Análisis de la Consanguinidad Mediante la Utilización de Información Genealógica de las Ganaderías de Raza de Lidia Pertenecientes a la UCTL

Transcripción

1 VIII Congresso Ibérico sobre Recursos Genéticos Animais Évora (Portugal) setembro 2012 Análisis de la Consanguinidad Mediante la Utilización de Información Genealógica de las Ganaderías de Raza de Lidia Pertenecientes a la UCTL Javier Cañón Julio Fernández Oscar Cortés jcanon@vet.ucm.es

2 Una característica poco común (canjeabilidad ecológica y genética) (genetic and ecological exchangeability) Algunas características ecológicas (ecosistema mediterráneo), genéticas (división en subpoblaciones) y productivas (explotación de caracteres de comportamiento relacionados con agresividad)......hacen de esta raza una verdadera Unidad Evolutiva con dificultad de poder ser substituida por otra (exchangeability) y, gran prioridad en programas de conservación

3 Principales resultados Subdivisión en encastes (elevada diversidad genética entre encastes) La mayoría de esta diversidad es consecuencia de diferencias genéticas entre ganaderías

4 Consecuencias Subdivisión en encastes (la raza de lidia no se comporta como una población con apareamiento aleatorio) Tendencia a aumentar las diferencias genéticas entre encastes Incremento del parecido entre los individuos de un encaste F

5 Consecuencias Aplicando los criterios de la FAO sobre razas en peligro a los encastes de lidia se obtiene la siguiente tabla de encastes en peligro de extinción en España Datos de las 5 asociaciones Datos sólo de la UCTL CASTA / ENCASTE / LÍNEA Número de Ganaderías Vacas Sementales Número de Ganaderías Vacas Porcentaje Sementales de vacas Porcentaje de sementales 1 Concha y Sierra % 100% 2 Saltillo % 100% 3 Pablo-Romero % 100% 4 Conde de la Corte % 100% 5 Pedrajas % 100% 6 Miura % 100% 7 Urcola % 100% 8 Villamarta % 85% 9 Hidalgo Barquero % 100% 10 Veragua % 50% 11 Coquilla % 9% 12 Albaserrada % 100% 13 Graciliano Pérez-Tabernero % 93% 14 Vega-Villar % 74% 15 Contreras % 17% 16 Osborne % 47% % 75%

6 Información a elaborar Historia filogenética Estructura genética Diferenciación morfológica y genética

7 Información a elaborar Estructura genética

8 Resumen del material genealógico disponible Nº de ganaderías 369 Nº de siglas 455 Nº de animales

9 Información a elaborar Base genética Censo efectivo de fundadores Censo efectivo de ancestros Nº de ancestros que explican el 50% Censo efectivo ajustado por cantidad de información Censo efectivo última generación (>2004)

10 Información a elaborar Endogamia y consecuencias % animales endogámicos % animales con endogamia > 6,25% Endogamia media Endogamia media de animales endogámicos Endogamia media de animales con endogamia > 6,25 Incremento consanguinidad última generación (>2004) Incremento esperado en endogamia en 50 años

11 Cálculo de los parámetros Censo efectivo de fundadores 1/Σq 2 Censo efectivo de ancestros 1/Σp k 2 i Censo efectivo ajustado por cantidad de información N e = 1/2b Censo efectivo última generación N e = 1/2ΔF 50/ t b es el coeficiente de regresión de la endogamia sobre el número equivalente de Fgeneraciones 50 = 1 (1 conocidas ΔF) Incremento esperado en endogamia en 50 años ΔF= (F t F t 1 )/(1 F t 1 ) t es el intervalo medio entre generaciones (7,5)

12 Software utilizado RePed (Baro et al. 2000) PEDIG (Boichard, 2002) SAS Baro, J.A., Alvarez, R., Carleos, C., García, D., Lamelas, H RePed. A tool for checking, exploring and debugging pedigris. ITEA, 96A: Boichard, D PEDIG: A Fortran package for pedigree analysis suited to large populations. In Proc. 7th World Congr. Genet. Appl. Liv. sgqa.jouy.inra.fr/article.php3?id_article=110

13 Resultados Base genética Total Censo efectivo de fundadores 468 Censo efectivo de ancestros 275 Nº de ancestros que explican el 50% 228 Censo efectivo ajustado por cantidad de información 36 Censo efectivo última generación (>2004) 32

14 Resultados Base genética Total Censo efectivo de fundadores 468 Censo efectivo de ancestros 275 Nº de ancestros que explican el 50% 228 Censo efectivo ajustado por cantidad de información 36 Censo efectivo última generación (>2004) 32

15 Resultados Base genética Total Censo efectivo de fundadores 468 Censo efectivo de ancestros 275 Nº de ancestros que explican el 50% 228 Censo efectivo ajustado por cantidad de información 36 Censo efectivo última generación (>2004) 32

16 Resultados Base genética Total Censo efectivo de fundadores 468 Censo efectivo de ancestros 275 Nº de ancestros que explican el 50% 228 Censo efectivo ajustado por cantidad de información 36 Censo efectivo última generación (>2004) 32

17 Resultados Base genética Total Censo efectivo de fundadores 468 Censo efectivo de ancestros 275 Nº de ancestros que explican el 50% 228 Censo efectivo ajustado por cantidad de información 36 Censo efectivo última generación (>2004) 32

18 Resultados Endogamia y consecuencias Total % animales endogámicos 73 % animales con endogamia > 6,25% 51 Endogamia media 6,9 Endogamia media de animales endogámicos 9,1 Endogamia media de animales con endogamia > 6,25 14,8 Incremento consanguinidad última generación (>2004) 1,6 Incremento esperado en endogamia en 50 años 10

19 Resultados Endogamia y consecuencias Total % animales endogámicos 73 % animales con endogamia > 6,25% 51 Endogamia media 6,9 Endogamia media de animales endogámicos 9,1 Endogamia media de animales con endogamia > 6,25 14,8 Incremento consanguinidad última generación (>2004) 1,6 Incremento esperado en endogamia en 50 años 10

20 Resultados Endogamia y consecuencias Total % animales endogámicos 73 % animales con endogamia > 6,25% 51 Endogamia media 6,9 Endogamia media de animales endogámicos 9,1 Endogamia media de animales con endogamia > 6,25 14,8 Incremento consanguinidad última generación (>2004) 1,6 Incremento esperado en endogamia en 50 años 10

21 Resultados Endogamia y consecuencias Total % animales endogámicos 73 % animales con endogamia > 6,25% 51 Endogamia media 6,9 Endogamia media de animales endogámicos 9,1 Endogamia media de animales con endogamia > 6,25 14,8 Incremento consanguinidad última generación (>2004) 1,6 Incremento esperado en endogamia en 50 años 10

22 Resultados Endogamia y consecuencias Total % animales endogámicos 73 % animales con endogamia > 6,25% 51 Endogamia media 6,9 Endogamia media de animales endogámicos 9,1 Endogamia media de animales con endogamia > 6,25 14,8 Incremento consanguinidad última generación (>2004) 1,6 Incremento esperado en endogamia en 50 años 10 % apareamientos entre hermanos o padre hijo 6%

23 Resultados Endogamia y consecuencias Total % animales endogámicos 73 % animales con endogamia > 6,25% 51 Endogamia media 6,9 Endogamia media de animales endogámicos 9,1 Endogamia media de animales con endogamia > 6,25 14,8 Incremento consanguinidad última generación (>2004) 1,6 Incremento esperado en endogamia en 50 años 10

24 Resultados Endogamia y consecuencias Total % animales endogámicos 73 % animales con endogamia > 6,25% 51 Endogamia media 6,9 Endogamia media de animales endogámicos 9,1 Endogamia media de animales con endogamia > 6,25 14,8 Incremento consanguinidad última generación (>2004) 1,6 Incremento esperado en endogamia en 50 años 10 Simon (1999) * <5 ausencia de riesgo; 5-15 riesgo bajo; riesgo moderado; en peligro; > 40 situación crítica

25 Resumen del material genealógico disponible Total ADN Nº de ganaderías Nº de siglas Nº de animales

26 Resultados Endogamia e información molecular Total ADN % animales endogámicos % animales con endogamia > 6,25% Endogamia media 6,9 7,8 Endogamia media de animales endogámicos 9,1 9,7 Endogamia media de animales con endogamia > 6,25 14,8 14,8 Incremento consanguinidad última generación (>2004) 1,6 1,9 Incremento esperado en endogamia en 50 años Correlación entre homocigosis y endogamia = 0,16

27 Conclusiones A pesar de su aparente elevado censo real: Censo efectivo global reducido, por debajo de la sostenibilidad La diversidad reside en los encastes Programas de conservación de los encastes en peligro

28 Conclusiones Programas de conservación de los encastes en peligro CASTA / ENCASTE / LÍNEA Número de Ganaderías Vacas Sementales N G 1 Concha y Sierra Saltillo Pablo-Romero Conde de la Corte Pedrajas Miura Urcola Villamarta Hidalgo Barquero Veragua Coquilla Albaserrada Graciliano Pérez-Tabernero Vega-Villar Contreras Osborne

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