Cariotipador Automático

Transcripción

1 MetaClass Cariotipador Automático Qué es MetaClass? Sistema completamente automático que permite obtener a partir de la captura de metafases su cariotipo Compuesto por: Ordenador con tarjeta digitalizadora Microscopio triocular Cámara B/N de alta sensibilidad Software MetaClass Impresora de datos Detalles...

2 Equipo estandard Unidad de control - Ordenador Pentium IV a 1.6GHz Mb RAM - Tarjeta gráfica de 16 Mb - Disco duro de 40 Gb - CD-ROM 48x - Grabadora 24x/10x/40x - Tarjeta de red 10/100 - Monitor de 19 (1600x1200) - Teclado, ratón y disquetera - S.O Windows 2000 Professional - Tarjeta Meteor2/4 (Standard o MC) - Impresora laser y/o color (FISH) Microscopio triocular - Nikon Eclipse E400 - Objetivos 100x Cámara de adquisición - Sony XC-ES50/CE - Cable video-alimentación Acceso a MetaClass

3 Pantalla general MetaClass Pasos a seguir Captura de la metafase Clasificación automática Manipulación de los cromosomas no cariotipados de los cromosomas cariotipados Imprimir el informe y almacenar los datos

4 Pasos a seguir : Captura Captura de la metafase A través del microscopio con una o más imágenes Imágenes de disco Clasificación automática Manipulación de los cromosomas no cariotipados Manipulación de los cromosomas cariotipados Imprimir el informe y almacenar los datos Captura en vivo

5 Cambiar brillo y contraste Cambiar umbral En imágenes poco contrastadas, se puede usar la función de definir el umbral para eliminar suciedad y objetos que no son cromosomas

6 Capturar otra imagen para completar la metafase Imagen original Cromosomas añadidos de la segunda imagen Segunda imagen (Se añaden encuadrando el cromosoma deseado con el ratón) Captura de la metafase a través de un fichero guardado en el disco

7 Pasos a seguir : Clasificación Captura de la metafase Clasificación automática de los cromosomas Manipulación de los cromosomas no cariotipados Manipulación de los cromosomas cariotipados Imprimir el informe y almacenar los datos Tipo de célula Antes de clasificar se puede escoger el tipo de célula a analizar, para así obligar que sea masculina o femenina

8 Clasificar Cromosomas ordenados automáticamente Encima de la imagen de la Metafase, se puede observar el tipo de los cromosomas que le ha asignado el cariotipador de forma automática Ventana del Cariotipo ordenado

9 1 Tipos de vista 1.- Ventana con la metafase 2.- Ventana del cariotipo 3.- Ventana con los cromosomas no clasificados 2 3 Pasos a seguir : Manipulación (1) Captura de la metafase Clasificación automática Manipulación de los cromosomas no cariotipados correctamente Clasificación directa Separación de cromosomas pegados Eliminación de cruces Manipulación de los cromosomas cariotipados Imprimir el informe y almacenar los datos

10 Cromosoma válido En casos donde el sistema duda, pero se observa que no hay cruce, simplemente apretando este botón, el cromosoma pasa a la ventana de cariotipos, ordenandolo automáticamente. También se puede apretar directamente el número deseado obligandolo a ponerse en la posición seleccionada. Separación de cruces automático Simplemente apretando este botón, el sistema detecta el cruce y lo separa automáticamente con el máximo detalle

11 Separación de cromosomas Si dos cromosomas se están tocando pero no existe cruce, apretando este botón los separa automáticamente. La opción reintentar sirve para casos que nos de una separación incorrecta, mostrará otras posibilidades. Si hay tres o más cromosomas, el programa nos irá dando todas las separaciones hasta que queden los cromosomas cortados individualmente. Separación manual de cruces En casos con cruces difíciles de resolver con la herramienta automática, existe la posibilidad de hacerlo de forma manual. Simplemente se tendrá que marcar cuatro puntos alrededor del cruce y la separación y clasificación se hará automáticamente.

12 Deseleccionado Separación Deshacer Separación manual de cromosomas Línea que corta el cromosoma, hecha directamente con el ratón Igual que en el caso anterior, pero con separación de cromosomas unidos por la zona periférica. Se trazará una línea directamente encima de la imagen y se apretará el botón de separación. Automáticamente separará el cromosoma del resto de la imagen y lo ordenará en el lugar oportuno. Cromosoma obtenido cortando el duplicado Cromosoma obtenido con la separación automática Duplicar objetos Si aparecen cromosomas sobrepuestos, esta herramiente será útil para duplicar el objeto, y por lo tanto coger primero uno y luego el otro.

13 Borrar objetos Si aparecen objetos que no son cromosomas, estos se podrán borrar directamente apretando este botón. Existe también la posibilidad de borrar objetos directamente en la metafase. Nueva imagen Selección Coger más cromosomas... En todo momento se pueden coger más cromosomas: - De video directamente, cogiendo una nueva imagen y seleccionando los cromosomas deseados. - Directamente de la imagen de la metafase, si no se ha cogido alguno, seleccionandolo con el ratón haciendo un cuadro encima de él. - De la misma forma que antes, si se selecciona un cromosoma clasificado, se elimina del cariotipo. Número de cromosomas

14 Pasos a seguir : Manipulación (2) Captura de la metafase Clasificación automática Manipulación de los cromosomas no cariotipados Manipulación de los cromosomas Clasificación por arrastre de los cromosomas mal colocados Desplazamiento, rotación y zoom Variaciones de brillo y contraste Imprimir el informe y almacenar los datos Ordenar los cromosomas - Seleccionar y elegir número - Seleccionar y arrastrar con el ratón Arrastre

15 Deseleccionar todos Seleccionar todos Selección de cromosomas Apretando encima de cualquier cromosoma se selecciona individualmente Zoom Desplazar derecha/izquierda arriba/abajo Rotar 90º o 180º (si se aprieta el botón derecho del ratón encima de un cromosoma, este rota 180º) Retocar presentación del cariotipo

16 Brillo Contraste Se puede modificar el brillo y contraste de los cromosomas seleccionados Cambio de brillo/contraste Idiogramas

17 Cambiar color de fondo Pasos a seguir : Imprimir y guardar Captura de la metafase Clasificación automática Manipulación de los cromosomas no cariotipados Manipulación de los cromosomas cariotipados Imprimir el informe y almacenar los datos Datos propios de cada análisis Imágenes de la metafase inicial y de los cromosomas clasificados

18 Imprimir sólo cariotipo Los cromosomas se pueden marcar y poner en la posición/orientación que se quiera Etiqueta del cariotipo

19 Imprimir informe general Etiqueta Imprimir informe general Cariotipo

20 Imprimir informe general Metafase Base de datos del análisis Se puede guardar: Sesión con : Imágenes (metafase y cariotipo ordenado) Etiqueta del cariotipo Si no se ha acabado de analizar, datos intermedios para continuar posteriormente Imagen de la metafase (archivo bmp) Imagen del cariotipo ordenado (bmp)

21 Recuperar análisis Guardar análisis Análisis nuevo MetaClass Cariotipador Automático