacterias que producen enfermedades infecciosas, destacando los cuadros clínicos de mayor relevancia en Chile. - Conocer las medidas epidemiológicas que se aplican para el manejo y control de las enfermedades infecciosas de origen bacteriano. - Identificar y aplicar técnicas de diagnóstico microbiológico en la identificación de bacterias en diferentes muestras clínicas.

3 - Preparar correctamente medios de cultivos básicos, especiales y reactivos útiles en el diagnóstico bacteriológico. - Aplicar métodos de estudio de sensibilidad a los antimicrobianos y evaluar aquellos más utilizados para la mejer orientación del tratamiento de las enfermedades infecciosas. - Identificar y manejar técnicas de tomas de muestras utilizadas en el diagnóstico de las infecciones bacterianas. - Mantener una actitud lógica para valorar los hallazgos microbiológicos y permitir su correcta interpretación en bien de los pacientes. - Demostrar sistemáticamente hábitos de estudio y búsqueda de información que permitan su desarrollo como profesional en formación. II UNIDAD: HONGOS DE IMPORTANCIA CLÍNICA Al término de la segunda unidad el alumno será capaz de: - Conocer las características taxonómicas de los hongos de importancia médica. - Diferenciar y reconocer los principales géneros de hongos. - Identificar las principales características morfológicas, fisiológicas y patogénicas de hongos, filamentosos y levaduriformes, patógenos y oportunistas, de importancia en Chile. - Conocer las principales características de los cuadros clínicos, epidemiología, tratamiento y profilaxis de las infecciones micóticas. - Aplicar las técnicas de diagnóstico micológico más utilizadas. - Preparar correctamente medios de cultivo y reactivos utilizados en Micología. - Aplicar técnicas de toma de muestras para realizar diagnósticos micológicos. - Valorar la importancia de los hongos como agentes infecciosos en Chile. III UNIDAD: VIRUS DE IMPORTANCIA CLÍNICA Al término de la tercera unidad el alumno será capaz de: - Diferenciar las principales características biológicas de los virus de mayor importancia clínica. - Describir la patogenia de las principales virosis. - Analizar la epidemiología, tratamiento y profilaxis de los tipos de virosis más frecuentes. - Identificar y diferenciar los métodos de diagnóstico virológico directos e indirectos de mayor uso en nuestro país.

4 METODOLOGÍA DOCENTE Clases teóricas expositivas, clases interactivas, aprendizaje basado en la resolución de problemas y revisiones bibliograficas, con participación importante de los alumnos que estimula su autoaprendizaje. Material de apoyo: diapositivas, transparencias, dramatizaciones, power point. Actividades prácticas se realizarán en base a clases prácticas, seminarios, trabajos de grupo, investigaciones protocolizadas. Estas actividades son de carácter tutorial. CONTENIDOS I UNIDAD: BAERIAS DE IMPORTANCIA CLÍNICA - Sistemática bacteriana. Clasificación, identificación y denominación de las bacterias. - Microbiota comensal residente y transiente. - Género Staphylococcus y microorganismos relacionados - Género Streptococcus y especies más importantes. - Género Enterococcus y otras cocáceas Gran positivas relacionadas - Género Neisseria y microorganismos relacionados - Familia Enterobacteriaceae: especies comensales - Familia Enterobacteriaceae: especies patógenas - Género Vibrio y especies relacionadas - Género Campylobacter y Helicobacter. - Bacilos Gram negativos no fermentadores: Género Pseudomonas y especies relacionadas - Género Haemophilus - Género Bordetella - Género Brucella - Género Corynebacterium - Género Mycobacterium - Género Nocardia - Género Listeria y Erysipelothrix - Género Bacillus

5 - Bacilos Gram positivos anaerobios. No esporulados: Géneros Actinomyces, Arachnia, Bifidobacterium, Propionibacterium, Mobiluncus, Lactobacillus, Eubacterium. - Cocáceas anaerobias Gram positivas y negativas: Género Peptostrptococcus y Veillonella. - Bacilos Gram negativos anaerobios. No esporulados: Géneros Bacteroides, Fusobacterium, Prevotella, Porphyromonas. - Bacilos Gram positivos anaerobios esporulados: Género Clostridium - Géneros Treponema, Borrelia y Leptospira. - Géneros Micoplasma y Ureaplasma - Género Chlamydia. - Género Rickettsia II UNIDAD: HONGOS DE INTERÉS CLÍNICO - Sistemática de los hongos de importancia clínica. - Género Microsporum - Género Trichophyton - Género Epidermophyton - Género Candida: Candida albicans y especies relacionadas. - Género Malassezia - Género Trichosporum - Género Exophiala - Género Piedraia - Género Sporothrix - Género Histoplasma - Género Aspergillus - Género Rhizophus - Género Absidia - Género Mucor - Género Penicillium - Género Fusarium - Género Acremonium

6 - Género Pneumocystis III UNIDAD: VIRUS DE IMPORTANCIA CLÍNICA - Virus respiratorios - Virus entéricos - Virus Herpes - Virus de la Inmuno Deficiencia Humana. CONTENIDOS DE CLASES PRÁICAS (LABORATORIOS) - Técnicas microbiológicas para el diagnóstico de las infecciones bacterianas - Procesamiento de muestras clínicas (hemocultivo, urocultivo, coprocultivo, expectoración, secreciones y otras) - Género Staphylococcus. S. Aureus, Staphylococcus coagulasa negativos y Géneros relacionados - Género Streptococcus. S. Pyogenes, S. Agalactiae, S. Pneumoniae, Streptococcus Grupo viridans y otras especies. - Género Enterococcus. E. Faecalis, E. Faecium y otros. - Género Neisseria. N. Meningitidis, N. Gonorrhoeae y especies comensales - Familia Enterobacteriaceae. Enterobacterias comensales, Escherichia coli, Klebsiella, Enterobacter, Proteus, Providencia, Citrobacter, Edwarsiella y especies relacionadas - Familia Enterobacteriaceae. Enterobacterias patógenas, Salmonellas, Shigellas, Escherichia coli diarreogénicas, Yersinia. - Bacilos Gram negativos No fermentadores. Género Pseudomonas, Género Acinetobacter y microorganismos relacionados. - Género Mycobacterium. Mycobacterium tuberculosis y otras especies de crecimiento lento. Especies de Mycobacterium de crecimiento rápido. - Género Corynebacterium. Corynebacterium diphtheriae y especies relacionadas. - Género Haemophilus. Haemophilus influenzae y especies relacionadas - Género Bordetella. Bordetella pertussis y especies relacionadas. - Anaerobios esporulados - Anaerobios No esporulados - Zoonosis Bacterianas. Bruella sp., Bacillus anthracis, Listeria monocytogenes, Leptospira y otros agentes

7 - Cuadro clínico, patogenia, diagnóstico microbiológico, toma de muestra, tratamiento, prevención y aspectos epidemiológicos de: - Infecciones del Tracto Urinario - Infecciones Respiratorias - Síndrome Diarreico Agudo. - Toxinfecciones Alimentarias - Enfermedades de Transmisión Sexual - Infecciones de Piel y Tejidos Blandos - Infecciones de Recién Nacido - Meningitis - Infecciones Intrahospitalarias - Toma de muestra para estudio micológico y procesamiento. - Diagnóstico de laboratorio de hongos filamentosos - Diagnóstico de laboratorio y estudio de sensibilidad de levaduras - Cuadros clínicos, diagnóstico micológico, tratamiento y prevención de: - Infecciones Superficiales - Infecciones Cutáneas - Infecciones Oportunistas - Diagnóstico de infecciones Virales

8 NORMAS DE LA ASIGNATURA - Toda inasistencia a una actividad obligatoria, deberá ser justificada dentro de 2 días hábiles, posteriores a la inasistencia en la secretaria de estudio de la carrera. - Inasistencias justificadas a pruebas parciales serán recuperadas en la oportunidad más próxima. Si no es justificada, la nota será la mínima (1.0). - El alumno que justifique la inasistencia a una prueba solemne, recuperativa o al examen, será evaluado mediante interrogación oral o escrita, en la fecha que indique el grupo docente. - El alumno que llegue a una prueba o evaluación de cualquier tipo, después de iniciada ésta, no dispondrá de tiempo adicional. - El alumno deberá ingresar a las evaluaciones con su lápiz, goma y corrector. Queda prohibido el ingreso con mochilas, celular u otro elemento distractor. - Después de 10 minutos de iniciadas las actividades, no se permitirá el ingreso de los alumnos. - Está estrictamente prohibido, como medida de seguridad, comer o beber en el laboratorio.

9 CALENDARIO DE AIVIDADES TEÓRICAS Y PRÁICOS FECHA CLASE PROFESOR AGOSTO Lunes 01 Entrega de Programas. Calendario de Actividades. Martes 02 Jueves 04 Viernes 05 Lunes 08 Martes 09 Jueves 11 Análisis, desarrollo y discusión de curso práctico. 1 1ra. Sesión Medios de cultivo. Siembra y aislamiento. 1 2da. Sesión Medios de Cultivo. Siembra y aislamiento. Observación microscópica. Género Staphylococcus, Patogenia. Principales cuadros clínicos, Diagnostico Bacteriológico. Medios de cultivo. Siembra y aislamiento. Observación microscópica. 1 3era. Sesión Género Staphylococcus I, Investigación Protocolizada Nº 1-1era. Sesión. Género Streptococcus, Características generales. pyogenes, S. agalactiae y otras especies. Patogenia. Principales cuadros clínicos. Diagnostico Microbiológico. Género Staphylococcus II, Investigación protocolizada Nº 1-2da. Sesión. Evaluación. Género Staphylococcus III. Investigación Protocolizada Nº 1 3era. Sesión. Revisión bibliográfica.

10 Viernes 12 Nº1 Sesión Plenaria. Evaluación Género Staphylococcus IV. Investigación protocolizada Nº 1 4ta. Sesión. Presentación de protocolos. Martes 16 Jueves 18 Viernes 19 Lunes 22 S. Pneumoniae y S. viridans. Patogenia. Principales cuadros clínicos, diagnostico microbiológico. Género Streptococcus I. Investigación protocolizada. Nº 2 1era. Sesión Género Streptococcus II. Investigación protocolizada. Nº 2 2da. Sesión. Familia Enterobacteriaceae. Enterobacterias comensales. Patogenia principales cuadros clínicos. Diagnostico microbiológico. Género Streptococcus III. Investigación Protocolizada Nº 2 3era. Sesión Revisión Bibliográfica. Género Streptococcus IV. Investigación protocolizada Nº 2 4ta. Sesión. Presentación de protocolos. Evaluación Martes 23 CI Clase Interactiva Nº 1 Salmonellas diarreogénicas, Shigellas, Patogenia Principales cuadros clínicos. Diagnostico microbiológico. Nº 2 1era. Sesión.

11 Jueves 25 Viernes 26 Lunes 29 Martes 30 SEPTIEMBRE Jueves 01 S Viernes 02 Lunes 05 Nº 2 2da. Sesión. Enterobacterias I, Ivestigación protocolizada Nº3 1era. sesión Escherichia coli enteropatogénicas características generales, patogenia diagnostico microbiológico. Enterobacterias II Investigación protocolizada Nº 3 2da. Sesión. Revisión Bibliográfica. Enterobacterias III. Investigación protocolizada III 3era. Sesión. Nº 2 2da. Sesión. Género Neisseria, N. Meningitidis, género Haemoplilus, H. Influenzae tipo b. Enterobacterias IV, investigación protocolizada Nº 3 4ta. Sesión. Presentación de Protocolos. Seminario Nº 1, Diagnostico microbiológico de infecciones producidas por cocáceas piogenas. Evaluación. Enterobacterias Patógenas I, investigación protocolizada Nº 4 1era. Sesión. Nº 2 3era. Sesión. Enterobacterias Patógenas II, Investigación protocolizada Nº 4 2da. Sesión., Revisión Bibliográfica Enterobacterias Patógenas III, Investigación protocolizada Nº 4 3era. Sesión. Evaluación. Sra. Ema del Canto Sra. Rosalba Urbina

12 Martes 06 Jueves 08 Viernes 09 CI S Lunes 12 Martes 13 P Jueves 14 Viernes 15 Nº 2, Sesión Plenaria. Evaluación. Enterobacterias Patógenas IV, Investigación protocolizada. Nº 4 4ta. Sesión. Enterobacterias Patógenas V, Investigación protocolizada Nº 4 5ta. Sesión. Presentación de Protocolos. Clase interactiva Nº 2, Bacilos Gram negativos no fermentadores. Seminario Nº 2, diagnostico microbiológicos de infecciones producidas por Enterobacterias. Evaluación. Bacilos Gram (-) No fermentadores I. Bacilos Gram (-) No fermentadores II. Presentación de protolocos. Revisión Bibliográfica. 1era. Prueba Solemne. Investigación protocolizada Nº 5 1era. Sesión., Nº 3 1era. Sesión. Investigación protocolizada Nº 5 2da. Sesión. Género Bordetella, Género Moraxella. Patogenia. Principales cuadros clínicos diagnostico microbiológico. Investigación protocolizada Nº 5 3er. Sesión. Presentación de protocolos.

13 Lunes 26 Martes 27 Jueves 29 PP Viernes 30 CI OUBRE Lunes 03 Martes 04 Jueves 06 S Nº 3 2da. Sesión. Trabajo de grupo Nº 1, Infecciones del Tracto Urinario 1era. Sesión. Revisión bibliográfica. Géneros Vibrio Compylobacter y Helicobacter. Patogenia, cuadros clínicos mas comunes, diagnostico de laboratorio. Trabajo de grupo Nº 1, Infecciones del Tracto Urinario 2da. Sesión. 1era. Prueba Práctica. Trabajo de grupo Nº 1, Infecciones del Tracto Urinario 3era. Sesión. Clase Interactiva Nº 3. Género Mycobacterium. Infecciones por M. Tuberculosis. Trabajo de grupo Nº 1, Infecciones del Tracto Urinario 4ta. Sesión. Trabajo de grupo Nº 1 Infección del Tracto Urinario 5ta. Sesión. Presentación de protocolo. Revisión bibliográfica. Anaerobios Esporulados. Características generales Clostridium Especies de importancia clínica. Nº 3 3era. Sesión. Seminario Nº 3. Infecciones del Tracto Urinario. Evaluación. Trabajo de grupo Nº 2, Infecciones del Tracto Respiratorio. 1era. Sesión.

14 Martes 11 Jueves 13 Viernes 14 CI Lunes 17 Martes 18 S Jueves 20 Viernes 21 CI Nº 3, Sesión Plenaria. Trabajo de grupo, Infecciones del Tracto Respiratorio Nº 2 2da. Sesión. Trabajo de grupo Nº 2 3era. Sesión. Mycobacterium. Revisión Bibliográfica. Clase Interactiva Nº 4. Anaerobios No Esporulados. Trabajo grupo Nº 2 4ta. Sesión. Presentación de protocolos. Mycobacterium. Nº 4 1era. Sesión. Trabajo de grupo Nº 2 5ta. Sesión Mycobacterium. Género Corynobacterium C. diphtheriae Patogenia Cuadro Clínico. Seminario Nº 4, Infecciones del Tracto Respiratorio. Evaluación Trabajo de grupo Nº 3 1era. Sesión, Infecciones Septicémicas. Nº 4 2da. Sesión. Clase interactiva Nº 5. Zoonosis Bacteriana. Trabajo de grupo Nº 3 2da. Sesión. Revisión bibliográfica.

15 Lunes 24 Martes 25 P Jueves 27 S Viernes 28 Lunes 31 NOVIEMRE Jueves 03 Viernes 04 Trabajo de grupo Nº 3, Infecciones Septicémicas 3era. Sesión. Nº 4 3era. Sesión. 2da. Prueba Solemne Trabajo de grupo Nº 3, Infecciones Septicémicas 4ta. Sesión. Seminarios Nº 5, Infecciones Septicémicas. Evaluación., Trabajo de grupo Nº 3 5ta. Sesión. Presentación de Protocolos. Nº 4, Sesión Plenaria. Evaluación. Trabajo de grupo Nº 4. Infecciones de Piel Heridas y Tejidos blandos, 1era. Sesión. Revisión bibliográfica. Trabajo de grupo Nº 4. Infecciones de Piel y Heridas 2da. Sesión. Nº 5 1era. Sesión. Trabajo de grupo Nº 4-3era. Sesión. Nº 5 2da. Sesión. Género Chlamydia, Género Micoplasma. Patogenia, Cuadro Clínico, diagnostico microbiológico. Trabajo de grupo Nº 4 4ta. Sesión., Revisión Bibliográfica.

16 Lunes 07 Martes 08 Jueves 10 S Viernes 11 Lunes 14 Martes 15 CI Jueves 17 Trabajo de grupo Nº 4 5ta. Sesión. Presentación de protocolos. Nº5 3era. Sesión. Micología Generalidades. Hongos como agente de enfermedad. Trabajo de grupo Nº 5, Diagnostico etiológico de infecciones microbianas, 1era. Sesión. Trabajo de grupo Nº 5, Diagnostico etiológico de infecciones microbianas, 2da. Sesión. Seminario Nº 6. Infecciones transmitidas por agua y alimentos. Evaluación. Nº 5, Sesión Plenaria. Trabajo de grupo Nº 5 3era. Sesión. Revisión bibliográfica. Nº 6 1era. Sesión Trabajo de grupo Nº 5 4ta. Sesión. Presentación de Protocolos. Clase Interactiva Nº 6, Micosis Superficiales. Nº 6 2da. Sesión. Nº 6-3era. Sesión. Micología 1era. Sesión.

17 Viernes 18 Lunes 21 Martes 22 Jueves 24 S Viernes 25 CI Lunes 28 PP Martes 29 PP Micosis Oportunistas. Micología 2da. Sesión. Revisión bibliográfica. Nº 6, Sesión plenaria. Micología 3era. Sesión. Replicación y Patogenia Viral. Micología 4ta. Sesión. Seminario Nº 7. Virus Respiratorio. Micología 5ta. Sesión. Clase Interactiva Nº 7. Virus Herpes. Micología 6ta. Sesión. Revisión Bibliográfica. 2da. Prueba Práctica. 2da. Prueba Práctica

18 DICIEMBRE Jueves 01 PP PT Viernes 02 PP Viernes 09 P Viernes 16 EF 2da. Prueba Práctica. 3era. Prueba Solemne. 2da. Prueba Práctica. Prueba Recuperativa. Examen Teórico-Práctico. CI S P PP = Clase Teórica. = Clase Interactiva. = Clase Práctica. = Seminario. = Aprendizaje basado en problemas. = Revisión bibliográfica. = Prueba. = Prueba Práctica.

19 EVALUACIÓN DE LOS ALUMNOS Las actividades realizadas por los alumnos en el desarrollo del curso, se evaluarán mediante actividades teóricas con una ponderación de un 50% y actividades prácticas con igual ponderación. Actividades Teóricas: Los contenidos se evaluarán a través de 3 pruebas escritas con una ponderación de 12% de cada una. Clases interactivas, aprendizaje basado en la resolución de problemas y revisiones bibliográficas que tienen una ponderación de 14%. Actividades Prácticas: - Pruebas de laboratorios escritas y orales. - Trabajos de grupo y seminarios. - Investigaciones protocolizadas. 32 % - 2 Pruebas Prácticas acumulativas. 18% Los alumnos tendrán derecho a rendir una prueba recuperativa que reemplazará la nota más baja de las pruebas solemnes. Nota de presentación o examen: El alumno tendrá derecho a examen cuando la nota obtenida sea igual o superior a 3.5. Examen: La nota de presentación a examen tiene una ponderación de un 70% y la nota de examen un 30%. La nota mínima de aprobación de la asignatura es 4.0 EVALUACIÓN DEL PROCESO DOCENTE De acuerdo al Reglamento de Régimen de Estudio de Pregrado, para ser aprobado en la asignatura, el alumno deberá obtener nota mínima 4.0. tanto en el aspecto teórico como en el práctico, debiendo asistir al 100% de las actividades prácticas y a las evaluaciones programadas. Para los alumnos que no aprueben la asignatura ó algunos de los aspectos (teórico ó práctico). No existirán pruebas optativas ó de recuperación. BIBLIOGRAFÍA 1.- Jawetz, Ernest y otros. MICROBIOLOGÍA MÉDICA 17º Ed. El Manuel Moderno S.A. México ELMER KONEMAN: Diagnóstico Microbiológico 5º Ed. (1999) Editorial Médica Panamericana. 3.- Instituto de Salud Pública. PROCEDIMIENTOS Y TÉCNICAS DE LABORATORIO. Vol. 1,2 y WOLFGANG K. JOKLIK; HILDA, P. WILLET; D. BERNARD AMOS; CATHERINE M. WILFERT Microbiología 20º edición. Editorial Médica Panamericana. 5.- Tórtora, G. y otros. INTRODUCCIÓN A LA MICROBIOLOGÍA. 3º Ed. Acribia S.A.

20 Zaragoza, España Ballows, A. MANUAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY. 5º Ed. American Society of Microbiology. Washington D.C Schaechter, M. y otros. MECHANISMS OF MICROBIAL DISEASES. 2º Ed. Willims & Willimns. Baltimore, Maryland (U.S.A.) Davis, B. Dubelco, R. Y otros. TRATADO DE MICROBIOLOGÍA 2º Ed. Barcelona España Salvat Ediciones S.A PAUL A. ROCHELLE. «Environmental Molecular Microbiology : Protocols and applications» (amazon.com) PHILLIPE SANSONETTI ET AL Methods in Microbiology Vol31: Molecular Cellular Microbiology (2002) (amazon.com)